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Genomic survey of enteric pathogens in India for developing anti-adhesion therapies

Research Project

Project/Area Number 20KK0183
Research Category

Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 49:Pathology, infection/immunology, and related fields
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

Iida Tetsuya  大阪大学, 微生物病研究所, 教授 (90221746)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 沖 大也  大阪大学, 微生物病研究所, 特任研究員(常勤) (30845285)
河原 一樹  大阪大学, 大学院薬学研究科, 助教 (60585058)
Project Period (FY) 2020-10-27 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥18,590,000 (Direct Cost: ¥14,300,000、Indirect Cost: ¥4,290,000)
Fiscal Year 2022: ¥5,590,000 (Direct Cost: ¥4,300,000、Indirect Cost: ¥1,290,000)
Fiscal Year 2021: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2020: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Keywordsコレラ / メタゲノム解析 / IV型線毛 / コレラ菌 / 次世代シーケンサー / インド / 腸管病原体 / 下痢症
Outline of Research at the Start

世界的に公衆衛生の改善による感染症の制御が進められているが、腸管感染症は未だ乳幼児や高齢者の死亡要因の上位に位置しており、喫緊の課題である。代表的な腸管疾患であるコレラは、年間およそ10万人の死亡が推定され、自然災害や交通網発達などにより流行地からの感染拡大が認められており、先進国も例外ではない。本研究で取り組む大規模ゲノム疫学調査によるコレラ菌の性状及び宿主への付着・定着機構の理解に基づいた付着阻害剤開発は、耐性菌を生み出さない新規のコレラ対策であり、抗生物質やワクチンによる治療が難しい乳幼児や高齢者も対象とした有望な治療法として腸管感染症撲滅に大きく寄与することが期待される。

Outline of Final Research Achievements

Metagenomic analysis revealed that some citizens of Kolkata have a small number of V. cholerae in their intestines as a subclinical infection. In order to efficiently obtain the whole genome sequences of V. cholerae that cause subclinical infection, we made DNA probes targeting the V. cholerae genome. In addition, the transport mechanism of soluble colonization factor secreted by V. cholerae was elucidated by the crystal structures and interaction analysis.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究から得られたメタゲノム情報は、コレラ菌の不顕性感染者がインドでのコレラの拡散や蔓延に関与していることを示している。本研究で設計開発したDNAプローブによって効率的に収集されるコレラ菌のゲノム情報と、腸管定着に関わる因子の構造情報をあわせることで、コレラ菌に対するワクチンや新規薬剤の開発が可能となり、将来的にはコレラの感染制御に繋がることが期待される。

Report

(5 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2024 2023 2022 2021

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results)

  • [Journal Article] Structural basis for the toxin-coregulated pilus?dependent secretion of <i>Vibrio cholerae</i> colonization factor2022

    • Author(s)
      Oki Hiroya、Kawahara Kazuki、Iimori Minato、Imoto Yuka、Nishiumi Haruka、Maruno Takahiro、Uchiyama Susumu、Muroga Yuki、Yoshida Akihiro、Yoshida Takuya、Ohkubo Tadayasu、Matsuda Shigeaki、Iida Tetsuya、Nakamura Shota
    • Journal Title

      Science Advances

      Volume: 8 Issue: 41 Pages: 1-11

    • DOI

      10.1126/sciadv.abo3013

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 腸管毒素原性大腸菌が分泌する可溶性定着因子とリポソームの相互作用解析2024

    • Author(s)
      市岡慎也、飯森南斗、沖大也、今井友也、松田重輝、飯田哲也、吉田卓也、大久保忠恭、中村昇太、河原一樹
    • Organizer
      日本薬学会第144年会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Membrane recognition by secreted colonization factors of enterotoxigenic Escherichia coli.2023

    • Author(s)
      Iimori Minato, Oki Hiroya, Imai Tomoya, Matsuda Shigeaki, Yoshida Takuya, Ohkubo Tadayasu, Iida Tetsuya, Nakamura Shota, Kawahara Kazuki.
    • Organizer
      ASM Microbe 2023
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Secretion mechanism of the colonization factor via Type IVb pilus TCP from Vibrio cholerae.2023

    • Author(s)
      Hiroya Oki, Kazuki Kawahara, Minato Iimori, Haruka Nishiumi, Takahiro Maruno, Susumu Uchiyama, Shigeaki Matsuda, Takuya Yoshida, Tadayasu Ohkubo, Tetsuya Iida, and Shota Nakamura.
    • Organizer
      ASM Microbe 2023
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 腸管毒素原性大腸菌が分泌する可溶性定着因子の脂質膜認識機構の解明2023

    • Author(s)
      飯森南斗、沖大也、今井友也、松田重輝、飯田哲也、吉田卓也、大久保忠恭、中村昇太、河原一樹
    • Organizer
      第20回次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] コレラ菌が形成するIVb型線毛TCPによる定着因子TcpFの認識機構2023

    • Author(s)
      沖大也、河原一樹、飯森南斗、西海遥夏、丸野孝浩、内山進、松田重輝、吉田卓也、大久保忠恭、飯田哲也、中村昇太
    • Organizer
      第55回ビブリオシンポジウム
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] メタゲノム解析によるインド・コルカタ地域住民の便中のコレラ 菌の検査2021

    • Author(s)
      岡本 敬の介,北原 圭,高橋 栄造,三好 伸一,元岡 大祐,中村 昇太,飯田 哲也
    • Organizer
      第94回日本細菌学会総会
    • Related Report
      2020 Research-status Report

URL: 

Published: 2020-10-29   Modified: 2025-01-30  

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