A study for the construction and application of Jomon iPS cells

• Project/Area Number: 21H04779
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Review Section: Medium-sized Section 45:Biology at organismal to population levels and anthropology, and related fields
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: 太田 博樹 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (40401228)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 石田 貴文 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 名誉教授 (20184533) ; 立石 敬介 聖マリアンナ医科大学, 医学部, 教授 (20396948) ; 田辺 秀之 総合研究大学院大学, 統合進化科学研究センター, 准教授 (50261178) ; 野崎 智義 東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 教授 (60198588) ; 和久 大介 東京農業大学, 国際食料情報学部, 助教 (60793578) ; 竹沢 泰子 関西外国語大学, 国際文化研究所, 教授 (70227015) ; 覚張 隆史 金沢大学, 古代文明・文化資源学研究所, 助教 (70749530) ; 大橋 順 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (80301141) ; 今村 公紀 金沢大学, 医学系, 准教授 (80567743)
• Project Period (FY): 2021-04-05 – 2025-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥42,250,000 (Direct Cost: ¥32,500,000、Indirect Cost: ¥9,750,000); Fiscal Year 2024: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000); Fiscal Year 2023: ¥8,970,000 (Direct Cost: ¥6,900,000、Indirect Cost: ¥2,070,000); Fiscal Year 2022: ¥10,530,000 (Direct Cost: ¥8,100,000、Indirect Cost: ¥2,430,000); Fiscal Year 2021: ¥16,250,000 (Direct Cost: ¥12,500,000、Indirect Cost: ¥3,750,000)
• Keywords: iPS細胞 / 縄文人 / ゲノム / 集団遺伝学 / 肝細胞 / 適応的表現型 / トランスクリプトーム解析 / オルガノイド

Outline of Research at the Start

狩猟採集民であった縄文人は、東アジア大陸から隔離され、日本列島固有の環境に適応してきた。縄文人と現代日本人との遺伝形質の多くが異なっているのは、おそらくこのためである。しかし、この“狩猟採集生活に適応した縄文人ゲノム及びエピゲノム”が表現型とどのように結びつくか、まだほとんど研究されたことがない。本研究の目的は、縄文人由来ゲノム断片をもつiPS細胞を樹立し、分化誘導させ、網羅的かつ経時的に遺伝子発現及び代謝プロファイルを分析し、現代日本人のそれと比較することにある。これにより、ゲノムの一次情報だけからは理解が困難な縄文人が獲得した適応的表現型をin vitroで解析する実験系を構築する。