Analysis of proton permeation mechanism of voltage-gated proton channel

• Project/Area Number: 21770171
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Biophysics
• Research Institution: Osaka University
• Principal Investigator: KUROKAWA Tatsuki 大阪大学, 大学院・医学系研究科, 特任研究員 (40527701)
• Project Period (FY): 2009 – 2010
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2010)
• Budget Amount: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000); Fiscal Year 2010: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000); Fiscal Year 2009: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
• Keywords: 生体膜 / 受容体 / チャネル / イオンチャネル / プロトン

Research Abstract

We performed site-directed cysteine scanning using accessibility of maleimide-reagent (AMS or NEM) as detected by Western blotting. When we examined the accessibility of the S4 by using NEM, we found only 6 inaccessible residues. These results suggest that the S4 segment is lined by water-accessible crevices interrupted by a small hydrophobic region.

Research Products

• [Journal Article] 電位依存性プロトンチャネルに見る膜電位センサーの謎 (2011)
  • Author(s): 黒川竜紀、岡村康司
  • Journal Title: 細胞膜中に存在する電荷生物物理 Volume: Vol 51 Pages: 72-75
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] 電位依存性プロトンチャネルに見る膜電位センサーの謎:細胞膜中に存在する電荷 (2011)
  • Author(s): 黒川竜紀、岡村康司
  • Journal Title: 生物物理 Volume: (印刷中)
  • NAID: 10028105783
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Functionality of the voltage-gated proton channel truncated in S4 (2010)
  • Author(s): Sakata S, Kurokawa T, Norholm MH, Takagi M, Okochi Y, von Heijne G, Okamura Y.
  • Journal Title: Proc. Natl. Acad. Sci. USA. Volume: Vol 107 Pages: 2313-2318
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The cytochrome bcc-aa_3-type respiratory chain of Rhodococcus rhodochrous (2010)
  • Author(s): Kishikawa, J., Kabashima, Y., Kurokawa, T., Sakamoto, J.
  • Journal Title: Journal of Bioscience and Bioengineering Volume: 110 Pages: 42-47
  • NAID: 110007681442
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Functionality of the voltage-gated proton channel truncated in S4. (2010)
  • Author(s): Sakata S, Kurokawa T, Norholm MH, Takagi M, Okochi Y, von Heijne G, Okamura Y.
  • Journal Title: Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 107 Pages: 2313-2318
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Correlation between proton translocation and growth : genetic analysis of the respiratory chain of Corynebacterium glutamicum. (2009)
  • Author(s): Kabashima Y, Kishikawa J, Kurokawa T, Sakamoto J.
  • Journal Title: J. Biochem. 146 Pages: 845-855
  • NAID: 10026305303
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 電位依存性ホスファターゼVSPの基質特異性:PTENとの違い (2011)
  • Author(s): 岡村康司、黒川竜紀、松田真、坂田宗平、本間光一、中川敦史
  • Organizer: 第88回日本生理学会大会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜(神奈川)(招待講演)
  • Year and Date: 2011-03-29
• [Presentation] 構造に基づいた電位感受性ホスファターゼの其質特異性の解析 (2011)
  • Author(s): 黒川竜紀、岡村康司
  • Organizer: 第88回日本生理学会大会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜(神奈川)
  • Year and Date: 2011-03-28
• [Presentation] 電位依存性プロトンチャネルの温度感受性ゲーティングは2量体会合構造安定性により決定する (2011)
  • Author(s): 藤原祐一郎、黒川竜紀、竹下浩平、小林恵、中川敦史、岡村康司
  • Organizer: 第88回日本生理学会大会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜(神奈川)
  • Year and Date: 2011-03-28
• [Presentation] STABILITY OF THE CYTOPLASMIC DIMER ASSEMBLY REGULATES THE THERMOSENSITIVE GATING OF THE VOLTAGE-GATED H^+ CHANNEL (2011)
  • Author(s): 藤原祐一郎、黒川竜紀、竹下浩平、小林恵、中川敦史、岡村康司
  • Organizer: 55th Biophysical society meeting
  • Place of Presentation: Baltimore convention center (USA)(招待講演)
  • Year and Date: 2011-03-08
• [Presentation] 電位依存性プロトンチャネルにおけるS4トポロジー解析 (2010)
  • Author(s): 黒川竜紀、岡村康司
  • Organizer: 生理学研究所研究会
  • Place of Presentation: 岡崎コンファレンスセンター (愛知)(招待講演)
  • Year and Date: 2010-09-16
• [Presentation] 電位依存性プロトンチャネルにおけるS4トポロジー解析 (2010)
  • Author(s): 黒川竜紀、岡村康司
  • Organizer: 生理学研究所研究会
  • Place of Presentation: 岡崎コンファレンスセンター(愛知)(招待講演)
  • Year and Date: 2010-09-16
• [Presentation] 電位依存性プロトンチャネルVSOPのトポロジー解析 (2010)
  • Author(s): 黒川竜紀、岡村康司
  • Organizer: Neuro2010(第33回日本神経科学大会、第53回日本神経化学会大会、第20回日本神経回路学会大会合同大会)
  • Place of Presentation: 神戸コンベンションセンター(兵庫)
  • Year and Date: 2010-09-02
• [Presentation] 電位感受性ホスファターゼの動作原理と役割 (2010)
  • Author(s): 岡村康司、黒川竜紀、坂田宗平、平郁子、大河内善史、山口真二、小笠原道生、本間光一
  • Organizer: 第87回日本生理学会大会
  • Place of Presentation: 盛岡市民文化ホール(岩手)(招待講演)
  • Year and Date: 2010-05-21
• [Presentation] 電位依存性プロトンチャネルにおけるS4のトポロジー解析 (2010)
  • Author(s): 黒川竜紀、岡村康司
  • Organizer: 第87回日本生理学会大会
  • Place of Presentation: 盛岡市民文化ホール(岩手)(招待講演)
  • Year and Date: 2010-05-20
• [Presentation] The role of C-terminal cytoplasmic regions in dimerization of voltage-gated proton channel (2009)
  • Author(s): Tatsuki Kurokawa, Yoshifumi Okochi, Yasushi Okamura
  • Organizer: 36th International congress of physiological Sciences
  • Place of Presentation: 京都国際会館(京都府)
  • Year and Date: 2009-07-30
• [Presentation] The role of C-terminal cytoplasmic regions in dimerization of voltage-gated proton channel (2009)
  • Author(s): Tatsuki Kurokawa, Yoshifumi Okochi, Yasushi Okamura
  • Organizer: 36th International congress of physiological sciences
  • Place of Presentation: 京都国際会館(京都府)
  • Year and Date: 2009-07-30
• [Remarks]
  • URL: http://www.med.osaka-u.ac.jp/pub/phys2/okamura/index.html
• [Remarks]
  • URL: http://www.med.osaka-u.ac.jp/pub/phys2/okamura/index.html
• [Remarks]
  • URL: http://www.med.osaka-u.ac.jp/pub/phys2/tougouseiri/menu.htm