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RNA検出用デグラトンプローブの開発とRNA制御機構の解析

Research Project

Project/Area Number 21657043
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Molecular biology
Research InstitutionUniversity of Tsukuba

Principal Investigator

入江 賢児  筑波大学, 大学院・人間総合科学研究科, 教授 (90232628)

Project Period (FY) 2009 – 2010
Project Status Completed (Fiscal Year 2010)
Budget Amount *help
¥3,000,000 (Direct Cost: ¥3,000,000)
Fiscal Year 2010: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Fiscal Year 2009: ¥1,900,000 (Direct Cost: ¥1,900,000)
KeywordsRNA結合タンパク質 / 出芽酵母 / Khd1 / mRNA / デグラトンプローブ / Pボディ / Stress Granule / hnRNP K / イメージング
Research Abstract

本研究では、『出芽酵母におけるRNA局在と局所的翻訳に働くRNP複合体Locasome』および『動物細胞のストレスに応答したRNAの局在、安定性、翻訳の制御に働くRNP複合体Stress Granule』の系におけるRNA局在・RNA安定性・翻訳の時間的・空間的な制御系を解析し、その基本原理を明らかにする。そのために必要な、(1)生きた細胞内でRNAを高感度に可視化・定量化する『RNA検出用デグラトンプローブ』、(2)2種類のRNAを同時に可視化する『2カラーRNAイメージング』、(3)RNA局在をタンパク質合成と同時に可視化する『RNA-タンパク質デュアルイメージング』、(4)時空間的なタンパク質合成を可視化・定量化する『翻訳モニター系』を開発し、RNAレベルの制御について生きた細胞での高度なイメージング解析、定量化解析を実現させる。明らかにした基本原理をもとに、遺伝子発現をRNAレベルで制御する技術の確立を目指す。
本年度の研究では、出芽酵母RNA結合タンパク質KhdlpによるMTL1 mRNA安定性制御に関わるシス領域の限定とMTL1 mRNA安定性制御に関わるトランス因子の同定を行った。その結果、MTL1(532-1032)領域は、khd1変異株においてmRNAを不安定化させるのに必要かつ十分な配列であること、khd1変異株におけるMTL1 mRNAの不安定化には、5'→3'方向のmRNA分解酵素Xrnlpとキャップ構造除去酵素コファクターDcplpが関与することを明らかにした(Mauchi et aL.,2010)。また、Khd1をin vivoでイメージングを行い、Khd1がRNA分解に関わるプロセッシングボディ(Pボディ)に局在することを明らかにした。

Report

(2 results)
  • 2010 Annual Research Report
  • 2009 Annual Research Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2010 2009 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (6 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Stability control of MTL1 mRNA by the RNA-binding protein Khdlp in yeast2010

    • Author(s)
      Mauchi, et. al.
    • Journal Title

      Cell Structure and Function

      Volume: 35 Pages: 95-105

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] hnRNP K interacts with RNA binding motif protein 42 and functions in the maintenance of cellular ATP level during stress conditions.2009

    • Author(s)
      Fukuda, et al.
    • Journal Title

      Genes to Cells 14

      Pages: 113-128

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] RNA局在の制御2009

    • Author(s)
      入江賢児
    • Journal Title

      蛋白質核酸酵素増刊mRNAプログラム多様性と非対称性の獲得戦略 54

      Pages: 2133-2139

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] RNA結合タンパク質Khdlpは細胞壁合成系においてCcr4p, Pop2p/Caflpとオーバーラップした機能をもつ2010

    • Author(s)
      伊藤渉
    • Organizer
      BMB2010(第33回日本分子生物学会年会第83回日本生化学会大会合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県)
    • Year and Date
      2010-12-09
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] RNA結合タンパク質KhdlpによるmRNA安定性制御機構2010

    • Author(s)
      入江賢児
    • Organizer
      第12回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      一橋記念講堂(東京都)
    • Year and Date
      2010-07-28
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] RNA-binding protein Khdlp and Ccr4-Not complex play an overlapping role in a cell wall integrity pathway in yeast2010

    • Author(s)
      入江賢児
    • Organizer
      EMBO Conference on Gene Transcription in Yeast 2010
    • Place of Presentation
      サンフェリウデギホルス(スペイン)
    • Year and Date
      2010-06-20
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] RNA-binding protein Khdlp and Ccr4-Not complex play an overlapping role in a cell wall integrity pathway in yeast2010

    • Author(s)
      入江賢児
    • Organizer
      The 19^<th> CDB Meeting RNA Sciences in Cell and Deve lopmental Biology
    • Place of Presentation
      理研CDB(兵庫県)
    • Year and Date
      2010-05-11
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] Control of mRNA stability by RNA binding protein Khdlp, the yeast ortholog of mammalian hnRNP K2009

    • Author(s)
      入江賢児
    • Organizer
      FASEB summer research conferences RNA localization and Local translation
    • Place of Presentation
      アメリカ・バーモント州
    • Year and Date
      2009-07-14
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] Control of mRNA stability by RNA binding protein Khdlp, the yeast ortholog of mammalian hnRNP K2009

    • Author(s)
      入江賢児
    • Organizer
      第61回日本細胞生物学会大会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場
    • Year and Date
      2009-06-02
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.md.tsukuba.ac.jp/public/basic-med/molcellbiol/index.html

    • Related Report
      2010 Annual Research Report

URL: 

Published: 2009-04-01   Modified: 2016-04-21  

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