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Biophysical and Biochemical Characterization of Novel Membrane Vesicles Responsible for Intercellular Biological Signaling

Research Project

Project/Area Number 20K20297
Project/Area Number (Other) 17H06242 (2017-2019)
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)

Allocation TypeMulti-year Fund (2020)
Single-year Grants (2017-2019)
Research Field Biomolecular chemistry and related fields
Research InstitutionNational Institute of Advanced Industrial Science and Technology

Principal Investigator

Ishii Noriyuki  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 主任研究員 (10261174)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥25,610,000 (Direct Cost: ¥19,700,000、Indirect Cost: ¥5,910,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
Fiscal Year 2019: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
Fiscal Year 2018: ¥8,970,000 (Direct Cost: ¥6,900,000、Indirect Cost: ¥2,070,000)
Fiscal Year 2017: ¥11,700,000 (Direct Cost: ¥9,000,000、Indirect Cost: ¥2,700,000)
Keywords細胞外小胞 / エクソソーム/エキソソーム / マイクロベシクル / 生体分子 / ナノコロイド / 透過型電子顕微鏡 / ランタノイド酢酸塩 / 動的光散乱 / エクソソーム / エキソソーム / ランタノイド / 細胞外膜小胞 / 膜小胞 / エキソソーム/エクソソーム / 電子顕微鏡解析 / 電子顕微鏡 / 生物物理
Outline of Research at the Start

本研究では、非侵襲高感度がん早期診断や薬物デリバリー技術開発から注目されているエキソソーム等の細胞外膜小胞のバイオ特性を、生物物理学、物理化学的視点からナノスケールレベルで解明する。エキソソームは細胞が放出する膜小胞の一種であり、血液や尿、唾液、脳脊髄液等の体液中に安定に存在している。病態細胞に特異的な核酸や蛋白質を高濃度に内包しているため、重篤疾患の早期発見バイオマーカーや新規治療法として、膜小胞の臨床応用への期待が高まっている。独自に開発した「生物物理学的解析に適した膜小胞の調製方法」(PCT/JP2017/013999)を基盤技術として活用し、エキソソームの生物物理化学特性を解明する。

Outline of Final Research Achievements

Exosomes, important extracellular vesicles (EVs) for intercellular communication, are difficult to distinguish from microvesicles. This study focused on multivesicular bodies (MVBs) and optimized the isolation, fractionation, and preparation of exosomes through stepwise direct observation using transmission electron microscopy (TEM). Fractionation under low-salt Bis-Tris buffer conditions revealed a specific population of approximately 50 nm. Furthermore, the presence of CD63, known to be one of the exosome markers, was confirmed by immunoelectron microscopy. Additionally, an attempt was made to transfer EV isolation and preparation from density gradient ultracentrifugation to tangential flow filtration, demonstrating the effectiveness of a continuous filtration method using regenerated cellulose membranes with different molecular weight cut-offs (MWCO). The isolation and characterization of intact EVs under optimal conditions are critical for biomedical applications.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

細胞外小胞(EVs)をナノコロイドとして認識し、医学生物学分野で見過ごされていた物理化学的課題を明らかにしました。電子顕微鏡法による条件最適化で、EVsを細胞から放出されたインタクトな状態で分離・調製する条件を確立しました。エクソソーム(small EVs)研究の共通基盤として幅広く活用が期待されます。さらに、限外ろ過法の連続的適用を考案し、その過程でsmall EVsにも赤血球のような変形能が示唆されました。レオロジー的な解明が望まれます。EVsに適した電子染色試薬の開発も進めました。EVsの研究は、細胞間通信の理解、疾患の診断・治療、薬物送達、生態系への影響等に革新的な貢献が期待されます。

Report

(8 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Annual Research Report
  • 2018 Annual Research Report
  • 2017 Annual Research Report
  • Research Products

    (30 results)

All 2023 2022 2021 2020 2019 2018 2017

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 2 results) Presentation (14 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results) Patent(Industrial Property Rights) (10 results) (of which Overseas: 3 results)

  • [Journal Article] 3,4-Dihydroxybenzalacetone Inhibits the Propagation of Hydrogen Peroxide-Induced Oxidative Effect <i>via</i> Secretory Components from SH-SY5Y Cells2023

    • Author(s)
      Ikemoto Mitsushi J.、Aihara Yukine、Ishii Noriyuki、Shigemori Hideyuki
    • Journal Title

      Biological and Pharmaceutical Bulletin

      Volume: 46 Issue: 4 Pages: 599-607

    • DOI

      10.1248/bpb.b22-00727

    • ISSN
      0918-6158, 1347-5215
    • Year and Date
      2023-04-01
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  • [Journal Article] Optimizing Exosome Preparation Based on Size and Morphology: Insights From Electron Microscopy2023

    • Author(s)
      Ishii Noriyuki、Noguchi Keiichi、Ikemoto Mitsushi J、Yohda Masafumi、Odahara Takayuki
    • Journal Title

      Microscopy and Microanalysis

      Volume: 29 Issue: 6 Pages: 2068-2079

    • DOI

      10.1093/micmic/ozad103

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  • [Journal Article] Investigation of the Efficacy of Lanthanoid Heavy Metal Acetates as Electron Staining Reagents for Biomembrane Vesicles2023

    • Author(s)
      Ishii Noriyuki、Odahara Takayuki
    • Journal Title

      Microscopy and Microanalysis

      Volume: 29 Issue: 6 Pages: 2080-2089

    • DOI

      10.1093/micmic/ozad107

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  • [Journal Article] C‐shaped dipper: A novel useful auxiliary tool for preparation of specimen grids for transmission electron microscopy2022

    • Author(s)
      Ishii Noriyuki
    • Journal Title

      Microscopy Research and Technique

      Volume: 86 Issue: 4 Pages: 431-438

    • DOI

      10.1002/jemt.24283

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  • [Journal Article] Systematic Investigation of Lanthanoid Transition Heavy Metal Acetates as Electron Staining Reagents for Protein Molecules in Biological Transmission Electron Microscopy2022

    • Author(s)
      Noriyuki Ishii
    • Journal Title

      Microscopy and Microanalysis

      Volume: 28 Issue: 3 Pages: 780-789

    • DOI

      10.1017/s1431927622000411

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      Noriyuki Ishii
    • Journal Title

      Peripheral Membrane Proteins

      Volume: 1 Pages: 105-122

    • DOI

      10.5772/intechopen.75120

    • ISBN
      9781789235128, 9781789235135
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      石井則行、池本光志、小田原孝行
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      池本光志、石井則行
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  • [Patent(Industrial Property Rights)] 透過型電子顕微鏡の観察試料の積載具、及び透過型電子顕微鏡の試料作製方法2021

    • Inventor(s)
      石井 則行、丸田 節雄
    • Industrial Property Rights Holder
      国立研究開発法人 産業技術総合研究所、日新イーエム株式会社
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
      2021
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  • [Patent(Industrial Property Rights)] 透過型電子顕微鏡観察試料用工具2020

    • Inventor(s)
      石井 則行
    • Industrial Property Rights Holder
      国立研究開発法人産業技術総合研究所
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
      2020
    • Acquisition Date
      2023
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      2023 Annual Research Report 2022 Research-status Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 立体像観察方法及びこれに用いる試料グリッド2020

    • Inventor(s)
      石井 則行
    • Industrial Property Rights Holder
      国立研究開発法人産業技術総合研究所
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
      2020
    • Acquisition Date
      2023
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  • [Patent(Industrial Property Rights)] 透過型電子顕微鏡観察試料作成方法及びそのための工具2020

    • Inventor(s)
      石井 則行
    • Industrial Property Rights Holder
      国立研究開発法人産業技術総合研究所
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
      2020
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  • [Patent(Industrial Property Rights)] 立体像観察方法及びこれに用いる試料グリッド2020

    • Inventor(s)
      石井 則行
    • Industrial Property Rights Holder
      国立研究開発法人産業技術総合研究所
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
      2020
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  • [Patent(Industrial Property Rights)] 生物物理学的解析に適した膜小胞の調製方法2020

    • Inventor(s)
      石井 則行、池本 光志
    • Industrial Property Rights Holder
      国立研究開発法人産業技術総合研究所
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
      2020
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      2020
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  • [Patent(Industrial Property Rights)] 透過型電子顕微鏡観察試料用工具2019

    • Inventor(s)
      石井則行
    • Industrial Property Rights Holder
      国立研究開発法人 産業技術総合研究所
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2019-203033
    • Filing Date
      2019
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  • [Patent(Industrial Property Rights)] 立体像観察方法及びこれに用いる試料グリッド2019

    • Inventor(s)
      石井則行
    • Industrial Property Rights Holder
      国立研究開発法人 産業技術総合研究所
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2019-226381
    • Filing Date
      2019
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  • [Patent(Industrial Property Rights)] 生物物理学的解析に適した膜小胞の調製方法2018

    • Inventor(s)
      石井則行、池本光志
    • Industrial Property Rights Holder
      石井則行、池本光志
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2018-510600
    • Filing Date
      2018
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      2018 Annual Research Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 生物物理学的解析に適した膜小胞の調製方法2017

    • Inventor(s)
      石井則行、池本光志
    • Industrial Property Rights Holder
      国立研究開発法人 産業技術総合研究所
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
      2017
    • Related Report
      2017 Annual Research Report
    • Overseas

URL: 

Published: 2017-07-21   Modified: 2025-01-30  

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