新興感染症パンデミック予防に向けたタイ国における未知病原体の潜在的蔓延状況調査

• Project/Area Number: 20KK0199
• Research Category: Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Medium-sized Section 54:Internal medicine of the bio-information integration and related fields
• Research Institution: Rakuno Gakuen University (2023); Kyoto Prefectural University of Medicine (2020-2021)
• Principal Investigator: 大道寺 智 酪農学園大学, 獣医学群, 准教授 (80432433)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 西岡 敬介 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (50790713) ; 村越 ふみ 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (20759906) ; 萩原 克郎 酪農学園大学, 獣医学群, 教授 (50295896)
• Project Period (FY): 2020-10-27 – 2025-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2023)
• Budget Amount: ¥18,850,000 (Direct Cost: ¥14,500,000、Indirect Cost: ¥4,350,000); Fiscal Year 2023: ¥6,240,000 (Direct Cost: ¥4,800,000、Indirect Cost: ¥1,440,000); Fiscal Year 2022: ¥6,240,000 (Direct Cost: ¥4,800,000、Indirect Cost: ¥1,440,000); Fiscal Year 2021: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000); Fiscal Year 2020: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
• Keywords: 新興感染症 / 国際感染症 / 病原体検出

Outline of Research at the Start

今や感染症の流行はグローバル化により世界規模で起こるようになっている。予防には初期の対応も重要であるが、今後起こる感染症を予測し把握することが発生予防への第一歩であると考えられる。本研究は、タイにおける病原体の保有状況を把握し、新興感染症を起こす可能性がある病原体を検出することを目的とする。本成果はタイ国内の衛生環境の整備だけでなく、世界的規模で流行する感染症予防対策へ貢献できる。

Outline of Annual Research Achievements

本研究の目的は、タイ山間部において蔓延している病原体をヒト、野生動物、媒介節足動物から網羅的に同定することで、今後流行を起こす可能性がある未知病原体を検出することである。国際研究グループ(タイ)との連携により実施する。
本年度は北海道内の各地においてダニの採集を行い、ウイルス検出を試みた。今回採集できたダニはオオオトゲチマダニが主であった。また採集されたダニについては各ステージ(幼ダニ、若ダニ、成ダニ)のものが得られた。複数地域で採集したダニをそれぞれプールしホモジナイズした後にRNA抽出を行い、これまでに構築したフラビウイルス属を検出するユニバーサルプライマーを用いてPCRを実施した。今までに実施した結果では、これらのダニからはフラビウイルスは検出されなかった。一方で同様にダニ抽出DNAサンプルを用い、紅斑熱群を検出可能なユニバーサルプライマーを用いて、PCR法にてリケッチア類の検出を試みたが同様に検出されなかった。また同じく抽出DNAを鋳型にピロプラズマ原虫の検出を試みたところ、一部のダニサンプルより、タイレリア原虫を検出した。現在遺伝子配列を確認中である。
さらにダニを採集した牧野で飼育されていたウシの血液を用い核酸抽出を行った。現在これらのサンプルよりダニ同様に病原微生物の検出を試みている。
一方では、上記実験を推し進める傍らでタイ研究者と今後の研究の進め方について繰り返し協議し、情報交換を行った。サンプル処理や解析法について、タイ研究者と協議の上、現在必要な作業を進めている。

Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

新型コロナウイルスの流行状況は緩和し海外渡航もしやすくなったものの、最終年度が研究代表者の異動時期と重なり研究推進の時間確保が困難であったことが主たる理由である。

Strategy for Future Research Activity

最終年度が研究代表者の異動時期と重なり研究推進の時間確保が困難であったために、当該研究計画の1年間延長をした。1年間のうちに、これまでできなかった部分を進めたいと考えている。

Research Products

• [Int'l Joint Research] マヒドン大学(タイ)
• [Int'l Joint Research] マヒドン大学(タイ)
• [Journal Article] Emergence of SARS-CoV-2 with Dual-Drug Resistant Mutations During a Long-Term Infection in a Kidney Transplant Recipient (2024)
  • Author(s): Tanino Yoko、Nishioka Keisuke、Yamamoto Chie、Watanabe Yohei、Daidoji Tomo、Kawamoto Masataka、Uda Sayaka、Kirito Shoko、Nakagawa Yuta、Kasamatsu Yu、Kawahara Yoshiyuki、Sakai Yuri、Nobori Shuji、Inaba Tohru、Ota Bon、Fujita Naohisa、Hoshino Atsushi、Nukui Yoko、Nakaya Takaaki
  • Journal Title: Infection and Drug Resistance Volume: Volume 17 Pages: 531-541
  • DOI: 10.2147/idr.s438915
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Investigation of oncolytic effect of recombinant Newcastle disease virus in primary and metastatic oral melanoma (2023)
  • Author(s): Numpadit Supaporn、Ito Chiaki、Nakaya Takaaki、Hagiwara Katsuro
  • Journal Title: Medical Oncology Volume: 40 Issue: 5 Pages: 1-10
  • DOI: 10.1007/s12032-023-02002-z
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Decreased Immunoreactivity of Hepatitis E Virus Antigen Following Treatment with Sakhalin Spruce (Picea glehnii) Essential Oil (2023)
  • Author(s): Maeda Naoyuki、Horochi Shouya、Hasegawa Yasuhiro、Iwasaki Tomohito、Nakatani Nobutake、Miyasho Taku、Hagiwara Katsuro、Yokota Hiroshi、Funatsu Yasuhiro
  • Journal Title: Chemistry & Biodiversity Volume: 20 Issue: 4
  • DOI: 10.1002/cbdv.202200924
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Higher Viral Stability and Ethanol Resistance of Avian Influenza A(H5N1) Virus on Human Skin. (2022)
  • Author(s): Bandou R, Hirose R, Nakaya T, Miyazaki H, Watanabe N, Yoshida T, Daidoji T, Itoh Y, Ikegaya H.
  • Journal Title: Emerg Infect Dis. Volume: 28(3) Issue: 3 Pages: 639-649
  • DOI: 10.3201/eid2803.211752
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Downregulation of calcium-regulated heat stable protein 1 expression by low-temperature stimulation causes reduction of interferon-β expression and sensitivity to influenza viral infection (2022)
  • Author(s): Nishioka K, Daidoji T, Nakaya T.
  • Journal Title: Virus Res. Volume: 309 Pages: 198659-198659
  • DOI: 10.1016/j.virusres.2021.198659
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Stability of SARS-CoV-2 and influenza virus varies across different paper types. (2022)
  • Author(s): Hirose R, Miyazaki H, Bandou R, Watanabe N, Yoshida T, Daidoji T, Itoh Y, Nakaya T.
  • Journal Title: J Infect Chemother. Volume: 28(2) Issue: 2 Pages: 252-256
  • DOI: 10.1016/j.jiac.2021.11.006
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Evaluation of the Residual Disinfection Effects of Commonly Used Skin Disinfectants against Viruses: An Innovative Contact Transmission Control Method. (2021)
  • Author(s): Hirose R, Itoh Y, Ikegaya H, Miyazaki H, Watanabe N, Yoshida T, Bandou R, Daidoji T, Nakaya T.
  • Journal Title: Environ Sci Technol. Volume: 55(23) Issue: 23 Pages: 16044-16055
  • DOI: 10.1021/acs.est.1c05296
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Development of genus-specific universal primers for the detection of flaviviruses (2021)
  • Author(s): Daidoji Tomo、Morales Vargas Ronald Enrique、Hagiwara Katsuro、Arai Yasuha、Watanabe Yohei、Nishioka Keisuke、Murakoshi Fumi、Garan Kotaro、Sadakane Hiroki、Nakaya Takaaki
  • Journal Title: Virology Journal Volume: 18 Issue: 1 Pages: 1-13
  • DOI: 10.1186/s12985-021-01646-5
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Comparison of sodium alginate-based and sodium hyaluronate-based submucosal injection materials based on rheological analysis (2021)
  • Author(s): Hirose Ryohei、Watanabe Naoto、Naito Yuji、Hashimoto Hikaru、Sugino Satoshi、Yoshida Takuma、Bandou Risa、Daidoji Tomo、Inoue Ken、Dohi Osamu、Yoshida Naohisa、Nakaya Takaaki、Itoh Yoshito
  • Journal Title: Journal of the Mechanical Behavior of Biomedical Materials Volume: 124 Pages: 104816-104816
  • DOI: 10.1016/j.jmbbm.2021.104816
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Double mutations in the H9N2 avian influenza virus PB2 gene act cooperatively to increase viral host adaptation and replication for human infections (2021)
  • Author(s): Elgendy Emad Mohamed、Arai Yasuha、Kawashita Norihito、Isobe Ayana、Daidoji Tomo、Ibrahim Madiha Salah、Ono Takao、Takagi Tatsuya、Nakaya Takaaki、Matsumoto Kazuhiko、Watanabe Yohei
  • Journal Title: Journal of General Virology Volume: 102 Issue: 6 Pages: 1-17
  • DOI: 10.1099/jgv.0.001612
  • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
• [Journal Article] A Cytopathic Effect-Based Tissue Culture Method for HCoV-OC43 Titration Using TMPRSS2-Expressing VeroE6 Cells. (2021)
  • Author(s): Hirose R, Watanabe N, Bandou R, Yoshida T, Daidoji T, Naito Y, Itoh Y, Nakaya T.
  • Journal Title: mSphere Volume: 6(3) Issue: 3
  • DOI: 10.1128/msphere.00159-21
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Disinfectant effectiveness against SARS-CoV-2 and influenza viruses present on human skin: model-based evaluation. (2021)
  • Author(s): Hirose R, Bandou R, Ikegaya H, Watanabe N, Yoshida T, Daidoji T, Naito Y, Itoh Y, Nakaya T.
  • Journal Title: Clin Microbiol Infect. Volume: 27(7) Issue: 7 Pages: 1042.e1-1042.e4
  • DOI: 10.1016/j.cmi.2021.04.009
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Presentation] ウシ放牧地周辺におけるマダニの病原体保有状況調査 (2023)
  • Author(s): 村越ふみ、福田康弘、加藤健太郎
  • Organizer: 第69回日本寄生虫学会・日本衛生動物学会北日本支部合同大会
• [Presentation] 日本における鶏アイメリア共生ウイルスの疫学解析 (2023)
  • Author(s): 村越ふみ、田中悠太郎、千葉悠斗、浦山俊一、萩原大祐、松林誠、加藤健太郎、中屋隆明
  • Organizer: 第166回日本獣医学会学術集会
• [Presentation] 日本におけるクリプトスポリジウムおよびアイメリア共生ウイルスの検出と疫学解析 (2023)
  • Author(s): 村越ふみ
  • Organizer: 第37回寄生虫生態学・疫学談話会
  • Invited
• [Presentation] Hemagglutinin acid stability and infectivity of H5N6/H5N8 avian influenza viruses (2021)
  • Author(s): Tomo Daidoji, Hiroki Sadakane, Kotaro Garan, Yasuha Arai, Yohei Watanabe, Tatsufumi Usui, and Takaaki Nakaya
  • Organizer: 第６９回日本ウイルス学会学術集会
• [Presentation] 近年中国で優勢に流行するH9N2亜型鳥インフルエンザウイルスのPB2遺伝子に選択された同時変異群はヒト適応性を高く変化させている (2021)
  • Author(s): 荒井 泰葉、Elgendy Emad、川下理日人、磯邉 綾菜、大道寺 智、中屋 隆明、渡邊 洋平
  • Organizer: 第６９回日本ウイルス学会学術集会
• [Presentation] ヒト呼吸器上皮細胞を用いたH5N6/H5N8ウイルスの感染動態の解析 (2021)
  • Author(s): 大道寺 智、定金 広樹、加覧 浩太郎、荒井 泰葉、渡邊 洋平、笛吹 達史、中屋 隆明
  • Organizer: 第１６４回日本獣医学会学術集会