Effect of hydration and cavity on protein dynamics studied by neutron scattering and simulation

• Project/Area Number: 21770178
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Biophysics
• Research Institution: Japan Atomic Energy Agency
• Principal Investigator: NAKAGAWA Hiroshi Japan Atomic Energy Agency, 量子ビーム応用研究部門, 研究員 (20379598)
• Project Period (FY): 2009 – 2010
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2010)
• Budget Amount: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000); Fiscal Year 2010: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000); Fiscal Year 2009: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
• Keywords: タンパク質 / 中性子 / シミュレーション / ダイナミクス / 生物物理 / 蛋白質

Research Abstract

It was demonstrated that the protein internal dynamics is coupled with the dynamics of hydration water on protein surface and cavity in protein structure. This study will contribute not only bioscience but also food science because the decay of food is related with water and there is food processing by high pressure.

Research Products

• [Journal Article] 中性子非弾性散乱による生体高分子ダイナミックスの研究 (2011)
  • Author(s): 中川洋
  • Journal Title: 高分子 Volume: 60 Pages: 195-196
  • NAID: 10027971886
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Percolation of Hydration Water as a Control of Protein Dynamics (2010)
  • Author(s): H.Nakagawa, M.Kataoka
  • Journal Title: Journal of Physical Society of Japan 79 Pages: 83801-83801
  • NAID: 40017245105
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Percolation of Hydration Water as a Control of Protein Dynamics (2010)
  • Author(s): H.Nakagawa
  • Journal Title: Journal of Physical Society of Japan Volume: 79
  • NAID: 40017245105
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Effect of conformational states on protein dynamical transition (2010)
  • Author(s): 中川洋
  • Journal Title: Biochimica et Biophysica Acta. 1804 Pages: 27-33
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] 中性子非弾性散乱法で観るタンパク質ダイナミクスに対する水和の影響 (2010)
  • Author(s): 中川洋
  • Journal Title: 中性子産業利用推進協議会季報「四季」 6 Pages: 3-3
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] 中性子非弾性散乱法で観るタンパク質ダイナミクスの水和効果 (2009)
  • Author(s): 中川洋
  • Journal Title: 生物物理 49 Pages: 306-307
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] 非干渉性中性子非弾性散乱で観るタンパク質ダイナミクスの水和効果 (2009)
  • Author(s): 中川洋
  • Journal Title: 波紋 19 Pages: 91-94
  • NAID: 130006701975
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Effect of conformational states on protein dynamical transition (2008)
  • Author(s): H.Nakagawa, H.Kamikubo, M.Kataoka
  • Journal Title: Biochimica et Biophysca Acta 1804 Pages: 27-33
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 天然変性タンパク質の折り畳みに伴う水和状態と構造揺らぎの変化 (2011)
  • Author(s): 中川洋
  • Organizer: 新学術領域研究「天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現」平成22年度第一回領域会議
  • Place of Presentation: 大山
  • Year and Date: 2011-05-28
• [Presentation] Dynamics of protein and hydration water studied by inelastic neutron scattering (2011)
  • Author(s): 中川洋
  • Organizer: 茨城大学学術講演会-中性子構造生物学およびタンパク質水和構造に関するシンポジウム-
  • Place of Presentation: 東海
  • Year and Date: 2011-03-03
• [Presentation] 中性子非弾性散乱を用いたタンパク質ダイナミクスの研究 (2011)
  • Author(s): 中川洋
  • Organizer: 東北大学多元物質科学研究所若手交流講演会-新機能性物質の最先端研究とワークバランス-
  • Place of Presentation: 仙台
  • Year and Date: 2011-02-25
• [Presentation] Dynamics and hydration of intrinsically disordered protein studied by inelastic neutron scattering. (2011)
  • Author(s): 中川洋
  • Organizer: 第1回ISIDP国際シンポジウム
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2011-01-27
• [Presentation] Dynamics and hydration of intrinsically disordered protein studied by inelastic neutron scattering (2011)
  • Author(s): 中川洋
  • Organizer: 第1回ISIDP国際シンポジウム
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2011-01-27
• [Presentation] Expectation to detect correlated dynamics in protein (2011)
  • Author(s): 中川洋, 他
  • Organizer: nDDB Discussion Meeting
  • Place of Presentation: グルノーブル(フランス)
  • Year and Date: 2011-01-10
• [Presentation] 中性子非弾性散乱によるタンパク質の揺らぎと水和水ダイナミクスの研究 (2010)
  • Author(s): 中川洋
  • Organizer: 日本中性子科学会第10回年会
  • Place of Presentation: 仙台
  • Year and Date: 2010-12-09
• [Presentation] 中性子非弾性散乱法による水和したタンパク質の動的構造解析 (2010)
  • Author(s): 中川洋
  • Organizer: 学術振興会169委員会第33回研究会
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2010-11-24
• [Presentation] 中性子非弾性散乱による生体物質ダイナミクス研究 (2010)
  • Author(s): 中川洋
  • Organizer: J-PARC MLF BL01+BL14研究会
  • Place of Presentation: 東海
  • Year and Date: 2010-10-29
• [Presentation] 中性子非弾性散乱によるタンパク質と水和水のダイナミクス研究 (2010)
  • Author(s): 中川洋
  • Organizer: 力学と統計力学のはざま-生体高分子における情報伝達・エネルギー輸送・変換の素過程に潜む不可思議さ-
  • Place of Presentation: 草津
  • Year and Date: 2010-09-25
• [Presentation] 中性子非弾性散乱と分子動力学によるタンパク質の揺らぎと水和水ダイナミクスの研究 (2010)
  • Author(s): 中川洋, 他
  • Organizer: 日本物理学会2010年秋季大会
  • Place of Presentation: 大阪
  • Year and Date: 2010-09-23
• [Presentation] Dynamics of Biomolecules by Neutron Inelastic Scattering (2010)
  • Author(s): 中川洋
  • Organizer: 第48回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: 仙台
  • Year and Date: 2010-09-20
• [Presentation] Dynamics of Biomolecules by Neutron Inelastic Scattering (2010)
  • Author(s): 中川洋
  • Organizer: 第48回日本生物物理学会
  • Place of Presentation: 仙台
  • Year and Date: 2010-09-20
• [Presentation] 中性子非弾性散乱実験と分子動力学シミュレーションによるタンパク質ダイナミクスに対する水和効果の研究 (2010)
  • Author(s): 中川洋
  • Organizer: 第29回タンパク質・核酸構造理論勉強会
  • Place of Presentation: つくば
  • Year and Date: 2010-07-09
• [Presentation] Dynamics of biomolecule and its hydration water studied by neutron scattering (2010)
  • Author(s): 中川洋
  • Organizer: 岡山大学次世代研究者・異分野研究連携育成支援事業主催シンポジウム「エネルギー貯蔵材料の最前線」
  • Place of Presentation: 岡山
  • Year and Date: 2010-05-29
• [Presentation] 中性子非弾性散乱によるタンパク質ダイナミクス研究 (2010)
  • Author(s): 中川洋
  • Organizer: 第1回MLFシンポジウム
  • Place of Presentation: 東海
  • Year and Date: 2010-03-29
• [Presentation] 中性子非弾性散乱によるタンパク質の低エネルギーダイナミクスに対する水和効果 (2010)
  • Author(s): 中川洋, 他
  • Organizer: 日本物理学会第65回年次大会
  • Place of Presentation: 岡山
  • Year and Date: 2010-03-10
• [Presentation] タンパク質ダイナミクスの調和運動と非調和運動に対する水和効果 (2009)
  • Author(s): 中川洋, 他
  • Organizer: 第9回日本中性子科学会年会
  • Place of Presentation: 東海
  • Year and Date: 2009-12-09
• [Presentation] タンパク質ダイナミクスの調和運動と非調和運動に対する水和効果 (2009)
  • Author(s): 中川洋
  • Organizer: 第9回日本中性子科学会
  • Place of Presentation: 東海
  • Year and Date: 2009-12-09
• [Presentation] Hydration affects both harmonic and anharmonic nature of protein dynamics (2009)
  • Author(s): 中川洋, 他
  • Organizer: 第47回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: 徳島
  • Year and Date: 2009-10-30
• [Presentation] Hydration affects both harmonic and anharmonic nature of protein dynamics (2009)
  • Author(s): 中川洋
  • Organizer: 第47回日本生物物理学会
  • Place of Presentation: 徳島
  • Year and Date: 2009-10-30
• [Presentation] 中性子非弾性散乱法によるタンパク質ダイナミクスの研究 (2009)
  • Author(s): 中川洋
  • Organizer: 拡大IRT研究会
  • Place of Presentation: 東海
  • Year and Date: 2009-08-05
• [Presentation] 中性子線利用の基礎講座 (2009)
  • Author(s): 中川洋
  • Organizer: 第38回繊維応用技術研究会
  • Place of Presentation: 大阪
  • Year and Date: 2009-07-30
• [Presentation] 中性子散乱法で観るタンパク質と水界面の構造と揺らぎ～J-PARCへの期待 (2009)
  • Author(s): 中川洋
  • Organizer: 第27回関西界面科学セミナー
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 2009-07-24
• [Book] Water, The Forgotten Biological Molecule (2011)
  • Author(s): Kataoka M., Nakagawa H.
  • Publisher: Pan Stanford Publishing
• [Book] Neutrons in Soft Matter, John Wiley (2011)
  • Author(s): Kataoka M., Nakagawa H.
• [Book] Water, The Forgotten Biological Molecule (2011)
  • Author(s): H.Nakagawa(M.Kataoka)
  • Publisher: Pan Stanford Publishing
• [Book] Neutrons in Soft Matter (2011)
  • Author(s): H.Nakagawa(M.Kataoka)
  • Publisher: John Wiley
• [Remarks]
  • URL: http://www.jaea.go.jp/02/press2010/p10072801/index.html