Detection of bacteria in biofilms and drug-resistant bacteria using next-generation sequencer and nucleic acid amplification machine

• Project/Area Number: 20K18045
• Research Category: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Basic Section 56020:Orthopedics-related
• Research Institution: Kansai Medical University
• Principal Investigator: 植田 成実 関西医科大学, 医学部, 助教 (30632757)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2022-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2020)
• Budget Amount: ¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000); Fiscal Year 2021: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000); Fiscal Year 2020: ¥2,730,000 (Direct Cost: ¥2,100,000、Indirect Cost: ¥630,000)
• Keywords: バイオフィルム / LAMP法 / PCR / インプラント周囲感染・人工関節周囲感染 / 次世代シーケンサー

Outline of Research at the Start

1) PCR・OSNA法によるバイオフィルム内細菌定量PCR・耐性菌遺伝子検出
2) NGSによるバイオフィルム感染症診断・関節内細菌の薬剤耐性遺伝子検出
3) 非感染疾患関節内および非感染インプラント細菌叢の定量PCR・NGS検証