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非分裂細胞である心筋細胞のDNA損傷と老化による心不全発症機序の解明

Research Project

Project/Area Number 21H04821
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Medium-sized Section 53:Organ-based internal medicine and related fields
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

小室 一成  東京大学, 医学部附属病院, 教授 (30260483)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 野村 征太郎  東京大学, 医学部附属病院, 特任助教 (10722118)
候 聡志  東京大学, 医学部附属病院, 特任助教 (00836059)
加藤 愛巳  東京大学, 先端科学技術研究センター, 特任研究員 (60832045)
Project Period (FY) 2021-04-05 – 2022-03-31
Project Status Discontinued (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥42,250,000 (Direct Cost: ¥32,500,000、Indirect Cost: ¥9,750,000)
Fiscal Year 2021: ¥16,250,000 (Direct Cost: ¥12,500,000、Indirect Cost: ¥3,750,000)
Keywords心不全 / DNA損傷 / 老化 / シングルセル解析
Outline of Research at the Start

循環器疾患の終末像である心不全は、患者数、死亡者数が世界的に急増しており、その病態解明が喫緊の課題となっています。我々は、DNA損傷およびp53シグナル活性化が心筋細胞の老化・不全化を招き、最終的には心不全を誘導すること、さらにDNA損傷の程度は心不全患者の重症度・治療応答性を規定していることを世界に先駆けて明らかにしてきました。そこで本研究では、心筋細胞でDNA損傷が生じる機序、DNA損傷・p53シグナルが心筋細胞機能を破綻させる機序、老化・不全化心筋が心不全を誘導する機序と心筋リプログラミングによる健常化の機序を解明して、心筋細胞のDNA損傷と老化による心不全発症機序の解明を目指します。

Outline of Annual Research Achievements

本研究では、心筋細胞でDNA損傷が生じる機序、DNA損傷・p53シグナルが心筋細胞機能を破綻させる機序、老化・不全化心筋が心不全を誘導する機序と心筋リプログラミングによる健常化の機序、について研究を行った。
Step 1. 心筋細胞でDNA損傷が生じる機序の解明: 我々はまず、マウス心不全モデルおよびヒト心不全患者の心臓組織検体を空間的シングルセル解析し、心不全病態と関連するDNA損傷関連遺伝子を特定した(関連する2本の論文を投稿し、現在リバイズ中)。続いて、CRISPR/Cas9とシングルセルRNA-seq解析を統合してin vivo Perturb-seqシステムを構築し、このシステムでワークするためのgRNAを設計して心筋細胞に届けるためのAAV9ベクターを作成した。そして、このシステムによって心筋細胞で標的遺伝子を効率的にノックダウンできることを確認するとともに、多数のgRNAライブラリを心筋に届けた後に、シングルセルRNA-seqでその細胞の表現型(全遺伝子発現)を解析する仕組みを構築した。
Step 2. DNA損傷・p53シグナルが心筋細胞機能を破綻させる機序の解明: 心筋細胞でDNA損傷が誘発される動物モデル・iPS細胞由来心筋を用いて、シングルセルRNA-seq・シングルセルエピゲノム解析により背景に存在する分子機序を解明した(関連する1本の論文を投稿予定)。さらにCUT&RUNによって、心筋細胞の細胞核内でDNA損傷が生じる遺伝子座や領域を同定することに成功した。
Step 3. 老化・不全化心筋が心不全を誘導する機序と心筋健常化リプログラミング機序の解明: 心筋シングルセル解析の結果、肥大心筋細胞の特徴的な転写因子を同定することに成功し、この転写因子を用いて不全型心筋を健常化リプログラミングできる可能性を見出した。

Research Progress Status

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2021 Comments on the Screening Results   Annual Research Report
  • Research Products

    (19 results)

All 2021

All Journal Article (8 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 8 results,  Open Access: 8 results) Presentation (10 results) (of which Invited: 10 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results) (of which Overseas: 1 results)

  • [Journal Article] New Vision, Mission, and Values of the Japanese Circulation Society2021

    • Author(s)
      Ishida M, Matsumoto C, Kida K, Fukuda M, Kagiyama N, Kusunose K, Matsumoto S, Nomura S, Okumura T, Shiono Y, Taniguchi T, Mizuno A, Kishi T, Node K, Komuro I, Hirata KI; Directors of the Japanese Circulation Society.
    • Journal Title

      Circulation Journal

      Volume: 85 Issue: 12 Pages: 2248-2251

    • DOI

      10.1253/circj.CJ-21-0822

    • NAID

      130008119954

    • ISSN
      1346-9843, 1347-4820
    • Year and Date
      2021-11-25
    • Related Report
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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Recent Progress in Cardiovascular Research Involving Single-Cell Omics Approaches.2021

    • Author(s)
      Dai Z, Nomura S.
    • Journal Title

      Front Cardiovasc Med.

      Volume: 8 Pages: 783398-783398

    • DOI

      10.3389/fcvm.2021.783398

    • Related Report
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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Recent Findings Related to Cardiomyopathy and Genetics.2021

    • Author(s)
      Yamada T, Nomura S.
    • Journal Title

      Int J Mol Sci.

      Volume: 22 Issue: 22 Pages: 12522-12522

    • DOI

      10.3390/ijms222212522

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Single-Cell Analysis Revealed the Role of CD8+ Effector T Cells in Preventing Cardioprotective Macrophage Differentiation in the Early Phase of Heart Failure2021

    • Author(s)
      Komai Kyoko、Ito Minako、Nomura Seitaro、Shichino Shigeyuki、Katoh Manami、Yamada Shintaro、Ko Toshiyuki、Iizuka-Koga Mana、Nakatsukasa Hiroko、Yoshimura Akihiko
    • Journal Title

      Frontiers in Immunology

      Volume: 12 Pages: 763647-763647

    • DOI

      10.3389/fimmu.2021.763647

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Three-Dimensional Visualization of Hypoxia-Induced Pulmonary Vascular Remodeling in Mice2021

    • Author(s)
      Fujiwara Takayuki、Takeda Norifumi、Hara Hironori、Ishii Satoshi、Numata Genri、Tokiwa Hiroyuki、Maemura Sonoko、Suzuki Takaaki、Takiguchi Hiroshi、Kubota Yoshiaki、Seo Kinya、Sakata Asuka、Nomura Seitaro、Hatano Masaru、Ueda Kazutaka、Komuro Issei
    • Journal Title

      Circulation

      Volume: 144 Issue: 17 Pages: 1452-1455

    • DOI

      10.1161/circulationaha.121.056219

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Single-Cardiomyocyte RNA Sequencing to Dissect the Molecular Pathophysiology of the Heart.2021

    • Author(s)
      Katoh M, Nomura S, Yamada S, Aburatani H, Komuro I.
    • Journal Title

      Methods Mol Biol.

      Volume: 2320 Pages: 183-192

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-1484-6_18

    • ISBN
      9781071614839, 9781071614846
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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Activation of Sympathetic Signaling in Macrophages Blocks Systemic Inflammation and Protects against Renal Ischemia-Reperfusion Injury2021

    • Author(s)
      Hasegawa S, Inoue T, Nakamura Y, Fukaya D, Uni R, Wu CH, Fujii R, Peerapanyasut W, Taguchi A, Kohro T, Yamada S, Katagiri M, Ko T, Nomura S, Nakanishi Ozeki A, Susaki EA, Ueda HR, Akimitsu N, Wada Y, Komuro I, Nangaku M, Inagi R.
    • Journal Title

      J Am Soc Nephrol.

      Volume: - Issue: 7 Pages: 1599-1615

    • DOI

      10.1681/asn.2020121723

    • NAID

      120007174517

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      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Prediction of single-cell mechanisms for disease progression in hypertrophic remodelling by a trans-omics approach2021

    • Author(s)
      Hamano M, Nomura S, Iida M, Komuro I, Yamanishi Y.
    • Journal Title

      Sci Rep.

      Volume: 11 Issue: 1 Pages: 8112-8112

    • DOI

      10.1038/s41598-021-86821-y

    • Related Report
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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 循環器学会からのメッセージ2021

    • Author(s)
      小室一成
    • Organizer
      第64回日本糖尿病学会年次学術集会
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    • Invited
  • [Presentation] 脳卒中・循環器病対策基本法による心不全予防と治療の実現に向けて2021

    • Author(s)
      小室一成
    • Organizer
      第25回日本心不全学会学術集会
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    • Invited
  • [Presentation] 脈管学の未来とゲノム・オミックス研究2021

    • Author(s)
      小室一成
    • Organizer
      第62回日本脈管学会総会
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  • [Presentation] 脳卒中・循環器病対策基本法成立から基本計画、そして推進計画の策定へ2021

    • Author(s)
      小室一成
    • Organizer
      第260回日本循環器学会関東甲信越地方会
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    • Invited
  • [Presentation] これからの循環器研究2021

    • Author(s)
      小室一成
    • Organizer
      心血管代謝週間2021
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    • Invited
  • [Presentation] 環器疾患システム構造の理解を目指した統合的シングルセル解析2021

    • Author(s)
      野村征太郎
    • Organizer
      第25回日本心血管内分泌代謝学会学術総会
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    • Invited
  • [Presentation] Integrated single-cell analysis to understand the system architecture of cardiovascular disease2021

    • Author(s)
      野村征太郎
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会年会
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    • Invited
  • [Presentation] ゲノムからみた心筋症の精密医療2021

    • Author(s)
      野村征太郎
    • Organizer
      第3回老年不整脈研究会
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    • Invited
  • [Presentation] SGLT2阻害薬を中心とした糖尿病・心不全・慢性腎臓病の新たな治療戦略2021

    • Author(s)
      野村征太郎
    • Organizer
      東村山市医師会学術講演会
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    • Invited
  • [Presentation] 精密医療の実現を目指す次世代型心臓病学2021

    • Author(s)
      野村征太郎
    • Organizer
      Premium Hypertension Conference
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      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 心筋梗塞・心不全の治療標的としての心保護因子Htra3の同定2021

    • Inventor(s)
      野村征太郎、候聡志、油谷浩幸、小室一成
    • Industrial Property Rights Holder
      国立大学法人東京大学
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
      2021
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Overseas

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2022-12-28  

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