Functional analysis of the male-pattern baldness susceptibility locus by using transposon technology

• Project/Area Number: 21500388
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Laboratory animal science
• Research Institution: Osaka University
• Principal Investigator: KOKUBU Chikara 大阪大学, 大学院・医学系研究科, 特任講師 (70379238)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): KIRA Masahiro 大阪大学, 大学院・医学系研究科, 講師 (90314335) ; UNO Yoshihiro 大阪大学, 大学院・医学系研究科, 助手 (80252683)
• Project Period (FY): 2009 – 2011
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2011)
• Budget Amount: ¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000); Fiscal Year 2011: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000); Fiscal Year 2010: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000); Fiscal Year 2009: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
• Keywords: 疾患モデル / ゲノムエンジニアリング / トランスポゾン

Research Abstract

An intergenic non-coding region between human PAX1 and FOXA2 gene loci has been reported as a susceptibility locus for human male-pattern baldness by genome-wide association studies. To elucidate the function of the genomic region, we performed transposon-based functional analysis of the corresponding genomic region in the mouse. This allowed mapping of long-range genomic cis-regulatory regions and identification of a wide-variety of enhancer elements. No conclusive evidence has so far been obtained from the mouse to support an association between the Pax1 gene and the hair loss phenotype.

Research Products

• [Journal Article] ES/ iPS細胞研究のための遺伝学的手法の新展開 (2012)
  • Author(s): 堀江恭二, 國府力, 竹田潤二
  • Journal Title: 進展する幹細胞のサイエンスから再生医療へ Volume: (印刷中)
• [Journal Article] ES/iPS細胞研究のための遺伝学的手法の新展開 (2012)
  • Author(s): 堀江恭二
  • Journal Title: 実験医学増刊号再生医療を実現化する「幹細胞のメディカルサイエンス」 Volume: 30 Pages: 1632-1688
• [Journal Article] A homozygous mutant embryonic stem cell bank applicable for phenotype-driven genetic screening (2011)
  • Author(s): Horie K., Kokubu C., Yoshida J., Keiko Akagi K., Isotani A., Oshitani A., Yusa K., Ikeda R., Huang Y., Bradley A. and Takeda J.
  • Journal Title: Nature Methods Volume: 8 Pages: 1071-7
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] A homozygous mutant embryonic stem cell bank applicable for phenotype-driven genetic screening (2011)
  • Author(s): Horie K.
  • Journal Title: Nature Methods Volume: 8 Issue: 12 Pages: 1071-1077
  • DOI: 10.1038/nmeth.1739
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Functional Genomics in the Mouse using the Sleeping Beauty Transposon System. In Wassarman PM and Soriano PM(Ed.), Guide to Techniques in Mouse Development, Part B : Mouse Molecular Genetics, 2nd Edition (2010)
  • Author(s): Horie K, Kokubu C, Takeda J.
  • Journal Title: Methods Enzymol Volume: 477C Pages: 71-89
• [Journal Article] Delayed dopaminergic neuron differentiation in Lrp6 mutant mice (2010)
  • Author(s): Castelo-Branco G, Andersson ER, Minina E, Sousa KM, Ribeiro D, Kokubu C, Imai K, Prakash N, Wurst W, Arenas E
  • Journal Title: Dev Dyn Volume: 239 Pages: 211-21
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Functional genomics in the mouse using the Sleeping Beauty transposon system. (2010)
  • Author(s): Horie K., et al
  • Journal Title: Methods in Enzymology. Volume: 477 Pages: 71-89
• [Journal Article] A transposon-based chromosomal engineering method to survey a large cis-regulatory landscape in mice (2009)
  • Author(s): *Kokubu C., Horie K., Abe K., Ikeda R., Mizuno S., Uno Y., Ogiwara S., Ohtsuka M., Isotani A., Okabe M., Imai K. and Takeda J.
  • Journal Title: Nature Genetics Volume: 41 Pages: 946-952
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] A transposon-based chromosomal engineering method to survey a large cis-regulatory landscape in mice (2009)
  • Author(s): Kokubu C., et al.
  • Journal Title: Nature Genetics 41 Pages: 946-952
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 哺乳類と魚の背骨はどこが違うのか:異種間ゲノム工学による脊椎形成の分子機構の研究 (2011)
  • Author(s): 國府力
  • Organizer: 京都大学再生医科学研究所「再生医学・再生医療の先端融合的共同研究拠点」平成23年度学術講演会
  • Place of Presentation: 芝蘭会館稲森ホール.京都大学医学部
  • Year and Date: 2011-12-26
• [Presentation] 哺乳類と魚の背骨はどこが違うのか:異種間ゲノム工学による脊椎形成の分子機構の研究 (2011)
  • Author(s): 國府力
  • Organizer: 京都大学再生医科学研究所「再生医学・再生医療の先端融合的共同研究拠点」平成23年度学術講演会
  • Place of Presentation: 京都大学芝蘭会館稲森ホール(招待講演)
  • Year and Date: 2011-12-26
• [Presentation] マウス・ゲノムエンジニアリングの進歩 (2011)
  • Author(s): 國府力
  • Organizer: 第29回日本骨代謝学会学術集会
  • Place of Presentation: Meet the Experts.大阪国際会議場
  • Year and Date: 2011-07-30
• [Presentation] マウス・ゲノムエンジニアリングの進歩 (2011)
  • Author(s): 國府力
  • Organizer: 第29回日本骨代謝学会学術集会
  • Place of Presentation: 大阪国際会議場(招待講演)
  • Year and Date: 2011-07-30
• [Presentation] 骨格組織構築に関与する幹細胞群の移動と局在 (2011)
  • Author(s): 國府力
  • Organizer: 平成22年度共同研究会
  • Place of Presentation: 京都大学再生医科学研究所.京都
  • Year and Date: 2011-06-09
• [Presentation] 骨格組織構築に関与する幹細胞群の移動と局在 (2011)
  • Author(s): 國府力
  • Organizer: 平成22年度共同研究会
  • Place of Presentation: 京都大学再生医科学研究所(招待講演)
  • Year and Date: 2011-06-09
• [Presentation] トランスポゾン飛跡追跡による3次元ゲノム構造解析の試み (2011)
  • Author(s): 國府力
  • Organizer: 次世代シークエンサー現場の会第1回研究会
  • Place of Presentation: 熱海ニューフジヤホテル
  • Year and Date: 2011-05-28
• [Presentation] トランスポゾン飛跡追跡による3次元ゲノム構造解析の試み (2011)
  • Author(s): 國府力、Xingya Xu
  • Organizer: 次世代シークエンサー現場の会第1回研究会
  • Place of Presentation: 熱海ニューフジヤホテル.熱海
• [Presentation] ベクター挿入部位の網羅的同定 (2010)
  • Author(s): 國府力
  • Organizer: 第53回共同研テクニカルセミナー
  • Place of Presentation: 大阪大学大学院医学系研究科
  • Year and Date: 2010-12-15
• [Presentation] レトロウイルスおよびDNA型トランスポゾンベクターのゲノムワイドな挿入部位の比較解析 (2010)
  • Author(s): 吉田純子、國府力、竹田潤二、堀江恭二
  • Organizer: 第33回日本分子生物学会大会
  • Place of Presentation: 神戸
• [Presentation] トランスポゾンベクターを用いたマウスゲノム制御領域の機能解析 (2010)
  • Author(s): 國府力
  • Organizer: 定量生物の会.第2回年会
  • Place of Presentation: 大阪大学吹田キャンパス
• [Presentation] トランスポゾンベクターを用いたマウスゲノム制御領域の機能解析 (2010)
  • Author(s): 國府力
  • Organizer: 定量生物の会. 第2回年会
  • Place of Presentation: 大阪大学吹田キャンパス
• [Presentation] トランスポゾンベクターによるマウス長距離ゲノム制御領域の探索 (2009)
  • Author(s): 國府力
  • Organizer: 京都大学再生医科学研究所特別セミナー
  • Place of Presentation: 京都大学再生医科学研究所.京都
  • Year and Date: 2009-12-21
• [Presentation] トランスポゾンベクターによるマウス長距離ゲノム制御領域の探索 (2009)
  • Author(s): 國府力
  • Organizer: 京都大学再生医科学研究所特別セミナー
  • Place of Presentation: 京都大学再生医科学研究所
  • Year and Date: 2009-12-21
• [Presentation] トランスポゾンベクターによるマウス長距離ゲノム制御領域の探索 (2009)
  • Author(s): 國府力
  • Organizer: 東海医学会講演会
  • Place of Presentation: 東海大学医学部.伊勢原
  • Year and Date: 2009-12-01
• [Presentation] トランスポゾンベクターによるマウス長距離ゲノム制御領域の探索 (2009)
  • Author(s): 國府力
  • Organizer: 東海医学会講演会
  • Place of Presentation: 東海大学医学部
  • Year and Date: 2009-12-01
• [Presentation] トランスポゾンベクターによる長距離ゲノム制御領域の探索 (2009)
  • Author(s): 國府力
  • Organizer: 第4回Skeletal Research Meeting
  • Place of Presentation: からすま京都ホテル.京都
  • Year and Date: 2009-11-21
• [Presentation] トランスポゾンベクターによる長距離ゲノム制御領域の探索 (2009)
  • Author(s): 國府力
  • Organizer: 第4回 Skeletal Research Meeting
  • Place of Presentation: からすま京都ホテル
  • Year and Date: 2009-11-21
• [Presentation] トランスポゾンを用いたローカルホッピング・ベクターの開発とマウス機能ゲノミクスへの応用 (2009)
  • Author(s): 國府力
  • Organizer: 日本遺伝学会第81回大会
  • Place of Presentation: 信州大学.長野
  • Year and Date: 2009-09-18
• [Presentation] トランスポゾンを用いたローカルホッピング・ベクターの開発とマウス機能ゲノミクスへの応用 (2009)
  • Author(s): 國府力
  • Organizer: 日本遺伝学会第81回大会
  • Place of Presentation: 信州大学
  • Year and Date: 2009-09-18
• [Presentation] Mapping by Hopping : A Transposon-Based Genome Engineering Method to Survey a Large Cis-Regulatory Landscape in a Model Organism (2009)
  • Author(s): Kokubu C.
  • Organizer: The IHG seminar
  • Place of Presentation: International Centre for Life, Newcastle University, Newcastle upon Tyne, UK
  • Year and Date: 2009-09-01
• [Presentation] Mapping by Hopping : A Transposon-Based Genome Engineering Method to Survey a Large Cis-Regulatory Landscape in a Model Organism (2009)
  • Author(s): 國府力
  • Organizer: The IHG seminar, International Centre for Life
  • Place of Presentation: Newcastle University, UK.
  • Year and Date: 2009-09-01
• [Presentation] Scanning a Shh-Responsive Gene Cluster With Transposon-Based Local Hopping Vector (2009)
  • Author(s): Kokubu C, Horie K and Takeda J.
  • Organizer: Mouse Genetics & Genomics, Development and Disease
  • Place of Presentation: Wellcome Trust Conference Centre. Cambridge, UK
• [Presentation] Scanning a Shh-Responsive Gene Cluster With Transposon-Based Local Hopping Vector (2009)
  • Author(s): 國府力, et al.
  • Organizer: Mouse Genetics & Genomics, Development and Disease
  • Place of Presentation: Wellcome Trust Conference Centre. Cambridge, UK.
• [Remarks]
  • URL: http://www.med.osaka-u.ac.jp/pub/mr-envi/www/japanese/member/detail/kokubu.html
• [Remarks]
  • URL: http://www.osaka-u.ac.jp/en/research/annual-report/volume-11/100_select_paper/copy6_of_science02.html
• [Remarks]
  • URL: http://www.med.osaka-u.ac.jp/jpn/activities/results/2009/005.html
• [Remarks]
  • URL: http://www.med.osaka-u.ac.jp/pub/mr-envi/www/japanese/meiber/detail/kokubu.html
• [Remarks] 大阪大学Annual Report 2009-2010
  • URL: http://www.osaka-u.ac.jp/en/research/annual-report/volume-11/100_select_paper/copy6_of_science02.html
• [Remarks]
  • URL: http://www.med.osaka-u.ac.jp/jp/seika/index.html