医薬品骨格含有新規天然物群の生合成機構解明および改変による薬用活性化合物の創出
Project/Area Number |
21H02636
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Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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Allocation Type | Single-year Grants |
Section | 一般 |
Review Section |
Basic Section 47050:Environmental and natural pharmaceutical resources-related
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Research Institution | Institute of Physical and Chemical Research (2022-2023) The University of Tokyo (2021) |
Principal Investigator |
淡川 孝義 国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, チームリーダー (80609834)
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Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2025-03-31
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Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
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Budget Amount *help |
¥17,160,000 (Direct Cost: ¥13,200,000、Indirect Cost: ¥3,960,000)
Fiscal Year 2023: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2022: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2021: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
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Keywords | 医薬品化合物 / 合成生物学 / 酵素工学 / 補酵素 / 二次代謝酵素 / 精密機能解析 / NAD / SAM / 生合成酵素 / 創薬シード |
Outline of Research at the Start |
新規天然物グループアルテミシジンの生合成機構を解明し、そのエンジニアリングによって、抗腫瘍活性を持つ新規な活性化合物を合成する。本研究により補酵素由来の新規天然物群の生合成機構を明らかにし、その利用による新規創薬シード合成基盤を構築する。
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Outline of Annual Research Achievements |
天然由来抗がん化合物アルテミシジンの骨格合成に関わる鍵酵素SbzPは、補酵素NADを基質として受け入れる、世界初の新規酵素であり、その触媒メカニズム、基質特異性は、極めて興味深い。また、そのホモログは100を超える微生物に保存されており、それぞれ異なる二次代謝酵素と遺伝子クラスターを組んでおり、その二次代謝生産ポテンシャルは極めて高いと言える。SbzPのクライオ電子顕微鏡解析による構造解析を最適化し、その基質複合体構造を取得し、その構造基盤を明らかにした。さらに変異導入による基質の消費や反応変化をストップトフローやUVスペクトル解析によって検出し、NADを基質として受け入れる酵素の触媒機能の詳細を明らかにしつつある。また、スルホンアミド転移、アミノアシル結合形成に関わるわるGNAT型アシル基転移酵素SbzIのキャリアープロテインとの複合体X線結晶構造に成功し、その機能解明を行っている。また、本生合成機構に存在するデアデノシルリボシル化酵素SbzNHOのアポ体X線結晶構造を取得し、現在、その詳細な機能解明を行っている。さらに、放線菌Streptomyces rishiriensisに存在するacyl-tRNA synthetase様アシル基転移酵素SbzAホモログの活性試験に成功し、本酵素についてX線結晶構造解析、クライオ電子顕微鏡解析による機能解析の条件検討を行っている。現在、他のゲノム中に存在する、SbzP、SbzI、SbzAホモログをコードする遺伝子クラスター異種発現系の構築を進めている。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
SbzP, SbzA, SbzIそれぞれの酵素の構造解析は進んでおり、順調と言えるが、酵素ホモログの異種発現は思うように進行しておらず、活性化合物の構造多様化、新規化合物の取得には至っておらず、物質生産の観点ではやや遅れている。
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Strategy for Future Research Activity |
SbzPとそのホモログ、修飾酵素の遺伝子の異種発現にはこれまでとは異なり、より広い遺伝子領域をBACやcosmidベクターを用いて導入を行う。遺伝子の異種発現だけでなく、野生型細菌の遺伝子操作、人工基質、酵素への変異導入によって、遺伝子発現を行い、新たな物質生産系の構築を進める。そのために、CRISPR等迅速な遺伝子配列改変の手法を整える。
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Report
(2 results)
Research Products
(50 results)
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[Journal Article] Genomic and Spectroscopic Signature-Based Discovery of Natural Macrolactams2023
Author(s)
Shin Yern-Hyerk、Im Ji Hyeon、Kang Ilnam、Kim Eunji、Jang Sung Chul、Cho Eunji、Shin Daniel、Hwang Sunghoon、Du Young Eun、Huynh Thanh-Hau、Ko Keebeom、Ko Yoon-Joo、Nam Sang-Jip、Awakawa Takayoshi、Lee Jeeyeon、Hong Suckchang、Abe Ikuro、Moore Bradley S.、Fenical William、Yoon Yeo Joon、Cho Jang-Cheon、Oh Dong-Chan
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Journal Title
Journal of the American Chemical Society
Volume: 145
Issue: 3
Pages: 1886-1896
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Book] 薬学雑誌2022
Author(s)
淡川 孝義
Total Pages
7
Publisher
公益社団法人 日本薬学会
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