Building a planarian total RNA atlas at single-cell resolution.

Research Project

Project/Area Number	20K20457
Project/Area Number (Other)	19H05544 (2019)
Research Category	Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)
Allocation Type	Multi-year Fund (2020) Single-year Grants (2019)
Review Section	Medium-sized Section 43:Biology at molecular to cellular levels, and related fields
Research Institution	Institute of Physical and Chemical Research
Principal Investigator	林哲太郎国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, 技師 (70745413)
Project Period (FY)	2019-06-28 – 2024-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help	¥17,160,000 (Direct Cost: ¥13,200,000、Indirect Cost: ¥3,960,000) Fiscal Year 2023: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000) Fiscal Year 2022: ¥2,990,000 (Direct Cost: ¥2,300,000、Indirect Cost: ¥690,000) Fiscal Year 2021: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000) Fiscal Year 2020: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000) Fiscal Year 2019: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Keywords	１細胞RNAシーケンス / プラナリア / 全能性幹細胞 / 非ポリＡ型RNA / 全RNAアトラス
Outline of Research at the Start	プラナリアは成体内に全能性幹細胞を恒常的に維持し、適切なタイミングで適切な場所に細胞分化や組織再生を促す機構をもつ。一方で、ヒトやマウスをはじめとする高等生物にはその様な機構はない。本研究では、新たに１細胞方向性全長トータルRNAシーケンス法を開発することで、プラナリア全RNAアトラスを構築し、全能性幹細胞の維持・分化制御機構に関与する非ポリA型RNAを含んだ遺伝子ネットワークの解明を目指す。本研究において創出されるプラナリア全RNAアトラスは、発生生物学の基礎分野だけでなく、再生医療や臨床研究においても非常に有用な資産となることが期待される。