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トランスファーRNA修飾酵素によるタンパク質品質管理機構の解明

Research Project

Project/Area Number 21K05272
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 37010:Bio-related chemistry
Research InstitutionUniversity of Occupational and Environmental Health, Japan

Principal Investigator

坂口 怜子  産業医科大学, 医学部, 講師 (80723197)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywordsイオンチャネル / シグナル伝達 / 転移RNA / タンパク質品質管理 / 神経変性疾患 / 創薬
Outline of Research at the Start

生物が恒常性を保つためには、タンパク質の翻訳とその品質管理が重要であり、tRNAの転写後修飾はその中核を担っている。特に37位グアノシンのメチル化は、原核生物では生存に必須である。このメチル化は生物間で保存されているが、修飾を担う酵素は原核生物と真核生物で異なっており、両者の違いを探索することは、タンパク質の収斂進化の知見として学術的に興味深いだけでなく、原核生物のみを標的とした副作用のない新規抗生物質設計の指針ともなり得る。
本研究では、各メチル転移酵素の金属要求性や、その上流の金属イオン濃度制御機構の探索と、真核生物と原核生物の酵素の違いを解明する。

Outline of Annual Research Achievements

細胞を構成する酵素・細胞骨格・抗体などを形作るタンパク質の合成機構は、全ての生物において共通であり、生命維持の根幹を成すシステムである。必要なときに必要なタンパク質を必要な量だけ発現させる仕組みにおいて、そのアミノ酸配列を正確に翻訳することは、タンパク質の品質管理上で一番重要である。そのため、遺伝暗号に従ってリボソーム上にアミノ酸を正しい順番で運ぶトランスファーRNA(tRNA)には、その正確さを担保するための仕組みが備わっている。tRNAが機能を発揮するためには、転写後に必要な修飾を受けた上で、各コドンに対応するアミノ酸でアミノアシル化されてリボソームに取り込まれる必要がある。修飾を担う酵素が選択性や反応速度などの点で正しく機能しなくなると、誤ったアミノ酸の取り込みや読み枠のズレなどによりタンパク質の品質が低下し、生体応答に異常をきたす。特に、メッセンジャーRNAとリボソーム上で塩基対を形成して特異的なアミノ酸認識に関わる、tRNAのアンチコドン領域(34~36位)とその周辺の配列の適切な修飾は、アミノ酸を正しい配列で結合させていく上で重要である。
tRNAの修飾のうちの一つである36位グアノシンのメチル化は、ワトソンークリック型の塩基対形成を阻害することで、タンパク質翻訳における読み枠のズレを防止する役割を担う。このメチル化を担う酵素は原核生物(TrmD)と真核生物(Trm5)で異なっており、原核生物のTrmDの欠損は致死性である。そして、原核生物の酵素のみ、その活性にCa2+、Mg2+、Mn2+などの2価金属イオン要求性がある。
そこで本研究では、この酵素活性に必須の金属イオンの細胞内濃度を制御している機構の解明を目指して、イオンチャネルの変異体の活性評価や、阻害剤の効果の検証を行なった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

本研究では、細胞内の金属イオンの濃度を制御する機構を明らかにすることを目的としている。具体的には、酵素の活性中心における金属イオン要求性や、その上流でイオン濃度を制御している分子実態の探索、その制御が機能しない場合の応答の変化と疾病との関連性の解明を目指している。本年度も前年度に引き続き、細胞内の金属イオン濃度を制御するイオンチャネルの分子実体として、外界の環境変化を感知してCa2+などを細胞内に流入させる非特異的陽イオン透過チャネルであるTransient Receptor Potential (TRP) チャネルファミリーの変異体の機能評価ならびに阻害剤の評価を行なった。
TRPファミリーは温度、 pH、レドックス環境、機械刺激など、それぞれが固有の刺激で活性化することが知られている。本年度は、腎障害患者から同定されてきたTRPCチャネル変異体の機能評価を行った。モデル生物として腎臓由来細胞を用いて、作製した変異体を遺伝子導入により発現させ、定常状態や受容体刺激時の細胞内Ca2+濃度の変化を測定した。評価した変異体のうち、数種類は細胞内へのCa2+流入量が減少し、数種類はCa2+流入能力が上昇していることを見出した。総合して、患者由来の遺伝子変異では、その臨床的な重篤さの度合いに応じて細胞内Ca2+流入能力が向上していることが明らかになった。そこで、チャネル機能の異常向上が疾患と関連することから、発症の抑制と進行を遅らせることを目指して、TRPCチャネルの阻害剤の評価を行った。
さらに、チャネル機能が異常に向上した変異を持つモデルマウスの作製に着手したが、本年度より別の競争的資金が採択され、本研究に対するエフォート率が下がったため、研究の進捗がやや遅れている。当初の計画では本年度中に変異マウスの評価まで行う予定であったが、来年度に行う見込みである。

Strategy for Future Research Activity

前年度までの成果で、HEK293細胞や膵細胞、腎細胞をモデル生物として用いて、膵炎や腎障害の患者から同定されたTRPチャネルの様々な変異体を遺伝子導入により発現させ、細胞内Ca2+濃度の変化を測定したところ、複数の変異体でCa2+流入能力が変化(向上、低下の双方)しており、患者由来の遺伝子変異では、その臨床的な重篤さの度合いに応じて細胞内Ca2+流入能力が向上していることが明らかになった。今後の方針として、各変異体の、Ca2+以外の金属イオン(Mg, Zn, Fe, Coなど)に対する透過性(選択性の変化)を評価したり、イオンチャネルに対する阻害剤の効果(作用機構への影響)を評価したりする。
また、TRPCチャネル機能の異常向上が疾患と関連することから、チャネル機能が異常に向上した変異を持つモデルマウスをCrispr-Cas9法で作製し、第1世代が生まれてきたところである。今後、この変異マウスたちの遺伝型を同定した後、組織を採取し、細胞骨格の形成やタンパク質産生における品質の変化があるか評価する。表現型の有意な差が観察された場合、TRPCチャネルの阻害剤をマウスたちに投与し、表現型の改善が見られるか評価を行う。

Report

(3 results)
  • 2023 Research-status Report
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (17 results)

All 2024 2023 2022 2021

All Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 6 results) Presentation (8 results) (of which Invited: 1 results) Patent(Industrial Property Rights) (2 results) (of which Overseas: 1 results)

  • [Journal Article] Photoactive carbon monoxide-releasing coordination polymer particles2022

    • Author(s)
      Carne-Sanchez Arnau、Ikemura Shuya、Sakaguchi Reiko、Craig Gavin A.、Furukawa Shuhei
    • Journal Title

      Chemical Communications

      Volume: 58 Issue: 71 Pages: 9894-9897

    • DOI

      10.1039/d2cc03907a

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] A two-step screening to optimize the signal response of an auto-fluorescent protein-based biosensor2022

    • Author(s)
      Tajima Shunsuke、Nakata Eiji、Sakaguchi Reiko、Saimura Masayuki、Mori Yasuo、Morii Takashi
    • Journal Title

      RSC Advances

      Volume: 12 Issue: 24 Pages: 15407-15419

    • DOI

      10.1039/d2ra02226e

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Critical contributions of pre-S1 shoulder and distal TRP box in DAG-activated TRPC6 channel by PIP2 regulation2022

    • Author(s)
      Mori Masayuki X.、Okada Ryo、Sakaguchi Reiko、Hase Hideharu、Imai Yuko、Polat Onur K.、Itoh Satoru G.、Okumura Hisashi、Mori Yasuo、Okamura Yasushi、Inoue Ryuji
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 12 Issue: 1 Pages: 1-13

    • DOI

      10.1038/s41598-022-14766-x

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Cell-autonomous control of intracellular temperature by unsaturation of phospholipid acyl chains2022

    • Author(s)
      Murakami A., Nagao K., Sakaguchi R., Kida K., Hara Y., Mori Y., Okabe K., Harada Y., Umeda M.
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 38 Issue: 11 Pages: 110487-110487

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2022.110487

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Osteoclasts adapt to physioxia perturbation through DNA demethylation2021

    • Author(s)
      Nishikawa Keizo、Seno Shigeto、Yoshihara Toshitada、Narazaki Ayako、Sugiura Yuki、Shimizu Reito、Kikuta Junichi、Sakaguchi Reiko、Suzuki Norio、Takeda Norihiko、Semba Hiroaki、Yamamoto Masamichi、et al
    • Journal Title

      EMBO reports

      Volume: 22 Issue: 12 Pages: 53035-53035

    • DOI

      10.15252/embr.202153035

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase B promotes Ca2+ mobilization and the inflammatory activity of dendritic cells2021

    • Author(s)
      Marongiu Laura、Morii Takashi、Granucci Francesca, et al
    • Journal Title

      Science Signaling

      Volume: 14 Issue: 676

    • DOI

      10.1126/scisignal.aaz2120

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Functionally deficient TRPV6 variants contribute to hereditary and familial chronic pancreatitis2021

    • Author(s)
      Hamada S, Masson E, Chen JM, Sakaguchi R, Rebours V, Buscail L, Matsumoto R, Tanaka Y, Kikuta K, Kataoka F, Sasaki A, Le Rhun M, Audin H, Lachaux A, Caumont B, Lorenzo D, Billiemaz K, Besnard R, Koch S, Lamireau T, De Koninck X; GREPAN Study Group, Genin E, Cooper DN, Mori Y, Masamune A, Ferec C
    • Journal Title

      Human Mutation

      Volume: 43 Issue: 2 Pages: 228-239

    • DOI

      10.1002/humu.24315

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Dynamic remodeling of TRPC5-caveolin-1-eNOS complexes regulates the precise signal transfer between Ca2+ and NO2024

    • Author(s)
      Reiko Sakaguchi, Nobuaki Takahashi, Takashi Yoshida, Nozomi Ogawa, Yoshifumi Ueda, Satoshi Hamano, Kaori Yamaguchi, Seishiro Sawamura, Shinichiro Yamamoto, Yuji Hara, Tomoya Kawamoto, Akito Nakao, Masayuki X. Mori, Tetsushi Furukawa, Shunichi Shimizu, Ryuji Inoue, and Yasuo Mori
    • Organizer
      第101回 日本生理学会大会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] Effect of novel selective TRPC3/6 dual inhibitor L862 to rat PAN-induced nephropathy2023

    • Author(s)
      Reiko Sakaguchi, Yoshimune Matsuda, Ryo Okada, Marie Konomi, Takanori Kihara, Takeshi Yamamoto, Yoshitaka Isaka, Ryu Nagata, Masayuki X. Mori
    • Organizer
      第97回日本薬理学会年会
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      2023 Research-status Report
  • [Presentation] イオンチャネル機能と連動する蛋白尿におけるバイオマーカーの探索2023

    • Author(s)
      松田 由宗、坂口 怜子、岡田 亮、木原 隆典、永田 龍、森 誠之
    • Organizer
      第96回日本生化学会大会
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      2023 Research-status Report
  • [Presentation] 蛋白尿改善を目指したイオンチャネル阻害剤の 開発と評価2023

    • Author(s)
      坂口 怜子, 松田 由宗, 岡田 亮, 石兼 真, 高橋 富美, 片渕 瑛介, 中山 敏幸, 眞田 賢哉, 上田 陽一, 木原 隆典, 永田 龍, 森 誠之
    • Organizer
      令和5年度 産業医科大学学会
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      2023 Research-status Report
  • [Presentation] PAN腎症モデルラットに対するTRPC3/6チャネル阻害剤L862による蛋白尿改善2023

    • Author(s)
      坂口 怜子、松田 由宗、岡田 亮、木稲 真利慧、永田 龍、森 誠之
    • Organizer
      第100回 日本生理学会大会
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      2022 Research-status Report
  • [Presentation] TRPC5-Caveolin-1-eNOSシグナルタンパク質複合体が内皮細胞におけるCa2+とNOシグナル調節に果たす役割2023

    • Author(s)
      坂口怜子,森誠之, 森泰生
    • Organizer
      第52回日本心脈管作動物質学会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 新規選択的TRPC3/6チャネルブロッカーによるラットPAN-誘導性腎症の緩和2022

    • Author(s)
      坂口 怜子、岡田 亮、松田 由宗、木稲 真利慧、永田 龍、森 誠之
    • Organizer
      第99回 日本生理学会大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] Visualization and Understanding of Subcellular Thermodynamics using Fluorescent Protein-based Thermosensors2021

    • Author(s)
      坂口 怜子
    • Organizer
      第59回 生物物理学会年会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Invited
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 腎臓疾患の予防および/または治療用医薬組成物2023

    • Inventor(s)
      永田龍,猪阪善隆,山本毅士,余西洋明,森誠之,坂口怜子,岡田亮
    • Industrial Property Rights Holder
      永田龍,猪阪善隆,山本毅士,余西洋明,森誠之,坂口怜子,岡田亮
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
      2023
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Overseas
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 腎臓疾患の予防および/または治療用医薬組成物2022

    • Inventor(s)
      永田龍,猪阪善隆,山本毅士,余西洋明,森誠之,坂口怜子,岡田亮
    • Industrial Property Rights Holder
      永田龍,猪阪善隆,山本毅士,余西洋明,森誠之,坂口怜子,岡田亮
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2022-029773
    • Filing Date
      2022
    • Related Report
      2021 Research-status Report

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2024-12-25  

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