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特定一塩基、一細胞レベルでのDNAメチル化可視化技術の開発とその細胞生物学的応用

Research Project

Project/Area Number 21657050
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Cell biology
Research InstitutionNara Institute of Science and Technology

Principal Investigator

滝沢 琢己  奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 助教 (30531115)

Project Period (FY) 2009 – 2010
Project Status Completed (Fiscal Year 2010)
Budget Amount *help
¥3,100,000 (Direct Cost: ¥3,100,000)
Fiscal Year 2010: ¥1,500,000 (Direct Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2009: ¥1,600,000 (Direct Cost: ¥1,600,000)
Keywordsエピジェネティクス / DNAメチル化 / 細胞分化 / 核構造
Research Abstract

申請者らがこれまでにDNAメチル化が分化に伴い減少することを明らかにしたアストロサイト特異的遺伝子glial fibrillary acidic protein (GFAP)のプロモーター上のSTAT3結合配列を標的とし、メチル化頻度が高いマウス胎生11.5日由来神経上皮細胞を用いて昨年に引き続き検討した。既に、定量的PCRにてメチル化に感受性があることを確認しているICONプローブ技術を用いて、標的配列に相補的なプローブを作成した。昨年度は、プローブの5'側をビオチン分子で標識し、定法に則って、プローブをハイブリダイゼーションさせた後、オスミウムの存在下で反応させプローブとメチル化標的配列との間にオスミウム塩による架橋を形成し、ほぼ不可逆的なハイブリッドを誘導した。この後、ストレプトアビジンペルオキシダーゼを反応させ、プローブにペルオキシダーゼを結合させた後に、Tyramid-ビオチンを用い周囲のタンパク質をビオチンラベルしプロープ検出感度の増加を図った。更に、ストレプトアビジンペルオキシダーゼを反応させた後に、tyramidとAlexa555色素の化合物を反応させ、プローブの蛍光色素ラベルを試みた。しかし、プローブの検出はできなかった。このため、プローブの標識を増やすために、aminoallyl-dUTPを複数ふくむプローブを作成し、Biotin-conjugated succinyl esterにて複数のbiotinで標識、あるいは、Psoralen-biotinシステム(Ambion)を用いて、非特異的にプローブを複数のbiotin分子標識を行い、上記手技を施行しシグナルの検出を図ったが、感度が低く検出に至らなかった。現在、検出方法を改良し、感度を上げる方法を検討中である。

Report

(2 results)
  • 2010 Annual Research Report
  • 2009 Annual Research Report
  • Research Products

    (30 results)

All 2011 2010 2009

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (27 results)

  • [Journal Article] ゲノムDNAの核内配置と遺伝子発現制御2010

    • Author(s)
      滝沢琢己、高木美智、笹岡寛敏
    • Journal Title

      生化学 82

      Pages: 143-149

    • NAID

      10026300564

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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 神経系におけるゲノム核内配置2009

    • Author(s)
      滝沢琢己
    • Journal Title

      Clinical Neuroscience 26

      Pages: 848-849

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  • [Journal Article] 神経系細胞における核内機能ドメイン配置2009

    • Author(s)
      滝沢琢己、中島欽一
    • Journal Title

      実験医学 10月増刊号 27

      Pages: 146-152

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      滝沢琢己
    • Organizer
      日本農芸化学会2011年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学の予定が中止となり、講演予稿集の発行をもって成立
    • Year and Date
      2011-03-28
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      滝沢琢己
    • Organizer
      International Symposium on the Physicochemical Field for Genetic Activities
    • Place of Presentation
      淡路夢舞台国際会議場
    • Year and Date
      2011-01-25
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      滝沢琢己
    • Organizer
      BMB2010
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      BMB2010
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      40^<th> Annual Meeting NEUROSCIENCE2010
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      San Diego, USA
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      2010-11-15
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      40^<th> Annual Meeting NEUROSCIENCE2010
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      San Diego, USA
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      2010-11-15
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      The 29^<th> NAITO CONFERENCE ON GLIA WORLD
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      湘南国際村センター
    • Year and Date
      2010-10-06
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      佐野坂司、波平昌一、滝沢琢己、中島欽一
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      滝沢琢己、高木美智、笹岡寛敏、伊藤謙治、中島欽一
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      Neuro2010
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      神戸コンベンションセンター
    • Year and Date
      2010-09-03
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      裏山悟司、滝沢琢己、堀由貴奈、神山淳、中島欽一
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      日本分子生物学会第10回春季シンポジウム
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      ホテル松島大観荘
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      2010-06-08
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  • [Presentation] Spatiotemporal regulation of activity-dependent genes in post-mitotic neurons2010

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      Misato Tkagi, Hirotoshi Sasaoka, Kenji Itoh, Hiroshi Kimura, Kinichi Nakashima, Takumi Takizawa
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      The 75^<th> Cold Spring Harbor Symposium : Nuclear Organization & Function
    • Place of Presentation
      Cold Spring Harbor Laboratory, NY, USA
    • Year and Date
      2010-06-05
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  • [Presentation] 神経活動依存性転写の時空間的制御2010

    • Author(s)
      滝沢琢己、高木美智、伊藤謙治、中島欽一
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      第9回核ダイナミクス研究会
    • Place of Presentation
      ラフォーレ修善寺
    • Year and Date
      2010-05-28
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  • [Presentation] Analysis of DNA methylation-independent regulatory mechanisms of astrocyte specific gene expression2009

    • Author(s)
      裏山悟司, 滝沢琢己, 堀由貴奈, 神山淳, 中島欽一
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜市
    • Year and Date
      2009-12-09
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  • [Presentation] A source of astrocyte-inducing cytokines in the developing mouse brain2009

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      佐野坂司, 犬伏浩規神山淳, 滝沢琢己, 中島欽一
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      第32回日本分子生物学会年会
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      横浜市
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      2009-12-09
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  • [Presentation] Analysis of chromatin modifications and trascriptional regulations of activity-dependent genes in post-mitotic neurons2009

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      笹岡寛敏, 滝沢琢己, 木村宏, 中島欽一
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
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      横浜市
    • Year and Date
      2009-12-09
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      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] ニューロン活動依存的に発現する遺伝子の核内空間配置解析2009

    • Author(s)
      高木美智, 滝沢琢己, 笹岡寛敏, 中島欽一
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜市
    • Year and Date
      2009-12-09
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  • [Presentation] The spatiotemporal regulation of activity- dependent genes in post-mitotic neurons2009

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      Takumi Takizawa
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      第32回日本分子生物学会年会
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      横浜市
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      2009-12-09
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  • [Presentation] The spatio-temporal regulation of activity- dependent genes in post-mitotic neurons2009

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      Takizawa T, Sasaoka H, Takagi M, Kimura H, Nakashima K
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      The 4th International Workshop on Cell Regulations in Division and Arrest
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      沖縄
    • Year and Date
      2009-11-29
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  • [Presentation] ニューロン活動依存的に発現する遺伝子の核内空間配置解析2009

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      高木美智, 笹岡寛敏, 滝沢琢己, 中島欽一
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      第82回日本生化学会大会
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      神戸市
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  • [Presentation] ニューロンでの遺伝子発現におけるエピジェネティック修飾の解析2009

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      笹岡寛敏, 滝沢琢己, 木村宏, 中島欽一
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      第82回日本生化学会大会
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      神戸市
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      2009-10-23
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  • [Presentation] DYNAMIC CHANGES IN DNA METHYLATION AND SPATIAL POSITIONING OF AN ASTROCYTE SPECIFIC GENE, GFAP DURING ASTRO CYTE DIFFERENTIATION2009

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      Takizawa T, Taga T, Misteli T, Nakashima K
    • Organizer
      ISSCR 7th Annual Meeting
    • Place of Presentation
      Barcelona, Spain
    • Year and Date
      2009-07-08
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  • [Presentation] Allele-specific nuclear positioning of the monoallelically expressed astrocyte marker GFAP2009

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      Takizawa T, Nakashima K, Gudla RP, Lockett S, Misteli T
    • Organizer
      第24回内藤コンファレンス
    • Place of Presentation
      札幌市
    • Year and Date
      2009-06-23
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  • [Presentation] アストロサイト特異的遺伝子GFAP発現制御に関するDNAメチル化と遺伝子座核内配置2009

    • Author(s)
      滝沢琢己, 中島欽一
    • Organizer
      第52回日本神経化学会大会
    • Place of Presentation
      渋川市
    • Year and Date
      2009-06-22
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  • [Presentation] アストロサイト特異的遺伝子GEAPの核内配置と転写活性2009

    • Author(s)
      滝沢琢己、Tom Misteli
    • Organizer
      第8回 核ダイナミクス研究会
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      伊豆市
    • Year and Date
      2009-06-19
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  • [Presentation] アストロサイト特異的遺伝子GEAPの核内配置と転写活性2009

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      滝沢琢己, Tom Misteli, 中島欽一
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      第3回日本エピジェネティクス研究会年会
    • Place of Presentation
      東京都
    • Year and Date
      2009-05-22
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  • [Presentation] ニューロンでの遺伝子発現におけるエピジェネティック修飾の解析2009

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      笹岡寛敏, 滝沢琢己, 中島欽一
    • Organizer
      第3回日本エピジェネティクス研究会年会
    • Place of Presentation
      東京都
    • Year and Date
      2009-05-22
    • Related Report
      2009 Annual Research Report

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Published: 2009-04-01   Modified: 2016-04-21  

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