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Identification of metabolon fot plant cell wall polysaccharide synthesis

Research Project

Project/Area Number 20K21403
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 43:Biology at molecular to cellular levels, and related fields
Research InstitutionRitsumeikan University

Principal Investigator

Ishimizu Takeshi  立命館大学, 生命科学部, 教授 (30314355)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 大橋 貴生  摂南大学, 理工学部, 准教授 (10597876)
Project Period (FY) 2020-07-30 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Keywords糖転移酵素 / 植物細胞壁 / 多糖 / タンパク質複合体 / ペクチン / 酵素複合体 / 細胞壁 / メタボロン
Outline of Research at the Start

植物細胞壁ペクチン成分のラムノガラクツロナンI (RG-I)の生合成について、複数の糖転移酵素がどのように連携して複雑な構造の多糖を合成しているか、理解が進んでいない。RG-I生合成酵素の一つ、RG-Iガラクトース転移酵素が天然変性領域を介して、複数の糖転移酵素が相分離してメタボロンを形成し、RG-Iを効率的に生合成しているのではないか、という仮説を検証する。RG-Iガラクトース転移酵素の遺伝子を同定し、複数のRG-I生合成糖転移酵素が存在するときの酵素の集合状態・酵素の活性化を解析する。本研究は複雑な生体分子の生合成機構のモデルとなる。

Outline of Final Research Achievements

It is thought that carbohydrate compounds in plants are efficiently biosynthesized by a protein complex including glycosyltransferases. In this study, we aimed to detect such an enzyme complex.
We found that pectin rhamnogalacturonan I biosynthetic galactosyltransferase is superactivated by polyelectrolytes, suggesting that a protein complex was formed with this enzyme at the core. We also found a protein complex with molecular mass of 610 kDa that contains xylan biosynthetic glycosyltransferases IRX9, IRX10, and IRX14-L. Furthermore, a complex with molecular mass of 450 kDa containing the flavonoid glycoside apiin biosynthetic enzymes was found. These complexes were detected in very low amounts, suggesting that they were formed temporarily.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

生命科学における主流研究技術(次世代シーケンサーを用いた遺伝子発現解析や各種オミクス解析、変異体の解析など)では、酵素複合体は解析できない。このような技術的な理由から、本研究が目指す糖転移酵素を含む複合体の検出・解析は遅れている。本研究では、植物糖質化合物の生合成に関する酵素複合体を複数見出した。いずれも量が少ないことも見出しており、一過的に形成されることが多い相分離集合体である可能性もある。このように本研究成果は、未解明なことが多い細胞内でのタンパク質集合体の形成と機能について、一定の回答を示すものであり、学術的意義が大きい。

Report

(3 results)
  • 2022 Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (15 results)

All 2022 2021 2020 Other

All Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 2 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 3 results) Book (1 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Wolfberry genomes and the evolution of Lycium (Solanaceae)2021

    • Author(s)
      Cao You-Long、Li Yan-Long、Fan Yun-Fang、Li Zhen、Yoshida Kouki、Wang Jie-Yu、Ma Xiao-Kai、Wng Ning、Mitsuda Nobutaka、Kotake Toshihisa、Ishimizu Takeshi 、Tsai Kun-Chan、Niu Shan-Ce、Zhang Diyang、Sun Wei-Hong、Luo Qing、Zhao Jian-Hua、Yin Yue、Zhang Bo、Wang Jun-Yi、他
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 4 Issue: 1 Pages: 671-671

    • DOI

      10.1038/s42003-021-02152-8

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Diversity of Pectin Rhamnogalacturonan I Rhamnosyltransferases in Glycosyltransferase Family 1062020

    • Author(s)
      Wachananawat Bussarin、Kuroha Takeshi、Takenaka Yuto、Kajiura Hiroyuki、Naramoto Satoshi、Yokoyama Ryusuke、Ishizaki Kimitsune、Nishitani Kazuhiko、Ishimizu Takeshi
    • Journal Title

      Frontiers in Plant Science

      Volume: 11 Pages: 997-997

    • DOI

      10.3389/fpls.2020.00997

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] 植物細胞壁ペクチン生合成機構解明への幕開け2020

    • Author(s)
      竹中悠人、石水毅
    • Journal Title

      応用糖質科学

      Volume: 10 Pages: 96-102

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 植物細胞壁ペクチンの構造と機能2020

    • Author(s)
      石水毅、竹中悠人
    • Journal Title

      応用糖質科学

      Volume: 10 Pages: 215-221

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 大腸菌を用いたアピゲニン-7-O-グルコシドの生産2022

    • Author(s)
      小林美稀、柿木優佑、石水毅、大橋貴生
    • Organizer
      日本農芸化学会2022年度大会
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  • [Presentation] セロリ由来フラボノイド配糖体アピイン生合成アピオース転移酵素の同定と基質認識2022

    • Author(s)
      山下真穂、藤森多恵、An Song、竹中悠人、小林優、石水毅
    • Organizer
      日本農芸化学会2022年度大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 植物フラボノイド配糖体アピインの生合成2021

    • Author(s)
      石水毅
    • Organizer
      第62回日本生化学会中国・四国支部例会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 逆生化学的手法による植物糖転移酵素の機能同定2021

    • Author(s)
      石水毅
    • Organizer
      第18回糖鎖科学コンソーシアムシンポジウム
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    • Invited
  • [Presentation] Diversity of Pectin RG-I Rhamnosyltransferases in GT1062021

    • Author(s)
      Bussarin Wachananawat, Takeshi Kuroha, Yuto Takenaka,Kazuhiko Nishitani,Takeshi Ishimizu
    • Organizer
      The 7th International Conference on Plant Cell Wall Biology
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] セロリ由来フラボノイド配糖体アピイン生合成アピオース転移酵素の同定とその性質2021

    • Author(s)
      山下真穂、藤森多恵、竹中悠人、梶浦裕之、小林優、小埜栄一郎、石水毅
    • Organizer
      第70回日本応用糖質科学会2021年度大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] シロイヌナズナmur1-1胚軸をモデルとした細胞壁の化学/物理学的特性の解析2020

    • Author(s)
      九鬼寛明、曽我康一、西垣南歩、竹中悠人、山口雅利、石水毅、高橋大輔、小竹敬久
    • Organizer
      日本植物学会第84回大会
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  • [Presentation] 植物糖鎖生合成に関わる新規糖転移酵素2020

    • Author(s)
      石水毅、竹中悠人
    • Organizer
      第93回日本生化学会大会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Invited
  • [Book] 相分離生物学の全貌2020

    • Author(s)
      白木賢太郎 編
    • Total Pages
      416
    • Publisher
      東京科学同人
    • ISBN
      9784807913466
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Remarks] 立命館大学・石水研ホームページ

    • URL

      http://www.ismz.sk.ritsumei.ac.jp/

    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Remarks] 立命館大学生命科学部生物工学科石水研ボームページ

    • URL

      http://www.ismz.sk.ritsumei.ac.jp/

    • Related Report
      2020 Research-status Report

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Published: 2020-08-03   Modified: 2024-01-30  

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