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Functional mechanisms of branched chain polyamines in thermophiles

Research Project

Project/Area Number 21H02112
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Basic Section 38020:Applied microbiology-related
Research InstitutionKwansei Gakuin University

Principal Investigator

Fujiwara Shinsuke  関西学院大学, 生命環境学部, 教授 (90263219)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 福田 青郎  関西学院大学, 生命環境学部, 研究員 (30421283)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥17,160,000 (Direct Cost: ¥13,200,000、Indirect Cost: ¥3,960,000)
Fiscal Year 2023: ¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2022: ¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000)
Fiscal Year 2021: ¥8,060,000 (Direct Cost: ¥6,200,000、Indirect Cost: ¥1,860,000)
Keywordsアーキア / ポリアミン / 超好熱菌 / 遺伝子発現制御
Outline of Research at the Start

スペルミジンやスペルミンに代表されるポリアミンは、複数のアミノ基をもつ脂肪族炭化水素の塩基性分子である。中でも分岐鎖ポリアミンは、高温で生育する超好熱菌特有の分子である。本研究では、分岐鎖ポリアミンによって、遺伝子の発現が支配される被制御遺伝子の探索を行い、制御因子としての分岐鎖ポリアミンの可能性を調べ、作用機序の解明を目指す。また、分岐鎖ポリアミンのアセチル化を触媒する酵素についても探索も行い、アセチル体の細胞内での機能を考える。分岐鎖ポリアミン、及びそのアセチル体が、DNA構造へ与える影響を分光学的手法により検証し、超好熱菌の分岐鎖ポリアミンが司る生命ダイナミクスについて考察する。

Outline of Final Research Achievements

Hyperthermophiles possess branched-chain polyamines (BCPAs). In this study, the biological role of BCPA was analyzed using Thermococcus kodakarensis. In the cytoplasm of T. kodakarensis, BCPA is detected in chromosomal DNA and the membrane fraction, particularly in stationary-phase cells. BCPA appears to be crucial for survival under environmental stress, as BCPA-deficient mutants did not survive repeated cooling stress. The expression of several genes, including the hydrogenase gene hyhL, was repressed in the mutant strain, indicating that hyhL expression is regulated at the post-transcriptional level. The highly positive charge properties of BCPA were also investigated, and BCPA-immobilized micro- and nano-beads were constructed. BCPA magnetic micro-beads efficiently recovered nucleic acids, and BCPA-immobilized gold nanoparticles exhibited significant antibacterial activity against Gram-positive bacteria.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

超好熱菌は、生命の起源に最も近い現存生物と考えられている。超好熱菌のみが有する分岐鎖ポリアミンの機能解明は、生命誕生の仕組みを考える上でも意義深い。本研究はThermococcus kodakarensisを用い、分岐鎖ポリアミンを合成できない変異株を構築し、野生株と比較することで、本分子が温度変化の激しい環境で生き残るために必須の成分であることを明らかにした。また、分岐鎖ポリアミンは、核酸への親和性が高く、その固定化磁気ビーズは核酸回収に利用でき、グラム陽性菌に抗菌性を示すとともに枯草菌胞子の発芽も抑制した。極度な塩基性と特殊な構造を持つ分岐鎖ポリアミンには様々な利用性があることが示された。

Report

(3 results)
  • 2023 Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Annual Research Report
  • Research Products

    (23 results)

All 2023 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 2 results) Presentation (18 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] 国立台湾海洋大学(中国)

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      Journal of Bioscience and Bioengineering

      Volume: 135 Issue: 4 Pages: 282-290

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      Applied and Environmental Microbiology

      Volume: 88 Issue: 21 Pages: 1-11

    • DOI

      10.1128/aem.01153-22

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      Catalysts

      Volume: 12 Issue: 5 Pages: 567-567

    • DOI

      10.3390/catal12050567

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    • Journal Title

      Molecular Biology Reports

      Volume: 49 Issue: 4 Pages: 2847-2856

    • DOI

      10.1007/s11033-021-07098-y

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Published: 2021-04-28   Modified: 2025-01-30  

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