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褐虫藻-サンゴ共生系における代謝動態と白化現象との相関の体系的理解

Research Project

Project/Area Number 21J00113
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Review Section Basic Section 44030:Plant molecular biology and physiology-related
Research InstitutionKobe University

Principal Investigator

田中 謙也  神戸大学, 先端バイオ工学研究センター, 特別研究員(PD)

Project Period (FY) 2021-04-28 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥3,640,000 (Direct Cost: ¥2,800,000、Indirect Cost: ¥840,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Keywordsサンゴ / 褐虫藻 / 光合成 / レドックス / 代謝 / 白化現象 / 酸化還元 / 代謝状態 / シアノバクテリア / 酸化ストレス
Outline of Research at the Start

褐虫藻は酸素発生型光合成を行う藻類の一種で、サンゴやイソギンチャクをはじめとする無脊椎動物を宿主として共生を行うことで知られている。近年、共生している褐虫藻がサンゴから排出されてしまうというサンゴの白化現象が問題となっている。白化現象が起きるとまもなくサンゴは死に、周辺の豊かな生態系が失われてしまう。本研究では褐虫藻サンゴ共生系における褐虫藻の代謝変化と共生系全体の動態の関係を明らかにし、生態系全体の動態(白化現象)の予測に重要な代謝および数理的ファクターを見つけることを目的とする。この検証には幅広い代謝物の変化を測定して代謝状態を可視化できるメタボロミクスと数理モデル構築は非常に強力である。

Outline of Annual Research Achievements

サンゴ礁は、世界中の海洋生態系において最も多様で豊かな生物群集の一つであり、その栄養源となるのはサンゴの共生藻類(褐虫藻)が行う光合成プロセスである。しかし、近年の気候変動による海水温上昇や酸性化によって、サンゴ礁は大きな危機にさらされている。このような状況下で、サンゴの共生藻類が効率的な光合成を行うためには、CO2固定経路の調節機構が重要であることが考えられる。
このCO2固定経路の調節機構の解明を目指し、まず単純な光合成モデル生物としてシアノバクテリアSynechocystis sp 6803における、暗所から明所に移した後の代謝変化を秒単位で定量した。その結果、暗所で解糖系の代謝物である3-ホスホグリセリン酸、2-ホスホグリセリン酸、およびホスホエノールピルビン酸が高蓄積していることが明らかとなった。これらの代謝物は光照射後すぐにCO2固定代謝経路であるカルビンサイクルに流れ込み、光合成活性化中の動的な代謝フラックス変化を支えることが示された。この成果は、高速サンプリング手法と代謝物濃度の絶対定量法という独自アプローチを組み合わせることで達成された。
この研究は、環境適応において代謝物の適切な維持が重要であることを示唆しており、今後の研究においては、このような視点からサンゴや褐虫藻における代謝調節機構の解明が求められる。また、本研究の手法やアプローチは、褐虫藻およびサンゴの光合成活性化中の代謝フラックス変化を解明するために重要な手法となることが期待される。

Research Progress Status

翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Annual Research Report
  • Research Products

    (16 results)

All 2023 2022 2021 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 1 results) Presentation (9 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Dark accumulation of downstream glycolytic intermediates initiates robust photosynthesis in cyanobacteria2022

    • Author(s)
      Tanaka Kenya、Shirai Tomokazu、Vavricka Christopher J、Matsuda Mami、Kondo Akihiko、Hasunuma Tomohisa
    • Journal Title

      Plant Physiology

      Volume: 191 Issue: 4 Pages: 2400-2413

    • DOI

      10.1093/plphys/kiac602

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Accumulated 3-phosphoglycerate in darkness is a primary starting substrate for stepwise photosynthetic induction process in cyanobacteria2022

    • Author(s)
      Tanaka Kenya、Shirai Tomokazu、Matsuda Mami、Kondo Akihiko、Hasunuma Tomohisa
    • Journal Title

      BioRxiv

      Volume: -

    • DOI

      10.1101/2022.04.04.486922

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Open Access
  • [Journal Article] NADPH production in dark stages is critical for cyanobacterial photocurrent generation: a study using mutants deficient in oxidative pentose phosphate pathway2022

    • Author(s)
      Hatano Jiro、Kusama Shoko、Tanaka Kenya、Kohara Ayaka、Miyake Chikahiro、Nakanishi Shuji、Shimakawa Ginga
    • Journal Title

      Photosynthesis Research

      Volume: - Issue: 1-2 Pages: 113-120

    • DOI

      10.1007/s11120-022-00903-0

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Conserved Two-component Hik2?Rre1 Signaling Is Activated Under Temperature Upshift and Plastoquinone-reducing Conditions in the Cyanobacterium <i>Synechococcus elongatus</i> PCC 79422021

    • Author(s)
      Bairagi Nachiketa、Watanabe Satoru、Nimura-Matsune Kaori、Tanaka Kenya、Tsurumaki Tatsuhiro、Nakanishi Shuji、Tanaka Kan
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: 63 Issue: 2 Pages: 176-188

    • DOI

      10.1093/pcp/pcab158

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Coral symbionts evolved a functional polycistronic flavodiiron gene2021

    • Author(s)
      Shimakawa Ginga、Shoguchi Eiichi、Burlacot Adrien、Ifuku Kentaro、Che Yufen、Kumazawa Minoru、Tanaka Kenya、Nakanishi Shuji
    • Journal Title

      Photosynthesis Research

      Volume: 151 Issue: 1 Pages: 113-124

    • DOI

      10.1007/s11120-021-00867-7

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] シアノバクテリアにおいて下流解糖系中間体の維持が迅速な光合成開始を可能にする2023

    • Author(s)
      田中 謙也・白井 智量・松田 真実・近藤 昭彦・蓮沼 誠久
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 絶対定量メタボロミクスによる光合成活性化時の高速代謝変化の解析2022

    • Author(s)
      田中 謙也・白井 智量・松田 真実・近藤 昭彦・蓮沼 誠久
    • Organizer
      第16回メタボロームシンポジウム
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] シアノバクテリアにおけるカルビン回路活性化時の高速代謝変化の解析2022

    • Author(s)
      田中 謙也・白井 智量・松田 真実・近藤 昭彦・蓮沼 誠久
    • Organizer
      第74回日本生物工学会大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] シアノバクテリアにおけるスムーズな光合成開始を支える代謝状態2022

    • Author(s)
      田中 謙也・白井 智量・松田 真実・近藤 昭彦・蓮沼 誠久
    • Organizer
      藍藻の分子生物学2022
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Metabolism for robust initiation of photosynthesis in cyanobacteria2022

    • Author(s)
      Kenya Tanaka, Tomokazu Shirai, Mami Matsuda, Akihiko Kondo, Tomohisa Hasunuma
    • Organizer
      Photosynthesis and Chloroplast Regulation
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] シアノバクテリアにおける光合成代謝のin vivo活性化キネティクス2022

    • Author(s)
      田中 謙也・白井 智量・松田 真実・近藤 昭彦・蓮沼 誠久
    • Organizer
      第12回日本光合成学会年会およびシンポジウム
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] シアノバクテリアにおける光合成開始時の代謝ダイナミクスの定量的解析2022

    • Author(s)
      田中謙也, 松田真実, 白井智量, 蓮沼誠久
    • Organizer
      第63回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] フェノール抽出によるシアノバクテリア細胞内のNADPレドックス状態の定量2021

    • Author(s)
      田中謙也、嶋川銀河、田畑裕、草間翔子、蓮沼誠久、中西周次
    • Organizer
      第11回日本光合成学会年会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] シアノバクテリアにおけるNADP(H)の正確定量2021

    • Author(s)
      田中謙也, 嶋川銀河, 草間翔子, 松田真実, 蓮沼誠久, 中西周次
    • Organizer
      第73回 日本生物工学会大会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Remarks] バイオ生産工学研究室

    • URL

      http://www2.kobe-u.ac.jp/~akondo/tanaka2.html

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Remarks] 太陽エネルギー化学研究センター

    • URL

      https://rcsec.osaka-u.ac.jp/nakanishilab-publications

    • Related Report
      2021 Annual Research Report

URL: 

Published: 2021-05-27   Modified: 2024-03-26  

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