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Research and development of monoclonal antibodies that can strictly distinguish Flavi viruses

Research Project

Project/Area Number 21H02971
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Basic Section 54030:Infectious disease medicine-related
Research InstitutionHigh Energy Accelerator Research Organization

Principal Investigator

KATO Ryuichi  大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所, 准教授 (50240833)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 小澤 龍彦  富山大学, 学術研究部医学系, 准教授 (10432105)
宮下 尚之  近畿大学, 生物理工学部, 准教授 (20452162)
正木 秀幸  近畿大学, 生物理工学部, 准教授 (90247982)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥17,420,000 (Direct Cost: ¥13,400,000、Indirect Cost: ¥4,020,000)
Fiscal Year 2023: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000)
Fiscal Year 2022: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
Fiscal Year 2021: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Keywordsフラビウイルス / 中和抗体 / X線結晶構造解析 / MDシミュレーション / モノクローナル抗体 / 中和活性
Outline of Research at the Start

X線結晶構造解析、分子動力学(MD)シミュレーション、レポーターウイルス粒子(RVPs)を用いた中和活性測定、などを駆使し、ウエストナイルウイルス (WNV), 日本脳炎ウイルス (JEV), 黄熱ウイルス (YFV), デングウイルス (DENV) の各Eタンパク質と結合する抗体の開発と構造機能解析を行う。

Outline of Final Research Achievements

Based on the X-ray crystal structure of the complex between the West Nile virus (WNV) envelope protein (E protein) and the monoclonal antibody WN_83 that we determined, we carried out the crystal structure analysis of the complex between the E proteins of Japanese encephalitis virus (JEV), Yellow fever virus, and Zika virus, which belong to the Flaviviridae family, and WN_83. We established overexpression and purification procedure of them, confirmed to obtain the complexes, and crystallization. We also performed a model simulation of the interactions between WN_83 and full-length E proteins (WNV and JEV) based on the complex structure of WN_83 and WNV E protein (domain 3), and discussed the molecular mechanism of the interaction.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

WN_83と各種フラビウイルスのEタンパク質との複合体の結晶構造解析は完了しなかったが、それぞれのタンパク質の大量発現および精製系を構築することができたことは、今後の当分野の発展に寄与すると思われる。WN_83とWNVおよびJEVのEタンパク質全体構造についてモデルシュミレーションを行い、その相互作用の違いを見出した。さらに、抗体分子結合によるウイルス粒子全体構造のシミュレーションについての先進的な研究を開始した。これらの知見は、今後の当分野の発展に寄与すると共に、ウイルスという巨大分子を対象とするシミュレーションという新分野の今後の発展が期待される。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Annual Research Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2024 2023 2022 2021

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Rapid and efficient generation of T-cell receptor-like antibodies using chip-based single-cell analysis.2021

    • Author(s)
      Ozawa T, Kobayashi E, Hamana H, Nakamura T, Lyu F, Hayashi A, Muraguchi A, Kishi H
    • Journal Title

      Eur. J. Immunol.

      Volume: in press Issue: 7 Pages: 1850-1853

    • DOI

      10.1002/eji.202049083

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 乳酸菌を用いたジカウイルスに対する経口粘膜ワクチン開発の検討2024

    • Author(s)
      川﨑淳矢、西埜菜津紀、阪上仁頌、正木秀幸、芦田 久
    • Organizer
      2024年度日本農芸化学会大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Molecular Dynamics simulation of the complex of the multiple distinctive structurral regions in the WNV envelope and humanmonoclonal antibody2024

    • Author(s)
      Masahito Yoshikawa, Hideyuki Masaki, Ryuuichi Kato, Tatsuhiko Ozawa, Naoyuki Miyashita
    • Organizer
      21st IUPAB Congress 2024 (IUPAB2024)
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] MDシミュレーションを用いたWNVエンベロープ蛋白質部分モデルと中和ヒトモノクロナール抗体との相互作用に関する研究2023

    • Author(s)
      吉川誠仁, 加藤龍一, 小澤龍彦, 正木秀幸, 宮下尚之
    • Organizer
      第29回トガ・フラビ・ペスチウイルス研究会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 高エネ機構における結晶化の自動化の最新状況2023

    • Author(s)
      加藤龍一
    • Organizer
      iBIX-JAXA-KEK物構研-QST合同タンパク質研究会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 構造生物学研究センターにおける結晶化の自動化2022

    • Author(s)
      加藤龍一
    • Organizer
      量子ビームサイエンスフェスタ
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] モノクローナル抗体の迅速作製と創薬への応用2022

    • Author(s)
      小澤龍彦
    • Organizer
      熊本大学 第27回遺伝子実験施設セミナー
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 経口粘膜ワクチン開発に向けたジカウイルスエンベロープ蛋白質発現酵母菌株の樹立2021

    • Author(s)
      坂口久峻、辻 彩花、東 慶直、正木秀幸、加藤暢宏
    • Organizer
      第60回日本生体医工学会大会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 富山大学における抗体作製支援の取り組みーマラリア抗体やスーパー中和抗体など2021

    • Author(s)
      小澤龍彦
    • Organizer
      令和3年度BINDS公開シンポジウム
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      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Recognition mechanism of a monoclonal antibody which neutralizes different species of flavivirus2021

    • Author(s)
      Kobayashi J, Ozawa T, Masaki H, Kato R
    • Organizer
      第21回日本蛋白質科学会年会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report

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Published: 2021-04-28   Modified: 2025-01-30  

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