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Metagenomic analysis of microbiome involved in ocular surface stabilization

Research Project

Project/Area Number 20K18342
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 56060:Ophthalmology-related
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

Asao Kazunobu  大阪大学, 大学院医学系研究科, 寄附講座助教 (80866533)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2022: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Keywordsmicrobiome / metagenomic analysis / endophthalmitis / MALT lymphoma / マイクロバイオーム / 細菌叢 / 真菌叢 / 眼内炎 / 結膜MALTリンパ腫 / バイオーム / メタゲノム解析
Outline of Research at the Start

眼科領域では眼結膜における固有細菌叢の存在が報告されており、眼表面疾患ではその疾患発症が結膜細菌叢変化に起因する可能性が示唆されている。本研究では、多くの眼表面疾患におけるマイクロバイオームの同定を行い、結膜環境の安定化に必要なマイクロバイオームを同定、疾患治療へと役立てることを目標とする。また、変異した細菌叢に対し健常細菌叢を定着、環境変化を改善させるため、治療指標となりえるサイトカインの同定を行い、マイクロバイオームを介在した眼疾患治療への基盤情報取得を行う。

Outline of Final Research Achievements

Metagenomic analysis was performed to investigate the fungal differences. Fifty eyes of conjunctival MALT lymphoma and 50 eyes of healthy volunteers were included. At the conjunctiva in conjunctival MALT lymphoma, decrease in diversity and higher prevalence of Malassezia were detected. Patients with conjunctival MALT lymphoma have a significantly higher frequency of allergic conjunctivitis(P=0.0343) and tear mucin concentrations were significantly lower(P=0.0368). Fungal dysbiosis may be involved in the pathogenesis of conjunctival MALT lymphoma.
6 consecutive treatment-naive patients with endophthalmitis were recruited and cultures were positive in all cases. The isolated pathogens were 5 bacteria and one fungus. Pathogens from the metagenomic analysis were consistent with culture results at the species level. This analysis can detect pathogens in the short term, resulting in an accurate diagnosis, appropriate selection of antibiotics.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

メタゲノム解析を用いて眼表面疾患、眼感染症疾患におけるバイオームの同定を行った。疾患発症の原因が明らかではない結膜MALTリンパ腫では真菌叢変化、眼環境の変化を示すことができた。真菌叢変化の同定は治療介入の指標となり、予防治療へと繋がる可能性がある。
緊急疾患である眼感染症疾患である眼内炎において、メタゲノム解析で起炎菌の同定を行ったところ、培養で同定された起炎菌との一致が見られた。この結果は、メタゲノム解析は感染症疾患における起炎菌の同定方法として新たな選択肢となり、引いては適切な抗生剤選択に繋がる可能性を示すことができた。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (15 results)

All 2023 2022 2021 2020

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 1 results) Presentation (9 results) Book (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Mitochondrial DNA as a Biomarker for Acute Central Serous Chorioretinopathy: A Case-Control Study2022

    • Author(s)
      Hashida Noriyasu、Asao Kazunobu、Hara Chikako、Quantock Andrew J.、Saita Ryotaro、Kurakami Hiroyuki、Maruyama Kazuichi、Nishida Kohji
    • Journal Title

      Frontiers in Medicine

      Volume: 9 Pages: 2022-2022

    • DOI

      10.3389/fmed.2022.938600

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Rubicon Regulates A2E-induced Autophagy Impairment in the Retinal Pigment Epithelium Implicated in the Pathology of Age-related Macular Degeneration2021

    • Author(s)
      Ando S, Hashida N, Yamashita D, Kawabata T, Asao K, Kawasaki S, Sakurai K, Yoshimori T, Nishida K.
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun

      Volume: 551 Pages: 148-154

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 原発巣と転移巣で異なる抗癌剤の反応性を示した肺癌による転移性脈絡膜腫瘍の一例2020

    • Author(s)
      谷口隆英、橋田徳康、浅尾和伸、丸山和一、西田幸二
    • Journal Title

      眼科

      Volume: 62 Pages: 1005-1011

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] びまん性強膜炎の前眼部光干渉断層計による治療前後の前部強膜厚の比較2020

    • Author(s)
      家室 怜, 橋田 徳康, 浅尾 和伸, 丸山 和一, 西田 幸二
    • Journal Title

      眼科臨床紀要

      Volume: 13 Pages: 387-391

    • NAID

      40022272380

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 眼炎症疾患の鑑別診断におけるメタゲノム解析の有用性2023

    • Author(s)
      浅尾 和伸
    • Organizer
      第15回北摂眼科病診連携の会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 結膜MALTリンパ腫患者におけるアレルギー素因の検討2022

    • Author(s)
      浅尾 和伸, 橋田 徳康, 丸山 和一, 西田 幸二
    • Organizer
      第126回日本眼科学会総会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] PR3-ANCA陽性で結膜下に肉芽組織増殖を認めた壊死性強膜炎の1例2022

    • Author(s)
      浅尾和伸、橋田徳康、北口善之、丸山和一、西田幸二
    • Organizer
      第448回大阪眼科集談会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 眼内炎の起炎菌同定にメタゲノム解析を用いた6症例2022

    • Author(s)
      浅尾 和伸, 橋田 徳康, 丸山 和一, 西田 幸二
    • Organizer
      第76回日本臨床眼学会総会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 結膜MALTリンパ腫における真菌叢解析2021

    • Author(s)
      浅尾 和伸、橋田 徳康、山下 大輔、丸山 和一、西田 幸二
    • Organizer
      フォーサム2021 第57回日本眼感染症学会総会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 原発巣と転移巣で抗癌剤治療に対する異なる反応性を呈した転移性脈絡膜腫瘍の1例2021

    • Author(s)
      諏訪貴久, 橋田徳康, 丸山和一, 浅尾和伸, 宮澤宏輔, 西田幸二
    • Organizer
      第445回 大阪府眼科集談会
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      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 転移性悪性黒色腫に対するニボルマブ治療中に網膜色素上皮の散在性増殖変化を認めた1例2021

    • Author(s)
      藤原 秀, 橋田 徳康, 浅尾 和伸, 丸山 和一, 西田 幸二
    • Organizer
      第444回大阪眼科集談会
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      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 肺小細胞癌の虹彩転移に対し、メソトレキセート硝子体内注射と抗VEGFを併用し経過観察した一例2021

    • Author(s)
      前野友希, 浅尾和伸, 橋田徳康, 丸山和一, 西田幸二
    • Organizer
      第443回大阪眼科集談会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 結膜MALTリンパ腫におけるdysbiosisに伴う涙液・血清中サイトカインの検討2020

    • Author(s)
      浅尾和伸、橋田徳康、丸山和一、西田幸二
    • Organizer
      第124回日本眼科学会総会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Book] 強膜炎に対する生物学的製剤による治療2020

    • Author(s)
      浅尾和伸、橋田徳康
    • Total Pages
      6
    • Publisher
      金原出版株式会社
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 感染性の硝子体疾患の検出方法2023

    • Inventor(s)
      浅尾和伸、橋田徳康、丸山和一、西田幸二
    • Industrial Property Rights Holder
      浅尾和伸、橋田徳康、丸山和一、西田幸二
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2023-039897
    • Filing Date
      2023
    • Related Report
      2022 Annual Research Report

URL: 

Published: 2020-04-28   Modified: 2024-01-30  

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