• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

ANALYSIS OF DYNAMIC BEHAVIOR OF RNA USING LIGHT-UP RNA MODULE AS A TAG

Research Project

Project/Area Number 21350091
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Research Field Chemistry related to living body
Research InstitutionDoshisha University

Principal Investigator

AOYAMA Yasuhiro  同志社大学, 理工学部, 教授 (00038093)

Project Period (FY) 2009 – 2012
Project Status Completed (Fiscal Year 2012)
Budget Amount *help
¥18,720,000 (Direct Cost: ¥14,400,000、Indirect Cost: ¥4,320,000)
Fiscal Year 2012: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
Fiscal Year 2011: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2010: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2009: ¥6,110,000 (Direct Cost: ¥4,700,000、Indirect Cost: ¥1,410,000)
Keywords転写 / RNA / 蛍光 / 蛍光モニタリング / BODIPY / アプタマー / トブラマイシン / 融合遺伝子 / カナマシシン / 抗生物質 / リボソーム / 抗生物質修飾酵素 / 大腸菌 / タグ / 融合RNA(DNA) / 蛍光色素 / アミノ糖 / SELEX / カナマイシン / 回転阻害 / ヘキスト / 光るRNAモジュール
Research Abstract

The fluorescence intensity of tobramycin-bearing phenyl-BODIPY as a probe increases upon interaction with tobramycin-aptamer, an RNA sequence that specifically binds to tobramycin. Transcription of a target gene (tRNA in this case) containing the aptamer sequence downstream thereof affords a fused (target-aptamer) RNA, the aptamer component of which can be detected by enhanced fluorescence, although no big, in the presence of the probe. In this way, the transcription of the target gene can be fluorescence monitored.

Report

(5 results)
  • 2012 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2011 Annual Research Report
  • 2010 Annual Research Report
  • 2009 Annual Research Report
  • Research Products

    (27 results)

All 2012 2011 2010 2009

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (23 results)

  • [Journal Article] Modular Blue Fluorescent RNA Sensors for Label-Free Detection of Target Molecules2010

    • Author(s)
      C. Furutani, K. Shinomiya, Y. Aoyama, K. Yamada, S. Sando
    • Journal Title

      Molecular BioSystems

      Volume: 6 Issue: 9 Pages: 1569-1571

    • DOI

      10.1039/c001230k

    • Related Report
      2012 Final Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Modular Blue Fluorescent RNA Sensors for Label-Free Detection of Target Molecules2010

    • Author(s)
      C.Furutani, K.Shinomiya, Y.Aoyama, K.Yamada, S.Sando
    • Journal Title

      Molecular Biosystems

      Volume: 6巻 Pages: 1569-1571

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Modular Blue RNA Sensors for Label-Free Detection of Target Molecules2010

    • Author(s)
      C.Furutani, K.Shinomiya, Y.Aoyama, K.Yamada, S.Sando
    • Journal Title

      BioSystems (掲載確定)

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structure and Function of Molecular Assemblies. A Personal Reminiscence2009

    • Author(s)
      Y.Aoyama
    • Journal Title

      Bull.Chem.Soc.Jpn. VOL.82

      Pages: 419-438

    • NAID

      10025117037

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 抗生物質耐性菌の蛍光センシング2012

    • Author(s)
      井出敬一朗・清水康映・山本達望・青山安宏
    • Organizer
      第64回有機合成化学協会関東支部新潟シンポジウム
    • Place of Presentation
      長岡技術科学大学、長岡、新潟
    • Year and Date
      2012-12-01
    • Related Report
      2012 Final Research Report
  • [Presentation] 抗生物質部位を有する蛍光色素と抗生物質耐性菌との相互作用2012

    • Author(s)
      山本達望・田中愛・青山安宏
    • Organizer
      2012年日本化学会西日本大会
    • Place of Presentation
      佐賀大学、佐賀
    • Year and Date
      2012-11-10
    • Related Report
      2012 Final Research Report
  • [Presentation] 抗生物質置換BODIPYを用いる抗生物質耐性菌の蛍光センシング2012

    • Author(s)
      井出敬一朗・清水康映・青山安宏、徳永武士・山東信介
    • Organizer
      第6回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      北海道大学、札幌
    • Year and Date
      2012-09-07
    • Related Report
      2012 Final Research Report
  • [Presentation] 幾何異性体比蛍光センシング-特異的相互作用と非特異吸着の区別-2012

    • Author(s)
      辻智広・権田勝也・青山安宏・徳永武士・山東信介
    • Organizer
      第6回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      北海道大学、札幌
    • Year and Date
      2012-09-06
    • Related Report
      2012 Final Research Report
  • [Presentation] 抗生物質部位を有する蛍光色素と抗生物質耐性菌との相互作用2012

    • Author(s)
      山本達望・田中愛・青山安宏・徳永武士・山東信介
    • Organizer
      第6回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      北海道大学、札幌
    • Year and Date
      2012-09-06
    • Related Report
      2012 Final Research Report
  • [Presentation] 幾何異性体比蛍光センシング-特異的相互作用と非特異吸着の区別-2012

    • Author(s)
      辻智広、権田勝也、青山安宏、徳永武士、山東信介
    • Organizer
      第6回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      北海道大学
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 抗生物質部位を有する蛍光色素と抗生物質耐性菌との相互作用2012

    • Author(s)
      山本達望、田中愛、青山安宏、徳永武士、山東信介
    • Organizer
      第6回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      北海道大学
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 抗生物質置換BODIPYを用いる抗生物質耐性菌の蛍光センシング2012

    • Author(s)
      井出敬一朗、清水康映、青山安宏、徳永武士、山東信介
    • Organizer
      第6回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      北海道大学
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 抗生物質部位を有する蛍光色素と抗生物質耐性菌との相互作用2012

    • Author(s)
      山本達望、田中愛、青山安宏
    • Organizer
      2012日本化学会西日本大会
    • Place of Presentation
      佐賀大学
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 抗生物質耐性菌の蛍光センシング2012

    • Author(s)
      井出敬一朗、清水康映画、山本達望、青山安宏
    • Organizer
      第64回有機合成化学協会関東支部新潟シンポジウム
    • Place of Presentation
      長岡技術科学大学
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 抗生物質部位を有する蛍光プローブの開発と応用2011

    • Author(s)
      井出敬一朗・清水康映・水上久美・青山安宏・徳永武士・山東信介
    • Organizer
      2011年日本化学会西日本大会
    • Place of Presentation
      徳島大学、徳島
    • Year and Date
      2011-11-12
    • Related Report
      2012 Final Research Report
  • [Presentation] 抗生物質部位を有する蛍光プローブの開発と応用(1)2011

    • Author(s)
      井出敬一朗・清水康映・水上久美・青山安宏・徳永武士・山東信介
    • Organizer
      第5回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場「エポカルつくば」、筑波、茨城
    • Year and Date
      2011-09-13
    • Related Report
      2012 Final Research Report
  • [Presentation] 抗生物質部位を有する蛍光プローブの開発と応用(2)2011

    • Author(s)
      清水康映・井出敬一・水上久美・青山安宏・徳永武士・山東信介
    • Organizer
      第5回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場「エポカルつくば」、筑波、茨城
    • Year and Date
      2011-09-13
    • Related Report
      2012 Final Research Report
  • [Presentation] 生体イメージングの新手法開発"-混雑系の有機化学に向けて-2011

    • Author(s)
      青山安宏
    • Organizer
      岡山大学自然生命科学研究支援センター分析計測分野講演会
    • Place of Presentation
      岡山大学(岡山)
    • Year and Date
      2011-06-24
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] New Tools for Bioimaging: A Step toward in situ Chemistry of Complicated Admixture Systems2010

    • Author(s)
      Y. Aoyama
    • Organizer
      2010 International Chemistry Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem)
    • Place of Presentation
      Sheraton Hawaiian Village, Honolulu, Hawai, USA
    • Year and Date
      2010-12-18
    • Related Report
      2012 Final Research Report
  • [Presentation] バイオイメージングの新展開-夾雑系の有機化学に向けて-2010

    • Author(s)
      青山安宏
    • Organizer
      日本化学会東海支部地区講演会
    • Place of Presentation
      B-nest静岡市産学交流センター ペガサート、静岡
    • Year and Date
      2010-11-13
    • Related Report
      2012 Final Research Report
  • [Presentation] 阻害剤部位を有する蛍光色素の合成とそれを利用したタンパク質検出の試み2010

    • Author(s)
      辻智広・青山安宏・徳永武士・山東信介
    • Organizer
      2010年日本化学会西日本大会
    • Place of Presentation
      熊本大学、熊本
    • Year and Date
      2010-11-06
    • Related Report
      2012 Final Research Report
  • [Presentation] 核酸相互作用部位としてのアミノ糖を置換した蛍光色素の合成と応用2010

    • Author(s)
      水上久美・青山安宏・徳永武士・山東信介
    • Organizer
      2010年日本化学会西日本大会
    • Place of Presentation
      熊本大学、熊本
    • Year and Date
      2010-11-06
    • Related Report
      2012 Final Research Report
  • [Presentation] 生体イメージンの新手法開発-混雑系の有機化学に向けて-2010

    • Author(s)
      青山安宏
    • Organizer
      20周年記念万有福岡シンポジウム
    • Place of Presentation
      九州大学医学部百年講堂、福岡
    • Year and Date
      2010-05-22
    • Related Report
      2012 Final Research Report
  • [Presentation] 生体イメージングの新手法開発-混雑系の有機化学に向けて-2010

    • Author(s)
      青山安宏
    • Organizer
      20周年記念万有福岡シンポジウム
    • Place of Presentation
      九州大学医学部百年構造(福岡)
    • Year and Date
      2010-05-22
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] 生体イメージンに向けた新手法2009

    • Author(s)
      青山安宏
    • Organizer
      筑波大学学際物質科学センター第8回機能性分子シンポジウム
    • Place of Presentation
      筑波大学、筑波
    • Year and Date
      2009-12-19
    • Related Report
      2012 Final Research Report
  • [Presentation] 生体イメージングに向けた新手法2009

    • Author(s)
      青山安宏
    • Organizer
      筑波大学学際物質科学研究センター第8回機能性分子シンポジウム
    • Place of Presentation
      筑波大学総合研究棟B0108(つくば市)
    • Year and Date
      2009-12-19
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] A SELEX(Artificial Evolution)Approach to Light-Up Sensing Materialsfor Bioimaging2009

    • Author(s)
      Y.Aoyama
    • Organizer
      6th International Conference on Material Engineering for Resources
    • Place of Presentation
      Akita View Hotel(秋田市)
    • Year and Date
      2009-10-22
    • Related Report
      2009 Annual Research Report

URL: 

Published: 2009-04-01   Modified: 2019-07-29  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi