Understanding the genetic mechanism of adaptive evolution and parallel evolution in East African cichlids

• Project/Area Number: 20KK0167
• Research Category: Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Medium-sized Section 45:Biology at organismal to population levels and anthropology, and related fields
• Research Institution: Tokyo Institute of Technology
• Principal Investigator: 二階堂 雅人 東京工業大学, 生命理工学院, 准教授 (70432010)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 長澤 竜樹 東京工業大学, 生命理工学院, 助教 (60782828) ; 高橋 鉄美 兵庫県立大学, 自然・環境科学研究所, 教授 (70432359)
• Project Period (FY): 2020-10-27 – 2024-03-31
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2023)
• Budget Amount: ¥16,770,000 (Direct Cost: ¥12,900,000、Indirect Cost: ¥3,870,000); Fiscal Year 2023: ¥3,640,000 (Direct Cost: ¥2,800,000、Indirect Cost: ¥840,000); Fiscal Year 2022: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000); Fiscal Year 2021: ¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000); Fiscal Year 2020: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
• Keywords: 東アフリカ産シクリッド / 適応放散 / 平行進化 / 祖先多型 / シクリッド / ゲノム比較 / フェロモン / 適応進化 / 全ゲノム比較 / V1R / 祖先集団多型 / フェロモン受容体 / 全ゲノム比較解析

Outline of Research at the Start

本研究は適応放散や平行進化の典型例として知られているシクリッドに着目し、その適応放散・平行進化が祖先多型に由来するものか否かを検証する。そのため、タンザニアにおける野外調査、SGV由来アリルをもつV1R2を介したシクリッドの種分化の検証、SGV由来アリルをもつMAGP4遺伝子の発現低下と唇の肥大化の検証の３つのテーマを立てて、研究実施を進める。

Outline of Annual Research Achievements

本研究計画ではビクトリア湖シクリッドの「全ゲノム比較解析」に基づいた適応・種分化遺伝子の網羅探索を実施し、その候補遺伝子が包含する変異が、東アフリカ三大湖シクリッドの系統樹において、起源の古い祖先多型に由来することを示すことにあった。加えて、「唇の肥大化」や「V1Rフェロモン受容体」を実際の適応例に掲げ、これらが祖先多型によって説明しうるかを検証することを目的とした。最終年度には共同研究相手のタンザニア水産研究所を訪問し、ビクトリア湖の野外調査により必要なシクリッドサンプルの採集をおこなった。研究内容としては、かねてより集団サイズが小さく遺伝的多様性が極度に低いことが予備データとして得られていたビクトリア湖の卵稚魚食性シクリッド「マタンビハンター」のゲノムワイド集団遺伝解析を実施した。その結果、マタンビハンターにおいて、過去に急激な集団サイズが縮小したことが推定値として示され（ボトルネック現象の検出）、これはナイルパーチがビクトリア湖に移入され、環境破壊が報告された年代（1970年台）と一致することが分かった。系統解析によるとマタンビハンターは同じ食性に属する他のシクリッドと単系統群を形成することが分かったが、ボトルネックが確認されたのはこのグループではマタンビハンターだけであった。これは同じ食性をもつグループにもかかわらず、ナイルパーチの影響の受けやすさに差があることが興味深く、これは保全対象種を選別する際にはゲノムレベルでの集団サイズ推定が有用な判断材料になることを示している。この成果は米国の分子進化専門誌であるMol. Biol. Evol.に受理されている。また、祖先多型に由来するフェロモン受容体V1R2については、そのリガンド探索の基盤となる実験系を構築するところまで到達し、これについては英国の比較生理学専門誌のJ. Exp. Biol.に受理・発表された。

Research Products

• [Int'l Joint Research] タンザニア水産研究所(タンザニア)
• [Int'l Joint Research] メリーランド大学(米国)
• [Int'l Joint Research] ベルン大学(スイス)
• [Journal Article] Localized Expression of Olfactory Receptor Genes in the Olfactory Organ of Common Minke Whales (2024)
  • Author(s): Hirose Ayumi、Nakamura Gen、Nikaido Masato、Fujise Yoshihiro、Kato Hidehiro、Kishida Takushi
  • Journal Title: International Journal of Molecular Sciences Volume: 25 Issue: 7 Pages: 3855-3855
  • DOI: 10.3390/ijms25073855
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Unveiling the expansion of keratin genes in lungfishes: a possible link to terrestrial adaptation (2023)
  • Author(s): Kimura Yuki、Nikaido Masato
  • Journal Title: Genes & Genetic Systems Volume: 98 Issue: 5 Pages: 249-257
  • DOI: 10.1266/ggs.23-00188
  • ISSN: 1341-7568, 1880-5779
  • Year and Date: 2023-10-01
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Ancient standing genetic variation facilitated the adaptive radiation of Lake Victoria cichlids (2023)
  • Author(s): Nakamura Haruna、Aibara Mitsuto、Nikaido Masato
  • Journal Title: Genes & Genetic Systems Volume: 98 Issue: 2 Pages: 93-99
  • DOI: 10.1266/ggs.23-00024
  • ISSN: 1341-7568, 1880-5779
  • Year and Date: 2023-04-01
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] In situ hybridization analysis of odorant receptor expression in the olfactory organ of the pig-nosed turtle Carettochelys insculpta (2023)
  • Author(s): Nakamuta Shoko、Itoh Miho、Mori Masanori、Kurita Masanori、Zhang Zicong、Nikaido Masato、Miyazaki Masao、Yokoyama Takuya、Yamamoto Yoshio、Nakamuta Nobuaki
  • Journal Title: Tissue and Cell Volume: 85 Pages: 102255-102255
  • DOI: 10.1016/j.tice.2023.102255
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Expression of type 1 vomeronasal receptors in the olfactory organ of the African lungfish, Protopterus dolloi (2023)
  • Author(s): Nakamuta Shoko、Sakuma Atsuhiro、Nikaido Masato、Kato Hideaki、Miyazaki Masao、Yamamoto Yoshio、Nakamuta Nobuaki
  • Journal Title: Acta Histochemica Volume: 125 Issue: 7 Pages: 152078-152078
  • DOI: 10.1016/j.acthis.2023.152078
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Type 1 vomeronasal receptor expression in juvenile and adult lungfish olfactory organ (2023)
  • Author(s): Nakamuta Shoko、Yamamoto Yoshio、Miyazaki Masao、Sakuma Atsuhiro、Nikaido Masato、Nakamuta Nobuaki
  • Journal Title: Zoological Letters Volume: 9 Issue: 1 Pages: 6-6
  • DOI: 10.1186/s40851-023-00202-z
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Plastic loss of motile cilia in the gills of Polypterus in response to high CO2 or terrestrial environments (2023)
  • Author(s): Kimura Yuki、Nakamuta Nobuaki、Nikaido Masato
  • Journal Title: Ecology and Evolution Volume: 13 Issue: 4
  • DOI: 10.1002/ece3.9964
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] c-fos expression in the olfactory epithelium of the East African cichlid (Haplochromis chilotes) in response to odorant exposure (2022)
  • Author(s): Kawamura Riki、Nikaido Masato
  • Journal Title: Journal of Experimental Biology Volume: 225 Issue: 20
  • DOI: 10.1242/jeb.244737
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] New Sex Chromosomes in Lake Victoria Cichlid Fishes (Cichlidae: Haplochromini) (2022)
  • Author(s): Kocher Thomas D.、Behrens Kristen A.、Conte Matthew A.、Aibara Mitsuto、Mrosso Hillary D. J.、Green Elizabeth C. J.、Kidd Michael R.、Nikaido Masato、Koblmuller Stephan
  • Journal Title: Genes Volume: 13 Issue: 5 Pages: 804-804
  • DOI: 10.3390/genes13050804
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Data of RNA-seq transcriptomes in the brain associated with aggression in males of the fish Betta splendens (2021)
  • Author(s): Vu Trieu-Duc、Iwasaki Yuki、Oshima Kenshiro、Chiu Ming-Tzu、Nikaido Masato、Okada Norihiro
  • Journal Title: Data in Brief Volume: 38 Pages: 107448-107448
  • DOI: 10.1016/j.dib.2021.107448
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Conserved keratin gene clusters in ancient fish: An evolutionary seed for terrestrial adaptation (2021)
  • Author(s): Kimura Yuki、Nikaido Masato
  • Journal Title: Genomics Volume: 113 Issue: 1 Pages: 1120-1128
  • DOI: 10.1016/j.ygeno.2020.11.008
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Genomic Signatures for Species-Specific Adaptation in Lake Victoria Cichlids Derived from Large-Scale Standing Genetic Variation (2021)
  • Author(s): Nakamura Haruna、Aibara Mitsuto、Kajitani Rei、Mrosso Hillary D J、Mzighani Semvua I、Toyoda Atsushi、Itoh Takehiko、Okada Norihiro、Nikaido Masato
  • Journal Title: Molecular Biology and Evolution Volume: in press Issue: 8 Pages: 3111-3125
  • DOI: 10.1093/molbev/msab084
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] A unique neurogenomic state emerges after aggressive confrontations in males of the fish Betta splendens (2021)
  • Author(s): Vu Trieu-Duc、Iwasaki Yuki、Oshima Kenshiro、Chiu Ming-Tzu、Nikaido Masato、Okada Norihiro
  • Journal Title: Gene Volume: 784 Pages: 145601-145601
  • DOI: 10.1016/j.gene.2021.145601
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Presentation] ポリプテルスの鼻管における化学感覚の研究 (2024)
  • Author(s): 伊藤隆晃, 西浦賀乃子, 木村優希, 中牟田信明, 長澤竜樹, 二階堂雅人
  • Organizer: 日本動物学会関東支部第76回大会, 東京大学
• [Presentation] 哺乳類フェロモン受容体V1R の進化的起源 (2023)
  • Author(s): 二階堂雅人
  • Organizer: 第9回ケモビ研究会, 御殿場高原時之栖
• [Presentation] 魚類の全ゲノム倍化後のOMP 遺伝子発現パターンの進化的比較解析 (2023)
  • Author(s): 長澤竜樹，藤崎花美, 二階堂雅人
  • Organizer: 第9回ケモビ研究会, 御殿場高原時之栖
• [Presentation] シクリッドV1R 遺伝子の多様性と機能的関連 (2023)
  • Author(s): 滝隼輔, 二階堂雅人
  • Organizer: 第9回ケモビ研究会, 御殿場高原時之栖
• [Presentation] 魚類における化学受容体の異所的な分布 (2023)
  • Author(s): 西浦賀乃子，張子聡，長澤竜樹，二階堂雅人
  • Organizer: 日本味と匂学会第57回大会, 東京工業大学
• [Presentation] ヨザル属における鋤鼻機能退化の可能性に関する遺伝学的な検証 (2023)
  • Author(s): 小林愛実, 新宅勇太, 河村正二, 二階堂雅人
  • Organizer: 日本味と匂学会第57回大会, 東京工業大学
• [Presentation] 魚類の全ゲノム重複で倍化したOMP遺伝子の進化プロセスとその多様化 (2023)
  • Author(s): 長澤竜樹，藤崎花美, 二階堂雅人
  • Organizer: 日本味と匂学会第57回大会, 東京工業大学
• [Presentation] シクリッドにおけるV1R嗅覚受容体遺伝子の多様性創出メカニズムの解明 (2023)
  • Author(s): 滝隼輔，二階堂雅人
  • Organizer: 日本味と匂学会第57回大会, 東京工業大学
• [Presentation] 水陸両生魚・ポリプテルスの陸上環境における恒常性維持機構 (Homeostatic mechanism in the terrestrial environment of Polypterus) (2023)
  • Author(s): 木村優希, 神田真司, 兵藤晋, 二階堂雅人
  • Organizer: 日本動物学会第94回大会, 山形大学
• [Presentation] Ectopic expression of chemoreceptor genes in fish (2023)
  • Author(s): Nishiura, K.，Zhang, Z.，Nagasawa, T.，Nikaido, M.
  • Organizer: 日本進化学会第25回大会, 琉球大学共通教育棟, 沖縄県市町村自治会館
• [Presentation] Functional differentiation of food-related olfactory receptor V2R in cichlid (2023)
  • Author(s): Kawamura, R.，Nikaido, M.
  • Organizer: 日本進化学会第25回大会, 琉球大学共通教育棟, 沖縄県市町村自治会館
• [Presentation] The Genomic Basis for Trophic Adaptation of East African Egg-Eating Cichlids (2023)
  • Author(s): Imamoto, M., Nakamura, H., Aibara, M., Nikaido, M.
  • Organizer: 日本進化学会第25回大会, 琉球大学共通教育棟, 沖縄県市町村自治会館
• [Presentation] Comparative Analysis of Hypertrophic Lips in East African Cichlid (2023)
  • Author(s): Machii, N.，Hatashima, R.，Aibara, M.，Nagasawa, T.，Nikaido, M.
  • Organizer: 日本進化学会第25回大会, 琉球大学共通教育棟, 沖縄県市町村自治会館
• [Presentation] 哺乳類における塩基性アミノ酸トランスポーター遺伝子の多様化 (2023)
  • Author(s): 中村遥奈、二階堂雅人
  • Organizer: 日本進化学会第25回大会, 琉球大学共通教育棟, 沖縄県市町村自治会館
• [Presentation] Ancient standing genetic variation facilitated the adaptive radiation of Lake Victoria cichlids (2023)
  • Author(s): Nakamura, H., Aibara, M., Mrosso, H.D.J., Mzighani, S.I., Nikaido,M.
  • Organizer: XXIIIrd International Congress of Genetics, Melbourne AUS
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] Molecular evolution of the OMP genes after the whole genome duplication in teleost fish (2023)
  • Author(s): Nagasawa, T., Fujisaki, H., Nikaido, M.
  • Organizer: XXIIIrd International Congress of Genetics, Melbourne AUS
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Olfactory receptor genes expressed in whale’s main olfactory organ: an implication for sense of smell (2023)
  • Author(s): Hirose, A., Nikaido, M., Nakamura, G., Fujise, Y., Kato, H., Kishida, T.
  • Organizer: XXIIIrd International Congress of Genetics, Melbourne AUS
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Did egg-eater lose the ecological competition? Strong population bottleneck in matumbi hunter the paedophage (2023)
  • Author(s): Imamoto, M., Nakamura, H., Aibara, M., Itoh, T., Nikaido, M.
  • Organizer: XXIIIrd International Congress of Genetics, Melbourne AUS
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Function Divergence of Cichlid Candidate Pheromone Receptor V1R2 (2023)
  • Author(s): Kawamura, R., Murata, K., Touhara, K., Nikaido, M.
  • Organizer: XXIIIrd International Congress of Genetics, Melbourne AUS
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] 魚類に見られる鼻管の機能解明 (2023)
  • Author(s): 伊藤隆晃, 西浦賀乃子, 木村優希, 中牟田信明, 長澤竜樹, 二階堂雅人
  • Organizer: 第11回Tokyo Vertebrate Morphology Meeting 東京慈恵会医科大学
• [Presentation] Genetic mechanisms of lip hypertrophy in East African cichlids (2023)
  • Author(s): Machii, N., Hatashima R., Aibara M., Nagasawa T., Nikaido M.
  • Organizer: nternational Symposium on Evolutionary Genomics and Bioinformatics 2023 国立清華大学(台湾)
• [Presentation] 東アフリカ産シクリッドのV1R2受容体のリガンド分化 (2023)
  • Author(s): 河村理輝，二階堂雅人
  • Organizer: 第8回 ケモビ研究会
• [Presentation] Exceptional evolutionary history and population bottleneck of egg eating cichlids in Lake Victoria (2022)
  • Author(s): Imamoto, M., Nakamura, H., Aibara, M., Ito, T. and Nikaido, M.
  • Organizer: Cichlid Science 2022
• [Presentation] 東アフリカ産シクリッドにおける肥大化した唇の分子実態解明 (2022)
  • Author(s): 待井長敏, 畑島諒, 中村遥奈, 丹羽達也, 長澤竜樹, 二階堂雅人
  • Organizer: 日本進化学会第24回沼津大会
• [Presentation] 卵泥棒・マタンビハンターのボトルネックと進化史 (2022)
  • Author(s): 今本南，中村遥奈，相原光人，伊藤武彦，二階堂雅人
  • Organizer: 日本進化学会第24回沼津大会
• [Presentation] 免疫関連遺伝子の発現消失がもたらしたシクリッドの唇肥大化平行進化 (2022)
  • Author(s): 畑島諒, 豊田敦, 梶谷嶺, 伊藤武彦, 二階堂雅人
  • Organizer: 日本進化学会第24回沼津大会
• [Presentation] シクリッドにおけるV1R遺伝子の種間比較解析 (2022)
  • Author(s): 滝隼輔，二階堂雅人
  • Organizer: 日本進化学会第24回沼津大会
• [Presentation] ヴィクトリア湖産シクリッドにおけるcollagen 6a6遺伝子の機能解析 (2022)
  • Author(s): 久保田和樹，中村遥奈，長澤竜樹，二階堂雅人
  • Organizer: 日本進化学会第24回沼津大会
• [Presentation] 免疫システムがもたらしたシクリッドの唇肥大化平行進化 (2022)
  • Author(s): 畑島諒, 待井長敏, 豊田敦, 梶谷嶺, 長澤竜樹, 伊藤武彦, 二階堂雅人
  • Organizer: 第2回日本遺伝学会春の分科会
• [Presentation] 東アフリカ産シクリッドのV1R2受容体の多型によるリガンド受容能の違いの検証 (2022)
  • Author(s): 河村理輝, 村田健, 東原和成, 二階堂雅人
  • Organizer: 第2回日本遺伝学会春の分科会
• [Presentation] 卵を食べるシクリッドの系統的起源 (2022)
  • Author(s): 今本南，中村遥奈，相原光人，伊藤武彦，二階堂雅人
  • Organizer: 日本動物学会関東支部第74回大会
• [Presentation] 肥厚した唇を持つヴィクトリア湖シクリッドの進化史推定 (2022)
  • Author(s): 中村遥奈，相原光人，伊藤武彦，二階堂雅人
  • Organizer: 日本動物学会関東支部第74回大会
• [Presentation] ヴィクトリア湖産シクリッド嗅上皮の外部形態の種間比較 (2022)
  • Author(s): 鈴木海理, 相原光人, 二階堂雅人
  • Organizer: 日本動物学会関東支部第74回大会
• [Presentation] シクリッドにおけるV1R遺伝子の網羅的解析 (2022)
  • Author(s): 滝隼輔，二階堂雅人
  • Organizer: 日本動物学会関東支部第74回大会
• [Presentation] マルチオミクス解析で探る「シクリッドの唇肥大化」の平行進化メカニズム (2022)
  • Author(s): 待井長敏，畑島諒，中村遥奈，丹羽達也，田口 英樹，長澤竜樹，二階堂雅人
  • Organizer: 日本動物学会関東支部第74回大会
• [Presentation] 東アフリカ産シクリッドのフェロモン受容体候補V1R2受容体の多型による選択的交配の可能性の検証 (2021)
  • Author(s): 河村理輝，村田健，清水翔子，川辺悠士郎，二階堂雅人
  • Organizer: 日本味と匂学会第55回福岡大会
• [Presentation] 全ゲノムから迫るビクトリア湖産シクリッド Haplochromis sp. “matumbi hunter”の集団史 (2021)
  • Author(s): 今本南，中村遥奈，相原光人，伊藤武彦，二階堂雅人
  • Organizer: 日本遺伝学会第93回大会
• [Presentation] ヴィクトリア湖産シクリッド Haplochromis chilotes の集団遺伝解析 (2021)
  • Author(s): 中村遥奈，相原光人，二階堂雅人
  • Organizer: 日本遺伝学会第93回大会
• [Presentation] シクリッドフェロモン受容体 V1R2 の成長に伴う発現量解析 (2021)
  • Author(s): 川辺悠士郎，清水翔子，河村理輝，二階堂雅人
  • Organizer: 日本遺伝学会第93回大会
• [Presentation] 匂い暴露による東アフリカ産シクリッドの嗅神経細胞の応答 (2021)
  • Author(s): 河村理輝，二階堂雅人
  • Organizer: 日本動物学会第92回大会
• [Presentation] シクリッドの適応形質・肥大化した唇の遺伝的基盤の解明 (2021)
  • Author(s): 待井長敏, 畑島諒, 中村遥奈, 長澤竜樹, 二階堂雅人
  • Organizer: 日本動物学会第92回大会
• [Presentation] 東アフリカ産シクリッドにおける遺伝子系統樹間の大規模な不一致 (2021)
  • Author(s): 二階堂雅人
  • Organizer: 日本進化学会第23回東京大会シンポジウム
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Whole-genome comparative analyses among subpopulations in Lake Victoria cichlid, Haplochromis chilotes (2021)
  • Author(s): Nakamura, H., Aibara, M. and Nikaido, M.
  • Organizer: The 2nd AsiaEvo Conference
  • Invited
• [Presentation] Possibility of assortative mating via putative pheromone receptor V1R2 in East African Cichlid (2021)
  • Author(s): Kawamura, R., Murata K., Shimizu, S., Kawabe, Y., Touhara, K., and Nikaido, M.
  • Organizer: The 2nd AsiaEvo Conference
  • Invited
• [Presentation] A key factor for parallel evolution of hypertrophied lips in East African cichlid fishes (2021)
  • Author(s): Hatashima, R., Toyoda, A., Kajitani, R. Itoh, T. and Nikaido, M.
  • Organizer: The 2nd AsiaEvo Conference
  • Invited
• [Presentation] Evolutionary history of egg hunting cichlids in Lake Victoria (2021)
  • Author(s): Imamoto, M., Nakamura, H., Aibara, M., Ito, Takehiko. and Nikaido, M.
  • Organizer: The 2nd AsiaEvo Conference
  • Invited
• [Presentation] Elucidating genetic mechanism of cichlid hypertrophic lips, using differentially expressed gene analysis (2021)
  • Author(s): Machii, N., Hatashima, R., Nakamura, H., Nagasawa, T. and Nikaido, M.
  • Organizer: The 2nd AsiaEvo Conference
  • Invited
• [Presentation] 東アフリカ産シクリッドで見られる唇肥大化平行進化の分子メカニズム (2021)
  • Author(s): 畑島諒, 豊田敦, 梶谷嶺, 伊藤武彦, 二階堂雅人
  • Organizer: 日本進化学会第23回東京大会
• [Presentation] 卵泥棒の起源からシクリッドの適応放散を探る (2021)
  • Author(s): 今本南，中村遥奈，相原光人，伊藤武彦，二階堂雅人
  • Organizer: 日本進化学会第23回東京大会
• [Presentation] 東アフリカシクリッドにおける唇肥大化の遺伝的基盤の解明 (2021)
  • Author(s): 待井長敏, 畑島諒, 中村遥奈, 長澤竜樹, 二階堂雅人
  • Organizer: 日本進化学会第23回東京大会
• [Presentation] 東アフリカ産シクリッドの唇肥大化に関わる平行進化の遺伝的機構 (2021)
  • Author(s): 二階堂雅人
  • Organizer: 第43回日本分子生物学会年会ワークショップ
  • Invited
• [Presentation] ヴィクトリア湖に生息する卵・稚魚食性シクリッド Haplochromis sp. “matumbi hunter” の進化の歴史 (2021)
  • Author(s): 今本南，中村遥奈，相原光人，伊藤武彦，二階堂雅人
  • Organizer: 日本動物学会関東支部第73回大会
• [Presentation] 東アフリカ産シクリッドにおける VI 型コラーゲンの進化 (2021)
  • Author(s): 中村遥奈，相原光人，二階堂雅人
  • Organizer: 日本動物学会関東支部第73回大会
• [Presentation] 熱帯魚シクリッドの匂い受容の検出 (2021)
  • Author(s): 河村理輝，二階堂雅人
  • Organizer: 第7回 ケモビ研究会
• [Book] 第４章 霊長類の遺伝」『霊長類学の百科事典』(日本霊長類学会 編集) (2023)
  • Author(s): 二階堂雅人 分担執筆
  • Publisher: 丸善出版
• [Book] あらゆる脊椎動物が共有するフェロモン受容体「科学」 (2023)
  • Author(s): 二階堂雅人 分担執筆
  • Publisher: 岩波出版
• [Remarks] 二階堂研究室HP
  • URL: http://www.nikaido.bio.titech.ac.jp/
• [Remarks] 二階堂研究室
  • URL: http://www.nikaido.bio.titech.ac.jp
• [Remarks] シクリッドゲノム中に適応進化の痕跡を発見（プレスリリース）
  • URL: https://www.titech.ac.jp/news/2021/049658.html