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Heterogeneity and Plasticity of DNA Methylation during Clonal Evolution in Pancreatic Cancer

Research Project

Project/Area Number 20K22821
Research Category

Grant-in-Aid for Research Activity Start-up

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section 0901:Oncology and related fields
Research InstitutionKyorin University

Principal Investigator

Hayashi Akimasa  杏林大学, 医学部, 講師 (40735396)

Project Period (FY) 2020-09-11 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywords膵癌 / DNAメチル化 / 腫瘍内不均一性 / 腫瘍不均一性 / クローン進展
Outline of Research at the Start

癌は、従来は、均一な集団だと考えられて来ましたが、近年の研究から、癌が進化し、また治療に抵抗性を示す過程において、集団の不均一性が重要であることがわかってきました。今回の研究では、難治性癌の一つである膵癌において、遺伝子の発現を制御する重要なメカニズムの一つであるDNAのメチル化という観点から、一つの腫瘍の中の不均一性を探索します。そして、その不均一性が、癌の遺伝学的進化とどのような関連があるかについて解明することを目的とします。

Outline of Final Research Achievements

We performed genome-wide DNA methylation analysis using multisampling methods with FFPE samples at the department of pathology, Kyorin University, School of Medicine. We optimized our DNA extraction protocol and successfully gained high-quality genome-wide DNA methylation data. We are currently integrating our data with data from Memorial Sloan-Kettering Cancer Center to search for intratumoral heterogeneity in DNA methylation, its plasticity during clonal evolution, and functional annotations of these intratumoral differentially methylated genes.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究により、膵癌の腫瘍内DNAメチル化不均一性が明らかになりつつある。膵癌は、その発生過程において、主要ながん抑制遺伝子にDNAメチル化が起こることが知られている。今回得られたDNAメチル化データの解析を進め、クローン進展過程におけるDNAメチル化の可塑性や腫瘍内メチル化変動遺伝子の生物学的意義を探索することは、分子遺伝学的な新たな腫瘍進展メカニズムの解明につながると考えられる。

Report

(3 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2022 2021 2020

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (4 results)

  • [Journal Article] The pancreatic cancer genome revisited2021

    • Author(s)
      Hayashi Akimasa、Hong Jungeui、Iacobuzio-Donahue Christine A.
    • Journal Title

      Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology

      Volume: 18 Issue: 7 Pages: 469-481

    • DOI

      10.1038/s41575-021-00463-z

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genomic and Epigenomic Landscaping Defines New Therapeutic Targets for Adenosquamous Carcinoma of the Pancreas2020

    • Author(s)
      Lenkiewicz Elizabeth、Malasi Smriti、Hogenson Tara L.、Flores Luis F.、Barham Whitney、Phillips William J.、Roesler Alexander S.、Chambers Kendall R.、Rajbhandari Nirakar、Hayashi Akimasa、…、Fernandez-Zapico Martin E.、Barrett Michael T.
    • Journal Title

      Cancer Research

      Volume: 80 Issue: 20 Pages: 4324-4334

    • DOI

      10.1158/0008-5472.can-20-0078

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 膵管癌におけるDNAメチル化の腫瘍内不均一性と遍在性2022

    • Author(s)
      林玲匡、Christine Iacobuzio-Donahue.
    • Organizer
      第111回日本病理学会総会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 膵癌の発生・進展過程におけるエピゲノム異常2021

    • Author(s)
      林玲匡ら
    • Organizer
      第110回日本病理学会総会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 膵癌の発生・進展過程におけるエピゲノム異常2021

    • Author(s)
      林玲匡
    • Organizer
      第110回日本病理学会総会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 膵癌の非翻訳領域のクローン進展動態2021

    • Author(s)
      林玲匡、Christine A. Iacobuzio-Donahue
    • Organizer
      第110回日本病理学会総会
    • Related Report
      2020 Research-status Report

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Published: 2020-09-29   Modified: 2023-01-30  

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