Functional analysis of chimeric photoreceptor gene, PHYCRY identified from marine metagenome data
Project/Area Number |
20K21438
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Research Category |
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Review Section |
Medium-sized Section 44:Biology at cellular to organismal levels, and related fields
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Research Institution | Institute of Physical and Chemical Research |
Principal Investigator |
Shimada Setsuko 国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 研究員 (40432033)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
蒔田 由布子 前橋工科大学, 工学部, 教授 (80443026)
鈴木 重勝 国立研究開発法人国立環境研究所, 生物・生態系環境研究センター, 特別研究員 (10785108)
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Project Period (FY) |
2020-07-30 – 2023-03-31
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Project Status |
Completed (Fiscal Year 2022)
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Budget Amount *help |
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2020: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000)
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Keywords | 光受容体 / フィトクロム / クリプトクロム / 藻類 / 植物 / ゲノム解析 / 海洋メタゲノム |
Outline of Research at the Start |
海洋メタゲノム解析により発見された赤色光受容体フィトクロム(PHY)と青色光受容体クリプトクロム(CRY)の構造を持つ新型キメラ光受容体PHYCRY遺伝子について、分光学的性質、生物的機能の解析、プラシノ藻の全ゲノム配列の決定、光受容体遺伝子の系統解析を行い、新型キメラ光受容体PHYCRYの機能を明らかにする。本研究により光受容体の進化について新知見を得ることができると考えられる。
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Outline of Final Research Achievements |
In this project, we tried to uncover function of a chimeric photoreceptor gene, PHYCRY composed of a red-light receptor, phytochrome and a blue-light receptor, cryptochrome in a prasinophyte, Pycnococcus provasolii. We found the PHYCRY detected both orange/far-red and blue light. Furthermore, we named this gene dualchrome1 (DUC1) and advanced functional analysis of PHYCRY by transcriptome analysis in P. provasolii, complement analysis for plant photoreceptors, determination of genome sequence of P. provasolii and phylogenetic analysis of photoreceptor genes.
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Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
本研究の成果である新型の新型キメラ光受容体PHYCRYの分光学的性質、生物的機能解明により、赤色光受容体フィトクロムと青色光受容体クリプトクロムの光受容体の進化さらに緑色植物の進化について新知見を得ることが出来た。さらに、将来的に、新型キメラ光受容体の分光学的性質の解明が生物工学的応用につながることや、植物の相補解析結果が農業的な応用につながることが期待できると考えている。P. provasoliiは様々な深さ、地域に生息していることから、この光受容体は海洋環境で増殖する上で重要な役割を果たしていると考えられる。本成果は今後のCO2固定の研究開発への寄与も期待できると考えている。
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Report
(4 results)
Research Products
(8 results)
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[Presentation] 海洋藻類が保持する橙色光/遠赤色光と青色光を感知する新規光受容体・Dualchromeの単離と機能解析2022
Author(s)
嶋田勢津子, 蒔田由布子, 鈴木重勝, 伏見圭司, 陶久あや, 平田愛実, 栗山朋子, 栗原志夫, 濱崎英史, 栗原恵美子, 吉武和敏, 渡辺 剛, 作田正明, 五條堀孝, 坂見知子, 成川礼, 山口晴代, 河地正伸, 松井南
Organizer
第22回 日本光生物学協会年会
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[Presentation] 海洋メタゲノムデータからの新規光受容体の発見2021
Author(s)
蒔田由布子, 鈴木重勝, 伏見圭司, 嶋田勢津子, 陶久あや, 平田愛実, 栗山朋子, 栗原志夫, 濱崎英史, 栗原恵美子, 吉武和敏, 渡辺剛,坂見知子, 作田正明, 五條堀孝, 成川礼, 山口晴代, 河地正伸, 松井南
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日本植物学会第85回大会
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[Presentation] 新規光受容体・Dualchromeの生物的機能解析2021
Author(s)
嶋田勢津子, 蒔田由布子, 鈴木重勝, 伏見圭司, 陶久あや, 平田愛実, 栗山朋子, 栗原志夫, 濱崎英史, 栗原恵美子, 吉武和敏, 渡辺剛, 作田正明, 五條堀 孝, 成川 礼, 山口晴代, 河地正伸, 松井南
Organizer
日本植物学会第85回大会
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[Presentation] 海洋メタゲノム配列からの新規光受容体の発見2020
Author(s)
蒔田由布子, 鈴木重勝, 伏見圭司, 嶋田勢津子, 陶久あや, 栗山朋子, 栗原志夫, 濱崎英史,平田愛実, 成川礼, 山口晴代, 河地正伸, 松井南
Organizer
生物多様性のDNA情報学
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