Identification of the biosynthetic genes for antifungal drugMicafungin by ATMT.

• Project/Area Number: 21780079
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Applied microbiology
• Research Institution: Toyama Prefectural University
• Principal Investigator: YAMADA Masato 富山県立大学, 工学部, 助教 (40448692)
• Project Period (FY): 2009 – 2011
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2011)
• Budget Amount: ¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000); Fiscal Year 2011: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000); Fiscal Year 2010: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000); Fiscal Year 2009: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
• Keywords: ミカファンギン / FR901379 / Coleophoma empetri / ATMT / NRPS / 変異解析 / 抗生物質 / スクリーニング

Research Abstract

T-DNA insertional mutagenesis by Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation (ATMT) and whole genomic DNA sequencing analysis with next generation sequencer for FR901379 producing fungus Coleophoma empetri F-11899 derived putative biosynthetic gene cluster encoding FR9013797. However, the region of gene cluster of FR901379 was so huge and containing various coding genes such as unknown function and oxidoreductases, that it was difficult to speculate the pathway for FR901379 biosynthesis without proof of each gene disruption.

Research Products

• [Journal Article] Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation of antifungal lipopeptide producing fungus Coleophoma empetri F-11899 (2009)
  • Author(s): Yamada M, Yawata K, Orino Y, Ueda S, Isogai Y, Taguchi G, Shimosaka M, Hashimoto S
  • Journal Title: Current Genetics Volume: 55 Pages: 623-630
  • URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=19876630
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation of antifungal lipopeptide producing fungus Coleophoma empetri F-11899. (2009)
  • Author(s): Yamada M, Yawata K, Orino Y, Ueda S, Isogai Y, Taguchi G, Shimosaka M, Hashimoto S.
  • Journal Title: Current Genetics 55 Pages: 623-630
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 糸状菌Coleophoma empetri F-11899における異種発現のためのgpdプロモーターの単離 (2011)
  • Author(s): 浅井 剛久、山田 雅人、上田 聡、磯貝 泰弘、橋本 正治
  • Organizer: 2011年度(平成23年度)日本農芸化学会
  • Place of Presentation: 京都女子大学(京都)
  • Year and Date: 2011-03-27
• [Presentation] 糸状菌Coleophoma empetri F-11899における2種の次世代シーケンサーを用いたゲノムアセンブル配列の比較 (2011)
  • Author(s): 中谷和也、山田雅人、織野陽介、磯貝泰弘、橋本正治
  • Organizer: 第11回糸状菌分子生物学コンファレンス
  • Place of Presentation: 東京大学弥生講堂(東京)
• [Presentation] 糸状菌Coleophoma empetri F-11899のFR901379非生産株のT-DNA挿入変異箇所の解析 (2011)
  • Author(s): 境井千佳子、山田雅人、織野陽介、磯貝泰弘、橋本正治
  • Organizer: 第11回糸状菌分子生物学コンファレンス
  • Place of Presentation: 東京大学弥生講堂(東京)
• [Presentation] 糸状菌Coleophoma empetri F-11899のFR901379非生産株のT-DNA挿入変異箇所の解析 (2011)
  • Author(s): 境井千佳子、山田雅人、織野陽介、磯貝泰弘、橋本正治
  • Organizer: 第11回糸状菌分子生物学コンファレンス
  • Place of Presentation: 東京大学弥生講堂
• [Presentation] 糸状菌Coleophoma empetri F-11899における2種の次世代シーケンサーを用いたゲノムアセンブル配列の比較 (2011)
  • Author(s): 中谷和也、山田雅人、織野陽介、磯貝泰弘、橋本正治
  • Organizer: 第11回糸状菌分子生物学コンファレンス
  • Place of Presentation: 東京大学弥生講堂
• [Presentation] 糸状菌Coleophoma empetri F-11899における異種タンパク質発現用プロモーターの検討 (2010)
  • Author(s): 浅井 剛久、山田 雅人、磯貝 泰弘、橋本 正治
  • Organizer: 2010年度(平成22年度)日本生物工学会
  • Place of Presentation: ワールドコンベンションセンターサミット宮崎シーガイア(宮崎)
  • Year and Date: 2010-10-29
• [Presentation] ミカファンギン原体生産糸状菌Coleophoma empetri F-11899のATMT変異株ライブラリーの作製とFR901379非生産株の単離 (2010)
  • Author(s): 山田 雅人、織野 陽介、境井 千佳子、磯貝 泰弘、橋本 正治
  • Organizer: 2010年度(平成22年度)日本農芸化学会
  • Place of Presentation: 東京大学駒場キャンパス(東京)
  • Year and Date: 2010-03-30
• [Presentation] ミカファンギン原体生産糸状菌Coleophoma empetri F-11899のATMT変異株ライブラリーの作製とFR301379非生物産株の単離 (2010)
  • Author(s): ○山田雅人、織野陽介、境井千佳子、磯貝泰弘、橋本正治
  • Organizer: 2010年度(平成22年度)日本農芸化学会
  • Place of Presentation: 東京大学駒場キャンパス(東京都)
  • Year and Date: 2010-03-30
• [Presentation] Coleophoma empetriのATMT変異株ライブラリーの作製とミカファンギン原体生合成遺伝子の単離 (2009)
  • Author(s): 山田雅人、織野陽介、磯貝泰弘、橋本正治
  • Organizer: 石川富山福井県大合同シンポジウム
  • Place of Presentation: あわらおんせん越路(福井)
  • Year and Date: 2009-12-18
• [Presentation] Coleophoma empetriのATMT変異株ライブラリーの作製とミカファンギン原体生合遺伝子の単離 (2009)
  • Author(s): ○山田雅人、織野陽介、磯貝泰弘、橋本正治
  • Organizer: 石川富山福井県大合同シンポジウム
  • Place of Presentation: あわらおんせん越路(福井県)
  • Year and Date: 2009-12-18
• [Presentation] Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation as a tool for genomics in an industrially important fungus (2009)
  • Author(s): Yamada M, Yawata K, Hashimoto S, Shimosaka M
  • Organizer: The Society for Industrial Microbiology, The Annual Meeting and Exhibition 2009
  • Place of Presentation: WESTIN Harbour Hotel, (Toronto, Canada)
  • Year and Date: 2009-07-27
• [Presentation] Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation as a tool for genomics in an industrially important fungus. (2009)
  • Author(s): ○Yamada M, Yawata K, Hashimoto S, Shimosaka M
  • Organizer: The Society for Industrial Microbiology, The Annual Meeting and Exhibition 2009
  • Place of Presentation: WESTIN Harbour Hotel (Toronto, Canada)
  • Year and Date: 2009-07-27