A basic study on the deep-dwelling common carp in Lake Biwa

• Project/Area Number: 21710242
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Resource conservation science
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: MABUCHI Kohji 東京大学, 大気海洋研究所, 助教 (50401295)
• Project Period (FY): 2009 – 2011
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2011)
• Budget Amount: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000); Fiscal Year 2011: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000); Fiscal Year 2010: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000); Fiscal Year 2009: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
• Keywords: コイ / 琵琶湖 / 深層 / 在来系統 / 保全 / 卵 / 核DNA / SNPs / ミトコンドリアDNA / 博物館標本

Research Abstract

A genetic survey using 7 nuclear DNA markers(SNPs) revealed that relatively pure Japanese-native population of common carp survives in the deep(> 20m) off-shore waters of Lake Biwa. These 7 SNP markers were also used for the analysis of eggs laid on the plants along a shore, which demonstrated that most of the eggs collected from the study site were hybrids intermediate between the Japanese-native and Eurasian-introduced strains

Research Products

• [Journal Article] A set of SNPs near or within STR regions useful for discriminating native Lake Biwa and introduced "Eurasian" strains of common carp (2012)
  • Author(s): Mabuchi, K., H. Song, H. Takeshima, and M. Nishida
  • Journal Title: Conservation Genetics Resources Volume: (in press) Issue: 3 Pages: 649-652
  • DOI: 10.1007/s12686-012-9613-x
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Evolutionary history of Otophysi(Teleostei), a major clade of the modern freshwater fishes : Pangaean origin and Mesozoic radiation (2011)
  • Author(s): Nakatani M, Miya M, Mabuchi K, Saitoh K and Nishida M
  • Journal Title: BMC Evolutionary Biology Volume: 11 Issue: 1 Pages: 177-177
  • DOI: 10.1186/1471-2148-11-177
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Multiple invasions into freshwater by pufferfishes(Teleostei : Tetraodontidae): a mitogenomic perspective (2011)
  • Author(s): Yamanoue, Y., M. Miya, H. Doi, K. Mabuchi, H. Sakai, and M. Nishida
  • Journal Title: PLoS ONE Volume: 6 Issue: 2 Pages: e17410-e17410
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0017410
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Evolutionary history of Otophysi (Teleostei), a major clade of the modern freshwater fishes : Pangaean origin and Mesozoic radiation (2011)
  • Author(s): Nakatani, M.
  • Journal Title: BMC Evolutionary Biology Volume: 11 Pages: 177-177
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Multiple invasions into freshwater by pufferfishes (Teleostei : Tetraodontidae) : a mitogenomic perspective (2011)
  • Author(s): Yamanoue, Y.
  • Journal Title: PLoS ONE Volume: 6
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Stable isotope and molecular analyses indicate that hybridization with non-native domesticated common carp influence habitat use of native carp (2010)
  • Author(s): Matsuzaki, S. S., K. Mabuchi, N. Takamura, B. J. Hicks, M. Nishida, and I. Washitani
  • Journal Title: Oikos Volume: 119 Issue: 6 Pages: 964-971
  • DOI: 10.1111/j.1600-0706.2009.18076.x
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] 琵琶湖におけるコイの日本在来mtDNAハプロタイプの分布 (2010)
  • Author(s): 馬渕浩司・瀬能宏・武島弘彦・中井克樹・西田睦
  • Journal Title: 魚類学雑誌 Volume: 57 Pages: 1-12
  • NAID: 40017117020
  • URL: http://www.wdc-jp.biz/pdf_store/isj/publication/pdf/57/5701-01.pdf
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] 琵琶湖におけるコイの日本在来mtDNAハプロタイプの分布 (2010)
  • Author(s): 馬渕浩司
  • Journal Title: 魚類学雑誌 Volume: 57 Pages: 27-34
  • NAID: 40017117020
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Behavioral and morphological differences between feral and domesticated strains of common carp (2009)
  • Author(s): Matsuzaki, S. S., K. Mabuchi, N. Takamura, M. Nishida, and I. Washitani
  • Journal Title: Journal of Fish Biology Volume: 75 Issue: 6 Pages: 1206-1220
  • DOI: 10.1111/j.1095-8649.2009.02345.x
  • Peer Reviewed
• [Presentation] マイクロサテライト隣接領域の一塩基多型を用いたコイの在来系統の識別 (2011)
  • Author(s): 馬渕浩司
  • Organizer: 日本魚類学会年会
  • Place of Presentation: 弘前大学文京町キャンパス
  • Year and Date: 2011-10-01
• [Presentation] マイクロサテライト隣接領域の一塩基多型を用いたコイの在来系統の識別(ポスター発表) (2011)
  • Author(s): 馬渕浩司・ソンハヨン・武島弘彦・中井克樹・瀬能宏・西田睦
  • Organizer: 日本魚類学会年会
  • Place of Presentation: 弘前大学文京町キャンパス
• [Presentation] 南太平洋の温帯魚類相との関係(口頭招待講演) (2010)
  • Author(s): 馬渕浩司
  • Organizer: 2010年度日本魚類学会シンポジウム「黒潮と日本の魚類相:ベルトコンベアーか障壁か」
  • Place of Presentation: 三重県文化会館
  • Year and Date: 2010-09-26
• [Presentation] 南太平洋の温帯魚類相との関係 (2010)
  • Author(s): 馬渕浩司
  • Organizer: 日本魚類学会年会
  • Place of Presentation: 三重県文化会館
  • Year and Date: 2010-09-26
• [Presentation] テンジクダイ科の分子系統どテンジクダイ属"の非単系統性 (2010)
  • Author(s): 馬渕浩司
  • Organizer: 日本魚類学会年会
  • Place of Presentation: 三重県文化会館
  • Year and Date: 2010-09-24
• [Presentation] テンジクダイ科の分子系統と"テンジクダイ属"の非単系統性(ポスター発表) (2010)
  • Author(s): 馬渕浩司・Thomas Fraser・東陽一郎・西田睦
  • Organizer: 日本魚類学会年会
  • Place of Presentation: 三重県文化会館
• [Presentation] 分子系統解析による東アジア魚類相形成史への新たな問題提起:ササノハベラ属と在来コイの研究から(日本魚類学会奨励賞受賞講演) (2009)
  • Author(s): 馬渕浩司
  • Organizer: 日本魚類学会年会
  • Place of Presentation: 東京海洋大学品川キャンパス
  • Year and Date: 2009-10-11
• [Presentation] 分子系統解析による東アジア魚類相形成史への新たな問題提起:ササノハベラ属と在来コイの研究から (2009)
  • Author(s): 馬渕浩司
  • Organizer: 日本魚類学会年会
  • Place of Presentation: 東京海洋大学品川キャンパス
  • Year and Date: 2009-10-11
• [Presentation] シーボルトとビュルゲル収集の日本産コイの標本(口頭発表) (2009)
  • Author(s): 瀬能宏・馬渕浩司・西田睦
  • Organizer: 日本魚類学会年会
  • Place of Presentation: 東京海洋大学品川キャンパス
  • Year and Date: 2009-10-10
• [Presentation] シーボルトとビュルゲル収集の日本産コイの標本 (2009)
  • Author(s): 瀬能宏
  • Organizer: 日本魚類学会年会
  • Place of Presentation: 東京海洋大学品川キャンパス
  • Year and Date: 2009-10-10
• [Book] 外来魚の保全遺伝学的解析・評価法.鷲谷いづみ・宮下直・西廣淳・角谷拓(編) pp.83-100.保全生態学の技法 (2010)
  • Author(s): 馬渕浩司
  • Publisher: 東京大学出版会
• [Book] 保全生態学の技法 (2010)
  • Author(s): 馬渕浩司(分担執筆)
  • Publisher: 東京大学出版会
• [Remarks] 報道関係京都新聞・滋賀版の2011年12月10日の遅版、早版の一面で研究が紹介された。「琵琶湖の深さ在来コイ守る」、三好吉彦記者
• [Remarks] 月刊アクアライフ2011年8月号の94-97ページで研究が紹介された。「太古からの使者古代ゴイを追え其の二翻筋斗網」、写真と文、直井秀幸
• [Remarks] 月刊アクアライフ2009年12月号の156-159ページおよび162-165ページで研究が紹介された。「太古からの使者古代ゴイを追え」、写真と文、直井秀幸