• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Development and validation of quantum physics and chemistry-interpretable deep learning methods in data-driven science

Research Project

Project/Area Number 20K19876
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 61030:Intelligent informatics-related
Research InstitutionNational Institute of Advanced Industrial Science and Technology

Principal Investigator

Tsubaki Masashi  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 情報・人間工学領域, 研究員 (80803874)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2022: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2021: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Keywords深層学習 / 密度汎関数理論 / 転移学習 / 機械学習 / 量子化学計算 / 密度汎関数法 / データ駆動科学 / マテリアルズ・インフォマティクス / 第一原理計算
Outline of Research at the Start

申請者は、本研究課題の核心をなす学術的「問い」を以下のように立てる。「大規模データ駆動の深層学習モデルは、量子物理・化学の法則を反映した上で、解釈可能な予測を我々に提供できるか?」実際に、昨今の深層学習モデルのほとんどは、精度向上のために様々な技術の寄せ集めになっており、必ずしも理論計算のように量子物理・化学に基づいていない。したがって、深層モデルが量子物理・化学を反映した上で学習し、最終的な予測を提供しているかどうかを、人間は解釈できない。申請者は、深層学習における解釈性という問題を、モデルの内部に量子物理・化学の法則、現象、あるいはメカニズムを与えることで具体的に解決することを目指す。

Outline of Final Research Achievements

The three main research results are as follows. First, we implemented the new deep learning model described above and showed that it can extrapolate and predict molecular energies within a certain error range. In the process of implementing this model, we also succeeded in mathematically demonstrating that the conventional deep learning model is equivalent to the superposition of wave functions in quantum chemical calculations. Furthermore, the new deep learning model was trained on a simple small molecule, and the learned model was transferred to the prediction of properties of more complex polymers. A total of three papers, one for each of these research results, were published in international journals.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

学術的意義は、物理化学と機械学習という二つの分野を適切に融合できたことである。分子データを扱う際には、どちらかの分野の理論やアプローチのみに偏ることなく、それぞれの分野の良い部分をうまくミックスさせることが必要不可欠であり、それを達成することができた。また社会的意義は、分子データは製薬企業や材料企業のすべてが密接に関わるデータであり、その分野の研究者や技術者にとっての基礎技術を開発できたことである。学習モデルは、製薬企業や材料企業が独自に持つデータでも再学習可能であり、広く使われることが期待できる。

Report

(5 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Products Report
  • Research Products

    (12 results)

All 2024 2023 2021 2020 Other

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (4 results) (of which Invited: 4 results) Book (1 results) Remarks (2 results) Patent(Industrial Property Rights) (2 results)

  • [Journal Article] Quantum deep descriptor: Physically informed transfer learning from small molecules to polymers2021

    • Author(s)
      Masashi Tsubaki and Teruyasu Mizoguchi
    • Journal Title

      Journal of Chemical Theory and Computation

      Volume: 17 Issue: 12 Pages: 7814-7821

    • DOI

      10.1021/acs.jctc.1c00568

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Quantum Deep Field: Data-Driven Wave Function, Electron Density Generation, and Atomization Energy Prediction and Extrapolation with Machine Learning2020

    • Author(s)
      Masashi Tsubaki and Teruyasu Mizoguchi
    • Journal Title

      Physical Review Letters

      Volume: 125 Issue: 20 Pages: 206401-206401

    • DOI

      10.1103/physrevlett.125.206401

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] On the equivalence of molecular graph convolution and molecular wave function with poor basis set2020

    • Author(s)
      Masashi Tsubaki and Teruyasu Mizoguchi
    • Journal Title

      Advances in Neural Information Processing Systems

      Volume: 33

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 量子化学計算のための深層学習技術の基礎と応用2021

    • Author(s)
      椿真史
    • Organizer
      顕微鏡計測インフォマティックス研究部会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 深層学習に基づく波動関数・電子構造の記述子表現と転移学習への応用依頼講演2021

    • Author(s)
      椿真史
    • Organizer
      日本化学会 第101回春季大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 深層学習に基づく波動関数・電子構造の記述子表現と転移学習への応用2021

    • Author(s)
      椿真史
    • Organizer
      日本化学会春季年会 2021
    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 創薬と新材料開発のための人工知能2021

    • Author(s)
      椿真史
    • Organizer
      情報処理学会全国大会 2021
    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Invited
  • [Book] ケモインフォマティクスにおけるデータ収集の最適化と解析手法~組成予測や化学構造の生成、合成経路探索や反応条件最適化、毒性評価~2023

    • Author(s)
      椿真史、その他
    • Total Pages
      657
    • Publisher
      技術情報協会
    • ISBN
      9784861049446
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Remarks] 開発した機械学習モデルのソースコードと整備したデータベース

    • URL

      https://github.com/masashitsubaki

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Remarks] 開発したソフトウエアの公開ページ

    • URL

      https://github.com/masashitsubaki

    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 物性予測方法及び物性予測装置2024

    • Inventor(s)
      椿 真史
    • Industrial Property Rights Holder
      国立研究開発法人産業技術総合研究所
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Acquisition Date
      2024
    • Related Report
      Products Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 物性予測方法及び物性予測装置2020

    • Inventor(s)
      椿真史
    • Industrial Property Rights Holder
      国立研究開発法人産業技術総合研究所
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
      2020
    • Related Report
      2020 Research-status Report

URL: 

Published: 2020-04-28   Modified: 2025-03-27  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi