ヒトとゼブラフィッシュの類似点・相違点を利用した、遺伝子と化合物スクリーニング

Research Project

Project/Area Number	20K20600
Research Category	Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)
Allocation Type	Multi-year Fund
Review Section	Medium-sized Section 50:Oncology and related fields
Research Institution	Aichi Cancer Center Research Institute
Principal Investigator	細野祥之愛知県がんセンター(研究所), がん標的治療TR分野, ユニット長 (60820363)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	山口類愛知県がんセンター(研究所), システム解析学分野, 分野長 (90380675)
Project Period (FY)	2020-07-30 – 2024-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help	¥26,000,000 (Direct Cost: ¥20,000,000、Indirect Cost: ¥6,000,000) Fiscal Year 2023: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000) Fiscal Year 2022: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000) Fiscal Year 2021: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000) Fiscal Year 2020: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Keywords	ゼブラフィッシュ / PDX / CRISPRスクリーニング法 / シングルセルRNAシークエンス法
Outline of Research at the Start	ゼブラフィッシュエンブリオを母体として作成した患者検体由来異種移植モデル（PDX）を用いた生体内CRISPRスクリーニングを行う。がん組織の不均一性に対する解決策としてCRISPRスクリーニング法とシングルセルRNAシークエンス法を組み合わせた方法を用い、CRISPRスクリーニング法のPDXに対する相性の悪さを解消する。その後、同定された遺伝子群の情報を元に候補化合物を推測し、それらに対してゼブラフィッシュPDXによるフェノタープスクリーニングを行う。以上の研究方法を一連の流れの確立には、細胞株を用いたゼブラフィッシュ異種移植モデルを用いて行う。