Identification and quantitation of low abundant tumor marker candidates in plasma derived from cancer tissue using recent proteomic technologies

• Project/Area Number: 21390354
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: General surgery
• Research Institution: National Institute of Biomedical Innovation
• Principal Investigator: TOMONAGA Takeshi 独立行政法人医薬基盤研究所, プロテオームリサーチプロジェクト, プロジェクトリーダー (80227644)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): MATSUBARA Hisahiro 千葉大学, 大学院・医学研究院, 教授 (20282486) ; NOMURA Fumio 千葉大学, 大学院・医学研究院, 教授 (80164739) ; NISHIMURA Motoi 千葉大学, 大学院・医学研究院, 助教 (80400969)
• Project Period (FY): 2009 – 2011
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2011)
• Budget Amount: ¥18,200,000 (Direct Cost: ¥14,000,000、Indirect Cost: ¥4,200,000); Fiscal Year 2011: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000); Fiscal Year 2010: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000); Fiscal Year 2009: ¥12,220,000 (Direct Cost: ¥9,400,000、Indirect Cost: ¥2,820,000)
• Keywords: プロテオーム / ペプチド / 癌 / 腫瘍マーカー / 診断 / プロテナーム

Research Abstract

Recent advance of proteomic technology have contributed to identify biomarkers for various disease, however, only a few proteins have been used in practical application. This study was aimed to identify and quantitate low abundant tumor marker candidates in plasma derived from cancer tissue using recent proteomic technologies. About 5000 membrane proteins from colorectal and breast cancer tissues were identified respectively. Among them, about 100 colorectal and 20 breast cancer biomarker candidate proteins were verified by SRM/MRM method. Some of the candidate proteins were detected in human serum.

Research Products

• [Journal Article] Plectin promotes migration and invasion of cancer cells and is a novel prognostic marker for head and neck squamous cell carcinoma (2012)
  • Author(s): Katada K, Tomonaga T, Satoh M, Matsushita K, Tonoike Y, Kodera Y, Hanazawa T, Nomura F, Okamoto Y
  • Journal Title: J Proteomics Volume: 75 Pages: 1803-15
  • URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22245045
• [Journal Article] Proteomic study of malignant pleural mesothelioma by laser microdissection and two-dimensional difference gel electrophoresis identified cathepsin D as a novel candidate for a differential diagnosis biomarker (2012)
  • Author(s): Hosako M, Muto T, Nakamura Y, Tsuta K, Tochigi N, Tsuda H, Asamura H, Tomonaga T, Kawai A, Kondo T
  • Journal Title: J Proteomics Volume: 75 Pages: 833-44
  • URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22051404
• [Journal Article] An alternative splicing isoform of eukaryotic initiation factor 4H promotes tumorigenesis in vivo and is a potential therapeutic target for human cancer (2011)
  • Author(s): Wu D, Matsushita K, Matsubara H, Nomura F, Tomonaga T
  • Journal Title: Int J Cancer Volume: 128 Pages: 1018-30
  • URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20473909
• [Journal Article] Adhesion molecule periplakin is involved in cellular movement and attachment in pharyngeal squamous cancer cells (2011)
  • Author(s): Tonoike Y., Matsushita K., Tomonaga T., Katada K., Tanaka N., Shimada H., Nakatani, Y., Okamoto, Y., Nomura, F
  • Journal Title: BMC Cell Biol Volume: 12 Pages: 41-41
  • URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21951621
• [Journal Article] The measurement of a fibrinogen alpha C-chain 5.9kDa fragment(FIC 5.9) using MALDI-TOF MS and a stable isotope-labeled peptide standard dilution (2011)
  • Author(s): Sogawa K, Kodera Y, Noda K, Ishizuka Y, Yamada M, Umemura H, Maruyama K, Tomonaga T, Yokosuka O, Nomura F
  • Journal Title: Clin Chim Acta Volume: 412 Pages: 1094-9
  • URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21354123
• [Journal Article] Global expression study in colorectal cancer on proteins with alkaline isoelectric point by two-dimensional difference gel electrophoresis (2011)
  • Author(s): Muto T, Taniguchi H, Kushima R, Tsuda H, Yonemori H, Chen C, Sugihara Y, Sakamoto K, Kobori Y, Palmer H, Nakamura Y, Tomonaga T, Tanaka H, Mizushima H, Fujita S, Kondo T
  • Journal Title: J Proteomics Volume: 74 Pages: 858-73
  • URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21385629
• [Journal Article] Synergistic effect of non-transmissible Sendai virus vector encoding the c-myc suppressor FUSE-binding protein-interacting repressor plus cisplatin in treatment of malignant pleural mesothelioma (2011)
  • Author(s): Kitamura A, Matsushita K, Takiguchi Y, Shimada H, Tada Y, Yamanaka M, Hiroshima K, Tagawa M, Tomonaga T, Matsubara H, Inoue M, Hasegawa M, Sato Y, Levens D, Tatsumi K, Nomura F
  • Journal Title: Cancer Sci Volume: 102 Issue: 7 Pages: 1366-73
  • DOI: 10.1111/j.1349-7006.2011.01931.x
  • NAID: 10029295478
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Adhesion molecule periplakin is involved in cellular movement and attachment in pharyngeal squamous cancer cells (2011)
  • Author(s): Tonoike, Y
  • Journal Title: Cell Biol Volume: 12 Pages: 41-41
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The measurement of a fibrinogen alpha C-chain 5.9kDa fragment (FIC 5.9) using MALDI-TOF MS and a stable isotope-labeled peptide standard dilution (2011)
  • Author(s): Sogawa, K
  • Journal Title: Clin Chim Acta Volume: 412 Pages: 1094-9
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] An alternative splicing isoform of eukaryotic initiation factor 4H promotes tumorigenesis in vivo and is a potential therapeutic target for human cancer. (2011)
  • Author(s): Wu D
  • Journal Title: Int J Cancer Volume: 128 Pages: 1018-1030
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Serum levels of complement C4 fragments correlate with disease activity in multiple sclerosis : proteomic analysis (2010)
  • Author(s): Sawai S, Umemura H, Mori M, Satoh M, Hayakawa S, Kodera Y, Tomonaga T, Kuwabara S, Nomura F
  • Journal Title: J Neuroimmunol Volume: 218 Pages: 112-5
  • URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19923011
• [Journal Article] Reduction of novel circulating long-chain fatty acids in colorectal cancer patients is independent of tumor burden and correlates with age (2010)
  • Author(s): Ritchie SA, Heath D, Yamazaki Y, Grimmalt B, Kavianpour A, Krenitsky K, Elshoni H, Takemasa I, Miyake M, Sekimoto M, Monden M, Tomonaga T, Matsubara H, Sogawa K, Matsushita K, Nomura F, Goodenowe DB
  • Journal Title: BMC Gastroenterol Volume: 10 Pages: 140-140
  • URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21114854
• [Journal Article] Phosphorylation statuses at different residues of lamin B2, B1, and A/C dynamically and independently change throughout the cell cycle (2010)
  • Author(s): Kuga T, Nozaki N, Matsushita K, Nomura F, Tomonaga T
  • Journal Title: Exp Cell Res Volume: 316 Pages: 2301-12
  • URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20580708
• [Journal Article] High-yield peptide-extraction method for the discovery of subnanomolar biomarkers from small serum samples (2010)
  • Author(s): Kawashima Y, Fukutomi T, Tomonaga T, Takahashi h, Nomura F, Maeda T, Kodera Y
  • Journal Title: J Proteome Res Volume: 9 Pages: 1694-705
  • URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20184378
• [Journal Article] The isolation and identification of apolipoprotein C-I in hormone-refractory prostate cancer using surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (2010)
  • Author(s): Yamamoto-Ishikawa K, Suzuki H, Nezu M, Kamiya N, Imamoto T, Komiya A, Sogawa K, Tomonaga T, Nomura F, Ichikawa T
  • Journal Title: Asian J Androl Volume: 11 Pages: 299-307
  • URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19182819
• [Journal Article] Phosphorylation statuses at different residues of laniin B2, B1, and A/C dynamically and independently change throughout the cell cycle (2010)
  • Author(s): Kuga T
  • Journal Title: Exp Cell Res Volume: 316 Pages: 2301-2312
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] High-yield peptide-extraction method for the discovery of subnanomolar biomarkers from small serum samples. (2010)
  • Author(s): Kawashima Y
  • Journal Title: J Proteome Res Volume: 9 Pages: 1694-1705
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Serum levels of complement C4 fragments correlate with disease activity in multiple sclerosis : Proteomic analysis. (2010)
  • Author(s): Sawai S
  • Journal Title: J Neuroimmunol Volume: 218 Pages: 112-115
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] 血漿バイオマーカー探索のための新しい前処理法の開発 (2010)
  • Author(s): 小寺義男, 朝長毅
  • Journal Title: 実験医学別冊「創薬研究のためのタンパク質・プロテオミクス解析」 Pages: 97-103
• [Journal Article] An alternative splicing isoform of eukaryotic initiation factor 4H promotes tumorigenesis in vivo and is a potential therapeutic target for human cancer. (2010)
  • Author(s): Wu D
  • Journal Title: Int J Cancer (印刷中)
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] High-yield peptide-extraction method for the discovery of subnanomolar biomarkers from small serum samples. (2010)
  • Author(s): Kawashima Y
  • Journal Title: J Proteome Res (印刷中)
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Effects of the time intervals between venipuncture and serum preparation for serum peptidome analysis by matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (2009)
  • Author(s): Umemura H, Nezu M, Kodera Y, Satoh M, Kimura A, Tomonaga T, Nomura F
  • Journal Title: Clin Chim Acta Volume: 406 Pages: 179-80
  • URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19520068
• [Journal Article] c-myc suppressor FBP-interacting repressor for cancer diagnosis and therapy (2009)
  • Author(s): Matsushita K, Tomonaga T, Kajiwara T, Shimada H, Itoga S, Hiwasa T, Kubo S, Ochiai T, Matsubara H, Nomura F
  • Journal Title: Front Biosci Volume: 14 Pages: 3401-8
  • URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19273283
• [Journal Article] YKL-40 identified by proteomic analysis as a biomarker of sepsis (2009)
  • Author(s): Hattori N, Oda S, Sadahiro T, Nakamura M, Abe R, Shinozaki K, Nomura F, Tomonaga T, Matsushita K, Kodera Y, Sogawa K, Satoh M
  • Journal Title: Shock Volume: 32 Pages: 393-400
  • URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19197227
• [Journal Article] Nm23-H1 is responsible for SUMO-2-involved DNA synthesis induction after X-ray irradiation in human cells (2009)
  • Author(s): Guo WZ, Sugaya S, Satoh M, Tomonaga T, Nomura F, Hiwasa T, Takiguchi M, Kita K, Suzuki N
  • Journal Title: Arch Biochem Biophys Volume: 486 Pages: 81-7
  • URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19332021
• [Journal Article] The isolation and identification of apolipoprotein C-I in hormone-refractory prostate cancer using surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry. (2009)
  • Author(s): Yamamoto-Ishikawa K
  • Journal Title: Asian J Androl 11 Pages: 299-307
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Effects of the time intervals between venipuncture and serum preparation for serum peptidome analysis by matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry. (2009)
  • Author(s): Umemura H
  • Journal Title: Clin Chim Acta 406 Pages: 179-80
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Serum levels of complement C4 fragments correlate with disease activity in multiple sclerosis : Proteomic analysis. (2009)
  • Author(s): Sawai S
  • Journal Title: J Neuroimmunol (印刷中)
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] YKL-40 identified by proteornic analysis as a biomarker of sepsis. (2009)
  • Author(s): Hattori N
  • Journal Title: Shock 32 Pages: 393-400
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Nm23-H1 is responsible for SUMO-2-involved DNA synthesis induction after X-ray irradiation in human cells. (2009)
  • Author(s): Guo WZ
  • Journal Title: Arch Biochem Biophys 486 Pages: 81-7
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] c-myc suppressor FBP-interacting repressor for cancer diagnosis and therapy. (2009)
  • Author(s): Matsushita K
  • Journal Title: Front Biosci 14 Pages: 3401-8
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Prohibitin in squamous cell carcinoma of the lung : Its expression and possible clinical significance
  • Author(s): Guo F, Hiroshima K, Wu D, Satoh M, Abulazi M, Yoshino I, Tomonaga T, Nomura F, Nakatani Y
  • Journal Title: Human pathology Volume: (in press)
  • URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22304787
• [Journal Article] The Application of a Three-Step Proteome Analysis for Identification of New Biomarkers of Pancreatic Cancer
  • Author(s): Abulaizi M, Tomonaga T, Satoh M, Sogawa K, Matsushita K, Kodera Y, Obul J, Takano S, Yoshitomi H, Miyazaki M, Nomura F
  • Journal Title: Int J Proteomics Volume: (in press)
  • URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22091389
• [Journal Article] Prohibitin in squamous cell carcinoma of the lung : Its expression and possible clinical significance
  • Author(s): Guo, F
  • Journal Title: Hum Pathol Volume: (印刷中)
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The Application of a Three-Step Proteome Analysis for Identification of New Biomarkers of Pancreatic Cancer
  • Author(s): Abulaizi, M
  • Journal Title: Int J Proteomics Volume: (印刷中)
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Goodenowe DB.Reduction of novel circulating long-chain fatty acids in colorectal cancer patients is independent of tumor burden and correlates with age.
  • Author(s): Ritchie SA
  • Journal Title: BMC Gastroenterol Volume: (印刷中)
  • Peer Reviewed
• [Presentation] リソソームにおけるc-Srcのチロシンリン酸化基質の解析 (2012)
  • Author(s): 阿部紘平
  • Organizer: 第132回日本薬学会年会
  • Place of Presentation: 北海道大学(札幌)
• [Presentation] 浮遊細胞におけるLynの高密度膜への集積化 (2012)
  • Author(s): 盛永敬郎
  • Organizer: 第132回日本薬学会年会
  • Place of Presentation: 北海道大学(札幌)
• [Presentation] Biomarker Discovery for Triglyceride Deposit Cardiomyovasculopathy using Proteome and Transcriptome Analysis (2011)
  • Author(s): 川崎直子
  • Organizer: THE FIRST INTERNATIONAL SYMPOSIUM on Triglyceride Deposit Cardiomyovasculopathy & Neutral Lipid Storage Disease
  • Place of Presentation: Kyoto(Kyoto)
  • Year and Date: 2011-11-26
• [Presentation] 近年のプロテオーム解析技術の進歩と循環器病研究への応用 (2011)
  • Author(s): 朝長毅
  • Organizer: 第11回Cardiovascular Frontier Conference
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2011-11-19
• [Presentation] 大規模定量プロテオミクスによる疾患バイオマーカー探索 (2011)
  • Author(s): 朝長毅
  • Organizer: 第131回質量分析関西談話会
  • Place of Presentation: 大阪
  • Year and Date: 2011-11-12
• [Presentation] 大規模定量プロテオミクスによる疾患バイオマーカー探索 (2011)
  • Author(s): 朝長毅
  • Organizer: 第131回質量分析関西談話会
  • Place of Presentation: 島津製作所関西支社(大阪)
  • Year and Date: 2011-11-12
• [Presentation] 大規模定量プロテオミクスを用いた疾患バイオマーカー探索とSRMを基盤とした実用化へのアプローチ (2011)
  • Author(s): 朝長毅
  • Organizer: 第9回北里疾患プロテオーム研究会
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2011-07-27
• [Presentation] 大規模定量プロテオミクスを用いた疾患バイオマーカー探索とSRMを基盤とした実用化へのアプローチ (2011)
  • Author(s): 朝長毅
  • Organizer: 第9回北里疾患プロテオーム研究会
  • Place of Presentation: 北里大学白金キャンパス・(東京)
  • Year and Date: 2011-07-27
• [Presentation] 定量プロテオミクス (2011)
  • Author(s): 朝長毅
  • Organizer: 日本プロテオーム学会2011年会
  • Place of Presentation: 新潟
• [Presentation] Absolute quantitation of plasma biomarker peptides for Alzheimer disease at pico-molar level using SRM coupled with stable isotope standards and capture by anti-peptide antibodies (2011)
  • Author(s): Shio Watanabe, Shinji Tagami, Seizo Sano, Kumiko Yoshizawa-Kumagaye, Masahiko Tsunemi, Masayasu Okochi and Takeshi Tomonaga
  • Organizer: HUPO 2011 10^<th> World Congress
  • Place of Presentation: Geneva, Switzerland
• [Presentation] 定量プロテオミクス (2011)
  • Author(s): 朝長毅
  • Organizer: 日本プロテオーム学会2011年会
  • Place of Presentation: 朱鷺メッセ(新潟)
• [Presentation] 近年のプロテオーム解析技術の進歩と循環器病研究への応用 (2011)
  • Author(s): 朝長毅
  • Organizer: 第11回Cardiovascular Frontier Conference
  • Place of Presentation: 六本木フォーラム(東京)
• [Presentation] Bioinformatics-GO annotation- (2011)
  • Author(s): 足立淳
  • Organizer: 日本プロテオーム学会2011年会
  • Place of Presentation: 朱鷺メッセ(新潟)
• [Presentation] 大規模リン酸化プロテオーム解析による癌転移に関わる新規リン酸化シグナルの探索 (2011)
  • Author(s): 白水崇
  • Organizer: 第63回日本細胞生物学会大会
  • Place of Presentation: 北海道大学(札幌)
• [Presentation] DNA損傷応答におけるリン酸化・ユビキチン化プロテオーム定量解析 (2011)
  • Author(s): 足立淳
  • Organizer: 日本プロテオーム学会2011年会
  • Place of Presentation: 朱鷺メッセ(新潟)
• [Presentation] 細気管支肺胞上皮癌のプロテオーム解析によるバイオマーカー探索 (2011)
  • Author(s): 原康洋
  • Organizer: 日本プロテオーム学会2011年会
  • Place of Presentation: 朱鷺メッセ(新潟)
• [Presentation] 大腸がん手術組織標本の定量的リン酸化プロテオーム解析 (2011)
  • Author(s): 久家貴寿
  • Organizer: 日本プロテオーム学会2011年会
  • Place of Presentation: 朱鷺メッセ(新潟)
• [Presentation] 大腸癌組織の細胞核プロテオーム解析による染色体不安定性に関連するタンパク質の探索 (2011)
  • Author(s): 越中屋里香
  • Organizer: 日本プロテオーム学会2011年会
  • Place of Presentation: 朱鷺メッセ(新潟)
• [Presentation] 大腸癌バイオマーカーとなる膜タンパク質の大規模プロテオーム解析とSRMによる検証 (2011)
  • Author(s): 久米秀明
  • Organizer: 日本プロテオーム学会2011年会
  • Place of Presentation: 朱鷺メッセ(新潟)
• [Presentation] ヒト大腸癌臨床検体を用いたリン酸化プロテオーム解析による新規転移因子の探索 (2011)
  • Author(s): 白水崇
  • Organizer: 日本プロテオーム学会2011年会
  • Place of Presentation: 朱鷺メッセ(新潟)
• [Presentation] 乳癌膜タンパク質の大規模プロテオーム解析とSRM解析による検証 (2011)
  • Author(s): 村岡賢
  • Organizer: 日本プロテオーム学会2011年会
  • Place of Presentation: 朱鷺メッセ(新潟)
• [Presentation] プロテオミクス、トランスクリプトミクスを用いた中性脂肪蓄積心筋血管症のバイオマーカー探索 (2011)
  • Author(s): 川崎直子
  • Organizer: 日本プロテオーム学会2011年会
  • Place of Presentation: 朱鷺メッセ(新潟)
• [Presentation] SISCAPA-SRMを用いた血漿中にpMレベルで存在するアルツハイマー病バイオマーカーペプチドAPL1ssの絶対定量筋血管症のバイオマーカー探索 (2011)
  • Author(s): 渡邊史生
  • Organizer: 日本プロテオーム学会2011年会
  • Place of Presentation: 朱鷺メッセ(新潟)
• [Presentation] SISCAPA-SRMを用いた血漿中のアルツハイマー病バイオマーカーペプチドAPL1ss定量のための前処理法の検討 (2011)
  • Author(s): 佐野聖三
  • Organizer: 日本プロテオーム学会2011年会
  • Place of Presentation: 朱鷺メッセ(新潟)
• [Presentation] 正常ヒト尿プロテオームの特徴:AKIバイオマーカーの多項目同時測定の基礎的検討 (2011)
  • Author(s): 吉田豊
  • Organizer: 日本プロテオーム学会2011年会
  • Place of Presentation: 朱鷺メッセ(新潟)
• [Presentation] Global phosphorylation and ubiquitination dynamics in DNA-damage response network (2011)
  • Author(s): 足立淳
  • Organizer: 第70回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 名古屋国際会議場(愛知)
• [Presentation] 細気管支肺胞上皮癌のプロテオーム解析によるバイオマーカー探索 (2011)
  • Author(s): 原康洋
  • Organizer: 第70回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 名古屋国際会議場(愛知)
• [Presentation] 膜タンパク質の大規模プロテオーム解析による大腸癌バイオマーカーの探索とSRM法を用いた検証 (2011)
  • Author(s): 久米秀明
  • Organizer: 第70回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 名古屋国際会議場(愛知)
• [Presentation] 大腸癌の定量的リン酸化プロテオーム解析 (2011)
  • Author(s): 久家貴寿
  • Organizer: 第70回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 名古屋国際会議場(愛知)
• [Presentation] Phosphoproteomic analysis of human colorectal cancer tissues for exploring a novel cancer metastatic biomarker (2011)
  • Author(s): 白水崇
  • Organizer: 第70回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 名古屋国際会議場(愛知)
• [Presentation] A strategy for Shotgun Proteomics and SRM-based systematic validation of membrane proteins in breast cancer tissues (2011)
  • Author(s): 村岡賢
  • Organizer: 第70回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 名古屋国際会議場(愛知)
• [Presentation] annexin A2の核内高発現はセントロメア損傷と染色体不安定性に関与する (2011)
  • Author(s): 風見隆浩
  • Organizer: 第70回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 名古屋国際会議場(愛知)
• [Presentation] c-myc遺伝子転写抑制因子FIRはSAP155によりスプライシング変化を受けc-Mycの発現スイッチとして機能する (2011)
  • Author(s): 松下一之
  • Organizer: 第70回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 名古屋国際会議場(愛知)
• [Presentation] 大腸がんにおけるバイオマーカー研究のためのプロテオミクス (2011)
  • Author(s): 杉原豊
  • Organizer: 第70回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 名古屋国際会議場(愛知)
• [Presentation] リン酸化プロテオミクスを用いた新規DNA損傷初期応答キナーゼの探索 (2011)
  • Author(s): 足立淳
  • Organizer: 第70回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 名古屋国際会議場(愛知)
• [Presentation] リン酸化プロテオミクスを用いた新規DNA損傷初期応答キナーゼの探索 (2011)
  • Author(s): 足立淳
  • Organizer: 34回日本分子生物学年会
  • Place of Presentation: パシフィシコ横浜(神奈川)
• [Presentation] 細気管支肺胞上皮癌のプロテオーム解析によるバイオマーカー探索 (2011)
  • Author(s): 原康洋
  • Organizer: 34回日本分子生物学年会
  • Place of Presentation: パシフィシコ横浜(神奈川)
• [Presentation] 大腸癌組織膜タンパク質の大規模プロテオーム解析によるバイオマーカー探索とSRM/MRM法を用いた定量法の確立および診断への応用 (2011)
  • Author(s): 久米秀明
  • Organizer: 34回日本分子生物学年会
  • Place of Presentation: パシフィシコ横浜(神奈川)
• [Presentation] 定量的リン酸化プロテオミクスとバイオインフォマティクスを用いた大腸がんリン酸化シグナル伝達機構の包括的理解 (2011)
  • Author(s): 久家貴寿
  • Organizer: 34回日本分子生物学年会
  • Place of Presentation: パシフィシコ横浜(神奈川)
• [Presentation] 乳癌膜タンパク質の大規模プロテオーム解析とSRM/MRMを用いたバイオマーカー候補タンパク質の検証および予後予測診断への応用 (2011)
  • Author(s): 村岡賢
  • Organizer: 34回日本分子生物学年会
  • Place of Presentation: パシフィシコ横浜(神奈川)
• [Presentation] SRM/MRM法を用いたリン酸化ペプチドの定量法の確立 (2011)
  • Author(s): 村上達夫
  • Organizer: 34回日本分子生物学年会
  • Place of Presentation: パシフィシコ横浜(神奈川)
• [Presentation] プロテオミクス、トランスクリプトミクスを用いた中性脂肪蓄積心筋血管症のバイオマーカー探索 (2011)
  • Author(s): 川崎直子
  • Organizer: 34回日本分子生物学年会
  • Place of Presentation: パシフィシコ横浜(神奈川)
• [Presentation] Immuno-SRM/MRMを用いた新規アルツハイマー病血漿バイオマーカーペプチドAPL1ssの絶対定量法の確立と臨床応用 (2011)
  • Author(s): 渡邊史生
  • Organizer: 34回日本分子生物学年会
  • Place of Presentation: パシフィシコ横浜(神奈川)
• [Presentation] Overexpression of annexin A2 in the nucleus is involved in centromere damage and chromosomal instability (2011)
  • Author(s): 風見隆浩
  • Organizer: 34回日本分子生物学年会
  • Place of Presentation: パシフィシコ横浜(神奈川)
• [Presentation] カニクイザル白血球における細胞外カルレティキュリンによる遺伝子発現の変化 (2011)
  • Author(s): 東濃篤徳
  • Organizer: 34回日本分子生物学年会
  • Place of Presentation: パシフィシコ横浜(神奈川)
• [Presentation] ヒト間葉系幹細胞株(UE6E7T-3)の形質転換過程におけるmRNA発現解析 (2011)
  • Author(s): 竹内昌夫
  • Organizer: 34回日本分子生物学年会
  • Place of Presentation: パシフィシコ横浜(神奈川)
• [Presentation] Absolute quantitation of plasma biomarker peptides for Alzheimer disease at pico-molar level using SRM coupled with stable isotope standards and capture by anti-peptide antibodies (2011)
  • Author(s): 渡邊史生
  • Organizer: HUPO2011
  • Place of Presentation: Geneva(Switzerland)
• [Presentation] Global phosphorylation and ubiquitination dynamics in DNA-damage response network (2011)
  • Author(s): 足立淳
  • Organizer: HUPO2011
  • Place of Presentation: Geneva(Switzerland)
• [Presentation] Phosphoproteomic analysis of clinical colon cancer specimen ; Exploring a novel factor of cancer metastasis (2011)
  • Author(s): 白水崇
  • Organizer: HUPO2011
  • Place of Presentation: Geneva(Switzerland)
• [Presentation] 国内のプロテオミクス研究拠点の動向 (2010)
  • Author(s): 朝長毅
  • Organizer: 日本ヒトプロテオーム機構第8回大会第6回日本臨床プロテオーム研究会連合会
  • Place of Presentation: 千葉
• [Presentation] 近年のプロテオミクス技術の進歩とそのがん研究への応用 (2010)
  • Author(s): 朝長毅
  • Organizer: 第69回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 大阪
• [Presentation] 最近のプロテオミクスの進歩～ターゲットプロテオミクス:翻訳後修飾解析とSRMを用いた絶対定量～ (2010)
  • Author(s): 朝長毅
  • Organizer: 第33回日本分子生物学会年会第83回日本生化学会大会合同大会
  • Place of Presentation: 神戸
• [Presentation] 国内のプロテオミクス研究拠点の動向 (2010)
  • Author(s): 朝長毅
  • Organizer: 日本ヒトプロテオーム機構第8回大会第6回日本臨床プロテオーム研究会連合会
  • Place of Presentation: 東京ベイホテル東急(千葉)
• [Presentation] 近年のプロテオミクス技術の進歩とそのがん研究への応用 (2010)
  • Author(s): 朝長毅
  • Organizer: 第69回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 大阪国際会議場(大阪)
• [Presentation] 最近のプロテオミクスの進歩～ターゲットプロテオミクス:翻訳後修飾解析とSRMを用いた絶対定量～ (2010)
  • Author(s): 朝長毅
  • Organizer: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド(神戸)
• [Presentation] アルツハイマー病の発症予期診断バイオマーカー開発を目的とした脳脊髄液中のペプチド解析amyloid beta42のサロゲートマーカー、APLIbeta28について (2010)
  • Author(s): 田上真次
  • Organizer: 日本ヒトプロテオーム機構第8回大会第6回日本臨床プロテオーム研究会連合会
  • Place of Presentation: 東京ベイホテル東急(千葉)
• [Presentation] SRM分析法を用いた血清中の診断マーカー候補タンパク質・ペプチドの定量分析 (2010)
  • Author(s): 斎藤達也
  • Organizer: 日本ヒトプロテオーム機構第8回大会第6回日本臨床プロテオーム研究会連合会
  • Place of Presentation: 東京ベイホテル東急(千葉)
• [Presentation] 血清を対象とした疾患ペプチドミクス (2010)
  • Author(s): 川島祐介
  • Organizer: 日本ヒトプロテオーム機構第8回大会第6回日本臨床プロテオーム研究会連合会
  • Place of Presentation: 東京ベイホテル東急(千葉)
• [Presentation] eEF21gG抗体は胃癌、大腸癌、乳癌、非小細胞肺癌の早期診断に有用なマーカーである (2010)
  • Author(s): 高木さやか
  • Organizer: 第69回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 大阪国際会議場(大阪)
• [Presentation] 新規抗癌剤スプライソスタチンAの細胞毒性にはc-myc転写抑制因子FIRのスプライシング阻害を伴うc-Mc発現増大がみられる (2010)
  • Author(s): 松下一之
  • Organizer: 第69回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 大阪国際会議場(大阪)
• [Presentation] c-myc転写抑制因子FIRとスプライシング制御因子複合体U2 snRNPsとの相互作用メカニズムについて (2010)
  • Author(s): 梶原寿子
  • Organizer: 第69回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 大阪国際会議場(大阪)
• [Presentation] 悪性胸膜中皮腫細胞移植マウスモデルを用いたc-myc転写抑制因子FIRセンダイウイルスベクターの治療効果 (2010)
  • Author(s): 北村淳史
  • Organizer: 第69回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 大阪国際会議場(大阪)
• [Presentation] annexinA2の核内高発現は染色体不安定性に関与する (2010)
  • Author(s): 風見隆浩
  • Organizer: 第69回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 大阪国際会議場(大阪)
• [Presentation] E3ユビキチンリガーゼである芳香族炭化水素受容体AhRの標的タンパク質の探索 (2010)
  • Author(s): 足立淳
  • Organizer: 日本ヒトプロテオーム機構第8回大会第6回日本臨床プロテオーム研究会連合会
  • Place of Presentation: 東京ベイホテル東急(千葉)
• [Presentation] DNA損傷応答ネットワークにおけるリン酸化・ユビキチン化修飾ダイナミクスのプロテオーム解析 (2010)
  • Author(s): 足立淳
  • Organizer: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド(神戸)
• [Presentation] 大腸癌臨床検体を用いた定量的大規模リン酸化プロテオーム解析 (2010)
  • Author(s): 久家貴寿
  • Organizer: 日本ヒトプロテオーム機構第8回大会第6回日本臨床プロテオーム研究会連合会
  • Place of Presentation: 東京ベイホテル東急(千葉)
• [Presentation] 大腸癌の大規模リン酸化プロテオーム解析 (2010)
  • Author(s): 久家貴寿
  • Organizer: 第69回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 大阪国際会議場(大阪)
• [Presentation] 大規模リン酸化プロテオーム解析による大腸癌バイオマーカー探索 (2010)
  • Author(s): 久家貴寿
  • Organizer: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド(神戸)
• [Presentation] 大腸癌組織膜タンパク質のプロテオーム解析 (2010)
  • Author(s): 久米秀明
  • Organizer: 日本ヒトプロテオーム機構第8回大会第6回日本臨床プロテオーム研究会連合会
  • Place of Presentation: 東京ベイホテル東急(千葉)
• [Presentation] 大腸癌組織膜タンパク質のプロテオーム解析 (2010)
  • Author(s): 久米秀明
  • Organizer: 第69回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 大阪国際会議場(大阪)
• [Presentation] 大腸癌の新たなバイオマーカーとなる膜タンパク質の探索 (2010)
  • Author(s): 久米秀明
  • Organizer: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド(神戸)
• [Presentation] 乳癌転移に関わるmicroRNA(miR-31)のターゲットタンパク質のプロテオーム解析 (2010)
  • Author(s): 原康洋
  • Organizer: 日本ヒトプロテオーム機構第8回大会第6回日本臨床プロテオーム研究会連合会
  • Place of Presentation: 東京ベイホテル東急(千葉)
• [Presentation] 乳癌転移に関わるmicroRNA(miR-31)のターゲットタンパク質のプロテオーム解析 (2010)
  • Author(s): 原康洋
  • Organizer: 第69回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: 大阪国際会議場(大阪)
• [Presentation] 定量的リン酸化プロテオミクスによる乳癌の予後不良群と予後良好群の比較 (2010)
  • Author(s): 鳴海良平
  • Organizer: 日本ヒトプロテオーム機構第8回大会第6回日本臨床プロテオーム研究会連合会
  • Place of Presentation: 東京ベイホテル東急(千葉)
• [Presentation] 定量的リン酸化プロテオミクスによる乳癌組織の予後不良群と予後良好群の比較 (2010)
  • Author(s): 鳴海良平
  • Organizer: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド(神戸)
• [Presentation] 細胞核のプロテオーム解析による染色体不安定性関連タンパク質の探索 (2010)
  • Author(s): 越中屋里香
  • Organizer: 日本ヒトプロテオーム機構第8回大会第6回日本臨床プロテオーム研究会連合会
  • Place of Presentation: 東京ベイホテル東急(千葉)
• [Presentation] 大腸癌細胞の細胞核プロテオーム解析による染色体不安定陸に関連するタンパク質の探索 (2010)
  • Author(s): 越中屋里香
  • Organizer: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド(神戸)
• [Presentation] MRM法におけるアルツハイマー病サロゲートマーカーAPL16の定量法の検討 (2010)
  • Author(s): 佐野聖三
  • Organizer: 日本ヒトプロテオーム機構第8回大会第6回日本臨床プロテオーム研究会連合会
  • Place of Presentation: 東京ベイホテル東急(千葉)
• [Presentation] 2DICAL法を用いた腎癌血漿バイオマーカーの探索.日本ヒトプロテオーム機構第8回大会 (2010)
  • Author(s): 金川章子
  • Organizer: 日本ヒトプロテオーム機構第8回大会第6回日本臨床プロテオーム研究会連合会
  • Place of Presentation: 東京ベイホテル東急(千葉)
• [Presentation] The human urinary proteome analysis and high-accuracy proteome database, MAPU. (2010)
  • Author(s): Jun Adachi
  • Organizer: HUPO2010
  • Place of Presentation: Sydney
• [Presentation] プロテオーム解析の最新事情と基盤研プロテオームリサーチセンターの現状 (2009)
  • Author(s): 朝長毅
  • Organizer: 彩都バイオサイエンスセミナー(口頭)
  • Place of Presentation: 大阪
  • Year and Date: 2009-11-26
• [Presentation] プロテオーム解析の最新事情と基盤研プロテオームリサーチセンターの現状 (2009)
  • Author(s): 朝長毅
  • Organizer: 彩都バイオサイエンスセミナー大阪
  • Place of Presentation: 大阪
  • Year and Date: 2009-11-26
• [Presentation] 最新プロテオーム解析技術を用いた疾患関連バイオマーカー探索研究. (2009)
  • Author(s): 朝長毅
  • Organizer: 第82回 日本生化学会大会
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 2009-10-21
• [Presentation] プロテオームリサーチセンターにおける疾患関連バイオマーカー探索研究. (2009)
  • Author(s): 朝長毅
  • Organizer: 日本ヒトプロテオーム機構 第7回大会
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2009-07-27
• [Presentation] 疾患関連バイオマーカー探索研究の現状と今後の方向性 (2009)
  • Author(s): 朝長毅
  • Organizer: 第7回北里疾患プロテオーム研究会(口頭)
  • Place of Presentation: 神奈川
  • Year and Date: 2009-07-26
• [Presentation] 疾患関連バイオマーカー探索研究の現状と今後の方向性. (2009)
  • Author(s): 朝長毅
  • Organizer: 第7回北里疾患プロテオーム研究会
  • Place of Presentation: 神奈川
  • Year and Date: 2009-07-26
• [Presentation] Validation and functional analysis of a tumor marker candidate, eIF4H isoform 1, identified by 2DE. (2009)
  • Author(s): Tomonaga T
  • Organizer: 3^<rd> EuPA Congress
  • Place of Presentation: Stockholm
  • Year and Date: 2009-06-15
• [Presentation] プロテオームリサーチセンターにおける疾患関連バイオマーカー探索研究 (2009)
  • Author(s): 朝長毅
  • Organizer: 日本ヒトプロテオーム機構第7回大会(口頭)
  • Place of Presentation: 東京
• [Presentation] 最新プロテオーム解析技術を用いた疾患関連バイオマーカー探索研究 (2009)
  • Author(s): 朝長毅
  • Organizer: 第82回日本生化学会大会(口頭)
  • Place of Presentation: 神戸
• [Presentation] Validation and functional analysis of a tumor marker candidate, eIF4H isoform 1, identified by 2DE (2009)
  • Author(s): Tomonaga T, Wu D, Nomura F.
  • Organizer: 3^<rd> EuPA Congress
  • Place of Presentation: Stockholm
• [Remarks]
  • URL: http://www.nibio.go.jp/proteome/index.html
• [Remarks]
  • URL: http://www.nibio.go.jp/proteome/index.html
• [Remarks]
  • URL: http://www.nibio.go.jp/proteome/index.html
• [Remarks]
  • URL: http://www.nibio.go.jp/proteome/index.html