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出芽酵母全ノックアウト株の寿命測定と新規寿命遺伝子の探索

Research Project

Project/Area Number 21651083
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field 基礎ゲノム科学
Research InstitutionNagahama Institute of Bio-Science and Technology

Principal Investigator

向 由起夫  長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, 准教授 (60252615)

Project Period (FY) 2009 – 2010
Project Status Completed (Fiscal Year 2010)
Budget Amount *help
¥3,200,000 (Direct Cost: ¥3,200,000)
Fiscal Year 2010: ¥600,000 (Direct Cost: ¥600,000)
Fiscal Year 2009: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,600,000)
Keywords寿命 / 酵母 / 老化 / ノックアウト株 / ゲノム機能
Research Abstract

寿命は生物種によってほぼ一定であり、老化は遺伝的にプログラミングされている。本研究の目的は、真核モデル生物である出芽酵母Saccharomyces cerevisiaeの分裂寿命を決める遺伝子を網羅的に同定することにより、真核生物の寿命制御メカニズムを解明することである。出芽酵母の分裂寿命は一つの細胞が死ぬまでに産む細胞を数えることにより決める。従来の測定法では、生育可能な約4,800株の酵母ノックアウト(KO)株の分裂寿命を測定するために多大な労力と時間を要する。そこで、増殖を指標とする分裂寿命アッセイ系を利用して、大規模かつ簡便に分裂寿命を測定することにより、寿命に関わる遺伝子を網羅的に同定することを計画した。以下のような研究成果を得た。
1. 母細胞だけが増殖する分裂寿命アッセイ酵母株を構築した。
2. 上のアッセイ系を151株のKO株(65個の転写因子、63個のタンパク質リン酸化酵素、23個のタンパク質脱リン酸化酵素)に導入し、増殖が顕著に悪くなる3株(sko1、not3、kin3)を同定した。従来の方法により、sko1とnot3KO株の分裂寿命が短かいことを確認した。Sko1pとNot3pは転写因子であり、これらが分裂寿命を制御することは初めての知見である。
3. 本アッセイ系のKO株への導入効率を94%まで向上させた。現在、残りのKO株について増殖を測定し、分裂寿命制御遺伝子の同定作業を継続している。
4. 転写因子が制御する標的遺伝子の中から分裂寿命に関わる遺伝子を探索するモデル実験を行った。転写因子Uga3pの標的遺伝子の中からGABA代謝酵素遺伝子UGA1が分裂寿命を制御することを初めて見つけた。メタボローム解析から、uga1KO株が長寿命である理由が発酵から呼吸への代謝シフトであることを明らかにした。

Report

(2 results)
  • 2010 Annual Research Report
  • 2009 Annual Research Report
  • Research Products

    (2 results)

All 2011 2010

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] GABA metabolism pathway genes, UGA1 and GAD 1, regulate replicative lifespan in Saccharomyces cerevisiae2011

    • Author(s)
      Yuka Kamei
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 407 Pages: 185-190

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 出芽酵母のγ・アミノ酪酸(GABA)代謝酵素遺伝子UGA1とGAD1は分裂寿命を制御する2010

    • Author(s)
      亀井優香
    • Organizer
      日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      ポートピアホテル(兵庫県)
    • Year and Date
      2010-12-09
    • Related Report
      2010 Annual Research Report

URL: 

Published: 2009-04-01   Modified: 2016-04-21  

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