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Functional analysis of cis-and trans-acting factors to govern chromatin dynamisms in transcriptional regulation

Research Project

Project/Area Number 21570185
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Research Field Molecular biology
Research InstitutionMeisei University

Principal Investigator

SHIMIZU Mitsuhiro  明星大学, 理工学部, 教授 (80231364)

Research Collaborator KURUMIZAKA Hitoshi  早稲田大学, 理工学術院, 教授 (80300870)
MITCHELL Aaron P.  米国カーネーギーメロン大学, 教授
Project Period (FY) 2009 – 2011
Project Status Completed (Fiscal Year 2011)
Budget Amount *help
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2011: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2010: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2009: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Keywords遺伝子 / 発現制御 / ゲノム / クロマチン / ヌクレオソーム / 転写制御 / DNA構造 / ヒストン / 出芽酵母 / 酵母
Research Abstract

Mechanisms of nucleosome positioning and its dynamics are one of the central issues to understand gene expression in eukaryotes. In this study, we identified several DNA repeat sequences acting as cis-elements for nucleosome formation and transcriptional regulation in the yeast cells. Also, we investigated the roles of the chromatin remodeling Isw2 complex, the histone deacetylase Rpd3 and histone H3 variants as trans-acting factors fbr nucleosome positioning as well as transcription.

Report

(4 results)
  • 2011 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2010 Annual Research Report
  • 2009 Annual Research Report
  • Research Products

    (37 results)

All 2012 2011 2010 2009 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (31 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Highly Efficient Chromatin Transcription Induced by Superhelically Curved DNA Segmens : The Underlying Mechanism Revealed by a Yeast System2010

    • Author(s)
      Jun-ichi Tanase, Nobuyuki Morohashi, Masashi Fujita, Jun-ichi Nishikawa, Mitsuhiro Shimizu, Takashi Ohyama
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      Volume: 277 Pages: 4539-4548

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      神戸
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      2009-10-21
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    • URL

      http://www.hino.meisei-u.ac.jp/chem/LBT/Shimizu01.html

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      http://www.hino.meisei-u.ac.jp/chem/LBT/Shimizu01.html

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Published: 2009-04-01   Modified: 2016-04-21  

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