Phylogeographical study of Cryptomeria japonica using nuclear and organelle DNAs information
| Project/Area Number |
21380102
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Section | 一般 |
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| Research Field |
Forest science
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| Research Institution | Forestry and Forest Products Research Institute |
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Principal Investigator |
KONDO Teiji 独立行政法人森林総合研究所, 林木育種センター育種部, 部長 (20370827)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
WATANABE Atsushi 独立行政法人森林総合研究所, 林木育種センター育種部, 室長 (10360471)
MIYAMOTO Naoko 独立行政法人森林総合研究所, 林木育種センター遺伝資源部, 主任研究員 (30370844)
HIRAO Tomonori 独立行政法人森林総合研究所, 森林バイオ研究センター, 研究員 (90457763)
TSUMURA Yoshihiko 独立行政法人森林総合研究所, 森林遺伝研究領域, 領域長 (20353774)
IHARA Tokuko 独立行政法人森林総合研究所, 森林遺伝研究領域, 主任研究員
TAKATA Katsuhiko 秋田県立大学, 木材高度加工研究所, 教授 (50264099)
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| Project Period (FY) |
2009 – 2011
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2011)
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| Budget Amount *help |
¥17,420,000 (Direct Cost: ¥13,400,000、Indirect Cost: ¥4,020,000)
Fiscal Year 2011: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2010: ¥6,110,000 (Direct Cost: ¥4,700,000、Indirect Cost: ¥1,410,000)
Fiscal Year 2009: ¥7,410,000 (Direct Cost: ¥5,700,000、Indirect Cost: ¥1,710,000)
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| Keywords | スギ / 系統地理学 / 核DNA / オルガネラDNA / 葉緑体 / オモテスギ / ウラスギ / 環境適応遺伝子 / 葉緑体ゲノム / SNP / ハプロタイプネットワーク / 突然変異率 / 環境適応的遺伝子 / ミトコンドリアゲノム / 父性遺伝 / コアコレクション / GIS / DNAマーカー / 集団構造 / 環境区分 |
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| Research Abstract |
Phylogeographical study of Cryptomeria japonica was conducted using nuclear and organelle DNA markers. There were two nuclear DNA markers which suggested to be linked to the differentiation between Pacific Oceanside line and Sea of Japan side line. Many SNP(Single Nucleotide Polymorphism) were found in chloroplast DNA. This polymorphism indicated that two large populations differentiated in the past.
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Report
(4 results)
Research Products
(12 results)
