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DNA三次元構造の動的変化を可視化する蛍光性低分子リガンドの創成

Research Project

Project/Area Number 21655060
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Chemistry related to living body
Research InstitutionTokyo University of Agriculture and Technology

Principal Investigator

長澤 和夫  東京農工大学, 大学院・工学研究院, 教授 (10247223)

Project Period (FY) 2009 – 2010
Project Status Completed (Fiscal Year 2010)
Budget Amount *help
¥3,200,000 (Direct Cost: ¥3,200,000)
Fiscal Year 2010: ¥1,500,000 (Direct Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2009: ¥1,700,000 (Direct Cost: ¥1,700,000)
KeywordsG-quadruplex / 蛍光プローブ / ポリオキサゾール / テロメスタチン / 動的挙動 / テロメア
Research Abstract

細胞内では、転写因子と呼ばれるタンパク質により転写が制御されている。これにより様々なタンパク質が合成され、複雑な生命活動が維持される。しかしごく最近、核酸塩基の特異な3次元構造であるグアニン四重鎖(G4)が「直接的に」遺伝子の転写を制御する、新たな調節機構が提唱された。この転写調節機構の詳細な解析は、新たな生命現象の理解につながる。G4の転写調節機能の解析を行うには、一本鎖G4が持つ特異な3次元構造を普遍的に検出し、かつ通常の二本鎖DNAと区別する手法が必要となる。そこで本研究では、従来法では困難であったG4構造の検出法を開発するため、G4を選択的に認識し安定化する蛍光化合物(蛍光G4リガンド)を有機合成化学的なアプローチにより創製することを計画した。これまでに開発した蛍光G4リガンドを用い、今年度はその機能評価を電気泳動法、蛍光偏光法により行った。その結果、電気泳動法により当該化合物は既知のG4配列(telomere,c-myc,c-kit,bcl-2等)に強力に結合し、一本鎖非G4、二本鎖DNAには全く結合しないことが分かった。さらに蛍光偏光法により評価したところ、当該化合物は既知のG4配列へ解離定数10nMで結合していることも明らかとなった。当該化合物は無細胞系で選択的にG4を検出できることがわかったので、次にこれを用いた細胞内G4の可視化を検討した。すなわち、細胞内のG4の局在部位を確認することを目的に、細胞を当該化合物にて処理し細胞を固定化した後に蛍光像を観察した。その結果、当該化合物は核内に移行していることが明らかとなり、特にrRNAの生合成が行われている核小体に局在が集中していることが明らかとなった。rRNAの生合成はシスプラチン,5-FU等の既存の抗がん剤の標的であることから、今後rDNA上でのG4形成の確認について検討を行う。

Report

(2 results)
  • 2010 Annual Research Report
  • 2009 Annual Research Report
  • Research Products

    (23 results)

All 2011 2010 2009

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results) Presentation (15 results)

  • [Journal Article] Disabling c-Myc in Childhood Medulloblastoma and Atypical Teratoid Rhabdoid Tumors by the Potent G-Quadruplex Interactive Agent S2T1-6OTD2010

    • Author(s)
      T.Shalaby, A.O.von Bueren, M.-L.Hurlimann, G.Fiaschetti, D.Castelletti, T.Masayuki, K.Nagasawa, Al.Arc aro, I.Jelesarov, K.Shin-ya, M.Grotzer
    • Journal Title

      Mol.Cancer The

      Volume: 9 Pages: 167-179

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  • [Journal Article] Synthesis of macrocyclic hexaoxazole (6OTD) dimers, containing guanidine and a mine functionalized side chains, and an evaluation of their telomeric G4 stabilizing properties2010

    • Author(s)
      K.Iida, M.Tera, T.Hirokawa, K.Shin-ya, K.Nagasawa
    • Journal Title

      J.Nucleic Acid

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  • [Journal Article] Visualization of G-quadruplexes by using a BODIPY-labeled Macrocyclic Heptaoxazole2010

    • Author(s)
      M.Tera, K.Iida, K.Ikebukuro, H.Seimiya, K.Shin-ya, K.Nagasawa
    • Journal Title

      Org.Biomol.Chem

      Volume: 8 Pages: 2749-2755

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  • [Journal Article] Synthesis of macrocyclic hexaoxazole(6OTD)dimers, containing guanidine and amine functionalized side chains, and an evaluation of their telomeric G4 stabilizing properties2010

    • Author(s)
      K.Iida, M.Tera, T.Hirokawa, K.Shin-ya, K.Nagasawa
    • Journal Title

      J.Nucleic Acid (印刷中)

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  • [Journal Article] Visualization of G-quadruplexes by using a BODIPY-labeled Macrocyclic Heptaoxazole2010

    • Author(s)
      M.Tera, K.Iida, K.Ikebukuro, H.Seimiya, K.Shin-ya, K.Nagasawa
    • Journal Title

      Organic Biomolecular Chemistry (印刷中)

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    • Author(s)
      M.Tera, H.Ishizuka, K.Iida, M.Takagi, M.Suganuma, T.Doi, K.Shin-ya, K.Nagasawa
    • Journal Title

      ChemBioChem 10

      Pages: 431-435

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    • Author(s)
      K.Iida, M.Tera, T.Hirokawa, K.Shin-ya, K.Nagasawa
    • Journal Title

      Chemical Communications

      Pages: 6481-6483

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      T.Shalaby, A.O.von Bueren, M.-L.Hurlimann, G.Fiaschetti, D.Castelletti, T.Masayuki, K.Nagaszwa, Al-Arearo, I.Jelesarov, K.Shin-ya, M.Grotzer
    • Journal Title

      Molecular Cancer Therapy 9

      Pages: 167-179

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      真島聡芸、飯田圭介、新家一男、寺正行、長澤和夫
    • Organizer
      The 2nd Symposium on Chiral Science & Technology : Mesochemistry & Chemical Wisdom
    • Place of Presentation
      早稲田大学、西早稲田キャンパス
    • Year and Date
      2011-03-02
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      日本化学会第91春季年会
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      真島聡芸、飯田圭介、新家一男、寺正行、長澤和夫
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      日本化学会第91春季年会
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      神奈川大学横浜キャンパス(講演予稿集)(H23.3.11講演予稿集発行日)
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      長澤和夫
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      日本化学会 第90春季年会
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      近畿大学(大阪)
    • Year and Date
      2010-03-26
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  • [Presentation] テロメスクチン誘導体を用いたグアニン四重鎖構造の安定化と可視化に関する研究2010

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      寺正行、飯田圭介、土井隆行、清宮啓之、新家一男、・長澤和夫
    • Organizer
      第52回天然有機化合物討論会
    • Place of Presentation
      グランシップ(静岡県コンベンションアーツセンター)
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  • [Presentation] Structure-activity relationship studies of macrocyclic hexaoxazole (6OTD) dimers and an evaluation of their telomeric G4 stabilizing properties2010

    • Author(s)
      K.Iida, M.Tera, K.Shin-ya, T.Hirokawa, K.Nagasawa
    • Organizer
      International chemical congress of pacific basin societies
    • Place of Presentation
      Hawaii、Mid-Pacific Conference Center
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  • [Presentation] グアニン四重鎖構造を安定化する大環状ヘプタオキサゾールの創製と可視化プローブへの応用2010

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      寺正行、飯由圭介、高城基樹、清宮啓之、新家一男、長澤和夫
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      日本化学会 第90春季年会
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      近畿大学(大阪)
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      近畿大学、大阪府
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      長澤和夫
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      東京大学化学生命工学専攻シンポジウム(化学と生命科学をつなぐ)
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      東京大学(東京)
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      2009-09-28
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      2nd International Meeting on Quadruplex DNA
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      Brown Hotel, Louisville, KY, USA
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      寺正行、飯田圭介、新家一男、長澤和夫
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      The 6th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2009
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      高山文化会館、岐阜県
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      飯田圭介、寺正行、新家一男、高木基樹、長澤和夫
    • Organizer
      第95回有機合成シンポジウム
    • Place of Presentation
      慶応大学薬学部(東京)
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      飯田圭介, 寺正行, K.Shin-ya, 長澤和夫
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      The 6th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2009
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      高山文化会館、岐阜県
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  • [Presentation] G-quadruplexを選択的に安定化する大環状ヘキサオキサゾールニ量体の合成と活性評価2009

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      飯田圭介、寺正行、新家一男、広川貴次、長澤和夫
    • Organizer
      第28回メディシナルケミストリーシンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学 安田講堂(東京)
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      2009 Annual Research Report

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Published: 2009-04-01   Modified: 2016-04-21  

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