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Genome-wide association study on glioma risk in Japan

Research Project

Project/Area Number 20K17965
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 56010:Neurosurgery-related
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

Umehara Toru  大阪大学, 大学院医学系研究科, 招へい教員 (20792469)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,730,000 (Direct Cost: ¥2,100,000、Indirect Cost: ¥630,000)
Keywordsglioma / meningioma / genetic polymorphism / 神経膠腫 / 髄膜腫 / 遺伝子多型 / 個別化医療 / オミクス解析 / 不均一性
Outline of Research at the Start

神経膠腫において、欧米を中心に宿主遺伝子背景と疾患を関連付けるゲノムワイド関連解析が行われてきたが、本邦からの体系的な報告は未だ存在しない。本研究では、人類遺伝学的に比較的均質であるという本邦の特性を生かし、国内神経膠腫症例を対象に遺伝子多型解析を行う。さらに臨床・画像情報や腫瘍分子プロファイルとの横断的統合解析により、人種・地域特異的な神経膠腫リスクモデルの構築や病態解明、予防、創薬、個別化医療の実現を最終目標とする。

Outline of Final Research Achievements

In this multicenter prospective case-control study, we studied 401 Japanese patients with meningioma.This GWAS eventually revealed no genetic variants with genome-wide significance (P < 5×10-8) and observed no significant association in the two previously reported risk variants (rs11012732 and rs2686876) due to low minor allele frequency in the Japanese population. The strongest association was provided by SNP rs35127183 on 15q25, where the A allele was associated with the increased risk (Odds ratio, 1.63; 95% confidence interval, 1.34-1.99; P=7.0×10-7), although without genome-wide significance.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

日本人の髄膜腫患者を対象としたGWAS研究を実施した。ゲノムワイド有意水準を満たす関連は検出されず、日本人集団に特異的な髄膜腫のリスクSNPを同定することはできなかった。また欧米から報告されているリスクSNPは日本人においてアレル頻度が極めて低いため、関連性を評価することが困難であった。しかしながら、本研究は東アジア人集団で初めての髄膜腫患者のGWASであり、今後の髄膜腫患者のGWAS研究に寄与する可能性がある。

Report

(5 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (4 results)

All 2022 2021 2020

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Revisiting the definition of glioma recurrence based on a phylogenetic investigation of primary and re-emerging tumor samples: a case report2022

    • Author(s)
      Umehara T, Arita H, Miya F, Achiha T, Shofuda T, Yoshioka E, Kanematsu D, Nakagawa T, Kinoshita M, Kagawa N, Fujimoto Y, Hashimoto N, Kiyokawa H, Morii E, Tsunoda T, Kanemura Y, Kishima H.
    • Journal Title

      Brain Tumor Pathol.

      Volume: 39(4) Issue: 4 Pages: 218-224

    • DOI

      10.1007/s10014-022-00438-1

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 全ゲノムシークエンスを用いた再発グリオーマ/de novo 腫瘍の鑑別2021

    • Author(s)
      梅原 徹、有田英之、宮 冬樹、平山龍一、木嶋教行、香川尚己、藤本康倫、橋本直哉、金村米博、貴島晴彦
    • Organizer
      日本脳神経外科学会 第80回学術総会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 機械学習による画像テクスチャ解析を用いた 初発膠芽腫の予後推定2020

    • Author(s)
      梅原徹, 木下学, 佐々木貴浩, 有田英之, 吉岡絵麻, 正札智子, 児玉良典, 香川尚己, 沖田典子, 高野浩司, 宇田武弘, 深井順也, 阪本大輔, 森艦二, 金村米博
    • Organizer
      日本脳神経外科学会第79回学術総会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 術前画像情報を用いた 初発膠芽腫の予後推定の有用性と限界2020

    • Author(s)
      梅原徹, 木下学, 佐々木貴浩, 有田英之, 吉岡絵麻, 正札智子, 児玉良典, 香川尚己, 沖田典子, 高野浩司, 宇田武弘, 深井順也, 阪本大輔, 森艦二, 金村米博
    • Organizer
      第38回日本脳腫瘍学会学術集会
    • Related Report
      2020 Research-status Report

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Published: 2020-04-28   Modified: 2025-01-30  

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