| Project/Area Number |
20KK0167
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| Research Category |
Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Medium-sized Section 45:Biology at organismal to population levels and anthropology, and related fields
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| Research Institution | Tokyo Institute of Technology |
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Principal Investigator |
Nikaido Masato 東京工業大学, 生命理工学院, 准教授 (70432010)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
長澤 竜樹 東京工業大学, 生命理工学院, 助教 (60782828)
高橋 鉄美 兵庫県立大学, 自然・環境科学研究所, 教授 (70432359)
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| Project Period (FY) |
2020-10-27 – 2024-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥16,770,000 (Direct Cost: ¥12,900,000、Indirect Cost: ¥3,870,000)
Fiscal Year 2023: ¥3,640,000 (Direct Cost: ¥2,800,000、Indirect Cost: ¥840,000)
Fiscal Year 2022: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2021: ¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
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| Keywords | シクリッド / 平行進化 / 適応放散 / 祖先多型 / 東アフリカ産シクリッド / ゲノム比較 / フェロモン / 適応進化 / 全ゲノム比較 / V1R / 祖先集団多型 / フェロモン受容体 / 全ゲノム比較解析 |
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| Outline of Research at the Start |
本研究は適応放散や平行進化の典型例として知られているシクリッドに着目し、その適応放散・平行進化が祖先多型に由来するものか否かを検証する。そのため、タンザニアにおける野外調査、SGV由来アリルをもつV1R2を介したシクリッドの種分化の検証、SGV由来アリルをもつMAGP4遺伝子の発現低下と唇の肥大化の検証の３つのテーマを立てて、研究実施を進める。
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| Outline of Final Research Achievements |
In this research plan, we comprehensively explored candidate genes involved in adaptation and speciation based on a whole-genome comparative analysis of Lake Victoria cichlids (three species, 6 individuals/species). Phylogenetic analysis of the candidate genes for the three major East African lake cichlids, revealed that the origin of the alleles of these 99 candidate genes were older than the common ancestor of Lake Victoria, indicating that they were derived from ancestral polymorphisms. This suggests that ancestral polymorphisms retained in the ancestral population have contributed to the genomic basis of the adaptive radiation and parallel evolution of cichlids.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
種分化やそれが連続して起こる適応放散、そしてその一環として起きた平行進化のメカニズムについては、現代進化学でも完全なる理解に至っていない命題といえる。本研究では適応放散や平行進化の典型例として知られる東アフリカ産シクリッドに着目して、この問題に取り組んだ。その結果、東アフリカ産シクリッドのゲノム中には、多くの祖先多型が存在していることが分かり、これが適応放散や平行進化の遺伝的基盤となった可能性を示唆することに成功し、この学術的意義は大きいと考えられる。
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