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環境中の細菌・ウイルスを対象としたモニタリング技術の開発

Research Project

Project/Area Number 21K04074
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 21030:Measurement engineering-related
Research InstitutionGunma University

Principal Investigator

桂 進司  群馬大学, 大学院理工学府, 教授 (10260598)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 高橋 俊介  東京電機大学, 理工学部, 准教授 (50778967)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Keywordsウイルス検出 / 電気集塵 / 静電噴霧 / PCR増幅
Outline of Research at the Start

本研究では、日常的に環境中の病原菌のモニタリングを行うために、電気集塵技術とマイクロ流体デバイスを利用した高感度・高選択性の微生物・ウイルスの検出を可能にするシステムを構築する。
このシステムでは①電気集塵と静電噴霧を組み合わせることにより微生物・ウイルスなどの試料を油中水溶液滴として回収し、②回収した水溶液滴を対象にエマルションPCRを行い、遺伝子を増幅する。その際、③液滴形成溶液に分子ビーコンを加えておくことにより高感度化、高選択性化を試みる。さらに、④誘電泳動型蛍光解析装置により油中水溶液滴の蛍光量を測定することにより、病原体量を簡便に評価する方法を開発する。

Outline of Annual Research Achievements

今年度は、静電噴霧によりPCR増幅バッファを含む液滴を生成し、その液滴に静電気力により病原体を捕集する方法を試みた。この方法でモデルウイルスの液滴への捕捉と生成した液滴の油相への回収、そして回収液滴の1step RT-PCR増幅により増幅産物を蛍光顕微鏡で検出できることを明らかにした。一方で、静電噴霧により生成された液滴径の単分散性は低く、その点での改良が求められた。
そこで、モデルウイルスを電気集塵によって水相に回収後、膜乳化技術鵜を用いたエマルション生成装置を用いて、回収したウイルスを油中水溶液滴に閉じ込め、その状態でPCRを行い、モデルウイルスを検出する方法を検討した。その結果、エマルジョンの液滴径の単分散性は改善されることが明らかになった。この方法でも、エマルジョンを対象に1step RT-PCR増幅を行ったところ、蛍光顕微鏡を用いて液滴の蛍光を観察することができた。この方法では、エマルジョン生成時の液滴の単分散性は高いと思われるが、PCR増幅過程における液滴の融合は抑えることができず、そのため、ウイルス検出の定量性が悪化することが問題であると考えている。
また、これらの液滴の蛍光強度を検出するための手法として、微小流路とマイクロ電極による誘電泳動を応用することを試みた。流路に直交する形で電極を設置し、高周波電界を印加したところ、微細流路により輸送されてきた油中水溶液滴が電極付近で捕捉され、電極付近に液滴を集め、そこで増幅された試料を含む液滴を観察することが可能になった。従来の基板上での顕微鏡観察では一カ所での観察にとどまっているため、顕微鏡において視野を変えて、蛍光ポジティブな液滴を探索する必要があったが、この方法では流路上でPCR産物を含む液滴を多数、捕捉し、電極近傍に集積することが可能なため、高感度、定量的な測定が容易になることが期待できる。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

本研究では、静電噴霧による液滴形成法と膜乳化の方法の2つを試みたが、いずれの方法を用いてもddPCRを行った後は、単分散な液滴が得られていない。それは、液滴同士の融合が頻繁に生じているためと考えられるため、この点の改善が求められる。

Strategy for Future Research Activity

液滴の融合を抑制するために、ナノ粒子を添加したピッカリングエマルジョン、そして、食品のエマルジョン構造を安定化している食品由来の両極性分子(現在、大豆レシチンを検討中)を添加することを検討している。また、静電噴霧の代わりにインクジェットノズルを用いた液滴散布法を検討したいが、そのためのドライバーは既に作成しており、液滴が生成されていることは確認している。引き続き、生成された液滴によるddPCRが可能かどうかの検討を進め、病原体回収・PCR増幅システムとの組み合わせについて検討を進めたい。

Report

(3 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2023 2022 2021

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (7 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] A new fluorescence labeling method for molecular analysis of double-stranded DNA2023

    • Author(s)
      Shunsuke Takahashi, Masahiko Oshige, Shinji Katsura, Yukitoshi Nagahara
    • Journal Title

      Analytical Biochemistry

      Volume: 662 Pages: 115000-115000

    • DOI

      10.1016/j.ab.2022.115000

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Local temperature control device using a transparent electrode in the viewing area of a microscope: development and application to RT-PCR2022

    • Author(s)
      Masahiko Oshige, Ryo Yokosawa, Hitomi Shinohara, Maho Suzuki, Shinji Katsura
    • Journal Title

      International Journal of Plasma Environmental Science and Technology

      Volume: 16 Issue: 03 Pages: e03005-e03005

    • DOI

      10.34343/ijpest.2022.16.e03005

    • ISSN
      1881-8692, 2435-0125
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] バクテリオファージMS2検出のためのエマルションRT-PCR用液滴作成装置の開発2023

    • Author(s)
      内田 温喜、田村 瑠唯、井上 拓巳、大重 真彦、桂 進司
    • Organizer
      第46回 日本分子生物学会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] マイクロ流路を用いたエマルションPCRの定量法の開発2023

    • Author(s)
      三木 涼平、森田 悠雅、大重 真彦、桂 進司
    • Organizer
      第46回 日本分子生物学会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] 電気集塵機を用いたMS2ファージ回収技術の開発2022

    • Author(s)
      松原一希、篠原瞳、石田夏生、水沼大祐、若林治哉、大重真彦、桂進司
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会(千葉県千葉市)
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 透明電極を用いた顕微鏡視野内における局所温度制御技術の開発とPCRへの応用2022

    • Author(s)
      山崎文佳、横澤遼、篠原瞳、大重真彦、桂進司
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会(千葉県千葉市)
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 透明電極を用いた顕微鏡視野内における局所温度制御技術の開発とPCRへの応用2022

    • Author(s)
      横澤遼、篠原瞳、大重真彦、桂進司
    • Organizer
      2022年度(第23回)静電気学会春期講演会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] PCRを用いた環境中のRNAウイルスの高感度検出法の開発2021

    • Author(s)
      篠原瞳、山崎文佳、石田夏生、松原一希、大重真彦、桂進司
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会(ハイブリット)
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 蛍光観察によるDNAまたはRNAウイルスの検出技術の確立2021

    • Author(s)
      木村圭介、石田夏生、松原一希、大重真彦、桂進司
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会(ハイブリット)
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 温度制御システム、観察システムおよび制御方法2022

    • Inventor(s)
      桂 進司、大重真彦他
    • Industrial Property Rights Holder
      群馬大学、アマノ株式会社
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2022-027811
    • Filing Date
      2022
    • Related Report
      2021 Research-status Report

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2024-12-25  

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