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転位固有のひずみ集中場を用いたナノ強誘電演算素子の力学的創出

Research Project

Project/Area Number 21J10412
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Review Section Basic Section 18010:Mechanics of materials and materials-related
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

益田 快理  京都大学, 工学研究科, 特別研究員(PD)

Project Period (FY) 2021-04-28 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2022: ¥520,000 (Direct Cost: ¥400,000、Indirect Cost: ¥120,000)
Fiscal Year 2021: ¥500,000 (Direct Cost: ¥500,000)
KeywordsDNA / 欠陥 / 分子動力学 / 量子化学計算 / 機械学習 / 強誘電性 / 転位 / マルチフィジックス / フェーズフィールド法 / チタン酸ストロンチウム
Outline of Research at the Start

コンピュータの中核を担う演算素子は近年ではナノスケールにまで縮小化した.一方,この微小領域では漏れ電流などの致命的な問題が起こり,さらなる縮小化が難しくなっている.本研究の概要は,従来の演算素子の代替として,チタン酸ストロンチウム中の混合転位によって超微小な強誘電演算素子(電場による電気分極の反転を用いた演算素子)の作製を示すことである.これを目的とし,ランダウ理論に基づくフェーズフィールド解析を行っていく.本研究の完成により,次世代の超高密度で省エネルギーの電子デバイスの開発に新たな指針を示していく.

Outline of Annual Research Achievements

申請者は自身の研究を分野外に広げるためにイギリスに渡り、オックスフォード大学の計算生物学の研究者であるAleksandr Sahakyan教授と共にDNAに関する研究を行った。得られた結果を以下にまとめる。
(1)DNAの量子力学的特徴量のデータセットの作成: DNAはアデニン(A)、シトシン(C)、グアニン(G)、チミン(T)の4種類のヌクレオチドが積層した構造である。先行研究の結果から、AAAAAAAといった7つのヌクレオチドが積層した7-mer DNAが生物学上重要であることが分かっている。このことから、総計4の7乗=16384のDNAの分子モデル(AAAAAAA, AAAAAAC, …)を作りだし、これらの全てに対して量子化学計算を行った。つまり、大規模量子化学計算を行い、DNAのHOMOやLUMOといった量子力学的な特徴量に関する包括的なデータセットを作った。
(2) 機械学習によるDNAの置換率予測モデルの作成: DNAは様々な理由で突然変異を起こし、AAAAAAA→AAACAAAといったヌクレオチドの置換が起こる。このヌクレオチドの置換は生物の進化やガンの発生と密接に関わっており、そのメカニズムを明らかにすることは非常に大切である。先行研究から、このDNAの置換率の包括的なデータセットが作成されている。この置換率のデータセットを上で述べた量子化学計算のデータセットをと組み合わせた。これを機械学習させてHOMOやLUMOといった量子力学的な特徴量からDNAの置換率を予測する決定木モデルを作成した。実際に使用してみると、この決定木は精度よく置換率を予測することができた。これはつまり、DNAの置換、つまり生物の進化やガンの発生等に量子力学が大きな役割を果たしていることを示している。

Research Progress Status

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Annual Research Report
  • Research Products

    (3 results)

All 2023 2021 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Open Access: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Oxford(英国)

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Journal Article] Quantum mechanical electronic and geometric parameters for DNA k-mers as features for machine learning2023

    • Author(s)
      Kairi Masuda, Adib A. Abdullah, Aleksandr B. Sahakyan
    • Journal Title

      bioRxiv (ただしscientific data誌において査読中である)

      Volume: NA Pages: 1-15

    • DOI

      10.1101/2023.01.25.525597

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Ferroelectric nanoscale logic gates by mixed dislocations in <mml:math xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML"><mml:msub><mml:mi>SrTiO</mml:mi><mml:mn>3</mml:mn></mml:msub></mml:math>2021

    • Author(s)
      Masuda Kairi、Shimada Takahiro、Kitamura Takayuki
    • Journal Title

      Physical Review B

      Volume: 104 Issue: 5 Pages: 054104-054104

    • DOI

      10.1103/physrevb.104.054104

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed

URL: 

Published: 2021-05-27   Modified: 2024-03-26  

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