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Existence and significance of a nutrient-mediated circadian clock feedback loop between root and shoot

Research Project

Project/Area Number 20K21428
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 44:Biology at cellular to organismal levels, and related fields
Research InstitutionNara Institute of Science and Technology

Principal Investigator

Endo Motomu  奈良先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 教授 (80551499)

Project Period (FY) 2020-07-30 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Fiscal Year 2020: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Keywords概日リズム / 長距離シグナル伝達 / シロイヌナズナ / 概日時計 / カリウム / 長距離輸送
Outline of Research at the Start

植物は器官・組織ごとに異なる環境情報を受容している。しかし、植物がどのようにして時間情報が個体レベルで統合されているかは、ほとんど明らかにされていない。そこで本研究では、概日周期の不安定性というこれまで着目されてこなかった新しいパラメーターを指標に、申請者が見出しつつある維管束を介したカリウムと糖の栄養シグナル伝達こそが植物の地上部と根をつなぐ時間情報の相互伝達の本質であることを明らかにする。これにより、植物が時間情報を伝達・共有する仕組みを解明すると共に、こうした仕組みが実際に植物の適応度を向上させることを証明する。

Outline of Final Research Achievements

Temporal information is transmitted over short and long distances, and this is thought to be involved in stabilizing circadian rhythms. Although temporal information has been shown to be transferred from the aboveground to the roots at the organ level, the presence or absence of temporal information transfer from the roots to the aboveground is unknown, and how these are involved in stabilizing circadian rhythms is also unknown. In this study, the clock gene PRR7 in roots regulated the potassium absorption rhythm. Furthermore, when the plants were grown in a potassium-deficient medium, the periodicity of the aboveground circadian rhythm was destabilized. This phenomenon was observed even when plants with grafted prr7 roots were grown on normal medium, indicating that prr7 is involved in the stabilization of the circadian rhythm in the aboveground portion of the substratum. Translated with www.DeepL.com/Translator (free version)

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

フィードバックループによって概日リズムは安定化していると考えられており、これを遺伝子間、オルガネラ間、細胞間と階層化することでより安定なリズムが形成されていると考えられる。本研究ではこれまでに報告されている地上部→根に加えて、根→地上部の長距離シグナル伝達経路を明らかにしたことで、植物でもっとも大きいレベルである器官間でのフィードバックループを強く示唆する結果を得た。
根の概日時計が栄養シグナルを介して地上部の概日リズムを制御することから、植物工場における水耕栽培などにおいては施肥のタイミングも収量や品質に影響しうることを示唆し、新たな制御ターゲットになると期待される。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (28 results)

All 2023 2022 2021 2020

All Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 3 results) Presentation (22 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 3 results)

  • [Journal Article] Root PRR7 Improves the Accuracy of the Shoot Circadian Clock through Nutrient Transport2023

    • Author(s)
      Uemoto Kyohei、Mori Fumito、Yamauchi Shota、Kubota Akane、Takahashi Nozomu、Egashira Haruki、Kunimoto Yumi、Araki Takashi、Takemiya Atsushi、Ito Hiroshi、Endo Motomu
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: 64 Issue: 3 Pages: 352-362

    • DOI

      10.1093/pcp/pcad003

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Sulfanilamide Regulates Flowering Time through Expression of the Circadian Clock Gene LUX2022

    • Author(s)
      Hirohata Atsuhiro、Yamatsuta Yuta、Ogawa Kaori、Kubota Akane、Suzuki Takamasa、Shimizu Hanako、Kanesaka Yuki、Takahashi Nozomu、Endo Motomu
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: - Issue: 5 Pages: 649-657

    • DOI

      10.1093/pcp/pcac027

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Color-Changing Fluorescent Barcode Based on Strand Displacement Reaction Enables Simple Multiplexed Labeling2022

    • Author(s)
      Makino Koki、Susaki Etsuo A.、Endo Motomu、Asanuma Hiroyuki、Kashida Hiromu
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 144 Issue: 4 Pages: 1572-1579

    • DOI

      10.1021/jacs.1c09844

    • Related Report
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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Spatially specific mechanisms and functions of the plant circadian clock.2022

    • Author(s)
      Davis W, Endo M, Locke JCW.
    • Journal Title

      Plant Physiology

      Volume: -

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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Na+/Ca2+ exchanger mediates cold Ca2+ signaling conserved for temperature-compensated circadian rhythms2021

    • Author(s)
      Kon Naohiro、Wang Hsin-tzu、Kato Yoshiaki S.、Uemoto Kyouhei、Kawamoto Naohiro、Kawasaki Koji、Enoki Ryosuke、Kurosawa Gen、Nakane Tatsuto、Sugiyama Yasunori、Tagashira Hideaki、Endo Motomu、Iwasaki Hideo、Iwamoto Takahiro、Kume Kazuhiko、Fukada Yoshitaka
    • Journal Title

      Science Advances

      Volume: 7 Issue: 18 Pages: 1-12

    • DOI

      10.1126/sciadv.abe8132

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Na+/Ca2+ exchanger mediates cold Ca2+ signaling conserved for temperature-compensated circadian rhythms.2021

    • Author(s)
      Kon, N, Wang, H, Kato, Y.S., Uemoto, K., Kawamoto, N., Kawasaki, K., Enoki, R., Kurosawa, G., Nakane, T. Sugiyama, Y., Tagashira, H., Endo M., Iwasaki, H., Iwamoto, T., Kume, K., Fukada Y.
    • Journal Title

      Science Advance

      Volume: -

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  • [Presentation] 時計遺伝子PRR7は光受容体phototropinのシグナル伝達系を制御する2022

    • Author(s)
      森本 隆弘, Carlo F M Gian 粕谷 日向子, 久保田 茜, 高橋 望, 中道 範人, 遠藤 求
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      第63回日本植物生理学会、オンライン
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      上本 恭平, 国本 由美, 森 史, 伊藤 浩史, 江頭 春樹, 久保田 茜, 木下 俊則, 荒木 崇, 遠藤 求
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      第63回日本植物生理学会、オンライン
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      第63回日本植物生理学会、オンライン
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  • [Presentation] B-boxファミリーGroupVは低温下で花成を制御する2022

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      近藤 祐雅, 久保田 茜, 菅野 茂夫, 村中 智明, 高橋 望, 今泉 貴登, 遠藤 求
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      Motomu Endo
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      Sapporo Symposium on Biological Rhythm 2021
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    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 時差ボケ実験から植物の外的符合モデルを再考する2021

    • Author(s)
      久保田 茜, 山本 いずみ, 遠藤 求
    • Organizer
      第28回 日本時間生物学会学術大会
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    • Invited
  • [Presentation] Clock genes show different spatiotemporal expression in Arabidopsis thaliana root2021

    • Author(s)
      Yu Leng, Akane Kubota, Nozomu Takahashi, Tatsuaki Goh, Motomu Endo
    • Organizer
      第28回 日本時間生物学会学術大会
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  • [Presentation] 地上部-根間での双方向カップリングによる概日周期の安定化の仕組み2021

    • Author(s)
      上本 恭平, 国本 有美, 荒木 崇, 遠藤 求
    • Organizer
      第28回 日本時間生物学会学術大会
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      2021 Research-status Report
  • [Presentation] Seasonal cues control the daily expression patterns of FT to optimize flowering time in nature2021

    • Author(s)
      Akane Kubota, Yusuke Ozaki, Yoshinori Kondo, Motomu Endo, Takato Imaizumi
    • Organizer
      第44回分子生物学会年会
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    • Invited
  • [Presentation] 地上部の概日時計による根毛伸長メカニズムの解析2021

    • Author(s)
      池田 ひかり, 内川 大雅, 近藤 洋平, 久保田 茜, 遠藤 求
    • Organizer
      日本植物学会 第85回大会、オンライン
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  • [Presentation] 野外環境における光と温度によるFT遺伝子の発現制御機構2021

    • Author(s)
      久保田 茜, 近藤 祐雅, 遠藤 求, 今泉 貴登
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      日本植物学会 第85回大会、オンライン
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  • [Presentation] 高温による花成制御機構の解析2021

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      日本植物学会 第85回大会、オンライン
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  • [Presentation] 栄養素の輸送を介した器官間でのカップリングが概日時計の安定性を高める2021

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      上本 恭平, 国本 有美, 森 史, 伊藤 浩史, 久保田 茜, 江頭 春樹, 木下 俊則, 荒木 崇, 遠藤 求
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      日本植物学会 第85回大会、オンライン
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  • [Presentation] シロイヌナズナの根を用いた概日時計による発生制御機構の解明2021

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      内川 大雅, Yu Leng, 近藤 洋平, 久保田 茜, 遠藤 求
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  • [Presentation] 概日時計を介した植物の季節認識機構の制御2021

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      廣畑 敦洋, 山蔦 祐太, 小河 香織, 久保田 茜, 鈴木 孝征, 遠藤 求
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  • [Presentation] 日中の高温は朝 FT の誘導を介して花成を促進する2021

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      廣畑 敦洋, 山蔦 祐太, 小河 香織, 久保田 茜, 鈴木 孝征, 遠藤 求
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      日本植物学会第84回大会
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Published: 2020-08-03   Modified: 2024-01-30  

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