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ATPからポリリン酸へ、生命エネルギー進化の逆をたどる分子改変

Research Project

Project/Area Number 21658031
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Applied microbiology
Research InstitutionHiroshima University

Principal Investigator

黒田 章夫  広島大学, 大学院・先端物質科学研究科, 教授 (50205241)

Project Period (FY) 2009 – 2010
Project Status Completed (Fiscal Year 2010)
Budget Amount *help
¥3,200,000 (Direct Cost: ¥3,200,000)
Fiscal Year 2010: ¥1,600,000 (Direct Cost: ¥1,600,000)
Fiscal Year 2009: ¥1,600,000 (Direct Cost: ¥1,600,000)
KeywordsATP / ポリリン酸 / 進化 / グルコキナーゼ / 生命エネルギー
Research Abstract

ATPは生命エネルギーの通貨と言われ、多くの酵素がATPをエネルギー源あるいはリン酸化の基質として利用している。我々はポリリン酸(polyP)を利用してグルコースをリン酸化する酵素(polyP-GK)を発見し、その立体構造を解明した。本研究ではATPを利用するグルコキナーゼ(ATP-GK)を改変し、polyPを利用できる様にする分子改変に挑戦した。1,ATP-GKの触媒部位周辺の塩基性のアミノ酸が比較的少ないため、polyPとの親和性が低い可能性がある。そこで、触媒部位の入り口のAsp302をLysに置換したがpolyPを利用できるようにはならなかった。2,ATP-GKのC末端に別酵素のpolyp結合ドメインを挿入し、polyPに対し親和性の高い融合タンパク質をつくった。しかし、この融合タンパク質はATPによる酵素活性は検出できたが、polyPを利用できるようにはならなかった。3,polyP-GKの触媒部位の構造に比べ、ATP-GKのリン酸結合部位が柔軟性を欠くことから、構造が不安定なpolyPとの親和性が低い可能性がある。リン酸結合部位の柔軟性を高めるため、Ala261のGlyへの置換及びGlyの挿入を行なった。しかし、その両方の酵素にグルコキナーゼ自体の酵素活性が消失した。以上の結果より、ATPの触媒部位への結合による構造変化(アロステリック活性化)が起こる酵素では、polyPを利用させることが困難であることが考えられる。しかし、アロステリック活性化を示さないタイプのATP依存酵素を使えば、潜在的にpolyPも利用できる可能性があると考えられた。

Report

(2 results)
  • 2010 Annual Research Report
  • 2009 Annual Research Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2010 2009 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (4 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Bacterial phosphate metabolism and its application to phosphorus recovery and industrial bioprocesses2010

    • Author(s)
      R.Hirota, A.Kuroda, J.Kato, H.Ohtake
    • Journal Title

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      Volume: 109 Pages: 423-432

    • NAID

      110007618916

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Reciprocating-flow ATP amplification system for increasing the number of amplification cycles2009

    • Author(s)
      T.Satoh, K.Tsuruta, Y.Shinoda, R.Hirota, K.Noda, A.Kuroda, Y.Murakam
    • Journal Title

      Anal.Biochem 395

      Pages: 161-165

    • NAID

      120001898368

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 大腸菌ポリリン酸高蓄積phoU変異株の不安定化機構の解明2010

    • Author(s)
      中井茂人、半田智大、本村圭、廣田隆一、黒田章夫
    • Organizer
      日本生物工学会
    • Place of Presentation
      宮崎シーガイア
    • Year and Date
      2010-10-28
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] 大腸菌YjbBはリン酸排出促進によりポリリン酸蓄積を抑制する2010

    • Author(s)
      本村圭、廣田隆一、大中信輝、岡田真以、黒田章夫
    • Organizer
      日本生物工学会
    • Place of Presentation
      宮崎シーガイア
    • Year and Date
      2010-10-28
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] バイオによるリンの濃縮と回収法2010

    • Author(s)
      黒田章夫、廣田隆一
    • Organizer
      リンの濃縮と回収に関するバイオとケミカルのコラボレーションセミナー
    • Place of Presentation
      早稲田大学(招待講演)
    • Year and Date
      2010-07-02
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] 微生物によるリンの濃縮と資源化2009

    • Author(s)
      黒田章夫
    • Organizer
      水環境学会シンポジウム
    • Place of Presentation
      お茶の水大学
    • Year and Date
      2009-09-15
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://home.hiroshima-u.ac.jp/akbio/research.htm

    • Related Report
      2009 Annual Research Report

URL: 

Published: 2009-04-01   Modified: 2016-04-21  

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