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白色腐朽菌―細菌複合微生物系構築による木材腐朽機構の完全解明

Research Project

Project/Area Number 21H04740
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Medium-sized Section 40:Forestry and forest products science, applied aquatic science, and related fields
Research InstitutionUniversity of Miyazaki

Principal Investigator

亀井 一郎  宮崎大学, 農学部, 教授 (90526526)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 堤 祐司  九州大学, 農学研究院, 教授 (30236921)
上村 直史  長岡技術科学大学, 工学研究科, 准教授 (50646528)
Project Period (FY) 2021-04-05 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥42,120,000 (Direct Cost: ¥32,400,000、Indirect Cost: ¥9,720,000)
Fiscal Year 2024: ¥9,360,000 (Direct Cost: ¥7,200,000、Indirect Cost: ¥2,160,000)
Fiscal Year 2023: ¥9,360,000 (Direct Cost: ¥7,200,000、Indirect Cost: ¥2,160,000)
Fiscal Year 2022: ¥9,360,000 (Direct Cost: ¥7,200,000、Indirect Cost: ¥2,160,000)
Fiscal Year 2021: ¥14,040,000 (Direct Cost: ¥10,800,000、Indirect Cost: ¥3,240,000)
Keywords白色腐朽菌 / 複合微生物系 / 微生物間相互作用 / リグニン / 木材腐朽 / バイオリファイナリー / 複合微生物 / 共存細菌 / マンガンペルオキシダーゼ / 細菌
Outline of Research at the Start

本研究では、複合微生物系による木材腐朽機構の完全解明を目指し、その知見を活かした新たな統合木質バイオリファイナリー技術を提案する。①白色腐朽菌の中には、嫌気条件下で木質のセルロースを糖化・発酵する多機能型担子菌が存在する。②植物細胞壁の主要成分を分解可能な白色腐朽菌の成長や分解活性を促進するヘルパー細菌が存在する。③白色腐朽菌と細菌はセルロースの分解においてシナジー効果を発揮し、協調的な物質生産が可能である。等の研究知見を基に木材腐朽における複合微生物の存在意義の解明とその可視化を実現する。さらに、白色腐朽菌と細菌との共培養による新規バイオリファイナリー技術を確立する。

Outline of Annual Research Achievements

本提案研究では、複合微生物による木材腐朽の理解と、その応用による新規バイオリファイナリー技術の創生を目指して以下の2つの項目について研究を進めた。
1.白色腐朽菌Phlebia brevisporaの成長促進細菌であるEnterobacter属細菌の構成的な蛍光化を進めている。2023年度はmGold恒常発現株の作成に成功し、白色腐朽菌P. brevisporaとの共培養を実施した。寒天培地において、蛍光化したEnterobacter属細菌においてもP. brevispora菌糸の成長促進作用は確認されたが、mGoldと同波長と考えられる自家蛍光が菌糸から観察され、細菌の明確な挙動を追跡することが出来なかった。また、液体培地においても菌糸の成長促進とともに、液体中の細菌の消失が確認されたが、P. brevispora菌糸内への細菌の侵入は確認されなかった。細菌の挙動をより明確にするために、波長の異なる蛍光化細菌が必要との結論となった。
2.細菌は白色腐朽菌と協調的にリグニンを資化するかについて、カワラタケと腐朽材中に共存しているバニリン酸資化性細菌の一部は、木材腐朽およびリグニン分解に正の影響を与える。そこで低分子化された木材成分の挙動をGC/MSで追跡し、糖、有機酸、芳香族化合物が検出されたものの、細菌が存在することによりこれら成分が分解されることを指示する明確な定量的傾向は得られなかった。一方で、木粉中における細菌の生存について検討するために、腐朽試験後の木粉培地を蒸留水で抽出し、寒天培地で生じる細菌のコロニーを計測したところ、カワラタケを接種していない木粉に細菌を接種した場合は、細菌のコロニーが一切観察されない一方で、カワラタケとともに培養した木粉培地からは、細菌のコロニーが検出された。すなわち、木材中での細菌の生存には白色腐朽菌の存在が必須であることが明らかとなった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

蛍光化細菌の検出が白色腐朽菌菌糸の自家蛍光により困難であることが明らかとなり、別波長の蛍光化細菌の再構築が必要となった。共培養した腐朽木粉の分析では、リグニン分解物の定量的な分解挙動を追跡することが困難であることが明らかとなったため、腐朽した木材の抽出物を細菌に資化させる新しいアプローチの試験が必要になった。

Strategy for Future Research Activity

相互作用の可視化を目指して、白色腐朽菌Phlebia brevisporaの成長促進細菌であるEnterobacter属細菌の構成的なGFP蛍光化に取り組む。作成次第、共培養試験を行い、寒天培地および液体培地、木粉培地における細菌の挙動を明らかにする。
カワラタケと共存するバニリン酸資化性細菌との共培養について、木粉培地上ではリグニンの協調的資化を明らかにすることが困難であった。そこで、カワラタケにより腐朽した腐朽木粉からメタノール抽出物を調製し、これを炭素源とした細菌による分解試験を行う。細菌の増殖をモニターし、分解物をGCMSおよびLCで分析することにより、細菌により資化される白色腐朽菌分解物を同定する。その情報を基に、木粉培地でカワラタケと細菌との共培養を行い、共培養区および単独培養区において、先に同定した物質の挙動を追跡する。さらに、2023年度に明らかとなった、カワラタケ菌糸が存在することが、木粉上における細菌の生存に必須であるという新規な知見が得られた。これは、細菌と白色腐朽菌との安定的な共存を人工的に生み出すうえで非常に重要な知見であるため、評価法を至急確立するとともに、特定の細菌にのみ見られる現象か調査する。さらに、どのようなメカニズムで木粉中での細菌の生存を可能にしているかを明らかにするために、複数の仮説を立てて、立証する試験を実施する。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Comments on the Screening Results   Annual Research Report
  • Research Products

    (16 results)

All 2024 2023 2022 2021

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 2 results) Presentation (7 results) (of which Invited: 3 results) Book (2 results)

  • [Journal Article] Biodecolorization and biotransformation of methylene blue using mixed cultures of brown-rot fungus <i>Daedalea dickinsii</i> and filamentous fungus <i>Aspergillus oryzae</i>: identification of metabolites and degradation pathway2024

    • Author(s)
      Purnomo Adi Setyo、Fauzany Umirul Solichah、Rizqi Hamdan Dwi、Alkas Taufiq Rinda、Kamei Ichiro
    • Journal Title

      RSC Advances

      Volume: 14 Issue: 8 Pages: 5061-5068

    • DOI

      10.1039/d3ra08544a

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characterization of microbial communities during Grifola frondosa (maitake) wood log cultivation2023

    • Author(s)
      Chen Fu-Chia、Motoda Taichi、Kamei Ichiro、Kijidani Yoshio
    • Journal Title

      Journal of Wood Science

      Volume: 69 Issue: 1 Pages: 39-39

    • DOI

      10.1186/s10086-023-02111-3

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Butanol production from alkaline pretreated bamboo using co-culture of wood-rotting fungus Phlebia sp. MG-60-P2 and bacterium Clostridium saccharoperbutylacetonicum2023

    • Author(s)
      Tri Chu Luong、Khuong Le Duy、Kamei Ichiro
    • Journal Title

      Biomass Conversion and Biorefinery

      Volume: - Issue: 17 Pages: 20551-20558

    • DOI

      10.1007/s13399-023-04320-8

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Upregulation of MAP kinase <i>HOG1</i> gene of white-rot fungus <i>Phlebia</i> sp. MG-60 inhibits the ethanol fermentation and mycelial growth2023

    • Author(s)
      Motoda Taichi、Chen Fu-Chia、Tsuyama Taku、Tokumoto Yuji、Kijidani Yoshio、Kamei Ichiro
    • Journal Title

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      Volume: 87 Issue: 2 Pages: 217-227

    • DOI

      10.1093/bbb/zbac203

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Selective Homologous Expression of Recombinant Manganese Peroxidase Isozyme of Salt-Tolerant White-Rot Fungus Phlebia sp. MG-60, and Its Salt-Tolerance and Thermostability2022

    • Author(s)
      Kamei, I., Tomitaka, N., Taichi, M., Yamasaki, Y.
    • Journal Title

      Journal of Microbiology and Biotechnology

      Volume: 32 Issue: 2 Pages: 248-255

    • DOI

      10.4014/jmb.2108.08042

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 木材の糖化と発酵を可能にするきのこの力2022

    • Author(s)
      亀井一郎
    • Journal Title

      でん粉と食品

      Volume: 47 Pages: 11-15

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Journal Article] Conversion of Biomass by Fungal Reaction: Potential of Integrated Fungal Fermentation by White-Rot Fungi2021

    • Author(s)
      KAMEI Ichiro
    • Journal Title

      KAGAKU TO SEIBUTSU

      Volume: 59 Issue: 3 Pages: 137-143

    • DOI

      10.1271/kagakutoseibutsu.59.137

    • NAID

      130008165569

    • ISSN
      0453-073X, 1883-6852
    • Year and Date
      2021-03-01
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 白色腐朽菌 Phlebia sp. MG-60 株における MAP キナーゼ HOG1 の過剰発現はエ タノール発酵と菌糸成長を抑制する2023

    • Author(s)
      元田多一、陳 富嘉、津山 濯、徳本雄史、亀井一郎、雉子谷佳男
    • Organizer
      第73回 日本木材学会大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] リグニンの生分解を解析するためのバクテリアセンサーの開発2023

    • Author(s)
      上村 直史、白濱 里帆、亀井 一郎、政井 英司
    • Organizer
      農芸化学会2023年度大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 耐塩性白色腐朽菌 Phlebia sp. MG-60 株におけるリグニン分解酵素生産およびエタノー ル発酵の制御機構に関する研究2022

    • Author(s)
      元田多一、陳 富嘉、津山 濯、徳本雄史、亀井一郎、雉子谷佳男
    • Organizer
      第28回日本木材学会九州支部大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 木材腐朽菌を用いた木材の有用物質への変換2022

    • Author(s)
      亀井一郎
    • Organizer
      第6回 SPIRITS生物-無機-有機融合化学セミナー
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 白色腐朽菌および細菌共培養系による木質の有価物への変換2022

    • Author(s)
      亀井一郎
    • Organizer
      四国紙パルプ研究協議会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] マイタケ栽培原木における共存細菌の探索と解析2021

    • Author(s)
      陳 富嘉、亀井 一郎
    • Organizer
      第66回リグニン討論会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 木材の糖化と発酵を可能にするきのこの力2021

    • Author(s)
      亀井一郎
    • Organizer
      第46回 日本応用糖質科学会九州支部講演会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Book] Fungal Biotechnology Prospects and Avenues2022

    • Author(s)
      Chu Luong Tri、Le Duy Khuong、Kamei Ichiro
    • Total Pages
      16
    • Publisher
      CRC Press
    • ISBN
      9781032163857
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Book] きのこの生物活性と応用展開2021

    • Author(s)
      河岸洋和
    • Total Pages
      360
    • Publisher
      シーエムシー出版
    • ISBN
      9784781316222
    • Related Report
      2021 Annual Research Report

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2024-12-25  

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