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NMR structural analysis for the whole structure of human general transcription factor, TFIIE.

Research Project

Project/Area Number 21770121
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Structural biochemistry
Research InstitutionYokohama City University

Principal Investigator

OKUDA Masahiko  Yokohama City University, 生命ナノシステム科学研究科, 特任助教 (60448686)

Project Period (FY) 2009 – 2010
Project Status Completed (Fiscal Year 2010)
Budget Amount *help
¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2010: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2009: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
Keywords構造生物学 / 転写 / 遺伝子発現 / 立体構造 / NMR / タンパク質
Research Abstract

This study was the NMR structural analysis for the whole structure of human TFIIE, a member of the general transcription factors, needed for the initiation of transcription for protein coding genes. Human TFIIE is a heterodimer, consisting of an alpha and a beta subunit. Although the tendency to aggregate besides the high molecular weight (~80kDa) made the structural analysis difficult, full use of the latest NMR technologies enabled to gain structural information on three functional domains, identify widely existing intrinsically disordered regions and reveal the dynamics.

Report

(3 results)
  • 2010 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2009 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2010 2009

All Presentation (8 results)

  • [Presentation] NMR STRUCTURE OF A GENERAL TRANSCRIPTION FACTOR TFIIE2010

    • Author(s)
      Y.Nishimura, M.Okuda
    • Organizer
      XXIVth ICMRBS (International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems)
    • Place of Presentation
      ケアンズコンベンションセンター(オーストラリア・ケアンズ)
    • Year and Date
      2010-08-26
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] 転写制御因子、ヒストン修飾因子の構造生物学2010

    • Author(s)
      長土居有隆, 奥田昌彦, 明石知子, 西村善文
    • Organizer
      ターゲットタンパク研究プログラム研究交流会
    • Place of Presentation
      東京国際フォーラム(東京都)
    • Year and Date
      2010-03-05
    • Related Report
      2010 Final Research Report
  • [Presentation] 基本転写因子TFIIEとそれと相互作用するタンパク質群の機能解析2010

    • Author(s)
      田中亜紀, 水田翔子, 奥田昌彦, 西村善文, 大熊芳明
    • Organizer
      ターゲットタンパク研究プログラム研究交流会
    • Place of Presentation
      東京国際フォーラム(東京都)
    • Year and Date
      2010-03-05
    • Related Report
      2010 Final Research Report
  • [Presentation] NMR STRUCTURE OF A GENERAL TRANSCRIPTION FACTOR TFIIE2010

    • Author(s)
      西村善文, 奥田昌彦
    • Organizer
      XXIVth ICMRBS(International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems)
    • Place of Presentation
      ケアンズ、ケアンズコンベンションセンター(オーストラリア)
    • Related Report
      2010 Final Research Report
  • [Presentation] 転写制御因子、ピストン修飾因子の構造生物学2010

    • Author(s)
      長土居有隆, 奥田昌彦, 明石知子, 西村善文
    • Organizer
      ターゲットタンパク研究プログラム基本生命WG班会議
    • Place of Presentation
      新神戸(兵庫県)
    • Related Report
      2010 Final Research Report
  • [Presentation] 基本転写因子TFIIEとそれと相互作用するタンパク質群の機能解析2010

    • Author(s)
      田中亜紀, 水田翔子, 奥田昌彦, 西村善文, 大熊芳明
    • Organizer
      ターゲットタンパク研究プログラム基本生命WG班会議
    • Place of Presentation
      新神戸(兵庫県)
    • Related Report
      2010 Final Research Report
  • [Presentation] ヒト基本転写因子TFIIE alpha 酸性ドメインの動的構造解析2009

    • Author(s)
      小松正史, 奥田昌彦, 長土居有隆, 菅瀬謙治, 西村善文
    • Organizer
      第48回NMR討論会
    • Place of Presentation
      九州大学医学部百年講堂(福岡県)
    • Related Report
      2010 Final Research Report
  • [Presentation] Intrinsically Disordered Transcription related Proteins2009

    • Author(s)
      奥田昌彦, 長土居有隆, 小松正史, 西村善文
    • Organizer
      第3回アジア-太平洋NMRシンポジウム(APNMR)
    • Place of Presentation
      Ramada Plaza Jeju Hotel(韓国)
    • Related Report
      2010 Final Research Report

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Published: 2009-04-01   Modified: 2016-04-21  

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