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Integrated Analysis of Transcriptome and Histone Modifications in Granulosa Cells During Ovulation in Female Mice

Research Project

Project/Area Number 20K18191
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 56040:Obstetrics and gynecology-related
Research InstitutionYamaguchi University

Principal Investigator

SHIRAFUTA YUICHIRO  山口大学, 医学部附属病院, 助教 (00845050)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2022: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Keywords卵巣 / 黄体化 / epigenetics / 顆粒膜細胞 / ゲノムワイド解析 / ヒストン修飾
Outline of Research at the Start

卵巣では、排卵時のLHサージによって顆粒膜細胞が黄体化することにより、遺伝子の発現が大きく変化する。この遺伝子発現調節についてのこれまでの研究は、個々の遺伝子について焦点を当てたものであり、DNA側から見た遺伝子発現制御機構の研究やゲノムワイドに検討した研究は極めて少ない。本研究では、次世代シークエンサーを用い、黄体化に伴う遺伝子発現調節領域のエピジェネティックな変化をヒストン修飾とクロマチン構造の変化から捉え、ゲノム全域にわたり統合的に解析したエピゲノム情報を確立する。このエピゲノム情報を基盤に、卵巣顆粒膜細胞の黄体化に関わるエピジェネティックな遺伝子発現調節機構のメカニズムを明らかにする。

Outline of Final Research Achievements

Genome-wide gene expression analysis using RNA sequencing revealed that the expression of about 6000 genes changes within 12 hours after the LH surge in mouse granulosa cells. Furthermore, ChIP sequencing revealed that genome-wide changes of the histone modification H3K4me3 are induced. Genes with H3K4me3 changes have greater expression changes than genes without H3K4me3 changes. These H3K4me3-regulated genes are involved in various cellular functional changes and may contribute to the luteinization of granulosa cells.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究により、LHサージ後に起こるゲノムワイドな遺伝子発現とヒストン修飾変化が、顆粒膜細胞の黄体化に寄与することがわかった。黄体化は妊娠の維持に必須の事象である。本研究により黄体化の調節機構のひとつが明らかになり、不妊症の一因である黄体機能不全の治療にも繋がるため、社会的意義のある研究である。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (1 results)

All 2021

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results)

  • [Journal Article] Integrated Analysis of Transcriptome and Histone Modifications in Granulosa Cells During Ovulation in Female Mice2021

    • Author(s)
      Shirafuta Yuichiro、Tamura Isao、Ohkawa Yasuyuki、Maekawa Ryo、Doi-Tanaka Yumiko、Takagi Haruka、Mihara Yumiko、Shinagawa Masahiro、Taketani Toshiaki、Sato Shun、Tamura Hiroshi、Sugino Norihiro
    • Journal Title

      Endocrinology

      Volume: 162 Issue: 9 Pages: 1-17

    • DOI

      10.1210/endocr/bqab128

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access

URL: 

Published: 2020-04-28   Modified: 2024-01-30  

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