Study for epigenetic control through cross-talk among biomolecules

• Project/Area Number: 21247016
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Functional biochemistry
• Research Institution: University of Tsukuba
• Principal Investigator: YANAGISAWA Junn 筑波大学, 生命環境系, 教授 (50301114)
• Project Period (FY): 2009 – 2011
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2011)
• Budget Amount: ¥45,890,000 (Direct Cost: ¥35,300,000、Indirect Cost: ¥10,590,000); Fiscal Year 2011: ¥15,080,000 (Direct Cost: ¥11,600,000、Indirect Cost: ¥3,480,000); Fiscal Year 2010: ¥15,080,000 (Direct Cost: ¥11,600,000、Indirect Cost: ¥3,480,000); Fiscal Year 2009: ¥15,730,000 (Direct Cost: ¥12,100,000、Indirect Cost: ¥3,630,000)
• Keywords: エピジェネティクス / 転写 / エネルギー代謝 / 核内レセプター / ネットワーク / 生体低分子 / クロマチン / ホルモン / 核内受容体 / p53 / 核小体

Research Abstract

Some bio-molecules, such as hormones, regulate transcription through epigenetic control of genes. In this study, we have focused on such bio-molecules, and investigated the mechanisms of bio-molecule-dependent epigenetic control. From our study, we have successfully developed chemical compounds which are able to control epigenetic status and cure some diseases, such as cancers and fibrosis.

Research Products

• [Journal Article] MYBBP1A suppresses breast cancer tumorigenesis by enhancing the p53 dependent anoikis (2013)
  • Author(s): Kensuke Akaogi, Wakana Ono, Yuki Hayashi, Hiroyuki Kishimoto and Junn Yanagisawa
  • Journal Title: BMC Cancer Volume: 13:65 Issue: 1 Pages: 1-13
  • DOI: 10.1186/1471-2407-13-65
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Enhancer of rudimentary homolog (ERH) plays an essential role in the progression of mitosis by promoting mitotic chromosome alignment (2012)
  • Author(s): Fujimura A, Kishimoto H, Yanagisawa J, Kimura K
  • Journal Title: Biochemical and Biophysical Research Communications Volume: 423 Pages: 588-92
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Global analysis of DNA methylation in early-stage liver fibrosis (2012)
  • Author(s): Komatsu Y, Waku T, Iwasaki N, Ono W, Yamaguchi C , Yanagisawa J
  • Journal Title: BMC Medical Genomics Volume: 5 Pages: 5-5
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Enhancer of rudimentary homolog (ERH) plays an essential role in the progression of mitosis by promoting mitotic chromosome alignment. (2012)
  • Author(s): Fujimura A, Kishimoto H, Yanagisawa J, Kimura K.
  • Journal Title: Biochemical and Biophysical Research Communications Volume: 423 Issue: 3 Pages: 588-592
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2012.06.018
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Global analysis of DNA methylation in early-stage liver fibrosis (2012)
  • Author(s): Komatsu Y, Waku T, Iwasaki N, Ono W, Yamaguchi C, Yanagisawa J
  • Journal Title: BMC Medical Genomics
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The E3 ubiquitin ligase activity of Trip12 is essential for mouse embryogenesis (2011)
  • Author(s): Kajiro M, Tsuchiya M, Kawabe Y, Furumai R, Iwasaki N, Hayashi Y, Katano M, Nakajima Y, Goto N, Watanabe T, Murayama A, Oishi H, Ema M, Takahashi S, Kishimoto H, Yanagisawa J
  • Journal Title: PLoS One Volume: 6(10)
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Estrogen and antiestrogens alter breast cancer invasiveness by modulating TGF- βsignaling pathway (2011)
  • Author(s): Goto N, Hiyoshi H, Ito I, Tsuchiya M, Nakajima Y, Yanagisawa J.
  • Journal Title: Cancer Science Volume: 102(8) Pages: 1501-8
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Novel nucleolar pathway connecting intracellular energy status with p53 activation (2011)
  • Author(s): Kumazawa T, Nishimura K, Kuroda T, Ono W, Yamaguchi C, Katagiri N, Tsuchiya M, Masumoto H, Nakajima Y, Murayama A, Kimura K, Yanagisawa J
  • Journal Title: J. Biol. Chem Volume: 286(23) Pages: 20861-9
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Estrogen regulates tumor growth through a nonclassical pathway that includes the transcription factors ERβ and KLF5 (2011)
  • Author(s): Nakajima Y, Akaogi K, Suzuki T,Osakabe A, Yamaguchi C, Sunahara N, Ishida J, Kako K, Ogawa S, Fujimura T, Homma Y, Fukamizu A, Murayama A, Kimura K, Inoue S, Yanagisawa J
  • Journal Title: Science Signaling Volume: 4(168)
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Critical role of the nucleolus in activation of the p53-dependent postmitotic checkpoint (2011)
  • Author(s): Tsuchiya M, Katagiri N, Kuroda T, Kishimoto H, Nishimura K, Kumazawa T, Iwasaki N, Kimura K, Yanagisawa J
  • Journal Title: Biochemical and Biophysical Research Communications Volume: 407(2) Pages: 378-82
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] RNA content in the nucleolus alters p53 acetylation via MYBBP1A (2011)
  • Author(s): Kuroda T, Murayama A, Katagiri N, Ohta Y, Fujita E, Masumoto H, Ema M, Takahashi S, Kimura K, Yanagisawa J
  • Journal Title: EMBO J Volume: 30(6) Pages: 1054-1066
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Peroxisome Proliferator-activated receptors (PPARs) have multiple binding points that accommodate ligands in various conformations : Phenypropanoic acid-type PPAR ligands bind to PPAR in different conformations, depending on the subtype (2011)
  • Author(s): Miyachi H, Kuwabara N, Oyama T, Tomioka D, Ohashi M, Yanagisawa J, Shimizu T
  • Journal Title: J Merd Chem Volume: 55(2) Pages: 893-902
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The E3 ubiquitin ligase activity of Trip 12 is essential for mouse embryogenesis (2011)
  • Author(s): Kajiro M, Tsuchiya M, Kawabe Y, Furumai R, Iwasaki N, Hayashi Y, Katano M, Nakajima Y, Goto N, Watanabe T, Murayama A, Oishi H, Ema M, Takahashi S, Kishimoto H, Yanagisawa J
  • Journal Title: PLoS One Volume: 6(10)
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Estrogen and antiestrogens alter breast cancer invasiveness by modulating TGF-・signaling pathway (2011)
  • Author(s): Goto N, Hiyoshi H, Ito I, Tsuchiya M, Nakajima Y, Yanagisawa J
  • Journal Title: Cancer Science Volume: 102(8) Pages: 1501-1508
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Novel nucleolar pathway connecting intracellular energy status with p53 activation (2011)
  • Author(s): Kumazawa T, Nishimura K, Kuroda T, Ono W, Yamaguchi C, Katagiri N, Tsuchiya M, Masumoto H, Nakajima Y, Murayama A, Kimura K, Yanagisawa J
  • Journal Title: J.Biol.Chem Volume: 286(23) Pages: 20861-20869
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Estrogen regulates tumor growth through a nonclassical pathway that includes the transcription factors ERβ and KLF5 (2011)
  • Author(s): Nakajima Y, Osakabe A, Suzuki T, Kishimoto H, Kuroda T, Fujimura T, Homma Y, Murayama A, Inoue S, Yanagisawa J
  • Journal Title: Science Signaling Volume: 4(168)
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Estrogen inhibits transforming growth factor β signaling by promoting Smad2/3 degradation (2010)
  • Author(s): Ito I, Hanyu A, Wayama M, Goto N, Katsuno Y, Kawasaki S, Nakajima Y, Kajiro M, Komatsu Y, Fujimura A, Hirota R, Murayama A, Kimura K, Imamura T, Yanagisawa J
  • Journal Title: J.Biol. Chem Volume: 285(19) Pages: 14747-14755
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Estrogen inhibits growth factor ss signaling by promoting Smad2/3 degradation (2010)
  • Author(s): Ito I, Hanyu A, Wayama M, Goto N, Katsuno Y, Kawasaki S, Nakajima Y, Kajiro M, Komatsu Y, Fujimura A, Hirota R, Murayama A, Kimura K, Imamura T, Yanagisawa J
  • Journal Title: J.Biol.Chem Volume: 285(19) Pages: 14747-14755
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The nucleolar protein NML regulates hepatic ATP levels during liver regeneration after partial hepatectomy (2009)
  • Author(s): Mikogai A, Yanagisawa J, Yasuzawa-Tanaka K, Murayama A
  • Journal Title: Biochemical and Biophysical Research Communications Volume: 390(3) Pages: 591-596
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The ubiquitin ligase CHIP acts as an upstream regulator of oncogenic pathways. (2009)
  • Author(s): Kajiro M, Yanagisawa J, et.al.
  • Journal Title: Nature Cell Biology Volume: 11 Pages: 312-319
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] KLF4 suppresses estrogen-dependent breast cancer growth by inhibiting the transcriptional activity of ER alpha. (2009)
  • Author(s): Akaogi K, Nakajima Y, Yanagisawa J, et.al.
  • Journal Title: Oncogene Volume: 28 Pages: 2894-2902
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The nucleolar protein NML regulates hepatic ATP levels during liver regeneration after partial henatectomy. (2009)
  • Author(s): Mikogai A, Yanagisawa J, Murayama A, et.al.
  • Journal Title: Biochem.Biophys.Res.Commun. Volume: 30 Pages: 591-596
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The chromosomal association of condensin II is regulated by a noncatalytic function of PP2A. (2009)
  • Author(s): Takemoto A, Yanagisawa J, Kimura K, et.al.
  • Journal Title: Nature Structural & Molecular Biology Volume: 16 Pages: 1302-1308
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Estrogen inhibits TGF-ss signaling by promoting Smad2/3 degradation. (2009)
  • Author(s): Ito I, Hanyu A, Yanagisawa J, et.al.
  • Journal Title: J.Biol.Chem. Volume: 285 Pages: 14747-14755
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 性ステロイドホルモンと癌の新展開 (2012)
  • Author(s): 柳澤純
  • Organizer: 第12回関東ホルモンと癌研究会
  • Place of Presentation: 東京大学山上会館東京(招待講演)
  • Year and Date: 2012-01-21
• [Presentation] 核内レセプターの新規機能解析と構造情報に基づいた線維化疾患治療法の開発 (2011)
  • Author(s): 柳澤純
  • Organizer: 平成23年度ターゲットタンパク成果発表会
  • Place of Presentation: 東京大学薬学系総合研究棟東京(招待講演)
  • Year and Date: 2011-12-27
• [Presentation] 核内受容体を介した転写と代謝のクロストーク (2011)
  • Author(s): 柳澤純
  • Organizer: 第12回Wakoつくばフォーラム転写と代謝のクロストーク病態バイオロジーの新展開
  • Place of Presentation: 筑波和光ホールつくば(招待講演)
  • Year and Date: 2011-11-29
• [Presentation] 核内受容体と疾患 (2011)
  • Author(s): 柳澤純
  • Organizer: 第5回川島腎糸球体カンファレンス
  • Place of Presentation: 内藤記念くすり博物館岐阜(招待講演)
  • Year and Date: 2011-11-19
• [Presentation] エピジェネティクスによる脂肪代謝制御 (2011)
  • Author(s): 柳澤純
  • Organizer: 第37回新潟脂質研究会
  • Place of Presentation: 新潟大学新潟(招待講演)
  • Year and Date: 2011-11-17
• [Presentation] 核小体の新規機能とエネルギー代謝 (2011)
  • Author(s): 柳澤純
  • Organizer: 平成23年度発足新学術領域研究「生命素子による転写環境とエネルギー代謝のクロストーク制御」キックオフミーティング
  • Place of Presentation: 大手町サンケイプラザ東京(招待講演)
  • Year and Date: 2011-10-19
• [Presentation] 核内受容体の新規メカニズムと疾患 (2011)
  • Author(s): 柳澤純
  • Organizer: 第51回生命科学夏の学校
  • Place of Presentation: 八王子セミナーハウス東京(招待講演)
  • Year and Date: 2011-09-02
• [Presentation] 核小体ダイナミクスとエネルギー代謝 (2011)
  • Author(s): 柳澤純
  • Organizer: 千葉・骨を守る会
  • Place of Presentation: ホテルランクス千葉(招待講演)
  • Year and Date: 2011-07-14
• [Presentation] 核小体ダイナミクス (2011)
  • Author(s): 柳澤 純
  • Organizer: 第63回日本細胞生物学会大会
  • Place of Presentation: 北海道大学 札幌
  • Year and Date: 2011-06-27
• [Presentation] 核小体ダイナミクス (2011)
  • Author(s): 柳澤純
  • Organizer: 第63回日本細胞生物学会大会
  • Place of Presentation: 北海道大学札幌(招待講演)
  • Year and Date: 2011-06-27
• [Presentation] 核小体のダイナミクスとその新機能 (2011)
  • Author(s): 柳澤純
  • Organizer: 平成23年度日本生化学会関東支部例会
  • Place of Presentation: 東京理科大学東京(招待講演)
  • Year and Date: 2011-06-25
• [Presentation] 核小体ダイナミクス (2011)
  • Author(s): 柳澤純
  • Organizer: 特定領域研究遺伝情報デコード成果報告シンポジウム
  • Place of Presentation: 東北大学東京分室東京(招待講演)
  • Year and Date: 2011-02-17
• [Presentation] 核内受容体の新規パスウェイと疾患-癌と脂肪肝を中心に- (2011)
  • Author(s): 柳澤純
  • Organizer: 第12回がんとホルモンセミナー
  • Place of Presentation: 山上会館東京(招待講演)
  • Year and Date: 2011-02-09
• [Presentation] 核内受容体の新規パスウェイによる腎臓の線維化制御 (2011)
  • Author(s): 柳澤純
  • Organizer: 第23回ROD研究会
  • Place of Presentation: 浅草ビューホテル東京(招待講演)
  • Year and Date: 2011-01-22
• [Presentation] 核小体ダイナミクス (2010)
  • Author(s): 柳澤純
  • Organizer: 第15回分生研シンポジウム
  • Place of Presentation: 東京大学東京(招待講演)
  • Year and Date: 2010-11-02
• [Presentation] 核内受容体の新規パスウェイと抗癌剤開発 (2010)
  • Author(s): 柳澤純
  • Organizer: 2010年度大学院医学薬学教育部修士課程講義「遺伝情報制御学持論」
  • Place of Presentation: 富山大学富山(招待講演)
  • Year and Date: 2010-10-12
• [Presentation] 細胞内シグナル伝達とがん治療 (2010)
  • Author(s): 柳澤純
  • Organizer: 第69回日本癌学会学術総会がん研究入門コース
  • Place of Presentation: 大阪国際会議場大阪(招待講演)
  • Year and Date: 2010-09-23
• [Presentation] CHIP減少による乳がん細胞の抗がん剤耐性獲得メカニズムの解析 (2010)
  • Author(s): 柳澤純
  • Organizer: 平成22年度京都大学原子炉実験所専門研究会放射線生物学と分子生物学の融合
  • Place of Presentation: 京都大学原子炉実験所大阪(招待講演)
  • Year and Date: 2010-09-10
• [Presentation] 核小体タンパク質によるエネルギー代謝制御 (2010)
  • Author(s): 柳澤純
  • Organizer: 第28回内分泌代謝学サマーセミナー
  • Place of Presentation: ハウステンボス・ユトレヒト会議室長崎(招待講演)
  • Year and Date: 2010-07-09
• [Presentation] がんの新規治療に向けた化合物探索 (2010)
  • Author(s): 柳澤純
  • Organizer: 第8回学際物質科学戦略イニシアティブバイオグループワークショップ「薬物デリバリーの設計と実際」
  • Place of Presentation: 筑波大学茨城(招待講演)
  • Year and Date: 2010-04-17
• [Presentation] 核小体の新規機能と分子修飾 (2010)
  • Author(s): 柳澤 純
  • Organizer: 第33回日本分子生物学会年会 第82回日本生化学会大会合同大会ワークショップ
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド 神戸
• [Presentation] 核内受容体の新しいネットワークと化学物質による制御 (2010)
  • Author(s): 柳澤 純
  • Organizer: 日本薬学会第130年会
  • Place of Presentation: 就実大学 岡山
• [Presentation] 核小体によるアセチル化制御 (2010)
  • Author(s): 柳澤純
  • Organizer: 大阪大学蛋白質研究所セミナー
  • Place of Presentation: 大阪大学蛋白質研究所吹田キャンパス大阪(招待講演)
• [Presentation] 核小体の新規機能と分子修飾 (2010)
  • Author(s): 柳澤純
  • Organizer: 第33回日本分子生物学会年会第82回日本生化学会大会合同大会ワークショップ
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド神戸(招待講演)
• [Presentation] 核内受容体の新しいネットワークと化学物質による制御 (2010)
  • Author(s): 柳澤純
  • Organizer: 日本薬学会第130年会
  • Place of Presentation: 岡山 就実大学
• [Presentation] 核小体の新規機能と分子修飾 (2010)
  • Author(s): 柳澤純
  • Organizer: 第33回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド
• [Presentation] 乳癌・前立腺癌における核内レセプターの新規機能とその制御 (2009)
  • Author(s): 柳澤純
  • Organizer: 第68回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜
  • Year and Date: 2009-10-01
• [Presentation] Epigenetic control of rDNA loci inresponse to intracellular energy status (2009)
  • Author(s): 柳澤 純
  • Organizer: 第32回日本分子生物学会年会ワークショップ
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜 横浜
• [Presentation] 核内受容体によるエピゲノム制御 (2009)
  • Author(s): 柳澤 純
  • Organizer: 第82回日本生化学会大会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド神戸
• [Presentation] エネルギー代謝と肥満症 (2009)
  • Author(s): 柳澤純
  • Organizer: 第30回日本肥満学会
  • Place of Presentation: アクトシティ浜松
• [Presentation] Epigenetic control of rDNA loci in response to intracellular energy status. (2009)
  • Author(s): 柳澤純
  • Organizer: 第32回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜
• [Presentation] 核小体のダイナミクスとその新機能.
  • Author(s): 柳澤 純．
  • Organizer: 平成23年度日本生化学会関東支部例会
  • Place of Presentation: 東京理科大学 東京
• [Presentation] 核小体ダイナミクス.
  • Author(s): 柳澤 純．
  • Organizer: 第63回日本細胞生物学会大会
  • Place of Presentation: 北海道大学 札幌
• [Presentation] 核小体ダイナミクスとエネルギー代謝．
  • Author(s): 柳澤 純．
  • Organizer: 千葉・骨を守る会
  • Place of Presentation: ホテルランクス 千葉
  • Invited
• [Presentation] 核内受容体の新規メカニズムと疾患.
  • Author(s): 柳澤 純．
  • Organizer: 第51回生命科学夏の学校
  • Place of Presentation: 八王子セミナーハウス 東京
  • Invited
• [Presentation] エピジェネティクスによる脂肪代謝制御．
  • Author(s): 柳澤 純．
  • Organizer: 第37回新潟脂質研究会
  • Place of Presentation: 新潟大学 新潟
  • Invited
• [Presentation] 核内受容体と疾患．
  • Author(s): 柳澤 純．
  • Organizer: 第5回川島腎糸球体カンファレンス
  • Place of Presentation: 内藤記念くすり博物館 岐阜
  • Invited
• [Presentation] 核内受容体を介した転写と代謝のクロストーク．
  • Author(s): 柳澤 純．
  • Organizer: 第12回Wakoつくばフォーラム
  • Place of Presentation: 筑波和光ホール つくば
  • Invited
• [Presentation] 核内レセプターの新規機能解析と構造情報に基づいた線維化疾患治療法の開発．
  • Author(s): 柳澤 純．
  • Organizer: 平成23年度ターゲットタンパク成果発表会
  • Place of Presentation: 東京大学薬学系総合研究棟 東京
• [Presentation] 性ステロイドホルモンと癌の新展開．
  • Author(s): 柳澤 純．
  • Organizer: 第12回関東ホルモンと癌研究会
  • Place of Presentation: 東京大学山上会館 東京
• [Remarks]
  • URL: http://yanagisawalab.org/index.html
• [Patent(Industrial Property Rights)] 標的遺伝子の発現制御方法 (2012)
  • Inventor(s): 柳澤 純
  • Industrial Property Rights Holder: 国立大学法人筑波大学
  • Industrial Property Number: 2012-187212
  • Filing Date: 2012-08-28