Creation of artificial genetic system with acyclic artificial nucleic acids and application to evolutionary molecular engineering

• Project/Area Number: 21H05025
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Review Section: Broad Section E
• Research Institution: Nagoya University
• Principal Investigator: 浅沼 浩之 名古屋大学, 工学研究科, 教授 (20282577)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 根本 直人 埼玉大学, 理工学研究科, 教授 (60509727)
• Project Period (FY): 2021-07-05 – 2026-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥190,450,000 (Direct Cost: ¥146,500,000、Indirect Cost: ¥43,950,000); Fiscal Year 2025: ¥33,020,000 (Direct Cost: ¥25,400,000、Indirect Cost: ¥7,620,000); Fiscal Year 2024: ¥32,110,000 (Direct Cost: ¥24,700,000、Indirect Cost: ¥7,410,000); Fiscal Year 2023: ¥27,560,000 (Direct Cost: ¥21,200,000、Indirect Cost: ¥6,360,000); Fiscal Year 2022: ¥43,550,000 (Direct Cost: ¥33,500,000、Indirect Cost: ¥10,050,000); Fiscal Year 2021: ¥54,210,000 (Direct Cost: ¥41,700,000、Indirect Cost: ¥12,510,000)
• Keywords: 人工核酸 / Pre-RNA world / 化学ライゲーション / SNA / L-aTNA / PNA

Outline of Research at the Start

本申請では、１）L-aTNAを”ゲノム”に見立てた自己複製(L-aTNA→L-aTNA)・転写（L-aTNA→DNA(RNA)）・逆転写(DNA(RNA)→L-aTNA)という人工遺伝システムを非酵素的に実現することで、L-aTNAがPre-RNAワールド仮説の候補になりうる原始核酸であることを実証し、さらに２）この人工遺伝システムを活用したL-aTNA人工アプタマー創成へと展開する。

Outline of Annual Research Achievements

鋳型鎖をDNAおよびRNAに代えて連結反応（逆転写反応）を行った。まず17 merの鋳型鎖上で2本の相補的な8-merのL-aTNAフラグメントの連結反応を行ったところ、Mn2+/CNImを縮合剤に使用しL-aTNA鋳型鎖の場合の連結反応速度が4℃で1.5 h-1だったのに対し、DNAおよびRNA鋳型鎖上ではそれぞれ1.1 h-1、1.2 h-1と、L-aTNA鋳型鎖と遜色ない速度で進行した。次に8-merのL-aTNAプライマーと3種類の相補的な3-merのL-aTNAフラグメントを用いて17merのDNAあるいはRNA鋳型鎖上で逐次的連結反応を4℃で行ったところ、いずれの場合も4℃24時間で完全長のL-aTNA鎖がほぼ100%で得られた。進捗状況で詳細に記すように、DNAおよびRNAの骨格のキラリティーが化学ライゲーションを促進することが明らかとなった。
この結果を受け、DNAの連結反応についても鋳型鎖を32 merのDNAに代えて16 merのDNAフラグメント同士のCd2+とCNImで連結反応を行った。その結果、Mn2+イオンを用いた場合の10倍以上反応速度が向上し、25℃2時間で90%以上の収率で連結反応が進行した。我々が発見したCNImとCd2+の組み合わせによる連結反応はリガーゼに匹敵する速度であった。そこでhalf-sliding型DNAを用いて長鎖DNA二重鎖の合成を、T4リガーゼとCNIm/Cd2+で比較したところ、CNIm/Cd2+の方がT4リガーゼより長いDNA二重鎖を合成できることが判明した。
さらに化学ライゲーションの主鎖骨格が与える影響についてSNAとL-aTNAの比較を行い、らせんの誘起とライゲーション部位の局所構造が影響を与えることが判明した。特に局所構造の相違は顕著であった。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

ライゲーション速度に与える影響について、主鎖がL-aTNAと酷似しているが骨格のユニットがアキラルなセリノールで構成される非環状型人工核酸SNAと、ライゲーション速度を比較した。興味深いことにSNAの化学ライゲーションは、求核性の高い一級水酸基を有するにもかかわらず、ライゲーション効率は大きく低下した。そこでSNA鎖中にL-aTNAユニットを部分的に導入したところ、らせん誘起に伴いSNAユニット同士のライゲーション速度の向上が観察された。次にSNA鎖中にライゲーション部位のみにL-aTNAユニットを導入したところ、fullのL-aTNA鎖に匹敵するライゲーション速度が得られた。これらの事実から、らせん構造の誘起と局所構造の両方がライゲーション速度の向上に貢献するが、特にライゲーション部位のキラリティーが重要であることが明らかとなった。さらにキラルな超分子であるDNAとRNAを鋳型にした場合、L-aTNA鎖のライゲーションはSNAを鋳型に用いた場合よりも優位に高いことも判明した。これらの結果は、キラリティーが配列複製を加速することを示した最初の例であり、生命の進化においてキラルな骨格が選ばれたことと密接に関係していると考えている。
これらの結果を踏まえ、RNA→L-aTNAへの効率的な逆転写も実現した。この過程でCd2+/CNIm（あるいはMn2+/CNIm）によるDNAの化学ライゲーションがリガーゼに匹敵する速度で進行することを明らかにした。またL-aTNA→DNA/RNAへの配列転写も、オプションとして提案したDNAランダムプールから人工核酸に相補的なDNAのみを釣り上げてくる方法が有効であることも明らかにした。このように研究機関後半の大きな課題であるL-aTNAアプタマー取得のための進化サイクルに向けた要素研究は現段階でほぼ実現した。

Strategy for Future Research Activity

研究計画に沿って１）L-aTNA二重鎖の自己増幅、２）金属錯体化による連結反応の高速化、３）L-aTNAアプタマー取得　を行う。
２）の金属錯体については、イミダゾール系の配位子を検討すると同時に、生命の起源の観点から、ヒスチジン/金属イオン（Mn2+, Cd2+など）/BrCNの三元系での効率的な化学ライゲーションの可能性を検討する。アミノ酸のヒスチジンで化学ライゲーションが可能ならば、我々が提唱するアミノ酸ベースのPre-RNA仮説が説得力を持つようになる。
３）のアプタマー取得に関しては、研究計画ではトロンビンアプタマーを計画していたが、トロンビンと同様に比較的短い配列でアプタマー取得が報告されているATPも標的とする。また効率的な化学ライゲーションを利用して、ストレプトアビジン修飾磁気ビーズを使わず全て水溶液中でL-aTNA→DNA配列転写する方法も併せて検討し、L-aTNAアプタマー取得へ応用する。

Assessment Rating

Interim Assessment Comments (Rating)

A: In light of the aim of introducing the research area into the research categories, the expected progress has been made in research.

Research Products

• [Journal Article] Unexpectedly stable homopurine parallel triplex of SNA:RNA*SNA and L-aTNA:RNA*L-aTNA (2024)
  • Author(s): Kamiya Yukiko、Lao Siyuan、Ariyoshi Jumpei、Sato Fuminori、Asanuma Hiroyuki
  • Journal Title: Chemical Communications Volume: 60 Issue: 10 Pages: 1257-1260
  • DOI: 10.1039/d3cc05555h
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] DNA Reaction System That Acquires Classical Conditioning (2024)
  • Author(s): Nakakuki Takashi、Toyonari Masato、Aso Kaori、Murayama Keiji、Asanuma Hiroyuki、de Greef Tom F. A.
  • Journal Title: ACS Synthetic Biology Volume: 13 Issue: 2 Pages: 521-529
  • DOI: 10.1021/acssynbio.3c00459
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Site‐Selective Photo‐Crosslinking of Stilbene Pairs in a DNA Duplex Mediated by Ruthenium Photocatalyst (2024)
  • Author(s): Kashida Hiromu、Azuma Hidenori、Sotome Hikaru、Miyasaka Hiroshi、Asanuma Hiroyuki
  • Journal Title: Angewandte Chemie International Edition Volume: 63 Issue: 14
  • DOI: 10.1002/anie.202319516
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Photosensitization of TiO2 electrodes immobilized with chiral plasmonic Au nanocolloids by circularly polarized light irradiation (2024)
  • Author(s): Kameyama Tatsuya、Isogawa Shuji、Akiyoshi Kazutaka、Kashida Hiromu、Asanuma Hiroyuki、Torimoto Tsukasa
  • Journal Title: The Journal of Chemical Physics Volume: 160 Issue: 9 Pages: 094709-094709
  • DOI: 10.1063/5.0192366
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Syntheses of Base-Labile Pseudo-Complementary SNA and L-aTNA Phosphoramidite Monomers (2023)
  • Author(s): Sato Fuminori、Kamiya Yukiko、Asanuma Hiroyuki
  • Journal Title: The Journal of Organic Chemistry Volume: 88 Issue: 2 Pages: 796-804
  • DOI: 10.1021/acs.joc.2c01911
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Orientational Control of Circularly Polarized Luminescence from Pyrene Clusters by Using a DNA Scaffold (2023)
  • Author(s): Kashida Hiromu、Ito Yuka、Kakuta Takahiro、Ogoshi Tomoki、Asanuma Hiroyuki
  • Journal Title: Chemistry - A European Journal Volume: 29 Issue: 22
  • DOI: 10.1002/chem.202300182
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Rapid Chemical Ligation of DNA and Acyclic Threoninol Nucleic Acid (aTNA) for Effective Nonenzymatic Primer Extension (2023)
  • Author(s): Okita Hikari、Kondo Shuto、Murayama Keiji、Asanuma Hiroyuki
  • Journal Title: Journal of the American Chemical Society Volume: 145 Issue: 32 Pages: 17872-17880
  • DOI: 10.1021/jacs.3c04979
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Illuminating miRNA Inhibition: Visualizing the Interaction between Anti-miRNA Oligonucleotide and Target miRNA Using FRET (2023)
  • Author(s): Zhu Hongyu、Kamiya Yukiko、Asanuma Hiroyuki
  • Journal Title: ACS Chemical Biology Volume: 18 Issue: 10 Pages: 2281-2289
  • DOI: 10.1021/acschembio.3c00353
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Highly Functional Acyclic Xeno Nucleic Acids (2023)
  • Author(s): Murayama Keiji、Okita Hikari、Asanuma Hiroyuki
  • Journal Title: Bulletin of the Chemical Society of Japan Volume: 96 Issue: 10 Pages: 1179-1187
  • DOI: 10.1246/bcsj.20230188
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Functionalization of acyclic xenonucleic acid with modified nucleobases (2023)
  • Author(s): Murayama Keiji、Yamano Yuuhei、Asanuma Hiroyuki
  • Journal Title: Polymer Journal Volume: 55 Issue: 7 Pages: 743-752
  • DOI: 10.1038/s41428-023-00776-7
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] A novel agonist with homobivalent single-domain antibodies that bind the FGF receptor 1 domain III functions as an FGF2 ligand (2023)
  • Author(s): Yonehara Ryo、Kumachi Shigefumi、Kashiwagi Kenji、Wakabayashi-Nakao Kanako、Motohashi Maiko、Murakami Taihei、Yanagisawa Teruhiko、Arai Hidenao、Murakami Akikazu、Ueno Yukio、Nemoto Naoto、Tsuchiya Masayuki
  • Journal Title: Journal of Biological Chemistry Volume: 299 Issue: 2 Pages: 102804-102804
  • DOI: 10.1016/j.jbc.2022.102804
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] RNA以前の世界を妄想する (2022)
  • Author(s): 浅沼浩之、村山恵司
  • Journal Title: 化学と工業 Volume: 75(8) Pages: 552-554
• [Journal Article] DNA二重鎖を利用したFRET配向依存性の検討 (2022)
  • Author(s): 樫田 啓, 浅沼浩之
  • Journal Title: 光化学 Volume: 53(3) Pages: 148-153
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Unexpected Dissociation of Photoresponsive UV-ON DNA Carrying p-tert-Butyl Azobenzene under UV Light Irradiation (2022)
  • Author(s): Ishii Satsuki、Murayama Keiji、Sada Kazuki、Asanuma Hiroyuki、Kakugo Akira
  • Journal Title: Chemistry Letters Volume: 51 Issue: 3 Pages: 292-295
  • DOI: 10.1246/cl.210788
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Signal Amplification Circuit Composed of Serinol Nucleic Acid for RNA Detection (2022)
  • Author(s): Chen Yanglingzhi、Murayama Keiji、Asanuma Hiroyuki
  • Journal Title: Chemistry Letters Volume: 51 Issue: 3 Pages: 330-333
  • DOI: 10.1246/cl.210813
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Color-Changing Fluorescent Barcode Based on Strand Displacement Reaction Enables Simple Multiplexed Labeling (2022)
  • Author(s): Makino Koki、Susaki Etsuo A.、Endo Motomu、Asanuma Hiroyuki、Kashida Hiromu
  • Journal Title: Journal of the American Chemical Society Volume: 144 Issue: 4 Pages: 1572-1579
  • DOI: 10.1021/jacs.1c09844
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Renewable DNA Proportional-Integral Controller with Photoresponsive Molecules (2022)
  • Author(s): Tamba Masaaki、Murayama Keiji、Asanuma Hiroyuki、Nakakuki Takashi
  • Journal Title: Micromachines Volume: 13 Issue: 2 Pages: 193-193
  • DOI: 10.3390/mi13020193
  • NAID: 120007186030
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Orthogonal Amplification Circuits Composed of Acyclic Nucleic Acids Enable RNA Detection (2022)
  • Author(s): Chen Yanglingzhi、Nagao Ryuya、Murayama Keiji、Asanuma Hiroyuki
  • Journal Title: Journal of the American Chemical Society Volume: 144 Issue: 13 Pages: 5887-5892
  • DOI: 10.1021/jacs.1c12659
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Methyl group configuration on acyclic threoninol nucleic acids (aTNAs) impacts supramolecular properties (2022)
  • Author(s): Murayama Keiji、Kashida Hiromu、Asanuma Hiroyuki
  • Journal Title: Organic & Biomolecular Chemistry Volume: - Issue: 20 Pages: 4115-4122
  • DOI: 10.1039/d2ob00266c
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Cooperative cargo transportation by a swarm of molecular machines (2022)
  • Author(s): Akter M.、Keya J. J.、Kayano K.、Kabir A. M. R.、Inoue D.、Hess H.、Sada K.、Kuzuya A.、Asanuma H.、Kakugo A.
  • Journal Title: Science Robotics Volume: 7 Issue: 65
  • DOI: 10.1126/scirobotics.abm0677
  • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Kinesin motors driven microtubule swarming triggered by UV light (2022)
  • Author(s): Ishii Satsuki、Akter Mousumi、Murayama Keiji、Kabir Arif Md. Rashedul、Asanuma Hiroyuki、Sada Kazuki、Kakugo Akira
  • Journal Title: Polymer Journal Volume: 54 Issue: 12 Pages: 1501-1507
  • DOI: 10.1038/s41428-022-00693-1
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] DNA Concentration Regulator That can be Driven for a Long Time (2022)
  • Author(s): Takashi Nakakuki, Keiji Murayama & Hiroyuki Asanuma
  • Journal Title: New Generation Computing Volume: 40 Issue: 2 Pages: 681-702
  • DOI: 10.1007/s00354-022-00173-3
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Construction of a Humanized Artificial VHH Library Reproducing Structural Features of Camelid VHHs for Therapeutics (2022)
  • Author(s): T. Murakami, S. Kumachi, Y. Matsunaga, M. Sato, K. Wakabayashi-Nakao, H. Masaki, R. Yonehara, M. Motohashi, N. Nemoto, and M. Tsuchiya
  • Journal Title: Antibodies Volume: 11 Issue: 1 Pages: 10-10
  • DOI: 10.3390/antib11010010
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Comprehensive analysis of transglutaminase substrate preference by cDNA display coupled with next-generation sequencing and bioinformatics (2022)
  • Author(s): Damnjanovic Jasmina、Odake Nana、Fan Jicheng、Camagna Maurizio、Jia Beixi、Kojima Takaaki、Nemoto Naoto、Hitomi Kiyotaka、Nakano Hideo
  • Journal Title: Scientific Reports Volume: 12 Issue: 1 Pages: 13578-13578
  • DOI: 10.1038/s41598-022-17494-4
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Xeno nucleic acids (XNAs) having non-ribose scaffolds with unique supramolecular properties (2022)
  • Author(s): Asanuma Hiroyuki、Kamiya Yukiko、Kashida Hiromu、Murayama Keiji
  • Journal Title: Chemical Communications Volume: 58 Issue: 25 Pages: 3993-4004
  • DOI: 10.1039/d1cc05868a
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Possibility of pre-RNA world with acyclic XNA before RNA (2021)
  • Author(s): 浅沼 浩之、沖田 ひかり、村山 恵司
  • Journal Title: Viva Origino Volume: 49 Issue: 3 Pages: 9
  • DOI: 10.50968/vivaorigino.49_9
  • NAID: 130008130258
  • ISSN: 0910-4003, 1346-6933
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Interleukin-17A Peptide Aptamers with an Unexpected Binding Moiety Selected by cDNA Display under Heterogenous Conditions (2021)
  • Author(s): Anzai Hiroki、Terai Takuya、Wakabayashi-Nakao Kanako、Noguchi Taro、Kumachi Shigefumi、Tsuchiya Masayuki、Nemoto Naoto
  • Journal Title: ACS Medicinal Chemistry Letters Volume: 12 Issue: 9 Pages: 1427-1434
  • DOI: 10.1021/acsmedchemlett.1c00217
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Nasal delivery of single-domain antibody improves symptoms of SARS-CoV-2 infection in an animal model (2021)
  • Author(s): Haga Kei、Takai-Todaka Reiko、Matsumura Yuta、Song Chihong、Takano Tomomi、Tojo Takuto、Nagami Atsushi、Ishida Yuki、Masaki Hidekazu、Tsuchiya Masayuki、Ebisudani Toshiki、Sugimoto Shinya、Sato Toshiro、Yasuda Hiroyuki、Fukunaga Koichi、Sawada Akihito、Nemoto Naoto、Murata Kazuyoshi、Morimoto Takuya、Katayama Kazuhiko
  • Journal Title: PLOS Pathogens Volume: 17 Issue: 10 Pages: 1009542-1009542
  • DOI: 10.1371/journal.ppat.1009542
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] A Pyrene‐Modified Serinol Nucleic Acid Nanostructure Converts the Chirality of Threoninol Nucleic Acids into Circularly Polarized Luminescence Signals (2021)
  • Author(s): Kashida Hiromu、Nishikawa Keiji、Ito Yuka、Murayama Keiji、Hayashi Ichiyo、Kakuta Takahiro、Ogoshi Tomoki、Asanuma Hiroyuki
  • Journal Title: Chemistry A European Journal Volume: 27 Issue: 59 Pages: 14582-14585
  • DOI: 10.1002/chem.202102333
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 蛍光色素導入SNAを利用したらせん増幅能評価 (2024)
  • Author(s): 杉山乙珠, 樫田 啓, 浅沼浩之
  • Organizer: 日本化学会第10春季年会
• [Presentation] DNAとの二重鎖形成による人工塩基導入SNAの配列解析 (2024)
  • Author(s): 日比野希美, 浅沼浩之, 樫田 啓
  • Organizer: 日本化学会第10春季年会
• [Presentation] 人工塩基を導入したPNA配列解析法の開発 (2024)
  • Author(s): 稲垣 和真、樫田 啓, 愛場雄一郎, 荘司長三, 浅沼浩之
  • Organizer: 日本化学会第10春季年会
• [Presentation] パラレル型ホモプリンXNAが形成するユニークな三重鎖構造 (2024)
  • Author(s): 労 思源, 有吉純平, 佐藤史経, 浅沼浩之, 神谷由紀子
  • Organizer: 日本化学会第10春季年会
• [Presentation] 光応答性核酸塩基を導入したXNA三重鎖によるナノ構造体形成 (2024)
  • Author(s): 村山恵司, 平野桂人, 浅沼浩之
  • Organizer: 日本化学会第10春季年会
• [Presentation] Ru錯体を利用した部位特異的DNA光架橋法の開発 (2024)
  • Author(s): 樫田 啓, 東 秀憲, 五月女 光, 宮坂 博, 浅沼浩之
  • Organizer: 日本化学会第10春季年会
• [Presentation] 人工核酸L-aTNAの長鎖伸長反応を目指したケミカルライゲーションの反応機構解析 (2024)
  • Author(s): 沖田ひかり, 村山恵司, 浅沼浩之
  • Organizer: 日本化学会第10春季年会
• [Presentation] FRETを応用した抗miRNA核酸の作用機序解析法の開発 (2024)
  • Author(s): 朱 紅宇, 神谷由紀子, 浅沼浩之
  • Organizer: 日本化学会第10春季年会
• [Presentation] DNAに導入したRu(II)錯体によるスチルベンの可視光二量化反応 (2023)
  • Author(s): 東 秀憲、浅沼浩之、樫田 啓
  • Organizer: 第72回高分子年次大会
• [Presentation] Orthogonal amplification circuits with acyclic nucleic acids (2023)
  • Author(s): Hiroyuki Asanuma, Ryuya Nagao, Keiji Murayama
  • Organizer: 17th International Symposium on Macrocyclic and Supramolecular Chemistry (ISMSC 2023)
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Photo-controllable Acyclic Xeno Nucleic Acid with Adenine Analogues (2023)
  • Author(s): Keiji Murayama, Yuuhei Yamano, Hiroyuki Asanuma
  • Organizer: 17th International Symposium on Macrocyclic and Supramolecular Chemistry (ISMSC 2023)
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Chemical Template-Directed Synthesis for Replication of Acyclic L-Threoninol Nucleic Acids (2023)
  • Author(s): Hikari Okita, Keiji Murayama, Hiroyuki Asanuma
  • Organizer: 17th International Symposium on Macrocyclic and Supramolecular Chemistry (ISMSC 2023)
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Development of efficient light harvesting antenna using DNA junction with multiple fluorophores (2023)
  • Author(s): Hidenori Azuma, Hiroyuki Asanuma, Hiromu Kashida
  • Organizer: 17th International Symposium on Macrocyclic and Supramolecular Chemistry (ISMSC 2023)
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Serinol nucleic acid(SNA)からなるmiR-21阻害型アンチセンス核酸の開発 (2023)
  • Author(s): 佐藤史経、神谷由紀子、浅沼浩之
  • Organizer: 第33回バイオ・高分子シンポジウム
• [Presentation] 人工核酸ナノ構造体を利用したキロプティカルシグナル発現 (2023)
  • Author(s): 樫田 啓、西川慧史、浅沼浩之
  • Organizer: 第33回バイオ・高分子シンポジウム
• [Presentation] 非環状型人工核酸が形成する新規な三重鎖構造 (2023)
  • Author(s): 労 思源、神谷由紀子、浅沼浩之
  • Organizer: 第33回バイオ・高分子シンポジウム
• [Presentation] 人工核酸L-aTNAを用いた膜貫通三重鎖の開発 (2023)
  • Author(s): 劉 凱夫、村山恵司、浅沼浩之
  • Organizer: 第33回バイオ・高分子シンポジウム
• [Presentation] ペリレン-Cy3間FRETを利用したDNA構造解析 (2023)
  • Author(s): 樫田 啓、河合隼人、浅沼浩之
  • Organizer: 2023年 光化学討論会
• [Presentation] 8-Pyrenylvinyl adenine導入L-aTNAの三重鎖形成を介した構造体の光制御 (2023)
  • Author(s): 平野桂人、村山恵司、浅沼浩之
  • Organizer: 2023年 光化学討論会
• [Presentation] Ru(II)錯体によるスチルベンの可視光二量化反応を利用したDNA二重鎖の架橋反応 (2023)
  • Author(s): 東 秀憲、浅沼浩之、樫田 啓
  • Organizer: 2023年 光化学討論会
• [Presentation] 人工核酸L-aTNAとDNAのケミカルライゲーションの速度論解析に基づく長鎖伸長反応の開発 (2023)
  • Author(s): 沖田ひかり、村山恵司、浅沼浩之
  • Organizer: 第17回バイオ関連化学シンポジウム
• [Presentation] 二重鎖形成を利用した人工核酸の配列解析 (2023)
  • Author(s): 樫田 啓、香川恵未莉、清水優香、愛場雄一郎、荘司長三、浅沼浩之
  • Organizer: 第17回バイオ関連化学シンポジウム
• [Presentation] Ru(II)錯体によるスチルベンの可視光二量化反応を利用したDNA二重鎖の安定化 (2023)
  • Author(s): 東 秀憲、浅沼浩之、樫田 啓
  • Organizer: 第17回バイオ関連化学シンポジウム
• [Presentation] 非環状型人工核酸からなるASOの細胞内取り込み経路と細胞内動態の解析 (2023)
  • Author(s): 坂下清佳、神谷由紀子、浅沼浩之
  • Organizer: 第17回バイオ関連化学シンポジウム
• [Presentation] 人工六重鎖を利用した超分子ポリマーの開発 (2023)
  • Author(s): 高柳 蓮、浅沼浩之、樫田 啓
  • Organizer: 第17回バイオ関連化学シンポジウム
• [Presentation] 非環状型核酸を基にした新規環状型人工核酸の開発 (2023)
  • Author(s): 柴田珠花、村山恵司、浅沼浩之
  • Organizer: 第17回バイオ関連化学シンポジウム
• [Presentation] 非環状型人工核酸が形成する三重鎖構造の解析 (2023)
  • Author(s): 労 思源、神谷由紀子、浅沼浩之
  • Organizer: 第17回バイオ関連化学シンポジウム
• [Presentation] 天然アミノ酸L-スレオニン由来の人工核酸を用いた非酵素的な鋳型合成 (2023)
  • Author(s): 沖田ひかり、村山恵司、浅沼浩之
  • Organizer: 細胞を創る研究会
• [Presentation] Ru(II)錯体によるスチルベンの可視光二量化反応を利用したDNA二重鎖の安定性制御 (2023)
  • Author(s): 東 秀憲、浅沼浩之、樫田 啓
  • Organizer: 第72回高分子討論会
• [Presentation] 非環状型人工核酸SNA, L-aTNAが形成する異常な三重鎖構造 (2023)
  • Author(s): 浅沼浩之、労 思源、神谷 由紀子
  • Organizer: 第72回高分子討論会
• [Presentation] 人工核酸L-aTNAの非酵素的な鋳型重合における反応メカニズム解析と長鎖伸長反応への応用 (2023)
  • Author(s): 沖田ひかり、村山恵司、浅沼浩之
  • Organizer: 第72回高分子討論会
• [Presentation] 8-Pyrenylvinyl adenine導入L-aTNAの三重鎖形成を介したナノ構造体の光制御 (2023)
  • Author(s): 平野桂人、村山恵司、浅沼浩之
  • Organizer: 第72回高分子討論会
• [Presentation] Intracellular visualization of interaction between anti-miRNA oligonucleotide and its target miRNA (2023)
  • Author(s): Hongyu Zhu、Yukiko Kamiya、Hiroyuki Asanuma
  • Organizer: International Symposium on Nucleic Acids Chemistry (ISNAC2023)
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Development of anti miR-21 oligonucleotide consisting of only SNA, an acyclic artificial nucleic acid (2023)
  • Author(s): Fuminori Sato, Yukiko Kamiya, Hiroyuki Asanuma
  • Organizer: OTS symposium
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Orthogonal amplification circuits for RNA detection with acyclic artificial nucleic acids (2023)
  • Author(s): Hiroyki Asanuma
  • Organizer: 16th Eurasia Conference on Chemical Sciences 2023
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] 反応メカニズム解析に基づく人工核酸L-aTNAの化学的な鎖伸長反応の高効率化 (2023)
  • Author(s): 沖田ひかり, 村山恵司, 浅沼浩之
  • Organizer: 日本化学会第103春季年会
• [Presentation] 二重鎖形成を利用した人工核酸配列解析法の開発 (2023)
  • Author(s): 樫田 啓, 香川恵未莉, 清水優香, 戸谷恵介, 愛場雄一郎, 荘司長三, 浅沼浩之
  • Organizer: 日本化学会第103春季年会
• [Presentation] 非環状型人工核酸を用いたGapmer型アンチセンス核酸の毒性軽減法の開発 (2023)
  • Author(s): 樋口昌也, 神谷由紀子, 浅沼浩之
  • Organizer: 日本化学会第103春季年会
• [Presentation] 非環状型人工核酸SNA, L-aTNAの細胞内取り込み経路と細胞内動態の解析 (2023)
  • Author(s): 神谷由紀子, 坂下清佳, 浅沼浩之
  • Organizer: 日本化学会第103春季年会
• [Presentation] 非環状型人工核酸が形成するユニークな三重鎖構造 (2023)
  • Author(s): 神谷由紀子, 労 思源, 浅沼浩之
  • Organizer: 日本化学会第103春季年会
• [Presentation] 三重鎖の光制御を目指した8-Pyrenylvinyl adenine導入L-aTNAの開発 (2023)
  • Author(s): 平野桂人, 村山恵司, 浅沼浩之
  • Organizer: 日本化学会第103春季年会
• [Presentation] Ru(II)錯体導入DNAによるスチルベンの可視光二量化反応 (2023)
  • Author(s): 東 秀憲, 浅沼浩之, 樫田 啓
  • Organizer: 日本化学会第103春季年会
• [Presentation] 非環状型人工核酸の修飾によるGapmer型アンチセンス核酸の毒性軽減法の開発 (2023)
  • Author(s): 樋口昌也, 神谷由紀子, 浅沼浩之
  • Organizer: 日本薬学会 第143年会
• [Presentation] 非環状型人工核酸SNA, L-aTNAの細胞内導入経路と細胞内動態の解析 (2023)
  • Author(s): 神谷由紀子, 坂下清佳, 浅沼浩之
  • Organizer: 日本薬学会 第143年会
• [Presentation] Pseudo-complementary SNA/L-aTNAの合成と自己二重鎖形成の抑制 (2023)
  • Author(s): 佐藤史経, 神谷由紀子, 浅沼浩之
  • Organizer: 日本薬学会 第143年会
• [Presentation] Pre-RNAワールド実証に向けた非環状型人工核酸（L-aTNA）の進化工学 (2023)
  • Author(s): 瀧澤佐恵、沖田ひかり、村山恵司、浅沼浩之、根本直人
  • Organizer: 第45回日本分子生物学会
• [Presentation] 新たな創薬モダリティとしての非環状型人工核酸 (2022)
  • Author(s): 浅沼浩之
  • Organizer: Link-J "名古屋大学発！先進的な取り組み事例×展望 vol.2 ～核酸医薬開発の新展開～"
  • Invited
• [Presentation] N-シアノイミダゾールを利用したDNA ケミカルライゲーションの高速化と応用 (2022)
  • Author(s): 近藤修斗、沖田ひかり、村山恵司、浅沼浩之
  • Organizer: 第32回バイオ・高分子シンポジウム
• [Presentation] 人工核酸aTNAを利用した直交性HCRの開発とRNA検出への応用 (2022)
  • Author(s): 村山恵司、陳 楊凌志、長尾竜弥、浅沼浩之
  • Organizer: 第32回バイオ・高分子シンポジウム
• [Presentation] 人工核酸L-aTNA・SNAを用いた非酵素的な鋳型重合の反応速度論解析と転写法への応用 (2022)
  • Author(s): 沖田ひかり、村山恵司、浅沼浩之
  • Organizer: 第32回バイオ・高分子シンポジウム
• [Presentation] 核酸の鎖交換反応を利用した蛍光色変化型バーコードによる多重タンパク質イメージング (2022)
  • Author(s): 牧野航海、浅沼浩之、樫田 啓
  • Organizer: 第32回バイオ・高分子シンポジウム
• [Presentation] 非環状型人工核酸からなるエキソンスキップ型アンチセンス核酸の評価 (2022)
  • Author(s): 神谷由紀子, 崔茜茜, 桑島諒太, 浅沼浩之
  • Organizer: 日本核酸医薬学会第7回年会
• [Presentation] FRET型プローブによるSNA型AMOと標的miRNAの相互作用の可視化 (2022)
  • Author(s): 朱 紅宇、神谷由紀子、浅沼浩之
  • Organizer: 日本核酸医薬学会第7回年会
• [Presentation] 塩基条件下で脱保護可能なPseudo-complementary SNA/L-aTNA amidite monomerの合成 (2022)
  • Author(s): 佐藤史経、神谷由紀子、浅沼浩之
  • Organizer: 日本核酸医薬学会第7回年会
• [Presentation] 人工核酸L-aTNAの非酵素的な鋳型重合の速度論解析に基づく長鎖伸長反応法の開発 (2022)
  • Author(s): 沖田ひかり、村山恵司、浅沼浩之
  • Organizer: 第71回高分子討論会
• [Presentation] 蛍光色が変化する核酸蛍光バーコードを用いたタンパク質のマルチイメージング (2022)
  • Author(s): 牧野航海、浅沼浩之、樫田 啓
  • Organizer: 第71回高分子討論会
• [Presentation] 非環状型XNAを利用した直交性シグナル増幅回路の開発とRNA検出への応用 (2022)
  • Author(s): 村山恵司、陳 楊凌志、長尾竜弥、浅沼浩之
  • Organizer: 第71回高分子討論会
• [Presentation] DNAを利用した色素-金属錯体間エネルギー移動の検討 (2022)
  • Author(s): 東 秀憲、浅沼浩之、樫田 啓
  • Organizer: 第16回バイオ関連化学シンポジウム
• [Presentation] 人工核酸L-aTNAとSNAの化学的な鋳型合成の速度論解析を基盤とした長鎖伸長反応法の構築 (2022)
  • Author(s): 沖田ひかり、村山恵司、浅沼浩之
  • Organizer: 第16回バイオ関連化学シンポジウム
• [Presentation] 塩基性条件下で脱保護可能なPseudo-complementary核酸塩基のSNA/L-aTNAホスホロアミダイトモノマーの合成 (2022)
  • Author(s): 佐藤史経、神谷由紀子、浅沼浩之
  • Organizer: 第16回バイオ関連化学シンポジウム
• [Presentation] SNA型抗アンチセンス核酸の細胞内作用機構解明に向けたFRET検出システムの開発 (2022)
  • Author(s): 朱 紅宇、神谷由紀子、浅沼浩之
  • Organizer: 第16回バイオ関連化学シンポジウム
• [Presentation] 光クロスリンク解析によるDicer-Platform/PAZのRNAコンタクトサイトの探索 (2022)
  • Author(s): 神谷由紀子、鈴木駿也、横田徳子、津田弘貴、吉田健司、浅沼浩之
  • Organizer: 第16回バイオ関連化学シンポジウム
• [Presentation] 非環状型XNAで構成される直交性シグナル増幅回路の開発とRNA検出への応用 (2022)
  • Author(s): 村山恵司、陳 楊凌志、長尾竜弥、浅沼浩之
  • Organizer: 第16回バイオ関連化学シンポジウム
• [Presentation] DNA junctionを利用した色素-金属錯体間エネルギー移動の検討 (2022)
  • Author(s): 東 秀憲、浅沼浩之、樫田 啓
  • Organizer: 2022年光化学討論会
• [Presentation] N-シアノイミダゾールを利用したケミカルライゲーションの高速化と長鎖DNA合成への応用 (2022)
  • Author(s): 近藤修斗、沖田ひかり、村山恵司、浅沼浩之
  • Organizer: 第183回東海高分子研究会講演会
• [Presentation] Elongation of long L-aTNA strand based on the kinetic analysis of chemical templatedirected synthesis (2022)
  • Author(s): Hikari Okita, Keiji Murayama, Hiroyuki Asanuma
  • Organizer: ISNAC 2022
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Multiplexed Imaging with Color-Changing Fluorescent Barcode Based on Strand Displacement Reaction (2022)
  • Author(s): Koki Makino, Hiroyuki Asanuma, Hiromu Kashida
  • Organizer: ISNAC 2022
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] DNA junctionに多数の蛍光色素を集積した光捕集アンテナの開発 (2022)
  • Author(s): 東 秀憲、浅沼浩之、樫田 啓
  • Organizer: 第53回 中部化学関係学協会支部連合秋季大会
• [Presentation] 非環状型XNAを利用した機能性ハイドロゲルの開発 (2022)
  • Author(s): 村山恵司、重松勇貴、奥田祐登、浅沼浩之
  • Organizer: 第53回 中部化学関係学協会支部連合秋季大会
• [Presentation] 人工核酸XNAを利用した直交性回路及び鎖連結法の開発 (2022)
  • Author(s): 村山恵司、陳 楊凌志、長尾竜弥、沖田ひかり、近藤修斗、浅沼浩之
  • Organizer: 第6回分子ロボティクス年次大会
• [Presentation] 光クロスリンク法を用いたDicer-PAZ/PlatformのdsRNA認識時における複合体構造の特定 (2022)
  • Author(s): 鈴木駿也, 横田徳子, 津田弘貴, 神谷由紀子, 浅沼浩之
  • Organizer: 日本化学会第102春季年会
• [Presentation] セリノール核酸配列解析法の開発 (2022)
  • Author(s): 香川恵未莉, 牧野航海, 東 秀憲, 浅沼浩之, 樫田 啓
  • Organizer: 日本化学会第102春季年会
• [Presentation] ペプチド核酸配列解析法の開発 (2022)
  • Author(s): 樫田 啓, 清水優香, 香川恵未莉, 牧野航海, 東 秀憲, 浅沼浩之
  • Organizer: 日本化学会第102春季年会
• [Presentation] 非環状人工核酸からなる直交性シグナル増幅回路の開発とRNA検出への応用 (2022)
  • Author(s): 陳 楊凌志, 村山恵司, 浅沼浩之
  • Organizer: 日本化学会第102春季年会
• [Presentation] DNAおよび人工核酸L-aTNAにおける鋳型特異的ケミカルライゲーションの高速化 (2022)
  • Author(s): 村山恵司, 近藤修斗, 沖田ひかり, 浅沼浩之
  • Organizer: 日本化学会第102春季年会
• [Presentation] 多重蛍光イメージングを目指した鎖交換反応による蛍光色変化型バーコードの開発 (2022)
  • Author(s): 牧野航海, 浅沼浩之, 樫田 啓
  • Organizer: 日本化学会第102春季年会
• [Presentation] Pseudocomplementary 塩基対の導入によるSNAからなる抗miRNA-21核酸の高活性化 (2022)
  • Author(s): 佐藤史経, 村山恵司, 神谷由紀子, 浅沼浩之
  • Organizer: 日本化学会第102春季年会
• [Presentation] 非酵素的ケミカルライゲーション法による人工核酸L-aTNAとSNAの鎖伸長反応の速度論解析 (2022)
  • Author(s): 沖田ひかり, 村山恵司, 浅沼浩之
  • Organizer: 日本化学会第102春季年会
• [Presentation] 非環状型人工核酸からなるエキソンスキップ型ASOの開発 (2022)
  • Author(s): 神谷由紀子, 桑島諒太, 浅沼浩之
  • Organizer: 日本化学会第102春季年会
• [Presentation] 細胞内イメージングによるSNA型抗miRNA核酸と標的miRNAの相互作用の可視化 (2022)
  • Author(s): 朱 紅宇, 神谷由紀子, 浅沼浩之
  • Organizer: 日本化学会第102春季年会
• [Presentation] SNA型抗miRNAアンチセンス核酸の作用機序解明に向けたイメージング解析 (2021)
  • Author(s): 朱紅宇, 神谷由紀子, 浅沼浩之
  • Organizer: 第15回バイオ関連化学シンポジウム
• [Presentation] Dicer-PAZ/PlatformとdsRNAの光クロスリンク解析による基質認識機構の解明 (2021)
  • Author(s): 鈴木駿也, 横田徳子, 津田弘貴, 神谷由紀子, 浅沼浩之
  • Organizer: 第15回バイオ関連化学シンポジウム
• [Presentation] 高輝度CPL発現に適したDNA導入ピレン会合体の探索 (2021)
  • Author(s): 伊藤有香, 角田貴洋, 生越友樹, 浅沼浩之, 樫田 啓
  • Organizer: 第15回バイオ関連化学シンポジウム
• [Presentation] 非酵素的な化学連結法を用いた人工核酸L-aTNAの配列複製・転写・逆転写法の構築 (2021)
  • Author(s): 沖田ひかり, 村山恵司, 浅沼浩之
  • Organizer: 第15回バイオ関連化学シンポジウム
• [Presentation] 生体分子のマルチラベリングを可能とする蛍光バーコードの開発 (2021)
  • Author(s): 牧野航海, 浅沼浩之, 樫田 啓
  • Organizer: 第15回バイオ関連化学シンポジウム
• [Presentation] 異なる波長で独立に制御可能な光応答性人工核酸の開発 (2021)
  • Author(s): 村山恵司, 山野雄平, 浅沼浩之
  • Organizer: 第15回バイオ関連化学シンポジウム
• [Presentation] RNA以前の世界を妄想する (2021)
  • Author(s): 浅沼浩之
  • Organizer: 第15回バイオ関連化学シンポジウム
  • Invited
• [Presentation] Investigation of pyrene aggregates for high-brightness CPL expression by using DNA backbone (2021)
  • Author(s): Yuka Ito, Hiromu Kashida, Takahiro Kakuta, Tomoki Ogoshi, Hiroyuki Asanuma
  • Organizer: 2021年光化学討論会
• [Presentation] Development of efficient light harvesting antenna by densely organizing fluorophores into DNA (2021)
  • Author(s): Hidenori Azuma, Hiromu Kashida, Yasuyuki Araki, Takehiko Wada, Hiroyuki Asanuma
  • Organizer: 2021年光化学討論会
• [Presentation] 光クロスリンカーを用いたDicer-PAZ/PlatformとdsRNAの結合部位特定による新たな複合体予測 (2021)
  • Author(s): 鈴木駿也, 横田徳子, 津田弘貴, 神谷由紀子, 浅沼浩之
  • Organizer: 第52回中部化学関係学協会支部連合秋季大会
• [Presentation] SNAの自己相互作用抑制法の開発と抗miRNA核酸の高活性化 (2021)
  • Author(s): 佐藤史経, 村山恵司, 神谷由紀子, 浅沼浩之
  • Organizer: 第52回中部化学関係学協会支部連合秋季大会
• [Presentation] 非酵素的なケミカルライゲーション法による人工核酸L-aTNAとSNAの鋳型重合法の反応速度解析 (2021)
  • Author(s): 沖田ひかり, 村山恵司, 浅沼浩之
  • Organizer: 第52回中部化学関係学協会支部連合秋季大会
• [Presentation] DNA導入ピレン会合体を利用した高輝度CPL発現条件の探索 (2021)
  • Author(s): 伊藤有香, 角田貴洋, 生越友樹, 浅沼浩之, 樫田 啓
  • Organizer: 第52回中部化学関係学協会支部連合秋季大会
• [Presentation] Nonenzymatic polymerase-like elongation of acyclic L-threoninol nucleic acid via chemical ligation (2021)
  • Author(s): Keiji Murayama, Hikari Okita, Hiroyuki Asanuma
  • Organizer: ISNAC2021
• [Presentation] Elucidation of the Mechanism of SNA-Anti-miRNA through Intracellular Imaging (2021)
  • Author(s): 朱紅宇, 神谷由紀子, 浅沼浩之
  • Organizer: 2021年度東海高分子研究会学生発表会
• [Presentation] DNA導入ピレン会合体によるCPL高輝度化条件の探索 (2021)
  • Author(s): 伊藤有香, 角田貴洋, 生越友樹, 浅沼浩之, 樫田 啓
  • Organizer: 2021年度東海高分子研究会学生発表会
• [Presentation] Serinol nucleic acid (SNA) based fluorescent probe for highly sensitive detection of RNA (2021)
  • Author(s): Keiji Murayama, Zehua Liu, Hiroyuki Asanuma
  • Organizer: Pacifichem2021
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Development of acyclic nucleic acid incorporating pseudocomplementary bases to promote hybridization with RNA (2021)
  • Author(s): Fuminori Sato, Keiji Murayama, Yukiko Kamiya, Hiroyuki Asanuma
  • Organizer: Pacifichem2021
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Nonenzymatic pseudo-primer extension reaction for duplication and reverse transcription of acyclic L-threoninol nucleic acids (2021)
  • Author(s): Hikari Okita, Keiji Murayama, Hiroyuki Asanuma
  • Organizer: Pacifichem2021
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Sensitive triplex-forming linear probe tethering perylene derivatives for duplex DNA detection with high affinity (2021)
  • Author(s): Yanglingzhi Chen, Keiji Murayama, Hiroyuki Asanuma
  • Organizer: Pacifichem2021
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Development of fluorescent barcode utilizing strand exchange reaction of nucleic acids (2021)
  • Author(s): Koki Makino, Hiromu Kashida, Hiroyuki Asanuma
  • Organizer: Pacifichem2021
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Development of light harvesting antenna using DNA with multiple fluorophores (2021)
  • Author(s): Hidenori Azuma, Hiromu Kashida, Yasuyuki Araki, Takehiko Wada, Hiroyuki Asanuma
  • Organizer: Pacifichem2021
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Serinol Nucleic Acid and its derivative for potential therapeutic applications (2021)
  • Author(s): Hiroyuki Asanuma
  • Organizer: Pacifichem2021
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] Development of siRNA and anti-miRNA oligonucleotide modified with SNA or L-aTNA (2021)
  • Author(s): Yukiko Kamiya, Fuminori Sato, Tomonari Mizuno, Hiroyuki Asanuma
  • Organizer: Pacifichem2021
  • Int'l Joint Research
• [Book] Orthogonality of Nucleic Acids (2022)
  • Author(s): Keiji Murayama, Hiroyuki Asanuma
  • Total Pages: 7
  • Publisher: Springer
• [Book] DNAポリマー (高分子材料の辞典） (2022)
  • Author(s): 村山恵司、浅沼浩之
  • Total Pages: 2
  • Publisher: 朝倉書店
• [Book] 光応答性DNAの搭載によるナノマシンとナノ構造体の光制御（進化を続ける核酸化学） (2021)
  • Author(s): 浅沼浩之, 神谷由紀子
  • Total Pages: 6
  • Publisher: 化学同人
  • ISBN: 9784759814019
• [Patent(Industrial Property Rights)] アミダイトモノマー (2022)
  • Inventor(s): 浅沼浩之、神谷由紀子、佐藤史経
  • Industrial Property Rights Holder: 国立大学法人東海国立大学機構
  • Industrial Property Rights Type: 特許
  • Filing Date: 2022
  • Overseas
• [Patent(Industrial Property Rights)] 配列解析方法 (2022)
  • Inventor(s): 浅沼浩之、村山 恵司、根本 直人、瀧澤 佐恵
  • Industrial Property Rights Holder: 国立大学法人東海国立大学機構、EME
  • Industrial Property Rights Type: 特許
  • Industrial Property Number: 2022-177900
  • Filing Date: 2022
• [Patent(Industrial Property Rights)] 配列解析方法 (2022)
  • Inventor(s): 樫田啓、香川恵未莉、浅沼浩之、村山 恵司、根本 直人、清水優香
  • Industrial Property Rights Holder: 国立大学法人東海国立大学機構、EME
  • Industrial Property Rights Type: 特許
  • Industrial Property Number: 2022-032911
  • Filing Date: 2022