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Regulation of gene expression using electricity: Lesson from electro-active microorganisms

Research Project

Project/Area Number 20K21297
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 38:Agricultural chemistry and related fields
Research InstitutionJapan Agency for Marine-Earth Science and Technology

Principal Investigator

Ishii Shun'ichi  国立研究開発法人海洋研究開発機構, 超先鋭研究開発部門(超先鋭研究プログラム), 副主任研究員 (10556913)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 井上 謙吾  宮崎大学, 農学部, 准教授 (70581304)
Project Period (FY) 2020-07-30 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2021: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
Fiscal Year 2020: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
Keywords電気微生物 / シトクロームC / ジオバクター属細菌 / 比較ゲノミクス / 転写制御因子 / Geobacter / 代謝制御因子 / 電子授受タンパク質
Outline of Research at the Start

バイオプロセスを用いた物質生産では、遺伝子の発現制御が重要であり、光、温度、電気などの物理刺激を用いて代謝経路のオン-オフを精密に制御するシステムの開発が待たれている。本研究では、化学物質を添加する遺伝子発現誘導方法に代わる新たな遺伝子発現の制御法として『電気』を利用する方法の可能性を探索する。その方法として、発電性ジオバクター属細菌の電位認識機構を同定し、その遺伝子群を大腸菌に導入する。

Outline of Final Research Achievements

This study aimed to explore the possibility of using electricity to regulate gene expression more effectively. We used the genes involved in potential recognition of redox potentials in the electrogenic bacteria, Geobacter sp. within anodic biofilm.
Comparative genomics of 23 Geobacter species revealed that several multi-heme c-type cytochromes were universally present in this genus, while sensor proteins with one heme binding domain in a two-component regulatory system were also conserved, which could associate with the recognition of redox potentials. We have succeeded in generating strains deficient in two c-type cytochromes and one b-type cytochrome genes in the model strain of genus Geobacter, and found that these mutant strains have altered iron-reducing activity. These results are expected to lead to the development of gene expression control methods using electricity in the future.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

「電気」を利用する方法の可能性を探索する。バイオプロセスを用いた物質生産では、遺伝子の発現制御が重要であり、光、温度、電気などの物理刺激を用いて代謝経路のオン-オフを精密に制御するシステムの開発が待たれている。本研究では、化学物質を添加する遺伝子発現誘導方法に代わる新たな遺伝子発現の制御法として「電気」を利用する方法の可能性を探索した。その結果、ジオバクター属細菌に、電子授受を担うタンパク質であるシトクロームCが、転写制御因子内に多数含まれると共にこの属に保存的である事が示された。これらの遺伝子群は、電気を用いた遺伝子発現制御法の開発に利活用可能であると考えられる。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (2 results)

All 2021

All Presentation (2 results) (of which Invited: 2 results)

  • [Presentation] 固体から電子を抜き取る電気合成微生物群集を用いた電気メタン生成2021

    • Author(s)
      石井俊一
    • Organizer
      日本微生物生態学会第34回大会 自由集会1:電気合成微生物の生理・生態と産業利用の可能性
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 地下圏における電気微生物の探索と電気メタン発酵2021

    • Author(s)
      石井俊一
    • Organizer
      農芸化学会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Invited

URL: 

Published: 2020-08-03   Modified: 2024-01-30  

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