| Project/Area Number |
21H02888
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 52050:Embryonic medicine and pediatrics-related
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| Research Institution | National Cardiovascular Center Research Institute |
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Principal Investigator |
Ohno Seiko 国立研究開発法人国立循環器病研究センター, オープンイノベーションセンター, 部長 (20610025)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
ZANKOV DimitarP 国立研究開発法人国立循環器病研究センター, オープンイノベーションセンター, 室長 (20631295)
牧山 武 京都大学, 医学研究科, 講師 (30528302)
相庭 武司 国立研究開発法人国立循環器病研究センター, 病院, 部長 (40574348)
福山 恵 滋賀医科大学, 医学部, 助教 (60625771)
加藤 浩一 滋賀医科大学, 医学部, 助教 (70736983)
園田 桂子 国立研究開発法人国立循環器病研究センター, オープンイノベーションセンター, 上級研究員 (90824417)
高山 幸一郎 国立研究開発法人国立循環器病研究センター, 研究所, リサーチフェロー (20816988)
Wang Qi 国立研究開発法人国立循環器病研究センター, 研究所, リサーチフェロー (70756767)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2024)
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| Budget Amount *help |
¥17,810,000 (Direct Cost: ¥13,700,000、Indirect Cost: ¥4,110,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,990,000 (Direct Cost: ¥2,300,000、Indirect Cost: ¥690,000)
Fiscal Year 2022: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2021: ¥10,270,000 (Direct Cost: ¥7,900,000、Indirect Cost: ¥2,370,000)
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| Keywords | ゲノム構造多型 / ロングリードシークエンサー / RYR2 / 遺伝性不整脈 / ゲノムDNA構造異常 / long read sequencer / DNA構造異常 / DNA構造多型 |
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| Outline of Research at the Start |
遺伝性不整脈は若年者突然死の原因となる疾患であり、これまでの研究で疾患の原因となる遺伝子および遺伝子変異が同定されてきた。しかし未だ変異が同定されていない症例がある。その原因として、これまでのシークエンサーでは同定困難な変異、つまりDNA構造多型が考えられている。本研究では、DNA構造多型の検出可能なシークエンサーを用い、遺伝性不整脈患者に対するスクリーニングを実施する。さらにiPS由来心筋細胞を用い、同定された構造多型がどのように疾患発症に関与しているのか、研究を行う。
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| Outline of Final Research Achievements |
In this study, we aim to elucidate the genetic background of hereditary cardiovascular diseases and analyze their functions. First, we extracted patients with suspected structural variants (SV) using a short-read sequencer. We also performed LRS analysis on patients in which the insertion sites were difficult to identify due to duplication. As a result, tandem repeats were identified in two families. Using probe capture methods, we established a targeted sequencing method to capture and analyze the entire RYR2 region by LRS. In addition, we determined the zygosity of variants in ARVC caused by multiple variants of DSG2 by using LRS.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
未だ遺伝的背景が解明されていない遺伝性疾患の原因の1つにゲノム構造異常 (structural variant, SV) が挙げられる。SVの同定にはロングリードシークエンサー (LRS) が有用であり、我々はその活用法につき検討してきた。LRSはSVの同定のみならず、compound heteroにおけるzygosity (どちらのアレルにvariantがあるか) の確定にも有用であった。今後LRSを用いた、さらなる遺伝性疾患の病態解明が進み、有効な治療法の開発に結びつくことが期待される。
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