| Project/Area Number |
20K21344
|
|---|
| Research Category |
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
|
| Allocation Type | Multi-year Fund |
|---|
| Review Section |
Medium-sized Section 40:Forestry and forest products science, applied aquatic science, and related fields
|
|---|
| Research Institution | Forest Research and Management Organization |
|---|
Principal Investigator |
松本 麻子 国立研究開発法人森林研究・整備機構, 森林総合研究所, 主任研究員 等 (90353862)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
草野 都 筑波大学, 生命環境系, 教授 (60415148)
福島 敦史 京都府立大学, 生命環境科学研究科, 教授 (80415281)
加藤 珠理 国立研究開発法人森林研究・整備機構, 森林総合研究所, 主任研究員 等 (90467217)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2020-07-30 – 2024-03-31
|
| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
|
| Budget Amount *help |
¥6,240,000 (Direct Cost: ¥4,800,000、Indirect Cost: ¥1,440,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
|
|---|
| Keywords | サクラクローン品種 / メチル化 / メタボローム / エピゲノム / クローン品種 |
|---|
| Outline of Research at the Start |
サクラ栽培品種ソメイヨシノを対象に、加齢によって生じるDNAの修飾とそれに伴うメタボロームの変化を捉える。ヒトなどではすでに、塩基配列の変異を伴わないエピジェネティックなDNAへの修飾が遺伝子の転写に影響を与え、細胞全体の生態にも影響し得ることが分かっているが、樹木のような長命な種においては、加齢と共に生じる生命を維持する上で重要な遺伝子のメチル化やそれに伴う不活性化現象は捉えられていない。本研究ではクローン個体を用いてゲノム配列の背景を統一し、樹齢の異なる個体でエピゲノムとメタボロームを統合解析して定性定量化することにより、長命である樹木の年齢（樹齢）推定に挑む。
|
| Outline of Annual Research Achievements |
サクラ栽培品種を対象に、加齢によって生じるDNAの修飾とそれに伴うメタボロームの変化を捉える課題である。
エピゲノム解析では、全ゲノムバイサルフェイトシークエンスの結果から遺伝子の転写に影響を及ぼす可能性が高い領域に起こるメチル化に焦点を当て、加齢に伴うメチル化の質的量的変化をゲノムワイドに検出する。
環境や樹齢が異なることによるDNAのメチル化の違いを明らかにするために、サクラ属の単一クローン品種10検体について、メチル化解析を実施した。全ゲノムの平均メチル化レベル、総メチル-シトシン量に占めるメチル化の割合、各染色体のメチル化シトシン密度、メチル化パターンの個体間の違いについて解析した。その結果、特に個体間比較で得られる異常ともみなされるメチル化の違いについては、異なる環境の同一品種間よりも同一環境の異なる品種間の方が、検出されるメチル化領域が多いことが明らかになった。それらメチル化領域については関連遺伝子の探索を行い、リノール酸代謝関連遺伝子などメチル化の影響を受けている可能性が有意に認められた。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
メチル化パターンが環境の影響を強く受けている可能性が示唆されたことから、研究目的を達成するには、より生育環境が同じ場所から得たサンプルの解析が必要になった、
|
| Strategy for Future Research Activity |
同一環境で樹齢の異なる個体を育成している候補地が見つかったことから、これらの試料の解析を実施する。
|
