The roles and mechanisms of chromatin memory in the robust responses under flactuating environments

• Project/Area Number: 21H04977
• Research Category: Grant-in-Aid for Specially Promoted Research
• Allocation Type: Single-year Grants
• Review Section: Biological Sciences
• Research Institution: Kyoto University
• Principal Investigator: 工藤 洋 京都大学, 生態学研究センター, 教授 (10291569)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 角谷 徹仁 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (20332174) ; 本庄 三恵 京都大学, 生態学研究センター, 准教授 (30450208)
• Project Period (FY): 2021-05-18 – 2026-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥631,150,000 (Direct Cost: ¥485,500,000、Indirect Cost: ¥145,650,000); Fiscal Year 2025: ¥120,380,000 (Direct Cost: ¥92,600,000、Indirect Cost: ¥27,780,000); Fiscal Year 2024: ¥119,730,000 (Direct Cost: ¥92,100,000、Indirect Cost: ¥27,630,000); Fiscal Year 2023: ¥120,900,000 (Direct Cost: ¥93,000,000、Indirect Cost: ¥27,900,000); Fiscal Year 2022: ¥124,280,000 (Direct Cost: ¥95,600,000、Indirect Cost: ¥28,680,000); Fiscal Year 2021: ¥145,860,000 (Direct Cost: ¥112,200,000、Indirect Cost: ¥33,660,000)
• Keywords: ヒストン修飾 / H3K27me3 / 長期環境応答 / エピジェネティクス / ハクサンハタザオ

Outline of Research at the Start

地球上の生態系が温暖化によって大きく変貌しつつある今、生態系のエネルギーフローの出発点にある植物の長期応答を理解することは急務である。生物の長期応答にはクロマチン記憶が主要な役割を果たすが、新たな課題は、長期クロマチン記憶における修飾間のクロストークを明らかにし、その生態機能を明らかにすることである。クロマチン記憶の環境応答におけるメカニズムと役割を明らかにする総合研究を実施する。

Outline of Annual Research Achievements

クロマチン長期記憶の環境応答におけるメカニズムと役割を理解するために、１．長期クロマチン記憶の新規メカニズム、２．新規環境要因で変化する長期クロマチン記憶のターゲット、３．長期クロマチン記憶の生態機能を明らかにすることが目的である。具体的には、① H3K27me3介在型プロモーターの解析による新規メカニズムの解明、② 修飾間のクロストークとDNAトポロジーの役割の解明、③ 温度ミミックのターゲット解析、④ ウイルスで変化するクロマチン記憶の解析、⑤ 長期クロマ チン記憶の温度依存性と生態機能の解明、⑥ 防御における季節ゲーティングの解明、である。
2023年度には、2022年度に引き続き、研究を進めるとともに、⑤と⑥も重点的にすすめた。その結果、シロイヌナズナのH3K4me2脱メチル化酵素LDL3が転写と協働して働くことを示した（Mori et al 2023 EMBO J）。また、LDL3の変異体やH3K4me2のメチル化酵素の変異体を用い、これがH3K27me3やH2AUbに影響することを示した（論文準備中）。さらに、クロマチン修飾変異体の背景で高温の影響を調べることにより、反復配列における特徴的な応答を見出した（未発表）。さらに、任意の遺伝子に長期環境応答を付与するプロモーターについて論文をまとめ投稿中である。また、「環境要因」では、温度ミミックの細胞内外の局在を明らかにするための実験をすすめた。「生態機能」では、ヒストン修飾を介して、病虫害に対する誘導防御がシャットダウンされる新しい機構について実験的な検証をすすめた。さらに、葉の老化が冬の間にシャットダウンされることを明らかにし、これについて解析を進めている。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

上記した①～⑥の計画ともに、期待通りの成果が出ており、その成果が一部論文として発表されるか、投稿準備中の状況にある。①「H3K27me3介在型プロモーターの解析による新規メカニズムの解明」については、長期的記憶を司るプロモーターおよび下流の遺伝子上におけるH3K27メチル化の長期低温応答についての論文を投稿中である。このプロモーターについての解析を進め、長期低温応答に必要な部位を特定した。②「修飾間のクロストークとDNAトポロジーの役割の解明」については、シロイヌナズナのH3K4me2脱メチル化酵素LDL3が転写と協働して働くことを示し、これが環境応答の長期記憶に貢献する可能性を提案した（Mori et al 2023 EMBO J）。また、LDL3の変異体やH3K4me2のメチル化酵素の変異体を用い、これがH3K27me3やH2AUbに影響することを示した。さらに、クロマチン修飾変異体の背景で高温の影響を調べることにより、反復配列における特徴的な応答を見出した　③「温度ミミックのターゲット解析」については、その細胞内外の局在を明らかにする実験をすすめた。⑥「防御における季節ゲーティングの実証と生態機能の解明」については、遺伝子発現レベルの季節ゲーティングについて、短期と長期の温度の効果を実験的に検証し、さらにその産物の季節性と温度依存性を明らかにした。また、　④「ウイルスで変化するクロマチン記憶の解析」と⑤「長期クロマチン記憶の温度依存性と生態機能の解明」については、前者ではカブモザイクウイルス感染のヒストン修飾に及ぼす効果、後者では葉の老化応答の季節ゲーティングの解析を進めており、当初予定していた範囲を越えてクロマチン記憶の生態機能が理解されることが期待される。

Strategy for Future Research Activity

クロマチン記憶における修飾間クロストークの役割を解明するために、東京大学ではエピゲノム形成に関与する因子の変異体を用いた解析に加えて、ロングリード解析を進める。京都大学では分子遺伝学的実験、温度ストレス・ウイルス感染実験に加えて引き続き自然集団での研究を実施する。また、新規のクロマチン記憶現象の探索も実施する。また、成果については、国際学会や学術論文としての発表を進める。計画①ついては、H3K27me3介在型プロモーターにおいて、長期温度応答に必要な領域を特定したので、その解析をすすめる。また、当該プロモーターを持つ内在遺伝子の機能について解析する。計画②については、H3K4に加えH3K27に影響する変異体を用い、これらの修飾の相互依存性を整理する。また、高温の影響をロングリード解析で調べる。計画③については、温度ミミックペプチドの機能を明らかにするとともに、細胞内の局在部位での働きについても研究を進める。また、この因子のターゲットの遺伝子発現変化とペプチド濃度との関係を解析する。計画④については、引き続き、ハクサンハタザオ―カブモザイクウイルス持続感染系において、野外の感染株と非感染株の間でヒストン修飾を比較し、感染によりH3K27me3の蓄積が変化する遺伝子を特定し、発現との関係を明らかにするとともに、接種実験により長期の感染の効果を検証する。計画⑤については、冬季における老化のスイッチオフ機構におけるクロマチン記憶について解析するとともに、高温・低温応答性の季節変化についてのデータ取得を進める。計画⑥については、みどりの香りのゲーティング現象において、遺伝子発現調節とH3K27me3の蓄積との関係について、阻害剤を用いた検証を試みる。

Assessment Rating

Interim Assessment Comments (Rating)

A: In light of the aim of introducing the research area into the research categories, the expected progress has been made in research.

Research Products

• [Journal Article] Arabidopsis SDG proteins mediate Polycomb removal and transcription-coupled H3K36 methylation for gene activation (2024)
  • Author(s): Yamaguchi Nobutoshi、Yicong Wang、Abe Masato、Kadoya Yuka、Saiki Takeru、Imai Kanae、Wang Xuejing、To Taiko、Inagaki Soichi、Suzuki Takamasa、Kakutani Tetsuji、Ito Toshiro
  • Journal Title: Nature Portfolio Volume: - Pages: 1-27
  • DOI: 10.21203/rs.3.rs-3988955/v1
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Seasonal pigment fluctuation in diploid and polyploid Arabidopsis revealed by machine learning-based phenotyping method PlantServation (2023)
  • Author(s): Akiyama Reiko、Goto Takao、Tameshige Toshiaki、Sugisaka Jiro、Kuroki Ken、Sun Jianqiang、Akita Junichi、Hatakeyama Masaomi、Kudoh Hiroshi、Kenta Tanaka、Tonouchi Aya、Shimahara Yuki、Sese Jun、Kutsuna Natsumaro、Shimizu-Inatsugi Rie、Shimizu Kentaro K.
  • Journal Title: Nature Communications Volume: 14 Issue: 1 Pages: 5792-5792
  • DOI: 10.1038/s41467-023-41260-3
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] A transcriptional program underlying the circannual rhythms of gonadal development in medaka (2023)
  • Author(s): Nakayama Tomoya、Tanikawa Miki、Okushi Yuki、Itoh Thoma、Shimmura Tsuyoshi、Maruyama Michiyo、Yamaguchi Taiki、Matsumiya Akiko、Shinomiya Ai、Guh Ying-Jey、Chen Junfeng、Naruse Kiyoshi、Kudoh Hiroshi、Kondo Yohei、Naoki Honda、Aoki Kazuhiro、Nagano Atsushi J.、Yoshimura Takashi
  • Journal Title: Proceedings of the National Academy of Sciences Volume: 120 Issue: 52 Pages: 120-120
  • DOI: 10.1073/pnas.2313514120
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Arms race between anti‐silencing and RdDM in noncoding regions of transposable elements (2023)
  • Author(s): Sasaki Taku、Kato Kae、Hosaka Aoi、Fu Yu、Toyoda Atsushi、Fujiyama Asao、Tarutani Yoshiaki、Kakutani Tetsuji
  • Journal Title: EMBO reports Volume: 24 Issue: 8
  • DOI: 10.15252/embr.202256678
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Cotranscriptional demethylation induces global loss of H3K4me2 from active genes in Arabidopsis (2023)
  • Author(s): Mori Shusei、Oya Satoyo、Takahashi Mayumi、Takashima Kazuya、Inagaki Soichi、Kakutani Tetsuji
  • Journal Title: The EMBO Journal Volume: 42 Issue: 23
  • DOI: 10.15252/embj.2023113798
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Spatial epidemiology model can explain the seasonal dynamics of infectious disease Cyprinid herpesvirus 3 (CyHV-3) by thermoregulation behavior of the host, common carp (Cyprinus carpio) (2023)
  • Author(s): Miki Takeshi、Yamanaka Hiroki、Sogabe Atsushi、Omori Koji、Saito Yasuhisa、Minamoto Toshifumi、Uchii Kimiko、Honjo Mie N.、Suzuki Alata A.、Kohmatsu Yukihiro、Kawabata Zen’ichiro
  • Journal Title: Theoretical Ecology Volume: 16 Issue: 3 Pages: 195-208
  • DOI: 10.1007/s12080-023-00563-3
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] e<scp>DNA</scp> metabarcoding analysis reveals the consequence of creating ecosystem‐scale refugia from deer grazing for the soil microbial communities (2023)
  • Author(s): Kadowaki Kohmei、Honjo Mie N.、Nakamura Naoto、Kitagawa Yoichiro、Ishihara Masae I.、Matsuoka Shunsuke、Tachiki Yuuya、Fukushima Keitaro、Sakaguchi Shota、Mizuki Inoue、Fujiki Daisuke、Sakai Masaru、Takayanagi Atsushi、Yamasaki Michimasa、Tokuchi Naoko、Takahashi Daiki、Nagasawa Koki、Masuda Kazutoshi
  • Journal Title: Environmental DNA Volume: 5 Issue: 6 Pages: 1732-1742
  • DOI: 10.1002/edn3.498
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Distinct responses to autumn and spring temperatures by the key flowering-time regulator FLOWERING LOCUS C (2023)
  • Author(s): Nishio Haruki、Kudoh Hiroshi
  • Journal Title: Current Opinion in Genetics &amp; Development Volume: 78 Pages: 102016-102016
  • DOI: 10.1016/j.gde.2022.102016
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Effects of fruit dimorphism on genetic structure and gene flow in the coastal shrub Scaevola taccada (2022)
  • Author(s): Naoko Emura, Tomoaki Muranaka, Takaya Iwasaki, Mie N Honjo, Atsushi J Nagano, Yuji Isagi, Hiroshi Kudoh
  • Journal Title: Annals of Botany Volume: 130 Issue: 7 Pages: 1029-1040
  • DOI: 10.1093/aob/mcac138
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Circadian-period variation underlies the local adaptation of photoperiodism in the short-day plant Lemna aequinoctialis (2022)
  • Author(s): Muranaka T, Ito S, Kudoh H, Oyama T
  • Journal Title: iScience Volume: 25(7) Pages: 104634-104634
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Tandemly repeated genes promote RNAi-mediated heterochromatin formation via an antisilencing factor, Epe1, in fission yeast (2022)
  • Author(s): Asanuma T, Inagaki S, Kakutani T, Aburatani H, Murakami Y
  • Journal Title: Genes &amp; Development Volume: 36 Issue: 21-24 Pages: 1145-1159
  • DOI: 10.1101/gad.350129.122
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Transcription-coupled and epigenome-encoded mechanisms direct H3K4 methylation (2022)
  • Author(s): Oya S, Takahashi M, Takashima K, Kakutani T, Inagaki S
  • Journal Title: Nature Communications Volume: 13 Issue: 1 Pages: 4521-4521
  • DOI: 10.1038/s41467-022-32165-8
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Fast co‐evolution of anti‐silencing systems shapes the invasiveness of <i>Mu</i> ‐like DNA transposons in eudicots (2022)
  • Author(s): Sasaki Taku、Ro Kyudo、Caillieux Erwann、Manabe Riku、Bohl‐Viallefond Gr?goire、Baduel Pierre、Colot Vincent、Kakutani Tetsuji、Quadrana Leandro
  • Journal Title: The EMBO Journal Volume: 41 Issue: 8
  • DOI: 10.15252/embj.2021110070
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Local and global crosstalk among heterochromatin marks drives DNA methylome patterning in Arabidopsis (2022)
  • Author(s): To Taiko Kim、Yamasaki Chikae、Oda Shoko、Tominaga Sayaka、Kobayashi Akie、Tarutani Yoshiaki、Kakutani Tetsuji
  • Journal Title: Nature Communications Volume: 13 Issue: 1 Pages: 861-861
  • DOI: 10.1038/s41467-022-28468-5
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Chromatin-based mechanisms to coordinate convergent overlapping transcription. (2021)
  • Author(s): Inagaki, S., Takahashi, M., Takashima, K., Oya, S., & Kakutani, T
  • Journal Title: Nature Plants Volume: 7 Issue: 3 Pages: 295-302
  • DOI: 10.1038/s41477-021-00868-3
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] H3K27me3 demethylases alter HSP22 and HSP17.6C expression in response to recurring heat in Arabidopsis (2021)
  • Author(s): Yamaguchi Nobutoshi、Matsubara Satoshi、Yoshimizu Kaori、Seki Motohide、Hamada Kouta、Kamitani Mari、Kurita Yuko、Nomura Yasuyuki、Nagashima Kota、Inagaki Soichi、Suzuki Takamasa、Gan Eng-Seng、To Taiko、Kakutani Tetsuji、Nagano Atsushi J.、Satake Akiko、Ito Toshiro
  • Journal Title: Nature Communications Volume: 12 Issue: 1 Pages: 3480-3480
  • DOI: 10.1038/s41467-021-23766-w
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] The genetic and epigenetic landscape of the <i>Arabidopsis</i> centromeres (2021)
  • Author(s): Naish M、Alonge M、Wlodzimierz P、Tock AJ.、Abramson BW.、Schmcker A、Mandkov T、Jamge B、Lambing C、Kuo P、Yelina N、Hartwick N、Colt K、Smith LM、Ton J、Kakutani T、Martienssen RA、Schneeberger K、Lysak MA、Berger F、Bousios A、Michael TP、Schatz MC、Henderson IR
  • Journal Title: Science Volume: 374 Issue: 6569
  • DOI: 10.1126/science.abi7489
  • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Altitudinal differentiation in the leaf wax-mediated flowering bud protection against frost in a perennial Arabidopsis (2021)
  • Author(s): Yumoto G., Sasaki-Sekimoto Y., Aryal B., Ohta H., Kudoh H.
  • Journal Title: Oecologia Volume: 195 Issue: 3 Pages: 677-687
  • DOI: 10.1007/s00442-021-04870-6
  • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Population differentiation in the leaf shape and growth form of Cardamine scutata Thunb. in tidal and non‐tidal habitats (2021)
  • Author(s): Soga Eri、Sugisaka Jiro、Watanabe Mikio、Kudoh Hiroshi
  • Journal Title: Plant Species Biology Volume: - Issue: 3 Pages: 1-13
  • DOI: 10.1111/1442-1984.12325
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Phylogeographic and demographic modelling analyses of the multiple origins of the rheophytic goldenrod Solidago yokusaiana Makino (2021)
  • Author(s): Kyan, R., Kimura, T., Yamashiro, T., Fujii, S., Sakaguchi, S., Ito, M., Nagano, A., Kudoh, H., and Maki, M.
  • Journal Title: Heredity Volume: 126 Issue: 5 Pages: 831-845
  • DOI: 10.1038/s41437-021-00408-x
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Combination of genetic analysis and ancient literature survey reveals the divergence of traditional Brassica rapa varieties from Kyoto, Japan (2021)
  • Author(s): Kawakatsu Y, Sakamoto T, Nakayama H, Kaminoyama K, Igarashi K, Yasugi M, Kudoh H, Nagano AJ, Yano K, Kubo N, Notaguchi M, Kimura S
  • Journal Title: Horticulture Research Volume: 8 Issue: 1 Pages: 132-132
  • DOI: 10.1038/s41438-021-00569-0
  • NAID: 120007041650
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Life-history monographs of Japanese plants 14: Cardamine leucantha (Tausch) O. E. Schulz (Brassicaceae) (2021)
  • Author(s): Araki KS, Tsujimoto M, Iwasaki T, Kudoh H
  • Journal Title: Plant Species Biology Volume: 36 Issue: 4 Pages: 542-553
  • DOI: 10.1111/1442-1984.12345
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Fine‐scale empirical data on niche divergence and homeolog expression patterns in an allopolyploid and its diploid progenitor species (2020)
  • Author(s): Akiyama Reiko、Sun Jianqiang、Hatakeyama Masaomi、Lischer Heidi E. L.、Briskine Roman V.、Hay Angela、Gan Xiangchao、Tsiantis Miltos、Kudoh Hiroshi、Kanaoka Masahiro M.、Sese Jun、Shimizu Kentaro K.、Shimizu‐Inatsugi Rie
  • Journal Title: New Phytologist Volume: 229 Issue: 6 Pages: 3587-3601
  • DOI: 10.1111/nph.17101
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Presentation] エピゲノム変異と熱刺激によるトランスポゾンの脱抑制機構 (2024)
  • Author(s): 越阪部晃永, 藤泰子, 小川公美, 田中祐梨子, 角谷徹仁
  • Organizer: 第41回染色体ワークショップ・第22回核ダイナミクス研究会
• [Presentation] H3K9メチル化はサイレンシングとアンチサイレンシングの二刀流として活躍する (2024)
  • Author(s): 矢部寛之助, 神尾明日香, 大矢恵代, 角谷徹仁, 平山眞美, 田中祐梨子, 稲垣宗一
  • Organizer: 第41回染色体ワークショップ・第22回核ダイナミクス研究会
• [Presentation] 比較ゲノム解析によるジャニンジン沖縄系統の海浜環境への適応メカニズムの解析 (2024)
  • Author(s): 佐川千理, 内藤健, 本庄三恵, 工藤洋, 植村智博, 岩崎貴也
  • Organizer: 第23回日本植物分類学会
• [Presentation] 常緑草本ハクサンハタザオにおける温度ストレスに対する耐性および遺伝子発現の応答性の季節変化 (2024)
  • Author(s): 湯本原樹, 辻祥子, 本庄三恵, 工藤洋
  • Organizer: 第65回日本植物生理学会年会
• [Presentation] ゼニゴケの蒴柄の形成を制御するbHLH型転写因子MpSETAの異所的発現による葉状体発生への影響 (2024)
  • Author(s): 守屋健太, 河野弘道, 岡義人, 松下智直, 工藤洋, Goodrich J, 嶋田知生
  • Organizer: 第65回日本植物生理学会年会
• [Presentation] カブモザイクウイルスの感染はハク サンハタザオのアブラムシに対する 防御を向上させる (2024)
  • Author(s): 大坪雅, 工藤洋, 本庄三恵
  • Organizer: 第65回日本植物生理学会年会
• [Presentation] 低温順化・脱順化過程での凍結耐性におけるハクサンハタザオ集団の標高分化 (2024)
  • Author(s): 湯本原樹, 本庄三恵, 工藤洋
  • Organizer: 第71回日本生態学会大会
• [Presentation] ウイルスに感染したハクサンハタザオの越冬：低温順化速度に生じる変化 (2024)
  • Author(s): 吉田直史, 本庄三恵, 工藤洋
  • Organizer: 第71回日本生態学会大会
• [Presentation] クサトベラの種子散布に関する果実二型が遺伝子流動に与える影響 (2024)
  • Author(s): 榮村奈緒子, 吉村良, 村中智明, 岩崎貴也, 永野惇, 博田哲郎, 内貴章世, 梶田忠, 本庄三恵, 井鷺裕司, 工藤洋
  • Organizer: 第71回日本生態学会大会
• [Presentation] 低温はウイルスに対するハクサンハタザオの遺伝子発現応答を変化させ、病徴を緩和する (2024)
  • Author(s): 本庄三恵, 榮村奈緒子, 神谷麻梨, 工藤洋
  • Organizer: 第71回日本生態学会大会
• [Presentation] Altitudinal genetic differentiation in the leaf wax-mediated flowering bud protection against frost in an early-spring flowering herb, Arabidopsis helleri. (2023)
  • Author(s): Kudoh H, Yumoto G, Aryal B, Honjo MN, Sasaki-Sekimoto Y, Shinohara W, Ohta H
  • Organizer: The 33rd ICAR International Conference on Arabidopsis Research.
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] Seasonal dynamics of epigenome in a natural population of Arabidopsis helleri. (2023)
  • Author(s): Nishio N, Ito T, Honjo MN, Muranaka T, Emura N, Shimizu H, Kimura H, To TK, Kakutani T, Kudoh H
  • Organizer: The 33rd ICAR International Conference on Arabidopsis Research.
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Time-series field phenotyping system PlantServation using machine learning revealed seasonal pigment fluctuation trends in diploid and polyploid Arabidopsis. (2023)
  • Author(s): Tameshige T, Akiyama R, Goto T, Sugisaka J, Kuroki K, Sun J, Akita J, Hatakeyama M, Kudoh H, Kenta T, Tonouchi A, Shimahara Y, Sese J, Kutsuna N, Shimizu-Inatsugi R, Shimizu KK
  • Organizer: The 33rd ICAR International Conference on Arabidopsis Research.
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Effects of Turnip mosaic virus on Arabidopsis halleri-aphid interaction and the exploration of its causal genes in a natural environment. (2023)
  • Author(s): Otsubo M, Kudoh H, Honjo MN
  • Organizer: The 33rd ICAR International Conference on Arabidopsis Research.
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Seasonality of virus-host interactions between Turnip mosaic virus and Arabidopsis halleri during the long-term infection in a natural environment. (2023)
  • Author(s): Honjo MN, Kamitani M, Kudoh H
  • Organizer: The 33rd ICAR International Conference on Arabidopsis Research.
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Weather-dependent flower movement: the functions and mechanisms for downward-facing of flowers during rain. (2023)
  • Author(s): Shibata A, Shimizu H, Honjo MN, Kudoh H
  • Organizer: The 33rd ICAR International Conference on Arabidopsis Research.
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Circadian-period variation underlies the local adaptation of photoperiodism. (2023)
  • Author(s): Muranaka T, Ito S, Kudoh H, Oyama T
  • Organizer: The 33rd ICAR International Conference on Arabidopsis Research.
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Seasonally distinct controls of leaf senescence in response to self-shading and sink demand in Arabidopsis helleri. (2023)
  • Author(s): Yumoto G, Muranaka T, Sugisaka J, Honjo MN, Kudoh H
  • Organizer: The 33rd ICAR International Conference on Arabidopsis Research.
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Epigenetic regulation by a long-term environment-responsive promoter of Arabidopsis helleri. (2023)
  • Author(s): Shimizu H, Nishio H, Kudoh H
  • Organizer: The 33rd ICAR International Conference on Arabidopsis Research.
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Cotranscriptional demethylation induces global loss of H3K4me2 from active genes in Arabidopsis (2023)
  • Author(s): Mori S, Oya S, Takahashi M, Takashima K, Inagaki S, Kakutani T
  • Organizer: The 33rd International Conference on Arabidopsis Research
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Targeted integrations of retrotransposons into centromeric regions in Arabidopsis (2023)
  • Author(s): Tsukahara S, Kawabe A, Kato K, Quadrana L, Laduque B, Kakutani T
  • Organizer: The 33rd International Conference on Arabidopsis Research
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] The roles of histone H2A variants for the establishment of transposon-specific silent modification in Arabidopsis (2023)
  • Author(s): Oda S, Tominaga S, Takeuchi S, To TK, Kakutani T
  • Organizer: The 33rd International Conference on Arabidopsis Research
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Molecular mechanisms on the maintenance of epigenetic silent marks regulated by histone variant H2A.W and chromatin remodeler DDM1. (2023)
  • Author(s): Osakabe A, Takizawa Y, Horikoshi N, Hatazawa S, Negishi L, Berger F, Kurumizaka H, and Kakutani T
  • Organizer: The 33rd International Conference on Arabidopsis Research
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] アブラナ科植物ハクサンハタザオの野外光応答 (2023)
  • Author(s): 長谷あきら，伊東杏花里，杉阪次郎，本庄三恵，工藤洋
  • Organizer: 第23回日本光生物学協会年会
• [Presentation] 温度応答遺伝子TTPは広範な温度応答に関与する (2023)
  • Author(s): 清水華子, 守屋健太, 工藤洋
  • Organizer: 日本植物学会第87回大会
• [Presentation] 野外に育成するハクサンハタザオの光応答の季節性 (2023)
  • Author(s): 長谷あきら, 伊東杏花里, 杉阪次郎, 本庄三恵, 工藤洋
  • Organizer: 日本植物学会第87回大会
• [Presentation] クローン繁殖による継代株の環境応答性の解析 (2023)
  • Author(s): 荒木希和子;西尾治幾;金岡雅浩;工藤洋
  • Organizer: 日本植物学会第87回大会
• [Presentation] 葉の老化調節の冬季における停止 (2023)
  • Author(s): 工藤洋, 湯本原樹, 西尾治幾, 村中智明, 杉阪次郎, 本庄三恵
  • Organizer: 日本植物学会第87回大会
• [Presentation] フィールドエピジェネティクス：ロバストな植物季節応答の理解 (2023)
  • Author(s): 工藤 洋
  • Organizer: 山口大学研究拠点群形成プロジェクト2023年度シンポジウム
• [Presentation] Epigenetic regulation by a long-term environment-responsive promoter of Arabidopsis helleri. (2023)
  • Author(s): Shimizu H, Nishio H, Kudoh H.
  • Organizer: IRN France-Japan Frontiers in Plant Biology 2023
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Turnip mosaic virus alters plant defense and gene expression against aphids in Arabidopsis helleri. (2023)
  • Author(s): Otsubo M, Kudoh H, Honjo MN.
  • Organizer: IRN France-Japan Frontiers in Plant Biology 2023
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Cold temperature affects virus-induced growth inhibition and transcriptome response of Arabidopsis helleri. (2023)
  • Author(s): Honjo MN, Emura N, Kamitani M, Kudoh H
  • Organizer: IRN France-Japan Frontiers in Plant Biology 2023
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Seasonality of H3K27me3 and H3K4me3 in a natural plant population (2023)
  • Author(s): Kudoh H
  • Organizer: IRN France-Japan Frontiers in Plant Biology 2023
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Molecular phenology: In natura plant responses to a seasonal environment. (2023)
  • Author(s): Kudoh H
  • Organizer: eminar at the University of Lille.
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] The role of H3K27me3 repressive histone modification in a seasonal environment. (2023)
  • Author(s): Kudoh H
  • Organizer: KEPLR Kick off meeting Zurich
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] The role of H3K27me3 repressive modification in the seasonal response of plants. (2023)
  • Author(s): Kudoh H
  • Organizer: MBSJ
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Cotranscriptional demethylation induces global loss of H3K4me2 from active genes in Arabidopsis (2023)
  • Author(s): 森秀世, 大矢恵代,稲垣宗一, 角谷徹仁
  • Organizer: 生命科学シンポジウム2023
• [Presentation] ヒストン修飾の季節変動に関する網羅的な探索 (2023)
  • Author(s): 野寄拓海, 西尾治幾, 角谷徹仁, 大矢恵代, 工藤洋
  • Organizer: 第22回 東京大学生命科学シンポジウム
• [Presentation] DDM1によるクロマチンリモデリング活性の生化学・構造生物学的解析 (2023)
  • Author(s): 越阪部晃永, 滝沢由政, 堀越直樹, 畠澤卓, 根岸瑠美, Berger T, 胡桃坂仁志, 角谷徹仁
  • Organizer: 第16回日本エピジェネティクス研究会
• [Presentation] 転写共役的な脱メチル化機構が転写活性領域におけるH3K4低メチル化を引き起こす (2023)
  • Author(s): 森秀世, 大矢恵代, 髙橋まゆみ, 高嶋和哉, 稲垣宗一, 角谷徹仁
  • Organizer: 日本遺伝学会第95回大会
• [Presentation] ヒストンH3K4メチル化による抑制的クロマチン修飾の制御 (2023)
  • Author(s): 野寄拓海, 大矢恵代, 森秀世, 稲垣宗一, 角谷徹仁
  • Organizer: 日本遺伝学会 第95回大会
• [Presentation] DDM1機能喪失変異によるトランスポゾン脱抑制の温度依存性 (2023)
  • Author(s): 越阪部晃永, 小川公美, 田中祐梨子, 角谷徹仁
  • Organizer: 日本遺伝学会 第95回大会
• [Presentation] シロイヌナズナ自然集団中でのネオセントロメアの探索 (2023)
  • Author(s): 山口 颯太, Juliarni, 長岐 清孝, 稲垣 宗一, 角谷 徹仁
  • Organizer: 日本遺伝学会第95回大会
• [Presentation] シロイヌナズナのトランスポゾン特異的抑制修飾の確立におけるエピゲノム修飾間クロストーク (2023)
  • Author(s): 小田頌子, 富永さやか, 竹内峻平, 角谷徹仁, 藤泰子
  • Organizer: 日本遺伝学会第95回大会
• [Presentation] クロマチンリモデリング因子DDM1によるヒストンバリアント特異的なリモデリング活性 (2023)
  • Author(s): 越阪部晃永、滝沢由政 堀越直樹, 畠澤卓, 根岸瑠美, Berger F, 角谷徹仁, 胡桃坂仁志
  • Organizer: 第96回日本生化学会年会
• [Presentation] The contribution of histone variants to regulate transposon silencing and expression. (2023)
  • Author(s): Osakabe A, Tanaka Y, Ogawa H, Jamge B, Lorkovic Z, Berger F and Kakutani T
  • Organizer: The 46th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] ハクサンハタザオへのカブモザイクウイルス感染はアブラムシ防御を向上させる (2023)
  • Author(s): 大坪雅, 工藤洋, 本庄三恵
  • Organizer: 第55回種生物学シンポジウム
• [Presentation] 花の天気依存的な上下運動のメカニズムと適応的意義 (2023)
  • Author(s): 柴田あかり, 清水華子, 本庄三恵;工藤洋
  • Organizer: 第55回種生物学シンポジウム
• [Presentation] ウイルス感染によるハクサンハタザオの低温応答性の変化 (2023)
  • Author(s): 吉田直史, 本庄三恵, 工藤洋
  • Organizer: 第55回種生物学シンポジウム
• [Presentation] 積雪の有無が植物葉面微生物群集に与える効果 (2023)
  • Author(s): Biva Aryal, 本庄三恵, 永野惇, 工藤洋
  • Organizer: 第55回種生物学シンポジウム
• [Presentation] 葉寿命のイン・ナチュラ研究：生育 シーズンと越冬シーズンとで対照的 な寿命制御 (2023)
  • Author(s): 工藤洋，湯本原樹，西尾治幾，村中智明，杉阪次郎，本庄三恵
  • Organizer: 第64回日本植物生理学会年会
• [Presentation] ウイルス感染によるハクサンハタザオ の成長阻害と遺伝子発現応答に対する 低温の効果 (2023)
  • Author(s): 本庄三恵，榮村奈緒子，神谷麻梨，工 藤洋
  • Organizer: 第64回日本植物生理学会年会
• [Presentation] カブモザイクウイルスがハクサンハタ ザオ―アブラムシ相互作用に与える影 響とその原因遺伝子の探索 (2023)
  • Author(s): 大坪雅，工藤洋，本庄三恵
  • Organizer: 第64回日本植物生理学会年会
• [Presentation] 常緑草本ハクサンハタザオの低温順化・ 脱順化過程を通した凍結耐性の標高生 態型間比較 (2023)
  • Author(s): 湯本原樹，本庄三恵，工藤洋
  • Organizer: 第64回日本植物生理学会年会
• [Presentation] 冬季の長期低温に応答する遺伝子の機能解析 (2023)
  • Author(s): 清水華子，柴田あかり，工藤洋
  • Organizer: 第64回日本植物生理学会年会
• [Presentation] 隠れマルコフモデルによる花成ステージ遷移の分析 (2023)
  • Author(s): 西尾治幾，工藤洋
  • Organizer: 第70回日本生態学会大会
• [Presentation] カブモザイクウイルスが植物－アブラムシ相互作用に与える影響と介在遺伝子の探索 (2023)
  • Author(s): 大坪雅，工藤洋，本庄三恵
  • Organizer: 第70回日本生態学会大会
• [Presentation] 花の晴雨反転運動：雨天時に下を向く仕組み (2023)
  • Author(s): 柴田あかり，本庄三恵，工藤洋
  • Organizer: 第70回日本生態学会大会
• [Presentation] 季節プライミング：ストレスに対する遺伝子発現応答における前歴環境の効果 (2023)
  • Author(s): 工藤洋，村中智明，伊藤佑，西尾治幾，本庄三恵
  • Organizer: 第70回日本生態学会大会
• [Presentation] DDM1 silences transposons by deposition of the histone variant H2A.W. (2023)
  • Author(s): Osakabe A, Jamge B, Axelsson E, Montgomery SA, Akimcheva S, Kuehn AL, Pisupati R, Lorkovic ZJ, Yelagandula R, Kakutani T and Frederic B
  • Organizer: nternational symposium on chromatin architecture: structure and function
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] In natura study of leaf longevity: Distinctive controls between growing and overwintering seasons (2022)
  • Author(s): Kudoh H
  • Organizer: 32ND INTERNATIONAL CONFERENCE ON ARABIDOPSIS RESEARCH
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] ハクサンハタザオが野外で経験する光環境変動とそれに対する応答 (2022)
  • Author(s): 長谷 あきら，伊東 杏花里，杉阪 次郎，本庄 三恵，工藤洋
  • Organizer: 日本植物学会第86回大会
• [Presentation] 成長期と越冬期にみられる対照的な自己被陰・シンク需要に対する葉寿命制御 (2022)
  • Author(s): 湯本 原樹，村中 智明，杉阪次郎，本庄 三恵，工藤 洋
  • Organizer: 日本植物学会第86回大会
• [Presentation] 環境ストレスに対する遺伝子発現応答における季節的前歴環境の効果 (2022)
  • Author(s): 工藤 洋，村中 智明，伊藤 佑，西尾 治幾，本庄 三恵
  • Organizer: 日本植物学会第86回大会
• [Presentation] ペプチドをコードする温度応答性遺伝子の機能解析 (2022)
  • Author(s): 清水 華子，工藤 洋
  • Organizer: 日本植物学会第86回大会
• [Presentation] 短日性アオウキクサの花成限界日長が日本で多様化する理由とその分子機構 (2022)
  • Author(s): 村中 智明，伊藤 照悟，工藤 洋，小山 時隆
  • Organizer: 日本植物学会第86回大会
• [Presentation] 異なる温度環境がカブモザイクウイルス感染におけるハクサンハタザオの遺伝子発現応答に与える影響 (2022)
  • Author(s): 本庄 三恵，榮村 奈緒子，神谷 麻梨，工藤 洋
  • Organizer: 日本植物学会第86回大会
• [Presentation] カブモザイクウイルス感染が野生植物ハクサンハタザオ上のアブラムシ個体数に与える影響 (2022)
  • Author(s): 大坪雅，工藤洋，本庄三恵
  • Organizer: 令和4年度日本植物病理学会関西部会
• [Presentation] 低温はハクサンハタザオでのカブモザイクウイルス増殖を抑制し遺伝子発現応答を変化させる (2022)
  • Author(s): 本庄三恵，榮村奈緒子，神谷麻梨，工藤洋
  • Organizer: 令和4年度日本植物病理学会関西部会
• [Presentation] MOLECULAR PHENOLOGY: IN NATURE RESPONSES OF PLANTS TO A SEASONAL ENVIRONMENT (2022)
  • Author(s): Kudoh H
  • Organizer: JIC Friday Seminar
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] Molecular phenology: In natura analyses of plant responses to a seasonal environment (2022)
  • Author(s): Kudoh H
  • Organizer: Department of Evolutionary Biology and Environmental Studies, Universityu of Zurich
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] An in natura study of epigenetic regulation: long-term analyses of H3K27me3 and H3K4me3 in a habitat of Arabidopsis helleri (2022)
  • Author(s): Kudoh H
  • Organizer: 第45回日本分子生物学会年会
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] 低温馴化に対する遺伝子発現応答における季節の効果 (2022)
  • Author(s): 工藤 洋，村中 智明，伊藤 佑，西尾 治幾，本庄 三恵
  • Organizer: 第54回種生物学シンポジウム
• [Presentation] アオウキクサ属の長日・短日植物の比較トランスクリプトーム (2022)
  • Author(s): 村中智明，工藤洋，小山時隆
  • Organizer: 第54回種生物学シンポジウム
• [Presentation] 常緑草本ハクサンハタザオにおける夏季の温度耐性の時系列変化 (2022)
  • Author(s): 湯本原樹，工藤洋
  • Organizer: 第54回種生物学シンポジウム
• [Presentation] アブラナ科タネツケバナ属の分類・進化・生態：見分け方から最新の研究成果まで (2022)
  • Author(s): 工藤 洋
  • Organizer: 2022年度日本植物分類学会
• [Presentation] H3K27ME3-MEDIATED ROBUST MECHANISMS FOR SEASONAL GENE EXPRESSION IN A NATURAL FLUCTUATING Integrative Epigenetics in Plants (2022)
  • Author(s): Kudoh H，Nishio H，Diaana BM
  • Organizer: Cold Spring Harbor Asia Conference
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Flowering-time control in the changing environment (2022)
  • Author(s): Kudoh H
  • Organizer: THE 34TH GENERAL ASSEMBLY OF THE IUBS
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] シロイヌナズナにおける転写と共役した遺伝子内H3K4メチル化の脱メチル化機構 (2022)
  • Author(s): 森秀世, 大矢恵代, 稲垣宗一, 角谷徹仁
  • Organizer: 第15回日本エピジェネティクス研究会年会
• [Presentation] ロマチンリモデリング因子によるヒストンバリアントダイナミクスを介したトランスポゾン調節機構 (2022)
  • Author(s): 越阪部晃永，山﨑慈恵，Bhagyshree J，田中祐梨子，小川公美，Zdravko L，Frederic B，角谷徹仁
  • Organizer: 第15回日本エピジェネティクス研究会年会
• [Presentation] 非ゲノム情報のゲノム内パターン形成における非ゲノム情報間クロストーク - 植物の視点から - (2022)
  • Author(s): 藤泰子、角谷徹仁
  • Organizer: 第74回細胞生物学会 シンポジウム
• [Presentation] シロイヌナズナのトランスポゾン特異的抑制修飾の確立におけるH2A バリアントの役割 (2022)
  • Author(s): 小田頌子、富永さやか、竹内峻平、藤泰子、角谷徹仁
  • Organizer: 第94回日本遺伝学会大会
• [Presentation] RNAポリメラーゼIICTDのリン酸化を介した新奇転写共役的H3K4me2脱メチル化機構 (2022)
  • Author(s): 森秀世, 大矢恵代, 稲垣宗一, 角谷徹仁
  • Organizer: 第94回日本遺伝学会大会
• [Presentation] ２種のDNAメチル化間のクロストークが植物エピゲノムパターン形成を駆動する (2022)
  • Author(s): 藤 泰子, 山崎慈恵, 小田頌子, 富永さやか, 竹内俊平, 角谷徹仁
  • Organizer: 第94回日本遺伝学会大会
• [Presentation] ヒストンバリアントのダイナミクスを介したトランスポゾン調節機構 (2022)
  • Author(s): 越阪部晃永、山﨑慈恵、Bhagyshree J、田中祐梨子、小川公美、Zdravko L、Frederic B、角谷徹仁
  • Organizer: 第95回日本生化学会大会
• [Presentation] Local and global crosstalk among heterochromatin marks drives epigenome patterning in plants (2022)
  • Author(s): To T, Kakutani T
  • Organizer: 第95回日本生化学会大会
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] DDM1によるクロマチンリモデリング活性とそのヒストンバリアント嗜好性 (2022)
  • Author(s): 越阪部晃永、滝沢由政、堀越直樹、Frederic B 、胡桃坂仁志、角谷徹仁
  • Organizer: 第45回日本分子生物学会年会
• [Presentation] Local and global crosstalk among heterochromatin marks drives epigenome patterning in plants (2022)
  • Author(s): To T, Kakutani T
  • Organizer: 第１回非ゲノム情報複製シンポジウム
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] The roles of histone H2A variants for the establishment of transposon-specific silent modification in Arabidopsis. Integrative Epigenetics in Plants (2022)
  • Author(s): Oda S, Tominaga S, Shumpei T, To TK, Kakutani T
  • Organizer: Cold Spring Harbor Asia Conference
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] argeted integrations of copia and gypsy retroelements into non-genic repetitive regions in Arabidopsis. Integrative Epigenetics in Plants (2022)
  • Author(s): Tsukahara S, Kobayashi A, Kawabe A, Kato A, Quadrana L, Laduque B, Kakutani T
  • Organizer: Cold Spring Harbor Asia Conference
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] o-transcriptional removal of H3K4me2 via targeting of demethylase to phosphorylated RNA polymerase II. Integrative Epigenetics in Plants (2022)
  • Author(s): Mori S, Oya S, Inagaki S, Kakutani T
  • Organizer: Cold Spring Harbor Asia Conference
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Comprehensive analyses of rules behind chromatin targeting of H3K4 methyltransferases. Integrative Epigenetics in Plants (2022)
  • Author(s): Oya S, Kakutani T, Noyori T, Inagaki S
  • Organizer: Cold Spring Harbor Asia Conference
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Crosstalk between CG and non-CG DNA methylation drives plant epigenomic pattern formation. Integrative Epigenetics in Plants (2022)
  • Author(s): To TK, Yamasaki C, Oda S, Takeuchi S, Tominaga S, Kakutani T
  • Organizer: Cold Spring Harbor Asia Conference
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Structural and biochemical analyses for the chromatin remodeling activity of DDM1. Integrative Epigenetics in Plants (2022)
  • Author(s): Osakabe A, Takizawa Y, Horikoshi N, Frederic B, Kurumizaka H, and Kakutani T
  • Organizer: Cold Spring Harbor Asia Conference
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Epigenetic control of transposable elements (2022)
  • Author(s): Kakutani T
  • Organizer: Cold Spring Harbor Asia Integrative Epigenetics in Plants
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] 自然生態系における植物ーウイルス相互作用をRNA-seqで紐解く (2022)
  • Author(s): 本庄三恵
  • Organizer: 第11回近畿植物学会講演会
  • Invited
• [Presentation] Phenology of epigenetic regulation: Long-term analyses of H3K27me3 and H3K4me3 in a natural plant population (2022)
  • Author(s): Kudoh H
  • Organizer: RIKEN IMS Seminar
  • Invited
• [Presentation] Determinants of leaf longevity of Arabidopsis halleriunder the seasonal environmental fluctuations (2022)
  • Author(s): Yumoto G, Nishio H, Muranaka T, Sugisaka J, Honjo MN, Kudoh H. 村中智明，工藤洋，伊藤照悟，小山時隆
  • Organizer: 【EPA】日本生態学会大会第69回全国大会
• [Presentation] 遺伝子発現制御の生態学：DNAメチル化・クロマチン修飾・RNAサイレンシング (2022)
  • Author(s): 工藤洋
  • Organizer: 日本生態学会大会第69回全国大会
• [Presentation] 新規の長期低温応答性プロモーターはH3K27me3を介して遺伝子発現を制御する (2022)
  • Author(s): 清水華子，西尾治幾，工藤洋
  • Organizer: 第63回日本植物生理学会年会
• [Presentation] 遺伝子発現制御の生態学：DNAメチル化・クロマチン修飾・RNAサイレンシング「ウイルス感染がもたらす自然環境下での宿主植物トランスクリプトームの応答」 (2022)
  • Author(s): 本庄三恵
  • Organizer: 第69回日本生態学会大会
• [Presentation] フィールド・エピジェネティクス：環境変動下での頑健性の基盤 (2021)
  • Author(s): 工藤 洋
  • Organizer: 日本植物学会第85回大会
• [Presentation] Eurasian phylogeographic study of a widely distributed plant, Cardamine impatiens, based on the genome-wide SNPs by MIG-seq. (2021)
  • Author(s): Iwasaki T, Ebisawa A, Tamura Y, Shiga T, Kucera J, Zozomova-Lihova, Marhold K, Li P, Pak J-H, Choi HJ, Kim Y-D, Sabirov R, Matsuo A, Tsunamoto Y, Suyama Y, Shimizu-Inatsugi R, Shimizu KK, and Kudoh H．
  • Organizer: 東アジア国際植物分類学シンポジウム
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] ハクサンハタザオの４年間毎週トランスクリプトームからわかる自然条件下での遺伝子発現の特徴 (2021)
  • Author(s): 工藤洋，杉阪次郎，本庄三恵
  • Organizer: 第５３回種生物学シンポジウム
• [Presentation] 自然条件下でのカブモザイクウイルスの感染によるハクサンハタザオの死亡と遺伝子発現の関係 (2021)
  • Author(s): 本庄三恵，西尾治幾，村中智明，工藤洋
  • Organizer: 第５３回種生物学シンポジウム
• [Presentation] Molecular Phenology: Seasonal changes in leaf longevity. (2021)
  • Author(s): Kudoh H
  • Organizer: Kyoto-Zurich Workshop in Plant Science 2021
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] シロイヌナズナのトランスポゾンにおける抑制修飾間のクロストーク (2021)
  • Author(s): 小田頌子，藤泰子，富永さやか，角谷徹仁
  • Organizer: 日本遺伝学会 第93回大会
• [Presentation] シロイヌナズナの遺伝子における抑制修飾間のクロストーク (2021)
  • Author(s): 山﨑慈，藤泰子，富永さやか，角谷徹仁
  • Organizer: 日本遺伝学会 第93回大会
• [Presentation] シロイヌナズナにおける転写と共役したH3K4脱メチル化機構 (2021)
  • Author(s): 森秀世，大矢恵代，稲垣宗一，角谷徹仁
  • Organizer: 日本遺伝学会 第93回大会
• [Presentation] 転写領域のエピゲノム修飾による転写抑制に拮抗するメカニズム (2021)
  • Author(s): 矢部寛之助，神尾明日香，大矢恵代，田中尚人，高橋まゆみ，角谷徹仁，稲垣宗一
  • Organizer: 日本遺伝学会 第93回大会
• [Presentation] 転写共役型と（エピ）ゲノムに制御される型の２種類の酵素がH3K4メチル化を担う (2021)
  • Author(s): 大矢恵代，角谷徹仁，稲垣宗一
  • Organizer: 日本遺伝学会 第93回大会
• [Presentation] Mechanism for transposon silencing regulated by chromatin remodeling factor (2021)
  • Author(s): 越阪部晃永，Jamge B，Axelsson E，Kuehn AL，Montgomery SA，Akimcheva S，Pisupati R，Yelagandula R，角谷徹仁 and Berger F
  • Organizer: 日本遺伝学会 第93回大会
• [Presentation] シロイヌナズナのトランスポゾンによる配列特異的な抗抑制系とその速い進化 (2021)
  • Author(s): 角谷徹仁
  • Organizer: 日本遺伝学会 第93回大会
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] ヒストンバリアントのダイナミクスを介したトランスポゾン発現制御機構 (2021)
  • Author(s): 越阪部晃永，山﨑慈恵，田中祐梨子，Jamge B，Lorkovic Z，Berger F，角谷徹仁
  • Organizer: 第44回分子生物学会年会
• [Presentation] The chromatin remodeling factor DDM1 mediates the deposition of heterochromatic histone variant for TE silencing (2021)
  • Author(s): Osakabe A, Jamge B, Axelsson E, Montgomery SA, Akimcheva S, Kuehn AL, Pisupati R, Lorkovic ZJ，Yelagandula R, Kakutani T, Berger F
  • Organizer: Cold Spring Harbor Asia “Integrative Epigenetics in Plants” Pre-conference
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] How are transposable elements (TEs) specifically modified and silenced? (2021)
  • Author(s): Kakutani T
  • Organizer: Cold Spring Harbor Asia “Integrative Epigenetics in Plants” Pre-conference
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] ヒストンバリアントによるトランスポゾン発現制御機構 (2021)
  • Author(s): 越阪部晃永，山﨑慈恵，田中祐梨子，Jamge B，Lorkovic Z，Berger F，角谷徹仁
  • Organizer: 第39回染色体ワークショップ・第20回核ダイナミクス研究会
• [Presentation] ウイルス生態学：水域から陸域へ (2021)
  • Author(s): 本庄三恵
  • Organizer: 第53回種生物学シンポジウム
• [Presentation] RNA-seqで見る継続感染下での 植物―ウイルス相互作用 (2021)
  • Author(s): 本庄三恵
  • Organizer: 縦横無尽の会
  • Invited
• [Presentation] 自然条件下でのカブモザイクウイルスの感染によるハクサンハタザオの死亡と遺伝子発現の関係 (2021)
  • Author(s): 本庄三恵，西尾治幾，村中智明，工藤洋
  • Organizer: 第53回種生物学シンポジウム
• [Presentation] クロノタイプ効果による適応形質の多様化：短日植物における限界日長の局所適応 (2021)
  • Author(s): 村中智明，工藤洋，伊藤照悟，小山時隆
  • Organizer: 日本生態学会大会第69回大会
• [Book] 植物における遺伝子名およびタンパク質名の表記方法、P 169-171、（種生物学会、山尾僚、川窪伸光編）「植物の行動生態学」 (2023)
  • Author(s): 本庄三恵
  • Total Pages: 224
  • Publisher: 文一総合出版
  • ISBN: 9784829962091
• [Book] 植物の記憶：誘導防御とプライミングP173-200（種生物学会、山尾僚、川窪伸光編）「植物の行動生態学」 (2023)
  • Author(s): 本庄三恵，工藤洋
  • Total Pages: 224
  • Publisher: 文一総合出版
  • ISBN: 9784829962091
• [Book] エピジェネティック防御とプライミング記憶P201-203（種生物学会、山尾僚、川窪伸光編）「植物の行動生態学」 (2023)
  • Author(s): 本庄三恵，工藤洋
  • Total Pages: 224
  • Publisher: 文一総合出版
  • ISBN: 9784829962091