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Initiation of Traumatic Brain Injury: Predicting Cellular Damage at the Molecular Scale

Research Project

Project/Area Number 20K20169
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 90110:Biomedical engineering-related
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

Shigematsu Taiki  大阪大学, 大学院基礎工学研究科, 助教 (50775765)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywords分子動力学シミュレーション / 生体膜 / せん断流れ / 不安定性 / 分子動力学法 / リン脂質二重膜 / 破断 / 張力 / うねり / 微小孔 / 引張 / 血液脳関門 / 非平衡
Outline of Research at the Start

外傷性脳損傷は,頭部に外部から機械的衝撃が作用した際に起こる障害で,様々な脳機能障害を引き起こす.外傷性脳損傷では,機械的衝撃が細胞や細胞間の接続関係に損傷を与えることは知られているが,損傷に至るまでと損傷から発症に至るまでに何が起こっているかは未だ明らかになっていない.本研究では,分子動力学シミュレーションを用いることで,細胞まで伝わってきた力学的な負荷が分子スケールでどのように細胞の“損傷”につながるかを明らかにする.特に,細胞膜の損傷と脳血管の内皮細胞間の密な接続の損傷に着目し,それらの力学的負荷による分子レベルでの構造変化,そして物質透過性といったマクロな物性値の変化を明らかにする.

Outline of Final Research Achievements

When an impact is applied to the head, non-physiological flow occurs within the interstitial fluid of the cerebral parenchyma. To investigate the effect of this flow on the cell membrane at the molecular level, molecular dynamics simulations of phospholipid bilayers under shear flow were conducted. The results revealed that the membrane structure becomes unstable and eventually ruptures when the applied shear rate exceeds a critical value. The critical shear rate could be predicted through linear stability analysis. Additionally, it was observed that the membrane experiences negative tension and undergoes compression below the critical shear rate.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究は,せん断流れがリン脂質二重膜に与える分子レベルでの影響を構造・力学的な面から明らかにし,理論モデルと比較することで理論的な予想の限界を示し,補間を行った点で学術的な意義がある.これらの成果は力学的負荷による生体膜の損傷というモデル化が難しかった部分について基礎的な知見を与えるもので,今後の膜損傷予測モデルの基盤になると期待される.また,近年の細胞工学技術の発展により,細胞単体や細胞組織を工学的に操作する必要性が増している.本研究で明らかにした力学的負荷と膜の関係は,外傷性脳損傷だけでなく,細胞操作時に細胞に与えられる負荷の許容範囲を力学的根拠に基づいて定める助けになりうる.

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2022 2021 2020

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (8 results)

  • [Journal Article] Kelvin-Helmholtz-like instability of phospholipid bilayers under shear flow: System-size dependence2020

    • Author(s)
      Shigematsu Taiki、Koshiyama Kenichiro、Wada Shigeo
    • Journal Title

      Physical Review E

      Volume: 102 Issue: 2 Pages: 022408-022408

    • DOI

      10.1103/physreve.102.022408

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 高せん断流れ下におけて脂質二重膜に生じる張力に関する分子動力学解析2022

    • Author(s)
      重松 大輝, 越山 顕一朗
    • Organizer
      日本機械学会 2022年度 年次大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Phospholipid bilayer under shear flow: a coarse-grained molecular dynamics simulation study2022

    • Author(s)
      Taiki Shigematsu
    • Organizer
      2nd International Workshop on Molecular-Scale Fluid Mechanics and Heat Transfer
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] せん断流れにより誘起されるリン脂質二重膜の張力: 分子動力学シミュレーション2021

    • Author(s)
      重松大輝, 越山顕一朗
    • Organizer
      日本流体力学会 年会2021
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] せん断流れ下におけるリン脂質二重膜のうねりに関する分子動力学シミュレーション: 超音波医療デバイスによる細胞膜損傷の解明に向けて2021

    • Author(s)
      重松大輝, 越山顕一朗
    • Organizer
      日本機械学会 2021年度年次大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] せん断流れ下でのリン脂質二重膜の不安定性:分子動力学解析2021

    • Author(s)
      重松大輝, 清野健
    • Organizer
      日本機械学会 第33回バイオエンジニアリング講演会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] せん断流れが脂質二重膜のうねりの特性に与える影響:分子動力学シミュレーション2020

    • Author(s)
      重松大輝, 越山顕一朗
    • Organizer
      第34 回数値流体力学シンポジウム
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] せん断流れ下での脂質二重膜のダイナミクス:分子動力学シミュレーション2020

    • Author(s)
      重松大輝, 越山顕一朗
    • Organizer
      日本流体力学会 年会2020
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] リン脂質二重膜中における微小孔形成の分子動力学とエネルギー論: 細胞膜透過化の理解に向けて2020

    • Author(s)
      重松大輝, 清野健
    • Organizer
      日本機械学会 2020年度年次大会
    • Related Report
      2020 Research-status Report

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Published: 2020-04-28   Modified: 2024-01-30  

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