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Comprehensive study of excessive light stress response in plants

Research Project

Project/Area Number 21H05040
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (S)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Broad Section G
Research InstitutionNational Institute for Basic Biology

Principal Investigator

皆川 純  基礎生物学研究所, 環境光生物学研究部門, 教授 (80280725)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 村田 和義  大学共同利用機関法人自然科学研究機構(機構直轄研究施設), 生命創成探究センター, 特任教授 (20311201)
山本 大輔  福岡大学, 理学部, 教授 (80377902)
Project Period (FY) 2021-07-05 – 2026-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥189,150,000 (Direct Cost: ¥145,500,000、Indirect Cost: ¥43,650,000)
Fiscal Year 2025: ¥36,010,000 (Direct Cost: ¥27,700,000、Indirect Cost: ¥8,310,000)
Fiscal Year 2024: ¥36,010,000 (Direct Cost: ¥27,700,000、Indirect Cost: ¥8,310,000)
Fiscal Year 2023: ¥36,010,000 (Direct Cost: ¥27,700,000、Indirect Cost: ¥8,310,000)
Fiscal Year 2022: ¥36,010,000 (Direct Cost: ¥27,700,000、Indirect Cost: ¥8,310,000)
Fiscal Year 2021: ¥45,110,000 (Direct Cost: ¥34,700,000、Indirect Cost: ¥10,410,000)
Keywords光合成 / 緑藻 / 環境適応 / NPQ / クライオ電子顕微鏡 / 高速AFM / 葉緑体
Outline of Research at the Start

光合成系の集光アンテナは最適な集光をするために発達したが、同時に過剰光環境下にあっても光化学系が壊れないよう保護機構も備えた。過剰な光エネルギーを安全に熱散逸するNPQ(non-photochemical quenching)が極めて有効な保護機構であることがわかってきたが、必要因子の誘導伝達系、熱散逸場の構造、反応メカニズムなど不明点は多い。本研究は、強光シグナルによって開始される一連の光保護反応の一般則を確立する。

Outline of Annual Research Achievements

Ostreococcus tauriは、海洋に偏在するピコ植物プランクトンであり、初期分岐型緑藻である。クライオ電子顕微鏡による構造解析により、その光化学系I超複合体は、光捕集複合体I(LHCI)および原始生物特有の光捕集複合体(Lhcp)と集合することによって光捕集能力を拡大させており、陸上植物型とコア緑藻型のPSI超複合体のハイブリッドな特徴を示していることがわかった。PSIコアの片側にはLHCIベルト、もう片側にPsaGとPsaHの間にはLHCIハーフベルトが結合していた。Lhca6とPsaKの間の第三の側面にはアミノ末端のスレオニンがリン酸化された1個のLhcp1モノマーと8個のLhcp2モノマーが、3つの三量体としてオリゴマー化しPSIと会合していた。Lhcp1のリン酸化とPSIの光捕集能は可逆的な光化学反応を示したことから、OtPSI-LHCI-Lhcp超複合体の形成は光強度変化によって誘導されるリン酸化依存的な機構による可能性が高いことも示唆された。非光化学消光(NPQ)は、緑藻類においては光保護タンパク質LHCSR1、LHCSR3、PsbSによって制御されている。最近、これらの光保護タンパク質をクラミドモナスにおいて過剰発現させることで、NPQ応答が著しく高くなるdet1-2 phot変異体が発見された。この応答がクラミドモナス細胞に与える生理的影響を詳細に解析したところ、野生型細胞が生存できないような高照度下で、det1-2 phot変異株は効率よく増殖できることがわかった。この変異体は、暗所でのPSII断面積が小さく、暗所での光化学消光のクロロフィル蛍光パラメータの上昇(qPd > 1)を示したことから、NPQ状態における周辺部の光捕集複合体II(LHCII)アンテナの剥離が示唆された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

研究が始まり1年半の時点であり、まだ研究項目全判に亘り展開を図っている時期だが、ほぼすべての研究項目において研究は着実に進展し成果が得られている。論文化も順調に進んでいる。当初計画どおりに進めた場合では期待値が低いと判断した課題は基盤技術の根本的な整備を図ると同時に、予備課題「原始緑藻における光環境適応の構造基盤」を立ち上げたが、その結果が想定以上であり、これは重要論文としてすでに出版された。本研究は、今後の研究展開において、緑藻、陸上植物双方の光環境適応戦略を理解を深める上での重要な布石となることは確実である。さらに、順調に進んでいる緑藻の LHCSR 強光発現誘導研究の成果の中からも予期外の結果が得られており、光合成研究の枠を越える重要な貢献に至る可能性も出てきた。総じて順調に研究が進展しており、期待どおりの成果が見込まれると判断した。

Strategy for Future Research Activity

1.緑藻のNPQはゼアキサンチンに依存しないとされてきたが再検証が必要である。これらの解析に有効な変異株det1をすでに見出しているため、各種変異株を作成した上で、緑藻におけるゼアキサンチン依存NPQを詳細に解析する。
2.植物チラコイド膜の高速AFM解析技術基盤が整備されたので、PSII超複合体マクロ構造とNPQ機能の連関に関するin situ動態解析を進める。
3.原始緑藻PSI超複合体構造は、従来色相順化と考えられてきたステート遷移の再検証の必要性を示唆している。この可能性を、各光化学系超複合体の精密精製、光学特性の解析、生化学特性の解析により検討する。

Assessment Rating
Interim Assessment Comments (Rating)

A: In light of the aim of introducing the research area into the research categories, the expected progress has been made in research.

Report

(6 results)
  • 2023 Abstract (Interim Assessment) ( PDF )   Interim Assessment (Comments) ( PDF )
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Abstract ( PDF )   Comments on the Screening Results ( PDF )   Annual Research Report
  • Research Products

    (31 results)

All 2023 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (10 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Peer Reviewed: 9 results,  Open Access: 1 results) Presentation (16 results) (of which Int'l Joint Research: 10 results,  Invited: 4 results) Book (3 results)

  • [Int'l Joint Research] Queen Marry University of London(英国)

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      Yamasaki T, Tokutsu R, Minagawa J
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      Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

      Volume: in press

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      Ruiz-Sola M, Flori S, Yuan Y, Villain G, Sanz-Luque E, Redekopp P, Tokutsu R, Kueken A, Tsichla A, Kepesidis G, Allorent G, Arend M, Iacono F, Finazzi G, Hippler M, Nikoloski Z, Minagawa J, Grossman A, Petroutsos D
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 14 Pages: 1977-1977

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    • Author(s)
      Ishii A, Shan J, Sheng S, Kim E, Watanabe A, Yokono M, Noda C, Chihong S, Murata K, Liu Z, Minagawa J
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 12

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      Minagawa J, Dann M
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      Plants

      Volume: 12 Pages: 265-265

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      Zhang XJ, FujitaY, Kaneda N, Tokutsu R, Ye S, Minagawa J, Shibata Y
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

      Volume: 119 Issue: 37

    • DOI

      10.1073/pnas.2122032119

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  • [Journal Article] Conformation of Light-Harvesting Complex II Trimer Depends upon Its Binding Site2022

    • Author(s)
      Kim E, Kubota-Kawai H, Kawai F, Yokono M, Minagawa J
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      The Journal of Physical Chemistry B

      Volume: 126 Issue: 31 Pages: 5855-5865

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.2c04061

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    • Author(s)
      Tokutsu R, Kim E, Akimoto S, Yokono M, Fujimura-Kamada K, Ohnishi N, Ueno Y, Minagawa J
    • Journal Title

      bioRxiv

      Volume: -

    • DOI

      10.1101/2022.07.10.499486

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      Leister D, Marino G, Minagawa J, Dann M
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      Trends in Plant Science

      Volume: 27 Issue: 10 Pages: 971-980

    • DOI

      10.1016/j.tplants.2022.04.006

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  • [Journal Article] AFM Imaging of Biological Macromolecules on Supported Lipid Bilayers2022

    • Author(s)
      Yamamoto Daisuke
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      MEMBRANE

      Volume: 47 Issue: 1 Pages: 10-14

    • DOI

      10.5360/membrane.47.10

    • NAID

      130008159581

    • ISSN
      0385-1036, 1884-6440
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  • [Journal Article] Below 3 A structure of apoferritin using a multipurpose TEM with a side entry cryoholder2021

    • Author(s)
      Kayama Y, Burton-Smith RN, Song C, Terahara N, Kato T, Murata K
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 11 Issue: 1 Pages: 8395-8395

    • DOI

      10.1038/s41598-021-87183-1

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    • Author(s)
      Kim E, Kubota-Kawai H, Kawai F, Yokono M, Minagawa J
    • Organizer
      67th Biophysical Society Annual Meeting
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  • [Presentation] Architencutre of algal photosystem I in state 22022

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      Minagawa J, Pan X, Shan J, Tokutsu R, Ishii A, Sheng X, Li A, Kim K, Watanabe A, Yokono M, Noda C, Song C, Murata K, Takizawa K, Yamasaki T, Mei L, Liu Z
    • Organizer
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      Kim E, Minagawa J
    • Organizer
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      Minagawa J
    • Organizer
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      International Congress on Photosynthesis Research 2022
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Architecture of the PSI-LHCI-Lhcp supercomplex from the prasinophyte Ostreococcus tauri2022

    • Author(s)
      Ishii A, Shan J, Sheng S, Kim E, Watanabe A, Yokono M, Noda C, Chihong S, Murata K, Liu Z, Minagawa J
    • Organizer
      International Congress on Photosynthesis Research 2022
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Structural basis for light harvesting regulation through state transitions in green algae2022

    • Author(s)
      Pan X, Tokutsu R, Li L, Takizawa K, Song C, Murata K, Yamasaki Y, Liu Z, Minagawa J, Li M
    • Organizer
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Site-dependent state transition and ultrastructural changes of thylakoid in Chlamydomonas2022

    • Author(s)
      Zhang X, Fujita Y, Kaneda N, TokutsuR, Minagawa J, Ye S, Shibata Y
    • Organizer
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  • [Presentation] 緑藻クラミドモナスにおける LHCII サブユニットの光防御機能解析2022

    • Author(s)
      Eunchul Kim, 川上 恵典, 鎌田 このみ, 石井 麻子, 皆川 純
    • Organizer
      第 15 回クラミドモナス研究会
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  • [Presentation] 高速 AFM によるグラナ膜に内在する PSII 側方運動の可視化2021

    • Author(s)
      井手美里, 山本大輔
    • Organizer
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  • [Presentation] 熱揺らぎ一定モード原子間力顕微鏡の開発2021

    • Author(s)
      山本大輔
    • Organizer
      日本生物物理学会第 59 回年会
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  • [Presentation] チラコイド膜内光合成タンパク質の高速 AFM による構造ダイナミクス解析2021

    • Author(s)
      山本大輔
    • Organizer
      第 94 回日本生化学会大会、シンポジウム「革新的解析技術で迫る膜輸送タンパク質の実像」
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    • Invited
  • [Presentation] Regulation of Light-Harvesting Systems by Inter-Protein Interactions in Green Algae and Plants2021

    • Author(s)
      Kim E, Minagawa J
    • Organizer
      The 11th Asian Photochemistry Conference
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    • Int'l Joint Research
  • [Book] 自然科学研究機構におけるクライオ電子顕微鏡支援 クライオ電子顕微鏡 ハンドブック(難波啓一、加藤貴之、牧野文信 監修)2023

    • Author(s)
      ソン・チホン, 村田和義
    • Total Pages
      8
    • Publisher
      (株)エヌ・ティー・エス
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  • [Book] 特集 クライオ電子顕微鏡の現在「生命分子動態機能解析システムと組み合わせたクライオEM研究支援」顕微鏡 Vol 57. No.32022

    • Author(s)
      ソン・チホン,村田和義
    • Total Pages
      5
    • Publisher
      日本顕微鏡学会
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  • [Book] クライオ電子顕微鏡で生体分子の構造解析をはじめよう 日本結晶学会誌 Vol.632021

    • Author(s)
      ソン・チホン,村田和義
    • Total Pages
      9
    • Publisher
      日本結晶学会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report

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Published: 2021-07-08   Modified: 2025-04-17  

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