• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

変形可能なアクティブマターにおける集団的秩序形成の数理的研究

Research Project

Project/Area Number 21K03496
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 13040:Biophysics, chemical physics and soft matter physics-related
Research InstitutionHiroshima University (2022-2023)
Center for Novel Science Initatives, National Institutes of Natural Sciences (2021)

Principal Investigator

斉藤 稔  広島大学, 統合生命科学研究科(理), 准教授 (20726236)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
Fiscal Year 2023: ¥390,000 (Direct Cost: ¥300,000、Indirect Cost: ¥90,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Keywordsアクティブマター / ソフトマター / フェーズフィールド / 自己組織化 / ジャミング / トポロジカル欠陥 / 集団運動 / 細胞遊走
Outline of Research at the Start

アクティブマター研究では、鳥や魚の運動を単純化し「群れ」がどのように自己組織化するのかを明らかにしてきた。しかし細胞集団の運動では、個々の細胞の形が変形しうるという要因が重要となる。特に、細胞集団による組織の形成・恒常性維持などの現象の普遍的法則を理解するためには、細胞の運動を極めて単純化しつつも変形を許す「ソフト」なアクティブマターの研究が不可欠となる。本研究では細胞輪郭のフーリエ級数展開を基礎として、千~万オーダーの細胞数を同時に計算可能な多細胞数理モデルを開発し、ソフトアクティブマター分野の基礎となるモデルを構築する。これを用いて、変形可能であることで初めて顕れる集団的秩序現象を探る。

Outline of Annual Research Achievements

変形可能なアクティブマターの数理的基礎を構築し、細胞の集団運動等を理解することが本研究の目的である。生体組織では細胞が高密度でパッキングしており、力学的相互作用を通じ絶えず変形することで、安定した発生や組織の恒常性が担われている。個々の細胞の変形が細胞集団や生体組織にどのような影響を与えるか、を読み解き、力学的相互作用から細胞集団の挙動を理解し、ソフトなアクティブマターの研究の基礎となる知見を蓄積することを目指す。

本年度までに、変形可能細胞モデルの構築、提案モデルを用いた高密度細胞集団の挙動の解析を行うことができた。特に、排除体積効果で相互作用する高密度の自己駆動細胞集団では、細胞の柔らかさ依存で液液相転移が起こることを発見した。この液液相転移では、細胞が大きく変形しながら流動化する相と、細胞が丸い形状を保ちなが ら流動化する相の間で転移が起こる。またKTHNY理論で現れるhexatic相の存在も明らかにした。
また変形可能細胞モデルと既存モデルであるphase-fieldモデルとの関係を調べた。その結果、提案したモデルとほぼ同様のモデルをphase-field方程式から導出可能であることも確認した。これはphase-fieldモデルの縮約方程式と考えることができる。この縮約方程式はphase-fieldモデルに比べ圧倒的に計算量が小さいため、多様な分野へ応用可能な重要な理論的ツールになりうる。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

当初の計画の1万細胞シミュレーションは達成済みであり、研究結果も論文として出版することができた。さらに既存モデルとの対応も理解でき、さまざまな発展が可能なことが明らかになりつつあるため、予想以上の進展であると評価した。

Strategy for Future Research Activity

提案モデルはさまざまな発展を考えることができる。例えば、接着、細胞分裂の導入や3次元系への発展などが挙げられる。またGPU計算を用いることでさらに多くの細胞数を扱える可能性がある。これらの可能性を検討し、研究を推進する。

Report

(3 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2024 2023 2022 2021

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 5 results)

  • [Journal Article] Cell deformability drives fluid-to-fluid phase transition in active cell monolayers2024

    • Author(s)
      Saito Nen、Ishihara Shuji
    • Journal Title

      Science Advances

      Volume: 10 Issue: 19 Pages: 1-9

    • DOI

      10.1126/sciadv.adi8433

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Three-dimensional morphodynamic simulations of macropinocytic cups2021

    • Author(s)
      Nen Saito, Satoshi Sawai
    • Journal Title

      iScience

      Volume: - Issue: 10 Pages: 103087-103087

    • DOI

      10.1016/j.isci.2021.103087

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Active Deformable Cells Exhibits Cell Shape Transition Mediated by Percolation of Topological Defects2023

    • Author(s)
      Nen Saito
    • Organizer
      STATPHYS28
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Cell Deformability Drives Fluid-to-Fluid Phase Transitions in Active Cell Monolayers2023

    • Author(s)
      Nen Saito
    • Organizer
      The 9th International Discussion Meeting on Relaxations in Complex Systems (9 IDMRCS)
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Mathematical modeling of cell morphology dynamics: from single-cell to multicellular systems2023

    • Author(s)
      Nen Saito
    • Organizer
      RIMS conference: Multidisciplinary Research on Nonlinear Phenomena: Modeling, Analysis and Applications
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 細胞運動動態の機械学習解析と数理モデリング2023

    • Author(s)
      斉藤稔
    • Organizer
      理論免疫ワークショップ
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] Evolutionary mechanism of bow-tie architecture2023

    • Author(s)
      Thoma Itoh, Kazuhiro Aoki, Yohei Kondo, Nen Saito
    • Organizer
      winter q-bio meeting
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] マクロピノサイトーシス動態の 3D 数理モデリング2022

    • Author(s)
      斉藤稔
    • Organizer
      数理生物学会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 変分オートエンコーダを用いた下顎骨形態の定量化2022

    • Author(s)
      Masato Tsutsumi, Nen Saito, Daisuke Koyabu, Chikara Furusawa
    • Organizer
      生物物理学会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 接着力を取り入れたアクティブブラウン粒子モデルによる細胞集団運動のモデル化2022

    • Author(s)
      Sota Shimamura , Nen Saito , Shuji Ishihara
    • Organizer
      生物物理学会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] アクティブ変形細胞モデルに現れる細胞形状転移現象2022

    • Author(s)
      斉藤稔
    • Organizer
      定量生物学の会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 変形可能なアクティブ粒子集団におけるジャミング現象2022

    • Author(s)
      斉藤稔、石原秀至
    • Organizer
      日本物理学会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 細胞変形動態の数理モデリング2021

    • Author(s)
      斉藤稔
    • Organizer
      日本数理生物学会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Invited

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2024-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi