Development of inhibitors based on short helical peptides for protein-protein interactions

• Project/Area Number: 21750167
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Chemistry related to living body
• Research Institution: University of Toyama
• Principal Investigator: FUJIMOTO Kazuhisa University of Toyama, 大学院・医学薬学研究部, 助教 (40334718)
• Project Period (FY): 2009 – 2010
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2010)
• Budget Amount: ¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000); Fiscal Year 2010: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000); Fiscal Year 2009: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
• Keywords: α-ヘリックス / タンパク間相互作用 / 阻害剤 / 生体高分子

Research Abstract

I explored the effect of α-helical stabilization upon the binding of short peptides to DNAs. When a cross-linked peptide based on the homeodomain of transcription factor was titrated with a target DNA duplex, its dissociation constant (Kd) was calculated to be ca. 0.5 nM. This value was the double-digit smaller than that of the corresponding non-cross-linked peptide. The cross-linked peptide showed high substrate specificity for DNAs at the same level as the original DNA-binding protein.

Research Products

• [Journal Article] Side Chain Cross-linked α-Helices That Behave Like Original Proteins in Biomacromolecular Interactions (2011)
  • Author(s): Masaoki Kajino, Kazuhisa Fujimoto, Masahiko Inouye
  • Journal Title: J.Am.Chem.Soc. 133巻 Pages: 656-659
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Side Chain Cross-linked α-Helices That Behave Like Original Proteins in Biomacromolecular Interactions (2011)
  • Author(s): Kajino, M.; Fujimoto, K ; Inouye, M.
  • Journal Title: J.Am.Chem.Soc. Volume: 133 Pages: 656-659
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Highly emissive pyrene-based fluorophores and highly sensitive fluorescent sensors using pyrene emission switching (2010)
  • Author(s): Kazuhisa Fujimoto
  • Journal Title: Yakugaku Zasshi 130巻 Pages: 1283-1287
  • NAID: 130000451670
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Specific Induced Circular Dichroism and Enhanced B to Z Transitions of Duplexes Stabilized by Chromophore-Linked Alkynylnucleoside Residues (2010)
  • Author(s): Kazuhisa Fujimoto, Sayaka Aizawa, Ikko Oota, Junya Chiba, Masahiko Inouye
  • Journal Title: Chem.-Eur.J. 16巻 Pages: 2401-2406
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Highly emissive pyrene-based fluorophores and highly sensitive fluorescent sensors using pyrene emission switching. (2010)
  • Author(s): Fujimoto K.
  • Journal Title: Yakugaku Zasshi Volume: 130 Pages: 1283-1287
  • NAID: 130000451670
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Specific Induced Circular Dichroism and Enhanced B to Z Transitions of Duplexes Stabilized by Chromophore-Linked Alkynylnucleoside Residues (2010)
  • Author(s): Fujimoto, K., Aizawa, S., Oota, I., Chiba, J., Inouye, M.
  • Journal Title: Chem.-Eur.J. 16 Pages: 2401-2406
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Photophysical Properties of 1,3,6,8-Tetrakis(arylethynyl)pyrenes with Donor or Acceptor Substituents: Their Fluorescence Solvatochromism and Lightfastness (2009)
  • Author(s): Kazuhisa Fujimoto, Hisao Shimizu, Masaru Furusyo, Seiji Akiyama, Mio Ishida, Utako Furukawa, Toshiaki Yokoo, Masahiko Inouye
  • Journal Title: Tetrahedron 65巻 Pages: 9357-9361
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Synthesis of Versatile Fluorescent Sensors Based on Click Chemistry: Detection of Fatty Acids by their Pyrene-Emission Switching (2009)
  • Author(s): Kazuhisa Fujimoto, Shogo Yamada, Masahiko Inouye
  • Journal Title: Chem.Commun. Pages: 7164-7166
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Characteristic Fluorescence Behavior of Dialkynylpyrene Derivatives in Hydrophobic Cavity of Protein (2009)
  • Author(s): Hideyuki Shinmori, Hirotoshi Furukawa, Kazuhisa Fujimoto, Hisao Shimizu, Masahiko Inouye, Toshifumi Takeuchi
  • Journal Title: Chem.Lett 38巻 Pages: 84-85
  • NAID: 10023990667
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Synthesis of Versatile Fluorescent Sensors Based on Click Chemistry : Detection of Fatty Acids by their Pyrene-Emission Switching (2009)
  • Author(s): Fujimoto, K., Yamada, S., Inouye, M.
  • Journal Title: Chem.Commun. Pages: 7164-7166
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Characteristic Fluorescence Behavior of Dialkynylpyrene Derivatives in Hydrophobic Cavity of Protein (2009)
  • Author(s): Shinmori, H., Furukawa, H., Fujimoto, K., Shimizu, H., Inouye, M., Takeuchi, T.
  • Journal Title: Chem.Lett. 38 Pages: 84-85
  • NAID: 10023990667
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Photophysical Properties of 1, 3, 6, 8-Tetrakis(arylethynyl)pyrenes with Donor or Acceptor Substituents : Their Fluorescence Solvatochromism and Lightfastness (2009)
  • Author(s): Fujimoto, K., Shimizu, H., Frusyo, M.Akiyama, S., Ishida, M., Furukawa, U., Yokoo, T., Inouye, M.
  • Journal Title: Tetrahedron 65 Pages: 9357-9361
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 金基板上に固定化したフェロセンラベル化ペプチドの電子移動 (2011)
  • Author(s): 藤原匡志・藤本和久・井上将彦
  • Organizer: 日本化学会第91春季年会
  • Place of Presentation: 神奈川大学
• [Presentation] 様々なタンパクをミニチュア化したヘリカルペプチドとDNAとの相互作用解析 (2011)
  • Author(s): 梶野雅起・藤本和久・井上将彦
  • Organizer: 日本化学会第91春季年会
  • Place of Presentation: 神奈川大学
• [Presentation] 様々なタンパクをミニチュア化したヘリカルペプチドとDNAとの相互作用解析 (2011)
  • Author(s): 梶野雅起, 藤本和久, 井上将彦
  • Organizer: 日本化学会第91春季年会
  • Place of Presentation: 横浜
• [Presentation] 金基板上に固定化したフェロセンラベル化ペプチドの電子移動 (2011)
  • Author(s): 藤原匡志, 藤本和久, 井上将彦
  • Organizer: 日本化学会第91春季年会
  • Place of Presentation: 横浜
• [Presentation] ジアリールエテンの光異性化を利用した生体分子間相互作用の制御 (2010)
  • Author(s): 藤本和久・梶野雅起・井上将彦
  • Organizer: 平成22年度北陸地区講演会と研究発表会
  • Place of Presentation: 富山大学五福キャンパス
  • Year and Date: 2010-11-19
• [Presentation] ジアリールエテンの光異性化を利用した生体分子間相互作用の制御 (2010)
  • Author(s): 藤本和久, 梶野雅起, 井上将彦
  • Organizer: 平成22年度北陸地区講演会と研究発表会
  • Place of Presentation: 富山
  • Year and Date: 2010-11-19
• [Presentation] 金電極上におけるフェロセンラベル化ペプチドのダイナミクスと電気化学応答 (2010)
  • Author(s): 藤原匡志・藤本和久・井上将彦
  • Organizer: 平成22年度有機合成化学北陸セミナー
  • Place of Presentation: 石川県青少年総合研修センター
• [Presentation] 金基板上に固定化したフェロセンラベル化ペプチドの二次構造とその電気化学応答との関係 (2010)
  • Author(s): 藤原匡志・藤本和久・井上将彦
  • Organizer: 第4回バイオ関連化学シンポジウム
  • Place of Presentation: 大阪大学豊中キャンパス
• [Presentation] ミニチュア化タンパク"としての架橋ヘリカルペプチドとDNAの相互作用 (2010)
  • Author(s): 梶野雅起・藤本和久・井上将彦
  • Organizer: 第4回バイオ関連化学シンポジウム
  • Place of Presentation: 大阪大学豊中キャンパス
• [Presentation] ヘリカルペプチドを用いたペプチド-DNA間相互作用の安定化 (2010)
  • Author(s): 梶野雅起・藤本和久・井上将彦
  • Organizer: ケミカルバイオロジー学会第5回年会
  • Place of Presentation: 慶應義塾大学日吉キャンパス
• [Presentation] 短鎖ヘリカルペプチドとDNAとの相互作用のFRETによる定量解析 (2010)
  • Author(s): 梶野雅起・藤本和久・井上将彦
  • Organizer: 日本化学会第90春季年会
  • Place of Presentation: 近畿大学本部キャンパス
• [Presentation] ジアリールエテンを骨格とする非天然アミノ酸残基をもつ新規光応答性ペプチドの開発 (2010)
  • Author(s): 岡田洋平・藤本和久・井上将彦
  • Organizer: 日本化学会第90春季年会
  • Place of Presentation: 近畿大学本部キャンパス
• [Presentation] フェロセン骨格を有する短鎖ヘリカルペプチドの金基板上への固定化とその電気化学応答 (2010)
  • Author(s): 深澤聡晃・藤本和久・井上将彦
  • Organizer: 日本化学会第90春季年会
  • Place of Presentation: 近畿大学本部キャンパス
• [Presentation] ジアリールエテンを利用したヘリカルペプチド/DNA相互作用の光制御 (2010)
  • Author(s): 藤本和久・梶野雅起・河合博和・井上将彦
  • Organizer: 第12回生命化学研究会
  • Place of Presentation: 芦原温泉清風荘
• [Presentation] ヘリカルペプチドを用いたペプチド-DNA間相互作用の安定化 (2010)
  • Author(s): 梶野雅起, 藤本和久, 井上将彦
  • Organizer: 日本ケミカルバイオロジー学会第5回年会
  • Place of Presentation: 横浜
• [Presentation] ミニチュア化タンパク"としての架橋ヘリカルペプチドとDNAの相互作用 (2010)
  • Author(s): 梶野雅起, 藤本和久, 井上将彦
  • Organizer: 第4回バイオ関連化学シンポジウム
  • Place of Presentation: 豊中
• [Presentation] 金基板上に固定化したフェロセンラベル化ペプチドの二次構造とその電気化学応答との関係 (2010)
  • Author(s): 藤原匡志, 藤本和久, 井上将彦
  • Organizer: 第4回バイオ関連化学シンポジウム
  • Place of Presentation: 豊中
• [Presentation] 金電極上におけるフェロセンラベル化ペプチドのダイナミクスと電気化学応答 (2010)
  • Author(s): 藤原匡志, 藤本和久, 井上将彦
  • Organizer: 平成22年度有機合成化学北陸セミナー
  • Place of Presentation: 金沢
• [Presentation] 短鎖ヘリカルペプチドとDNAとの相互作用のFRETによる定量解析 (2010)
  • Author(s): 梶野雅起・藤本和久・井上将彦
  • Organizer: 日本化学会第90春季年会
  • Place of Presentation: 近畿大学本部キャンパス(東大阪市)
• [Presentation] ジアリールエテンを骨格とする非天然アミノ酸残基をもっ新規光応答性ペプチドの開発 (2010)
  • Author(s): 岡田洋平・藤本和久・井上将彦
  • Organizer: 日本化学会第90春季年会
  • Place of Presentation: 近畿大学本部キャンパス(東大阪市)
• [Presentation] フェロセン骨格を有する短鎖ヘリカルペプチドの金基板上への固定化とその電気化学応答 (2010)
  • Author(s): 深澤聡晃・藤本和久・井上将彦
  • Organizer: 日本化学会第90春季年会
  • Place of Presentation: 近畿大学本部キャンパス(東大阪市)
• [Presentation] ジアリールエテンを利用したヘリカルペプチド/DNA相互作用の光制御 (2010)
  • Author(s): 藤本和久・梶野雅起・河合博和・井上将彦
  • Organizer: 第12回生命化学研究会
  • Place of Presentation: 芦原温泉清風荘(福井県あわら市)
• [Presentation] ジアリールエテンを骨格とする非天然アミノ酸を有するフォトクロミックペプチドの開発 (2009)
  • Author(s): 岡田洋平・藤本和久・井上将彦
  • Organizer: 平成21年度有機合成化学北陸セミナー
  • Place of Presentation: 富山観光ホテル
• [Presentation] クロスリンク剤で架橋したヘリカルペプチドの基板への固定化とその応用 (2009)
  • Author(s): 深澤聡晃・藤本和久・井上将彦
  • Organizer: 平成21年度有機合成化学北陸セミナー
  • Place of Presentation: 富山観光ホテル
• [Presentation] 光応答性DNA結合ペプチドの開発 (2009)
  • Author(s): 河合博和・藤本和久・井上将彦
  • Organizer: 第24回生体機能関連化学シンポジウム
  • Place of Presentation: 九州大学医系キャンパス・百年記念講堂
• [Presentation] 短鎖ヘリカルペプチドとDNAとの相互作用のスペクトル解析 (2009)
  • Author(s): 梶野雅起・藤本和久・井上将彦
  • Organizer: 第24回生体機能関連化学シンポジウム
  • Place of Presentation: 九州大学医系キャンパス・百年記念講堂
• [Presentation] ジアリールエテンで架橋したペプチドの DNA認識能の光制御 (2009)
  • Author(s): 河合博和・藤本和久・井上将彦
  • Organizer: ケミカルバイオロジー学会第4回年会
  • Place of Presentation: 神戸市産業振興センター
• [Presentation] 架橋ヘリカルペプチドの蛍光標識化とその核酸との相互作用の評価 (2009)
  • Author(s): 梶野雅起・藤本和久・井上将彦
  • Organizer: ケミカルバイオロジー学会第4回年会
  • Place of Presentation: 神戸市産業振興センター
• [Presentation] ジアリールエテンを骨格とする非天然アミノ酸を有するフォトクロミックペプチドの開発 (2009)
  • Author(s): 岡田洋平・河合博和・藤本和久・井上将彦
  • Organizer: 平成21年度有機合成化学北陸セミナー
  • Place of Presentation: 富山観光ホテル(富山市)
• [Presentation] クロスリンク剤で架橋したヘリカルペプチドの基板への固定化とその応用 (2009)
  • Author(s): 深澤聡晃・藤本和久・井上将彦
  • Organizer: 平成21年度有機合成化学北陸セミナー
  • Place of Presentation: 富山観光ホテル(富山市)
• [Presentation] 光応答性DNA結合ペプチドの開発 (2009)
  • Author(s): 河合博和・藤本和久・井上将彦
  • Organizer: 第24回生体機能関連化学シンポジウム
  • Place of Presentation: 九州大学医系キャンパス・百年記念講堂(福岡市)
• [Presentation] 短鎖ヘリカルペプチドとDNAとの相互作用のスペクトル解析 (2009)
  • Author(s): 梶野雅起・藤本和久・井上将彦
  • Organizer: 第24回生体機能関連化学シンポジウム
  • Place of Presentation: 九州大学医系キャンパス・百年記念講堂(福岡市)
• [Presentation] 短鎖ヘリカルペプチドとDNAとの相互作用のスペクトル解析 (2009)
  • Author(s): 藤原匡志・藤本和久・井上将彦
  • Organizer: 生体機能関連化学若手の会第21回サマースクール
  • Place of Presentation: 関西セミナーハウス(京都市)
• [Presentation] ジアリールエテンで架橋したペプチドのDNA認識能の光制御 (2009)
  • Author(s): 河合博和・藤本和久・井上将彦
  • Organizer: ケミカルバイオロジー学会第4回年会
  • Place of Presentation: 神戸市産業振興センター(神戸市)
• [Presentation] 架橋ヘリカルペプチドの蛍光標識化とその核酸との相互作用の評価 (2009)
  • Author(s): 梶野雅起・藤本和久・井上将彦
  • Organizer: ケミカルバイオロジー学会第4回年会
  • Place of Presentation: 神戸市産業振興センター(神戸市)
• [Remarks] 研究室ホームページ
  • URL: http://www.pha.u-toyama.ac.jp/yakka/index-j.html
• [Remarks] ReaD研究者情報
  • URL: http://jglobal.jst.go.jp/detail.php?JGLOBAL_ID=200901013658317736&t=1&d=1&q=1000370583
• [Remarks]
  • URL: http://www.pha.u-toyama.ac.jp/yakka/index-j.html
• [Remarks]
  • URL: http://www.pha.u-toyama.ac.jp/yakka/index-j.html